Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,486,178 |
G→A |
intergenic (+119/‑78) |
ydcF → / → ald |
hypothetical protein/aldehyde dehydrogenase, NAD‑linked |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,486,178 | 0 | G | A | 100.0%
| 919.0
/ NA
| 243 | intergenic (+119/‑78) | ydcF/ald | hypothetical protein/aldehyde dehydrogenase, NAD‑linked |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (124/119); total (124/119) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACGATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCC > NC_000913/1486088‑1486267
|
gCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAAt > 1:2766129/1‑93 (MQ=255)
aaCGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTcc > 2:2081606/1‑93 (MQ=255)
aCGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCg < 1:4576610/93‑1 (MQ=255)
gggCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGtc < 2:1362060/93‑1 (MQ=255)
aTGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGtctctc < 2:567906/93‑1 (MQ=255)
tGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTctctct > 1:3033461/1‑93 (MQ=255)
tGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTGTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTctctct < 1:892053/93‑1 (MQ=255)
gACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtg > 1:5839882/1‑93 (MQ=255)
gACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTACACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtg > 1:5432493/1‑93 (MQ=255)
aCTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtga < 2:2745264/93‑1 (MQ=255)
aCTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtga < 2:406141/93‑1 (MQ=255)
cTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgat < 2:3000831/93‑1 (MQ=255)
tCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatg > 1:222408/1‑93 (MQ=255)
tCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatg > 1:2663569/1‑93 (MQ=255)
tCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatg > 1:1555208/1‑93 (MQ=255)
tCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatg < 2:4532776/93‑1 (MQ=255)
tCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatg > 2:3490280/1‑93 (MQ=255)
ccTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCtgatga > 1:1597668/1‑93 (MQ=255)
ccTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGGCTCTCtgatga < 2:2774720/93‑1 (MQ=255)
cTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTgatgat < 2:3393822/93‑1 (MQ=255)
cTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTgatgat < 1:4792835/93‑1 (MQ=255)
cTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTgatgat > 1:1007969/1‑93 (MQ=255)
cTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTgatgat > 2:1451220/1‑93 (MQ=255)
tGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgatt > 1:333453/1‑93 (MQ=255)
tGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgatt > 1:3631211/1‑93 (MQ=255)
gACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgattg > 2:2610443/1‑93 (MQ=255)
gACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgattg > 2:817943/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgattga > 2:1169373/1‑93 (MQ=255)
cTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGAtgattgat > 1:4043797/1‑93 (MQ=255)
ttttATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATg > 2:1813094/1‑93 (MQ=255)
ttttATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATg > 1:535160/1‑93 (MQ=255)
tttATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGt < 1:4329173/93‑1 (MQ=255)
tttATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGt < 2:2917366/93‑1 (MQ=255)
aTTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaa < 1:467916/93‑1 (MQ=255)
aTTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaa < 2:4854670/93‑1 (MQ=255)
tgtCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaat < 1:2600767/91‑1 (MQ=255)
tCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaatta > 1:3910363/1‑93 (MQ=255)
cTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaattaa < 1:1960847/93‑1 (MQ=255)
cTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaattaa > 2:4372855/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGttaattaaa > 2:2874989/1‑92 (MQ=255)
tGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAAc > 1:590022/1‑93 (MQ=255)
cTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAAt < 1:240909/93‑1 (MQ=255)
ttttATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATg > 2:4258169/1‑93 (MQ=255)
ttttATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATg > 1:1406225/1‑93 (MQ=255)
tttATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGt < 1:6211423/93‑1 (MQ=255)
ttATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTa < 2:318872/93‑1 (MQ=255)
aTTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTAtt > 1:5516207/1‑93 (MQ=255)
aTTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTAtt > 2:2985629/1‑93 (MQ=255)
aTTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTAtt > 2:6225412/1‑93 (MQ=255)
tCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCa > 2:5884509/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAc > 1:1937742/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAc < 2:497817/93‑1 (MQ=255)
ccTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAc < 2:5590837/93‑1 (MQ=255)
cTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAcc < 2:126918/93‑1 (MQ=255)
ttttACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCg > 1:1792508/1‑93 (MQ=255)
tttACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGa > 2:5578909/1‑93 (MQ=255)
acacTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGaaaa < 2:4634586/93‑1 (MQ=255)
acacTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGaaaa < 1:4080567/93‑1 (MQ=255)
acacTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGaaaa > 2:616732/1‑93 (MQ=255)
cacTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAaaac > 2:2485146/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAaaacaa > 1:1675093/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAaaacaa < 1:4903086/93‑1 (MQ=255)
ttGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAaaacaaa > 2:1869519/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAaaacaaac < 1:2837023/93‑1 (MQ=255)
tttttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACat > 1:3609821/1‑93 (MQ=255)
ttttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACata < 1:116127/93‑1 (MQ=255)
ttttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACata < 2:5801756/93‑1 (MQ=255)
tttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACatat < 2:5239115/93‑1 (MQ=255)
tttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACatat < 2:6291393/93‑1 (MQ=255)
tttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACatat < 2:1047353/93‑1 (MQ=255)
ttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAtata < 2:5564448/93‑1 (MQ=255)
ttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAtata < 2:5342946/93‑1 (MQ=255)
ttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAtata < 1:2738419/93‑1 (MQ=255)
ttATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAtata < 2:2146855/93‑1 (MQ=255)
aagAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATaaa > 2:5063563/3‑93 (MQ=255)
aTGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGACAACAAACATATaaa > 2:3979869/1‑93 (MQ=255)
tGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAAt > 2:6099221/1‑93 (MQ=255)
gAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATc > 1:1238602/1‑93 (MQ=255)
gCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATcaca < 2:4361558/93‑1 (MQ=255)
cccTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAg > 1:5856341/1‑93 (MQ=255)
ccTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAgg < 2:3702327/93‑1 (MQ=255)
ccTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGAGTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAgg > 1:3378533/1‑93 (MQ=255)
cTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGa > 1:3724341/1‑93 (MQ=255)
cTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGa < 2:546923/93‑1 (MQ=255)
cTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATAACAGGa > 1:715825/1‑93 (MQ=255)
cacaGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTc < 1:6086022/93‑1 (MQ=255)
acaGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCg > 2:725578/1‑93 (MQ=255)
acaGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCg < 2:4807377/93‑1 (MQ=255)
caGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGc > 1:4242719/1‑93 (MQ=255)
aGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGcc < 1:2914223/93‑1 (MQ=255)
gAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGccc < 2:2409429/93‑1 (MQ=255)
ttGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATg > 1:1721561/1‑93 (MQ=255)
ttGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATg > 2:45916/1‑93 (MQ=255)
tGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGt < 1:1386244/93‑1 (MQ=255)
gTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTc > 1:5132255/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAg > 2:2757635/1‑93 (MQ=255)
ttCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTAc < 2:1579941/93‑1 (MQ=255)
tCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTAcc < 1:3918669/93‑1 (MQ=255)
tCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTAcc > 1:5234360/1‑93 (MQ=255)
cacaATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTAccc < 2:1685603/93‑1 (MQ=255)
|
GCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACGATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCC > NC_000913/1486088‑1486267
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACGATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCCGTT > NC_000913/1486085‑1486270
|
TTTGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACA < SRR4302533.180452/94‑1 (MQ=60)
TTTGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACA < SRR4302533.3079971/94‑1 (MQ=60)
TGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAAT < SRR4302533.2085088/94‑1 (MQ=60)
TGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAAT > SRR4302533.2783087/1‑94 (MQ=60)
AAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCC < SRR4302533.5409096/94‑1 (MQ=60)
AAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCC < SRR4302533.1533290/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCG < SRR4302533.2877542/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCG < SRR4302533.373995/94‑1 (MQ=60)
ACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGT < SRR4302533.4604348/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCT > SRR4302533.4203968/1‑94 (MQ=60)
GGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTC < SRR4302533.486498/94‑1 (MQ=60)
ATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCT > SRR4302533.3052018/1‑94 (MQ=60)
TGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTG > SRR4302533.5875192/1‑94 (MQ=60)
TGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTACACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTG > SRR4302533.5465208/1‑94 (MQ=60)
TGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTGTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTG < SRR4302533.897294/94‑1 (MQ=60)
GACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGA > SRR4302533.5300730/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG > SRR4302533.5174972/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG > SRR4302533.223799/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG > SRR4302533.2679920/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG < SRR4302533.84112/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG > SRR4302533.4223988/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATG > SRR4302533.1564570/1‑94 (MQ=60)
TCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGA > SRR4302533.1384998/1‑94 (MQ=60)
TCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGA > SRR4302533.1607342/1‑94 (MQ=60)
CCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGAT > SRR4302533.5574713/1‑94 (MQ=60)
CCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGAT > SRR4302533.1013866/1‑94 (MQ=60)
CCTGACTTTTATTTCTGCCATTTATTCCTTTTACACTTGAATTTATGACGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCACTGATGAT < SRR4302533.6334830/94‑1 (MQ=60)
CTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATT < SRR4302533.4821875/94‑1 (MQ=60)
CTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATT > SRR4302533.3653551/1‑94 (MQ=60)
CTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATT > SRR4302533.335492/1‑94 (MQ=60)
TGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTG < SRR4302533.3015912/94‑1 (MQ=60)
TGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTG < SRR4302533.2693202/94‑1 (MQ=60)
TGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTATGATGATTG < SRR4302533.1655561/94‑1 (MQ=60)
GACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGA < SRR4302533.4536044/94‑1 (MQ=60)
GACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGA < SRR4302533.4863118/94‑1 (MQ=60)
ACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGAT > SRR4302533.5721367/1‑94 (MQ=60)
ACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGAT > SRR4302533.4068411/1‑94 (MQ=60)
ACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGAT > SRR4302533.6255931/1‑94 (MQ=60)
ACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGAT < SRR4302533.2764466/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATG > SRR4302533.538340/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTT < SRR4302533.4355254/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTA > SRR4302533.4783711/1‑94 (MQ=60)
TATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAA > SRR4302533.4073313/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAAT > SRR4302533.469861/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAAT < SRR4302533.470711/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAAT < SRR4302533.2122411/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATT > SRR4302533.2494328/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATT < SRR4302533.2616746/94‑1 (MQ=60)
TTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTA > SRR4302533.3934243/1‑94 (MQ=60)
CTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAAC < SRR4302533.1972816/94‑1 (MQ=60)
CTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAAC > SRR4302533.593507/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAAT < SRR4302533.1759583/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATG > SRR4302533.1414729/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATG < SRR4302533.242405/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATG > SRR4302533.1095350/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATG > SRR4302533.4276068/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATG < SRR4302533.267699/94‑1 (MQ=60)
TTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGT < SRR4302533.6007846/94‑1 (MQ=60)
TTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTA < SRR4302533.6248671/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTAT > SRR4302533.1951125/1‑94 (MQ=60)
TATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATT < SRR4302533.2400467/94‑1 (MQ=60)
TATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATT > SRR4302533.3642777/1‑94 (MQ=60)
TATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATT > SRR4302533.5549510/1‑94 (MQ=60)
TCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAC < SRR4302533.3937063/94‑1 (MQ=60)
TCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCAC > SRR4302533.1949556/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACC > SRR4302533.3490189/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACC < SRR4302533.5899664/94‑1 (MQ=60)
CTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCG > SRR4302533.1803412/1‑94 (MQ=60)
TTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACTATGTATTCACCGAA > SRR4302533.1394598/1‑94 (MQ=60)
TTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAA > SRR4302533.3982222/1‑94 (MQ=60)
TTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAA < SRR4302533.3726319/94‑1 (MQ=60)
TACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAA < SRR4302533.1320839/94‑1 (MQ=60)
ACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAAC > SRR4302533.1533617/1‑94 (MQ=60)
ACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAAC < SRR4302533.4105410/94‑1 (MQ=60)
CACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACA > SRR4302533.2828226/1‑94 (MQ=60)
CACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACA < SRR4302533.183424/94‑1 (MQ=60)
ACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAA > SRR4302533.1685236/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAA < SRR4302533.4932798/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACA < SRR4302533.2854486/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAT > SRR4302533.3632039/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACAT < SRR4302533.3294058/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATAT < SRR4302533.3496341/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATAT < SRR4302533.116866/94‑1 (MQ=60)
TTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATAT > SRR4302533.1695817/1‑94 (MQ=60)
TTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATA < SRR4302533.6016996/94‑1 (MQ=60)
TTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAA > SRR4302533.1591917/1‑94 (MQ=60)
TTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAA < SRR4302533.2755213/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAAT < SRR4302533.3802111/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAAT < SRR4302533.1811929/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATC > SRR4302533.1246003/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCA < SRR4302533.1182992/94‑1 (MQ=60)
AGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACA < SRR4302533.3388068/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAG < SRR4302533.5495504/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAG < SRR4302533.93606/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAG > SRR4302533.5891745/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAG < SRR4302533.5879678/94‑1 (MQ=60)
CCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGG > SRR4302533.2491845/1‑94 (MQ=60)
CCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGAGTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGG > SRR4302533.3399391/1‑94 (MQ=60)
CCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGA > SRR4302533.3747191/1‑94 (MQ=60)
CCTTCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATAACAGGA > SRR4302533.720048/1‑94 (MQ=60)
TCACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTC < SRR4302533.6124687/94‑1 (MQ=60)
CACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCG < SRR4302533.6122816/94‑1 (MQ=60)
CACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCG > SRR4302533.3251147/1‑94 (MQ=60)
ACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGC < SRR4302533.4031851/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGC > SRR4302533.4268335/1‑94 (MQ=60)
AGAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCC < SRR4302533.2932100/94‑1 (MQ=60)
GAATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAAAAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCA < SRR4302533.444438/94‑1 (MQ=60)
AATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCAT < SRR4302533.5257403/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATG > SRR4302533.2905039/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATG > SRR4302533.1732002/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATG > SRR4302533.5431104/1‑94 (MQ=60)
TGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTC < SRR4302533.5097142/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTC > SRR4302533.5163259/1‑94 (MQ=60)
TGTCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTC < SRR4302533.1394586/94‑1 (MQ=60)
TCCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAG < SRR4302533.2736193/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGT < SRR4302533.1660541/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGT > SRR4302533.217480/1‑94 (MQ=60)
TTCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACC > SRR4302533.5265837/1‑94 (MQ=60)
TCACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCC < SRR4302533.3942598/94‑1 (MQ=60)
ACAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCCGT < SRR4302533.1176391/94‑1 (MQ=60)
CAATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCCGTT > SRR4302533.1676908/1‑94 (MQ=60)
|
TTTGCAAACGGGCATGACTCCTGACTTTTATTTCTGCCTTTTATTCCTTTTACACTTGTTTTTATGAAGCCCTTCACAGAATTGTCCTTTCACGATTCCGTCTCTCTGATGATTGATGTTAATTAACAATGTATTCACCGAAAACAAACATATAAATCACAGGAGTCGCCCATGTCAGTACCCGTT > NC_000913/1486085‑1486270
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
