Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,143,530 |
T→C |
L748P (CTG→CCG) |
yegE → |
putative sensor‑type protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,143,530 | 0 | T | C | 99.5%
| 630.1
/ NA
| 195 | L748P (CTG→CCG) | yegE | putative sensor‑type protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (97/97); minor base A (1/0); total (98/97) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619
|
ttATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGa < 2:3700248/93‑1 (MQ=255)
ttATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGa < 2:3064214/93‑1 (MQ=255)
tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg < 2:1780521/93‑1 (MQ=255)
tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 1:2516141/1‑93 (MQ=255)
aTCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGt > 2:746391/1‑93 (MQ=255)
aTCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGt > 1:167355/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc > 1:5206630/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc < 1:6176285/93‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc > 1:1001517/1‑93 (MQ=255)
cTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctg > 1:2745159/1‑93 (MQ=255)
cTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGAGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctg > 1:4087974/1‑93 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 1:3828905/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATTGCGAGTAtgctgg > 2:932414/1‑92 (MQ=255)
gATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGCGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGCTAATGTCGAGTATGCCGCGt > 2:1825363/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 2:2859772/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGCGCATGCGGCGGGCGACGGTTTGCTGCGCGAACTGTAGTCGTTAATGCCGCGGATGCTGTGtt > 2:1344050/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGCATGCTGCGTTcc > 2:4049351/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTccc > 1:3692908/1‑92 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa > 2:602245/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa < 2:1001191/93‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg > 2:3136806/1‑93 (MQ=255)
cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg > 2:910148/1‑93 (MQ=255)
cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg > 2:3253127/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc > 1:1260118/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc > 2:3968095/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc > 2:4332812/1‑93 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc < 1:4902256/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTGCAGCg > 1:3166182/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCg > 1:5551454/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAc < 2:3921924/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg < 1:2857063/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg > 1:6193617/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTg < 2:2696400/93‑1 (MQ=255)
gCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGAGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGACGAGTATGCTGCGTTCCACCAACGTg > 2:6228303/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc > 1:2065462/1‑93 (MQ=255)
ggTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCt < 2:4889041/93‑1 (MQ=255)
gAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgc > 1:4952544/1‑93 (MQ=255)
gAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgc > 2:228076/1‑93 (MQ=255)
gAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgc > 2:5310066/1‑93 (MQ=255)
aTGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcgc < 2:2387599/93‑1 (MQ=255)
tGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGTCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcgtg > 2:3692943/1‑91 (MQ=255)
tGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGcgcg > 1:5128511/1‑93 (MQ=255)
aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAc < 1:4599223/93‑1 (MQ=255)
aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAc > 1:4415963/1‑93 (MQ=255)
aGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTc > 1:434096/1‑93 (MQ=255)
aGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCACCGACGTGCTGGCGCGACTc < 2:1217514/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 2:5296041/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 1:4476445/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg < 1:3605883/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCAGAGTATGCTGCGTTACAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 1:1051740/1‑93 (MQ=255)
cgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCgg < 1:4282900/93‑1 (MQ=255)
cgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCgg < 1:2266829/93‑1 (MQ=255)
cgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCgg < 2:638606/93‑1 (MQ=255)
gcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGt < 1:2986387/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg > 2:3783200/1‑93 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 1:5804131/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 2:2920246/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 2:5606639/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 1:4748643/93‑1 (MQ=255)
ggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGgggggg > 2:4564009/1‑93 (MQ=255)
aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTg > 2:2242009/1‑93 (MQ=255)
aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATg > 1:646598/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGa > 1:1377198/1‑93 (MQ=255)
tGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGa < 1:1118164/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGGGGGGATGaa > 2:3014920/1‑93 (MQ=255)
gggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTgg > 2:2080114/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt > 1:5291641/1‑93 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGtt > 2:2577657/1‑92 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 2:4179857/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 2:1381547/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTct > 1:932175/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctg < 2:3217970/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc < 1:3954154/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgct > 1:469009/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgct > 1:1560740/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCtgctgc > 2:3964387/1‑93 (MQ=255)
tttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTgctgct > 1:1810398/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTa < 1:5068983/93‑1 (MQ=255)
tgctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTAc < 1:416392/93‑1 (MQ=255)
tgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAg > 2:588711/1‑93 (MQ=255)
tgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAg > 1:6079318/1‑93 (MQ=255)
tgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAg > 2:5111186/1‑93 (MQ=255)
cgcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGAc < 2:5783806/93‑1 (MQ=255)
cgcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGAc < 2:4440384/93‑1 (MQ=255)
aaCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTa > 1:19315/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 2:5435034/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa > 2:5750057/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 1:3263111/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 2:1080701/93‑1 (MQ=255)
gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt < 1:5483847/93‑1 (MQ=255)
gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt > 1:5922013/1‑93 (MQ=255)
gtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa > 1:3362744/1‑93 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 2:4192789/93‑1 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 2:1715250/93‑1 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa > 2:762860/1‑93 (MQ=255)
cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa < 1:2634299/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgc > 1:2103073/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCTACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgc < 1:687503/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgcg < 1:572436/93‑1 (MQ=255)
tGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgcgc < 2:2848163/93‑1 (MQ=255)
|
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT > NC_000913/2143437‑2143623
|
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCC > SRR4302533.4852033/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCC > SRR4302533.4639255/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCG > SRR4302533.2760263/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCG > SRR4302533.5034958/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCG < SRR4302533.1543318/94‑1 (MQ=60)
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAG > SRR4302533.2531645/1‑94 (MQ=60)
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAG < SRR4302533.4729998/94‑1 (MQ=60)
TATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGT > SRR4302533.168416/1‑94 (MQ=60)
ATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTA < SRR4302533.3311358/94‑1 (MQ=60)
TCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAT < SRR4302533.1659733/94‑1 (MQ=60)
GATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGC > SRR4302533.5237999/1‑94 (MQ=60)
GATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGC > SRR4302533.1007365/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT < SRR4302533.6213394/94‑1 (MQ=60)
TCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTG > SRR4302533.2761988/1‑94 (MQ=60)
TCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGAGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTG > SRR4302533.4112861/1‑94 (MQ=60)
tgtgtgcgtttaaagggggaaaagagccgggccggtgggggggggggtggcttTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGC < SRR4302533.3238747/41‑1 (MQ=60)
CTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGC < SRR4302533.6212436/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCG < SRR4302533.3852316/94‑1 (MQ=60)
TGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGGTGCGT > SRR4302533.549659/1‑94 (MQ=60)
TGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGT > SRR4302533.1037798/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCC > SRR4302533.3715595/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCA > SRR4302533.5814053/1‑94 (MQ=60)
GCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAG < SRR4302533.350467/94‑1 (MQ=60)
GCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAG < SRR4302533.676591/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC > SRR4302533.1267655/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGGACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGCTCCAGCG > SRR4302533.1242695/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTGCAGCG > SRR4302533.3185664/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG > SRR4302533.5584978/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG < SRR4302533.4931961/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG > SRR4302533.2672999/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTACAGCGA > SRR4302533.2806293/1‑94 (MQ=60)
cgctcttccgatctgctgtatCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAC > SRR4302533.5045838/22‑94 (MQ=60)
AAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACG > SRR4302533.6230782/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACG < SRR4302533.4269961/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTAGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGGATGGTGCGTTCCAGCGACG > SRR4302533.4457450/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGT < SRR4302533.2874643/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTG > SRR4302533.5900650/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGC > SRR4302533.2078192/1‑94 (MQ=60)
GTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGG > SRR4302533.6225049/1‑94 (MQ=60)
TGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGC > SRR4302533.4982540/1‑94 (MQ=60)
ATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCG > SRR4302533.2592585/1‑94 (MQ=60)
ATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCG > SRR4302533.5159493/1‑94 (MQ=60)
GACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAC > SRR4302533.4442630/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGTCGACGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302533.602481/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302533.6327386/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302533.4627086/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302533.3902520/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302533.1801844/94‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT > SRR4302533.4643673/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTC > SRR4302533.436683/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG > SRR4302533.4503519/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCAGAGTATGCTGCGTTACAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG > SRR4302533.1057932/1‑94 (MQ=60)
GCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGG < SRR4302533.3628077/94‑1 (MQ=60)
GCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGG > SRR4302533.4819522/1‑94 (MQ=60)
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CGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGT < SRR4302533.2280851/94‑1 (MQ=60)
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GCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTG < SRR4302533.3004656/94‑1 (MQ=60)
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CCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGG > SRR4302533.3250971/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGG < SRR4302533.5839185/94‑1 (MQ=60)
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GCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGAT < SRR4302533.519677/94‑1 (MQ=60)
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CATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATG < SRR4302533.2991509/94‑1 (MQ=60)
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ATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGA > SRR4302533.1385484/1‑94 (MQ=60)
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GGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCAACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGT > SRR4302533.5716705/1‑94 (MQ=60)
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ACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCT < SRR4302533.3978261/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCT > SRR4302533.1570140/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCT > SRR4302533.471810/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTG < SRR4302533.4117906/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCT > SRR4302533.1821459/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTC > SRR4302533.4587522/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTA > SRR4302533.960848/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTAC < SRR4302533.5099589/94‑1 (MQ=60)
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TGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACC > SRR4302533.5295334/1‑94 (MQ=60)
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CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG > SRR4302533.220185/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG < SRR4302533.3787917/94‑1 (MQ=60)
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CGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGT > SRR4302533.4040682/1‑94 (MQ=60)
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GAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTA > SRR4302533.5841685/1‑94 (MQ=60)
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ACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAT < SRR4302533.3283241/94‑1 (MQ=60)
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GGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTT > SRR4302533.5957809/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTG < SRR4302533.5516900/94‑1 (MQ=60)
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CGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGA < SRR4302533.1151489/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGA > SRR4302533.3383521/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGA < SRR4302533.4483759/94‑1 (MQ=60)
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CGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAG < SRR4302533.2650488/94‑1 (MQ=60)
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GTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGC < SRR4302533.4423937/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCTACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCG < SRR4302533.691569/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCG < SRR4302533.1445987/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCG < SRR4302533.5569455/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC < SRR4302533.575814/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGT > SRR4302533.6244264/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTT < SRR4302533.1893832/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302533.3874900/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302533.104505/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGCTGCGTGCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT < SRR4302533.5314273/94‑1 (MQ=60)
|
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTT > NC_000913/2143437‑2143623
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
