Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,281,515 |
A→G |
R151R (CGT→CGC) |
yejK ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,281,515 | 0 | A | G | 100.0%
| 737.4
/ NA
| 227 | R151R (CGT→CGC) | yejK | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (97/130); total (97/130) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > NC_000913/2281425‑2281604
|
gAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGcg > 1:2549716/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCGCCACTTTGCGCCCTAATCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATgcgc < 1:5880299/93‑1 (MQ=255)
ccGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGcaa > 1:1070697/1‑93 (MQ=255)
gCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGcaaca > 2:3548372/1‑93 (MQ=255)
ccACTTTGCGCCCTACTCGCCTTTTGAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGTTTAAATCGATGCGCGcaacaa < 2:4510566/93‑1 (MQ=255)
ccACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGcaacaa > 2:2428783/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAatat > 1:2468953/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATc < 2:1945804/93‑1 (MQ=255)
ttGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATcc < 1:715703/93‑1 (MQ=255)
gcgcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGc > 1:5663673/1‑93 (MQ=255)
cgcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCa < 2:1813146/93‑1 (MQ=255)
gcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAt < 2:1239939/93‑1 (MQ=255)
gcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAt > 2:5296202/1‑93 (MQ=255)
gcCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAt > 2:3765346/1‑93 (MQ=255)
ccTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtga > 1:237203/1‑93 (MQ=255)
cTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCGACAATATCCGCAtgat > 2:1596641/1‑93 (MQ=255)
cTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgat < 1:4957043/93‑1 (MQ=255)
tACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgatt < 2:5635225/93‑1 (MQ=255)
tACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgatt < 1:3746738/93‑1 (MQ=255)
aCTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattg > 2:1315404/1‑93 (MQ=255)
aCTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattg > 1:5003869/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattgat > 1:17314/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCAtgattgat > 1:4018029/1‑93 (MQ=255)
cGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGata < 1:1048416/93‑1 (MQ=255)
gCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGatat < 1:3297305/93‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATc > 2:1005512/1‑93 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa > 2:3977664/1‑93 (MQ=255)
cTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCaa > 1:1300965/1‑93 (MQ=255)
tttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCGACAATATCCGCATGATTGATATCAAg > 2:5088639/1‑93 (MQ=255)
tttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAg > 2:388464/1‑93 (MQ=255)
tttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAg > 1:2361644/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGa < 1:4873878/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGa > 1:6115010/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATCGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGa < 1:5094015/93‑1 (MQ=255)
tCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAt < 1:3513109/93‑1 (MQ=255)
tCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAt > 1:4747133/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATa < 2:2628933/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa < 1:3670186/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa > 2:5349735/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATaa < 1:28557/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAt < 2:3354717/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAt > 2:4365835/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgg < 1:3415543/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtggg < 1:2998354/93‑1 (MQ=255)
aaGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtggg > 1:5208866/1‑93 (MQ=255)
aGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggt < 2:6080592/93‑1 (MQ=255)
aGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggt < 1:2238464/93‑1 (MQ=255)
aGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggt > 2:2103114/1‑93 (MQ=255)
tGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttg > 2:5954619/1‑93 (MQ=255)
gaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttgggt > 1:6127930/1‑93 (MQ=255)
gaTAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAtgggttgggt > 1:2498700/1‑93 (MQ=255)
aGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGa < 1:2186766/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATg < 1:4366370/93‑1 (MQ=255)
gggTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGt < 2:3635207/93‑1 (MQ=255)
ggTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTc < 1:5776373/93‑1 (MQ=255)
ggTGGACGCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTc < 1:4134923/93‑1 (MQ=255)
gTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCg > 2:4892965/1‑93 (MQ=255)
tGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCga < 2:5142512/93‑1 (MQ=255)
tGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCga < 2:3685999/93‑1 (MQ=255)
ggACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCgag < 2:6028472/93‑1 (MQ=255)
gACTCTGGATTGTTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCgaga < 2:3669353/93‑1 (MQ=255)
gACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCgaga > 2:6042515/1‑93 (MQ=255)
gACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCgaga < 1:2324596/93‑1 (MQ=255)
gACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCgaga < 1:2118426/93‑1 (MQ=255)
aCTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAt < 1:5997626/93‑1 (MQ=255)
aCTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAt < 1:4626517/93‑1 (MQ=255)
tctGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAttt > 2:447048/1‑93 (MQ=255)
tctGGATTGGTTTCCCATTCGGGTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAttt < 1:3788567/93‑1 (MQ=255)
tgtaTTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTc < 2:3175440/90‑1 (MQ=255)
ggATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATTGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCg > 2:4220154/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTa < 2:4855629/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTa < 2:3300243/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTa > 1:4939990/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTa < 1:1884732/93‑1 (MQ=255)
tttCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAAcgc < 1:6282110/93‑1 (MQ=255)
tCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACgcgc > 2:5549974/1‑93 (MQ=255)
cccATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCa < 2:1752503/93‑1 (MQ=255)
cccATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCa < 2:5022048/93‑1 (MQ=255)
cATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATa < 2:5768792/93‑1 (MQ=255)
cATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATa > 2:836433/1‑93 (MQ=255)
cATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATa < 2:804007/93‑1 (MQ=255)
cATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATa < 2:2500506/93‑1 (MQ=255)
cATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATa > 2:1284502/1‑93 (MQ=255)
aTTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATAc > 2:746695/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACt < 2:5603967/93‑1 (MQ=255)
cGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGc > 1:4298250/1‑93 (MQ=255)
cGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGc < 1:5438363/93‑1 (MQ=255)
cGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGc < 2:2283880/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTc > 2:4656225/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTc > 2:2836502/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTc > 2:2331914/1‑93 (MQ=255)
aaaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAgg > 2:4612884/1‑93 (MQ=255)
aaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGt < 1:1431491/93‑1 (MQ=255)
aaTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGt > 2:4628033/1‑93 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTACCGCGCATACTGCTCAGGtt < 2:1465769/93‑1 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt < 2:270669/93‑1 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt < 2:3508002/93‑1 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt < 1:3181338/93‑1 (MQ=255)
aTCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGtt < 1:156278/93‑1 (MQ=255)
gATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCt > 2:4427848/1‑93 (MQ=255)
|
GAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > NC_000913/2281425‑2281604
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCAG > NC_000913/2281422‑2281607
|
AAAGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATG > SRR4302533.669345/1‑94 (MQ=60)
AGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCG > SRR4302533.2565410/1‑94 (MQ=60)
AGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCG < SRR4302533.3447941/94‑1 (MQ=60)
AGAAAGCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCG < SRR4302533.2385511/94‑1 (MQ=60)
AAATCCGCCACTTTGCGCCCTAATCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCG < SRR4302533.5915835/94‑1 (MQ=60)
ATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCA > SRR4302533.3853099/1‑94 (MQ=60)
TCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAA > SRR4302533.1077005/1‑94 (MQ=60)
CCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAAC > SRR4302533.1879620/1‑94 (MQ=60)
CGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACA < SRR4302533.1311921/94‑1 (MQ=60)
CGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACA < SRR4302533.4216060/94‑1 (MQ=60)
CGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACA > SRR4302533.5043193/1‑94 (MQ=60)
CCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAAT > SRR4302533.6195948/1‑94 (MQ=60)
CACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAAAAATA < SRR4302533.672462/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT < SRR4302533.150047/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT > SRR4302533.2395130/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATAT > SRR4302533.2484182/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATC < SRR4302533.5910426/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATC > SRR4302533.4653267/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATC > SRR4302533.5378629/1‑94 (MQ=60)
TTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGTATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCC < SRR4302533.3393503/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCG < SRR4302533.719925/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGC > SRR4302533.5697891/1‑94 (MQ=60)
CCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGA > SRR4302533.238670/1‑94 (MQ=60)
CCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGA < SRR4302533.1207787/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302533.4679097/1‑94 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302533.2293383/1‑94 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT < SRR4302533.3051986/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT < SRR4302533.5167534/94‑1 (MQ=60)
CCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGAT > SRR4302533.2554095/1‑94 (MQ=60)
CTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATT < SRR4302533.4987070/94‑1 (MQ=60)
CTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATT > SRR4302533.5609785/1‑94 (MQ=60)
TACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTG > SRR4302533.5034195/1‑94 (MQ=60)
TACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTG < SRR4302533.3769709/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGAT > SRR4302533.4042492/1‑94 (MQ=60)
CTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGAT > SRR4302533.17433/1‑94 (MQ=60)
CGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATAT < SRR4302533.3728704/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATAT < SRR4302533.1054577/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATC < SRR4302533.3317653/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATC > SRR4302533.601591/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAA > SRR4302533.2268567/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAA > SRR4302533.1308790/1‑94 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG > SRR4302533.2376258/1‑94 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG > SRR4302533.379191/1‑94 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG > SRR4302533.4334482/1‑94 (MQ=60)
CTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAG > SRR4302533.4036402/1‑94 (MQ=60)
TTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGA > SRR4302533.6151906/1‑94 (MQ=60)
TTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGA > SRR4302533.6190346/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAT < SRR4302533.4903409/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAT > SRR4302533.4775912/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATCGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGAT < SRR4302533.5124786/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATA < SRR4302533.5784806/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATA < SRR4302533.3534765/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAT < SRR4302533.28751/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAAT < SRR4302533.3692746/94‑1 (MQ=60)
GGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATG < SRR4302533.4065067/94‑1 (MQ=60)
GGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATG < SRR4302533.1056209/94‑1 (MQ=60)
GGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATG < SRR4302533.5575079/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGG < SRR4302533.506380/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGG > SRR4302533.5240243/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGG < SRR4302533.1963343/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGG < SRR4302533.3436648/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGG < SRR4302533.4974611/94‑1 (MQ=60)
AAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGT < SRR4302533.3016689/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTT < SRR4302533.2252297/94‑1 (MQ=60)
GTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTG < SRR4302533.592943/94‑1 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT > SRR4302533.2514116/1‑94 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT < SRR4302533.4943645/94‑1 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT > SRR4302533.4944633/1‑94 (MQ=60)
AGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGT > SRR4302533.6164863/1‑94 (MQ=60)
AGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGAT < SRR4302533.2200241/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATG < SRR4302533.2100400/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGT < SRR4302533.4392727/94‑1 (MQ=60)
GGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCG < SRR4302533.5811260/94‑1 (MQ=60)
GGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCG < SRR4302533.604894/94‑1 (MQ=60)
GGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCG < SRR4302533.6164103/94‑1 (MQ=60)
GGTGGACGCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCG < SRR4302533.4160020/94‑1 (MQ=60)
GTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGA > SRR4302533.1622205/1‑94 (MQ=60)
TGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAG < SRR4302533.2365895/94‑1 (MQ=60)
GGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGA > SRR4302533.2725899/1‑94 (MQ=60)
GGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGA > SRR4302533.2424416/1‑94 (MQ=60)
GACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAT < SRR4302533.2338987/94‑1 (MQ=60)
GACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAT < SRR4302533.2131491/94‑1 (MQ=60)
GACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGAT < SRR4302533.2489502/94‑1 (MQ=60)
GCTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATT < SRR4302533.3675940/94‑1 (MQ=60)
ACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATT < SRR4302533.6033951/94‑1 (MQ=60)
ACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATT < SRR4302533.4654556/94‑1 (MQ=60)
TCTGGATTGGTTTCCCATTCGGGTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTT < SRR4302533.3811769/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTC < SRR4302533.774448/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTC < SRR4302533.3530802/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTC < SRR4302533.4778110/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCG > SRR4302533.2630119/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTA > SRR4302533.4969896/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTA > SRR4302533.3245177/1‑94 (MQ=60)
ATTGATTTCCCCTTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAAATTTTCGTTA < SRR4302533.1442079/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAA < SRR4302533.5029009/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAA < SRR4302533.1896242/94‑1 (MQ=60)
GTTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGC < SRR4302533.445791/94‑1 (MQ=60)
TTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCG < SRR4302533.3207836/94‑1 (MQ=60)
TTTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCG < SRR4302533.6319604/94‑1 (MQ=60)
TTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGC > SRR4302533.237826/1‑94 (MQ=60)
TTCCCATTCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGC > SRR4302533.289857/1‑94 (MQ=60)
TCGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGC > SRR4302533.4324101/1‑94 (MQ=60)
CGGTTAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCT < SRR4302533.5471118/94‑1 (MQ=60)
TAAATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGG > SRR4302533.2211601/1‑94 (MQ=60)
AATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTT < SRR4302533.1440142/94‑1 (MQ=60)
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ATCGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTG < SRR4302533.157274/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCT > SRR4302533.2146646/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCA < SRR4302533.6156292/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCA > SRR4302533.3991128/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCAG < SRR4302533.4536244/94‑1 (MQ=60)
|
AAAGAAATCCGCCACTTTGCGCCCTACTCGCCCTTTCAGGAAAGTGAGATAGCGGGTGGACTCTGGATTGGTTTCCCATTCGGTTAAATCGATACGCGCAACAATATCCGCATGATTGATATCAAGATAATGGGTTGGGTTGATGTCGAGATTTTCGTTAACGCGCATACTGCTCAGGTTGCTCAG > NC_000913/2281422‑2281607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
