Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,321,092 |
G→A |
A403T (GCC→ACC) |
atoC → |
ornithine decarboxylase antizyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,321,092 | 0 | G | A | 99.2%
| 857.0
/ NA
| 251 | A403T (GCC→ACC) | atoC | ornithine decarboxylase antizyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (110/139); minor base C (0/2); total (110/141) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181
|
tcgtGATGAATTCAGGCCCGATCCTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGACTCGTCCGCCAGTCTGTCATGCTGGCGAGGGAAAAACAAccc > 2:5374267/1‑93 (MQ=255)
cgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcccc < 2:6065256/93‑1 (MQ=255)
cgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcccc < 2:4743448/93‑1 (MQ=255)
gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt < 1:3492709/93‑1 (MQ=255)
tgattaATTCAGGCCCGATCATTTGTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg < 1:2229568/93‑1 (MQ=255)
tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg > 1:1162173/1‑93 (MQ=255)
tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg > 2:3743923/1‑93 (MQ=255)
gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 1:6173401/93‑1 (MQ=255)
gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 2:237506/93‑1 (MQ=255)
aggaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTc < 2:554839/91‑1 (MQ=255)
tgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg > 1:780635/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTg > 2:4791592/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTg > 1:3455913/1‑93 (MQ=255)
cAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGc > 2:377607/1‑93 (MQ=255)
cAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGc < 2:2152503/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCGATCATTTTTGCTGAGCATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCg < 2:2566389/93‑1 (MQ=255)
ggCCCGATCTTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGt < 2:1205600/93‑1 (MQ=255)
cccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTaa < 1:6191419/93‑1 (MQ=255)
cccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTaa > 2:3285811/1‑93 (MQ=255)
cccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTaa > 2:1787359/1‑93 (MQ=255)
ccGATCTTTTTTTCTGAGGATCTGCCACCAGAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt < 1:2660459/93‑1 (MQ=255)
cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 2:2922520/1‑93 (MQ=255)
cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 1:609822/1‑93 (MQ=255)
tCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaa < 2:1041057/93‑1 (MQ=255)
tttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAACCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 1:1567249/92‑1 (MQ=255)
aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 2:842584/93‑1 (MQ=255)
aTTTTTTCTGAGGATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 1:4524241/93‑1 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag < 2:1392204/93‑1 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag > 1:3026179/1‑93 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag < 2:5655880/93‑1 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag < 1:5632556/93‑1 (MQ=255)
ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag < 1:4058979/93‑1 (MQ=255)
tttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAgg < 1:2521949/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGa < 2:3422839/93‑1 (MQ=255)
tGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAt > 1:4795373/1‑93 (MQ=255)
tGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAt < 2:402639/93‑1 (MQ=255)
gATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaaa < 1:3641348/93‑1 (MQ=255)
gATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaaa < 2:5240137/93‑1 (MQ=255)
aaTCTCCCCCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaaa < 2:3609364/92‑1 (MQ=255)
tCTTCCGCCACAGATTTGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcg > 1:5661021/1‑93 (MQ=255)
tCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcg < 1:2426756/93‑1 (MQ=255)
ctcccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgc < 2:2882039/90‑1 (MQ=255)
cTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgc > 1:1031471/1‑93 (MQ=255)
cTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgc > 1:2128680/1‑93 (MQ=255)
cTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgc < 2:4241418/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 2:501620/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:2000526/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGt < 1:5091737/93‑1 (MQ=255)
tCCCCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGt < 2:1512842/93‑1 (MQ=255)
ccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTc < 2:3660723/93‑1 (MQ=255)
ccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTc > 1:5954871/1‑93 (MQ=255)
ccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTc > 2:4318852/1‑93 (MQ=255)
acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 1:3661649/1‑93 (MQ=255)
gATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACg < 1:2267702/93‑1 (MQ=255)
aTTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGc < 2:4035683/93‑1 (MQ=255)
ttCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGca < 2:2832041/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcat > 1:3088756/1‑93 (MQ=255)
tCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcat < 2:5934422/93‑1 (MQ=255)
cGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatc < 2:2246887/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatca > 2:536796/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatcat > 2:2008216/1‑93 (MQ=255)
cAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCAtt < 2:2493126/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt > 2:3146586/1‑93 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt < 2:5768886/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt < 2:1292136/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt > 1:943081/1‑93 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt > 1:4260497/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACACCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTCAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATgg < 2:5132430/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATgg < 1:2725813/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGa > 1:3779193/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGa < 1:6044449/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGa < 2:4267535/93‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATGGTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGaa > 2:3859030/1‑93 (MQ=255)
gTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGaa > 1:1300231/1‑93 (MQ=255)
gTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGaa > 1:4598093/1‑93 (MQ=255)
tCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAg > 1:2578832/1‑93 (MQ=255)
tCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAg < 2:1654625/93‑1 (MQ=255)
cTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGt < 1:5340577/93‑1 (MQ=255)
tGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTg > 2:4570513/1‑93 (MQ=255)
gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGc > 2:4646549/1‑93 (MQ=255)
tAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCt < 1:1183399/93‑1 (MQ=255)
tAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCt < 1:3764409/93‑1 (MQ=255)
tAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCt < 1:3329270/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTg > 1:53840/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTg > 1:4128508/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGa > 1:3110484/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGa > 1:2943313/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaa > 1:4709469/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaa > 1:637302/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaa < 2:5082167/93‑1 (MQ=255)
gCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaacaac < 2:688906/93‑1 (MQ=255)
gCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaacaac < 1:1829133/93‑1 (MQ=255)
gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa > 2:1975569/1‑93 (MQ=255)
tAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaag < 1:6259210/93‑1 (MQ=255)
aaaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAgg > 2:3367685/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCCAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAgg < 2:2767618/93‑1 (MQ=255)
aaaaCACCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 2:5679367/93‑1 (MQ=255)
aaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 2:6084698/93‑1 (MQ=255)
aaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaa < 1:4930210/93‑1 (MQ=255)
aCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAc < 2:928912/93‑1 (MQ=255)
|
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGA > NC_000913/2320999‑2321184
|
GCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAA > SRR4302533.2755141/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAC < SRR4302533.3022498/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACC < SRR4302533.2336639/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACC > SRR4302533.5984687/1‑94 (MQ=60)
gcggtATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCCCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCC < SRR4302533.383288/89‑1 (MQ=60)
TCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCC < SRR4302533.5464830/94‑1 (MQ=60)
CGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCT < SRR4302533.6224596/94‑1 (MQ=60)
GTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTG > SRR4302533.1169145/1‑94 (MQ=60)
GTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTG > SRR4302533.4959367/1‑94 (MQ=60)
GTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTG < SRR4302533.3514247/94‑1 (MQ=60)
TGATTAATTCAGGCCCGATCATTTGTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGT < SRR4302533.2243330/94‑1 (MQ=60)
TGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGT > SRR4302533.5366449/1‑94 (MQ=60)
TGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGT > SRR4302533.2936985/1‑94 (MQ=60)
GATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTC < SRR4302533.6210498/94‑1 (MQ=60)
GATAAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTC < SRR4302533.4824116/94‑1 (MQ=60)
ATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCG > SRR4302533.785234/1‑94 (MQ=60)
TGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGG < SRR4302533.3392304/94‑1 (MQ=60)
GAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGT < SRR4302533.2581621/94‑1 (MQ=60)
GAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGT < SRR4302533.2143384/94‑1 (MQ=60)
GAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGT > SRR4302533.1707060/1‑94 (MQ=60)
AATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTG > SRR4302533.3477241/1‑94 (MQ=60)
AATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTG > SRR4302533.3477242/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAG < SRR4302533.1111114/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAG < SRR4302533.412112/94‑1 (MQ=60)
CAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCG < SRR4302533.1967208/94‑1 (MQ=60)
AGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGT > SRR4302533.2675104/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTA > SRR4302533.3580920/1‑94 (MQ=60)
GCTCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAA < SRR4302533.2701475/94‑1 (MQ=60)
CCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAT < SRR4302533.6228576/94‑1 (MQ=60)
CCGATCTTTTTTTCTGAGGATCTGCCACCAGAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT < SRR4302533.2676795/94‑1 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT > SRR4302533.613408/1‑94 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT > SRR4302533.6274747/1‑94 (MQ=60)
CGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTT > SRR4302533.4638638/1‑94 (MQ=60)
CGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTT > SRR4302533.6175961/1‑94 (MQ=60)
GATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTA > SRR4302533.4631259/1‑94 (MQ=60)
GATCATTTTTTCTGAGAATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTA < SRR4302533.308964/94‑1 (MQ=60)
CATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAA < SRR4302533.3734599/94‑1 (MQ=60)
CATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAA > SRR4302533.957859/1‑94 (MQ=60)
CATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACACCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAA > SRR4302533.4935173/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAACCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAG < SRR4302533.1576685/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAG > SRR4302533.3044697/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTTCTGAGGATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAG < SRR4302533.4551630/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGA < SRR4302533.5666617/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAG < SRR4302533.824676/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAG < SRR4302533.5547833/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGG < SRR4302533.4083687/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGG < SRR4302533.5667033/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGA < SRR4302533.2537489/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAA > SRR4302533.1294525/1‑94 (MQ=60)
CTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAT > SRR4302533.2997232/1‑94 (MQ=60)
CTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAT > SRR4302533.6139543/1‑94 (MQ=60)
CTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAT > SRR4302533.4824422/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTA > SRR4302533.6323764/1‑94 (MQ=60)
AGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAA < SRR4302533.6119207/94‑1 (MQ=60)
GGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAA > SRR4302533.5995162/1‑94 (MQ=60)
GATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAC < SRR4302533.3663741/94‑1 (MQ=60)
ATCTTCCGCCACAGATTTGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACG > SRR4302533.5695224/1‑94 (MQ=60)
ATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACG > SRR4302533.2040506/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGC > SRR4302533.2141806/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGC < SRR4302533.3673838/94‑1 (MQ=60)
TCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGC > SRR4302533.1037537/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGC < SRR4302533.2441760/94‑1 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG > SRR4302533.2012841/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG < SRR4302533.3851315/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGT > SRR4302533.3712583/1‑94 (MQ=60)
TTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGT < SRR4302533.656150/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGT < SRR4302533.5387791/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTC > SRR4302533.5990892/1‑94 (MQ=60)
TCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTC < SRR4302533.5122497/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG < SRR4302533.4221530/94‑1 (MQ=60)
CGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGA > SRR4302533.2635946/1‑94 (MQ=60)
GCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAA < SRR4302533.4982064/94‑1 (MQ=60)
CCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAACCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAGGCGTCGAAA > SRR4302533.247668/1‑94 (MQ=60)
CACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAA > SRR4302533.3684162/1‑94 (MQ=60)
GATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGC < SRR4302533.2281728/94‑1 (MQ=60)
TTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCAT > SRR4302533.4205345/1‑94 (MQ=60)
TTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCAT > SRR4302533.3107744/1‑94 (MQ=60)
TCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATC > SRR4302533.2149763/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCA > SRR4302533.2772951/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTA > SRR4302533.6021868/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT > SRR4302533.948628/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT > SRR4302533.4286169/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATG < SRR4302533.3302733/94‑1 (MQ=60)
CAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGA < SRR4302533.2742533/94‑1 (MQ=60)
CAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGA > SRR4302533.3802346/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA < SRR4302533.6081067/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA > SRR4302533.4625950/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA < SRR4302533.2275883/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA > SRR4302533.3450331/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA > SRR4302533.1308053/1‑94 (MQ=60)
GTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAATTTAACCCGGTCAAAAAACGCACAATTATGGAAG > SRR4302533.1181374/1‑94 (MQ=60)
GTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAG > SRR4302533.2594702/1‑94 (MQ=60)
TCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGT < SRR4302533.238854/94‑1 (MQ=60)
CTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTG < SRR4302533.5372603/94‑1 (MQ=60)
TGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGC > SRR4302533.1188794/1‑94 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT < SRR4302533.1960037/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT > SRR4302533.246596/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG < SRR4302533.3349848/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG < SRR4302533.5738111/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG > SRR4302533.54203/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG < SRR4302533.1190505/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG > SRR4302533.4153569/1‑94 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG < SRR4302533.3787484/94‑1 (MQ=60)
AATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGG < SRR4302533.4578585/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGA > SRR4302533.3129605/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGA > SRR4302533.2961280/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAA > SRR4302533.4738013/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAA > SRR4302533.641052/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACA < SRR4302533.3054818/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAA > SRR4302533.1429452/1‑94 (MQ=60)
GCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACA < SRR4302533.1840301/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA < SRR4302533.3129017/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA < SRR4302533.3321455/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA < SRR4302533.5195479/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA > SRR4302533.3800372/1‑94 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA < SRR4302533.6281959/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAA < SRR4302533.4368970/94‑1 (MQ=60)
TAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGG < SRR4302533.2312437/94‑1 (MQ=60)
TAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGG < SRR4302533.6296635/94‑1 (MQ=60)
AAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAA < SRR4302533.4960066/94‑1 (MQ=60)
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AACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATGATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > SRR4302533.641987/1‑94 (MQ=60)
ACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACC < SRR4302533.3550959/94‑1 (MQ=60)
ACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACC > SRR4302533.3978738/1‑94 (MQ=60)
ACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACC < SRR4302533.3891756/94‑1 (MQ=60)
ACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACC < SRR4302533.4607119/94‑1 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG < SRR4302533.92928/94‑1 (MQ=60)
AACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGA < SRR4302533.1237898/94‑1 (MQ=60)
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GCCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGA > NC_000913/2320999‑2321184
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
