Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,746,200 |
T→C |
S73S (AGT→AGC) |
b2611 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,746,200 | 0 | T | C | 100.0%
| 825.5
/ NA
| 250 | S73S (AGT→AGC) | b2611 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (121/129); total (121/129) |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAA > NC_000913/2746110‑2746289
|
gCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTtga > 2:4700353/1‑93 (MQ=255)
gCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTtga > 1:4878253/1‑93 (MQ=255)
aCGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTtgatga > 1:6140112/1‑93 (MQ=255)
cGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTgatgat > 1:6292730/1‑93 (MQ=255)
gCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATc < 2:2304474/93‑1 (MQ=255)
gCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATc > 1:4629411/1‑93 (MQ=255)
cAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCt < 2:4880865/93‑1 (MQ=255)
aaTCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTg < 2:6058823/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGt < 1:5034104/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGt > 1:4128953/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCACAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGt > 1:3610326/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTa < 2:5739432/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTAc < 1:4688559/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTAc > 2:4065948/1‑93 (MQ=255)
tctGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGt < 1:901709/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTaa > 2:3403516/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCATCTTGATGATCTGTACGGTAAt < 2:4495940/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAAt < 1:2300585/93‑1 (MQ=255)
aGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAc > 1:4361422/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAcc > 2:4032819/1‑93 (MQ=255)
cccGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCa > 1:264259/1‑93 (MQ=255)
cccGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCa > 2:3760738/1‑93 (MQ=255)
cGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAtt > 2:1671052/1‑93 (MQ=255)
cGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAtt > 2:4247139/1‑93 (MQ=255)
cGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAtt > 2:4384963/1‑93 (MQ=255)
cGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAtt < 1:1350769/93‑1 (MQ=255)
gCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtg > 1:1108577/1‑93 (MQ=255)
cATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtgt < 2:5791398/93‑1 (MQ=255)
aTCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATtgtg < 1:1656716/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTgg > 1:4858949/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGc < 1:5639802/93‑1 (MQ=255)
cTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCt > 1:5441976/1‑93 (MQ=255)
gCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtc < 1:4007559/93‑1 (MQ=255)
gCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtc < 1:3164844/93‑1 (MQ=255)
cccGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtct < 2:2529045/93‑1 (MQ=255)
cccGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtct < 2:1292464/93‑1 (MQ=255)
cccGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtct < 1:5337779/93‑1 (MQ=255)
ccGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtctc < 1:6009524/93‑1 (MQ=255)
ccGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTtctc > 1:1592978/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGc > 1:1234443/1‑93 (MQ=255)
tGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCg > 2:1662827/1‑93 (MQ=255)
tGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCg < 1:3816435/93‑1 (MQ=255)
aTAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtg > 2:4448442/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtgg > 2:2724244/1‑93 (MQ=255)
aGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggc < 2:824156/93‑1 (MQ=255)
gCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggct < 2:2831108/93‑1 (MQ=255)
cGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggctg > 1:2709652/1‑93 (MQ=255)
cGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggctg < 2:1133923/93‑1 (MQ=255)
ggACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATTGtggctgg < 2:6159770/93‑1 (MQ=255)
gACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggctggc < 2:2606579/93‑1 (MQ=255)
gACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGtggctggc > 1:4153224/1‑93 (MQ=255)
cAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGgctggctg > 2:4939228/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgctgc > 2:1059621/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgctgc > 2:479070/1‑93 (MQ=255)
aaaaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgctgc < 1:731197/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGgctggctggc > 2:1205911/1‑91 (MQ=255)
aaaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGGTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgccgct > 1:3410094/1‑93 (MQ=255)
aaCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgctgctg < 2:192717/93‑1 (MQ=255)
aCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGgctgctgc < 1:3738052/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTa > 2:506300/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTAcc < 1:582269/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCa < 1:6194781/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCAt < 1:1031722/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCAt < 1:451865/93‑1 (MQ=255)
ctgctgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCAtt > 2:5531507/1‑93 (MQ=255)
ctgctgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCAtt < 2:1510304/93‑1 (MQ=255)
tgctgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTg < 2:225740/93‑1 (MQ=255)
tgctgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTg > 2:2710478/1‑93 (MQ=255)
gctgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGt < 2:5367241/93‑1 (MQ=255)
tgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTGCGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCCTTGTCt > 2:2653809/1‑93 (MQ=255)
tgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCCTTGTCt > 1:5763961/1‑93 (MQ=255)
tgAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCt > 2:701319/1‑93 (MQ=255)
gAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTa < 2:4536550/93‑1 (MQ=255)
gAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTa < 2:580439/93‑1 (MQ=255)
gAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTa < 1:5462883/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAt < 2:2135545/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAt < 2:3918663/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCCTTGTCTAtc > 1:1796219/1‑92 (MQ=255)
aCGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATg > 2:2017605/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATg > 1:3100638/1‑93 (MQ=255)
cGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGc < 1:5119303/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGTCt > 2:3335546/1‑93 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt < 1:2918791/93‑1 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt > 2:5906408/1‑93 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt < 2:1860477/93‑1 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt < 1:3359643/93‑1 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt > 1:1503817/1‑93 (MQ=255)
ggTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCttt < 2:119059/93‑1 (MQ=255)
gTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTg > 1:5196899/1‑93 (MQ=255)
ttCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTCCCCATTGTCTATGCCTTTgc < 1:2132564/93‑1 (MQ=255)
tCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTATATGCCtttacc > 2:5261636/1‑90 (MQ=255)
tCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAACATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTTCTACCCATTGTCTATTGCTTTgcg > 1:2618814/1‑93 (MQ=255)
cATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTgcgc < 1:1865032/93‑1 (MQ=255)
cATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTgcgc > 1:529880/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCt > 1:2834819/1‑93 (MQ=255)
tGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTa < 2:663517/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATc < 1:21913/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCa < 1:5416343/93‑1 (MQ=255)
cAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCaa < 1:757021/93‑1 (MQ=255)
cAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCaa < 2:2871227/93‑1 (MQ=255)
|
CTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAA > NC_000913/2746110‑2746289
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTG > NC_000913/2746107‑2746293
|
GGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGC > SRR4302533.705211/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCT < SRR4302533.3849302/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTT < SRR4302533.4095506/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTT < SRR4302533.179508/94‑1 (MQ=60)
CTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAGCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTG < SRR4302533.1729837/94‑1 (MQ=60)
TGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGA < SRR4302533.3230656/94‑1 (MQ=60)
TGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGA > SRR4302533.4907807/1‑94 (MQ=60)
CCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATG < SRR4302533.5358911/94‑1 (MQ=60)
CACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGA > SRR4302533.2892984/1‑94 (MQ=60)
CACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGA > SRR4302533.6177094/1‑94 (MQ=60)
ACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGAT > SRR4302533.549294/1‑94 (MQ=60)
ACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGAT > SRR4302533.549293/1‑94 (MQ=60)
ACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGAT < SRR4302533.3293976/94‑1 (MQ=60)
ACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGAT > SRR4302533.6330246/1‑94 (MQ=60)
CGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATC > SRR4302533.4657472/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGT < SRR4302533.5794453/94‑1 (MQ=60)
AATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGT > SRR4302533.4154016/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCACAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGT > SRR4302533.3632546/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTA < SRR4302533.5064598/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTA < SRR4302533.295660/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTAC < SRR4302533.4897117/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACG < SRR4302533.85294/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACG < SRR4302533.5891532/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACG < SRR4302533.4716981/94‑1 (MQ=60)
GCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGG > SRR4302533.668428/1‑94 (MQ=60)
TCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTA < SRR4302533.906998/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAAT > SRR4302533.4451026/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAAT > SRR4302533.1555451/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATG < SRR4302533.2314843/94‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAC > SRR4302533.2722975/1‑94 (MQ=60)
AAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAC > SRR4302533.4387749/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCA > SRR4302533.5069906/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCA > SRR4302533.265863/1‑94 (MQ=60)
CCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCAT > SRR4302533.4560439/1‑94 (MQ=60)
CCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATT < SRR4302533.5784786/94‑1 (MQ=60)
CGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTG > SRR4302533.1115155/1‑94 (MQ=60)
CGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTG < SRR4302533.3827945/94‑1 (MQ=60)
CGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTG < SRR4302533.1358893/94‑1 (MQ=60)
CGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTG < SRR4302533.4553976/94‑1 (MQ=60)
CGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTG > SRR4302533.2353425/1‑94 (MQ=60)
GCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGT < SRR4302533.5449432/94‑1 (MQ=60)
GCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGT > SRR4302533.6221737/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTG < SRR4302533.2035652/94‑1 (MQ=60)
CATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTG > SRR4302533.3457166/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAATGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGATCATTGTGG > SRR4302533.1233769/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGG < SRR4302533.2150904/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGG > SRR4302533.4888400/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGG > SRR4302533.3544625/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGG < SRR4302533.1666743/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGG > SRR4302533.6109367/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGC < SRR4302533.2195087/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCT < SRR4302533.5673894/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCT > SRR4302533.5474755/1‑94 (MQ=60)
TGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTC > SRR4302533.1615812/1‑94 (MQ=60)
GCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCT < SRR4302533.3184321/94‑1 (MQ=60)
GCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCT > SRR4302533.5406719/1‑94 (MQ=60)
GCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCT < SRR4302533.4031958/94‑1 (MQ=60)
CCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTC > SRR4302533.1602616/1‑94 (MQ=60)
CCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTC < SRR4302533.5369782/94‑1 (MQ=60)
CCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGCAATGACCATTGTGGCTTCTC > SRR4302533.4703376/1‑94 (MQ=60)
CCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCG < SRR4302533.2815659/94‑1 (MQ=60)
CCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCG < SRR4302533.6045933/94‑1 (MQ=60)
CGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGC > SRR4302533.6304893/1‑94 (MQ=60)
CGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGC > SRR4302533.1241824/1‑94 (MQ=60)
GTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCG > SRR4302533.1485908/1‑94 (MQ=60)
TGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGT < SRR4302533.3839771/94‑1 (MQ=60)
TGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGT > SRR4302533.5278950/1‑94 (MQ=60)
TGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGT < SRR4302533.5133238/94‑1 (MQ=60)
GATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTG < SRR4302533.2631625/94‑1 (MQ=60)
ATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGG < SRR4302533.68009/94‑1 (MQ=60)
ATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGG < SRR4302533.5625306/94‑1 (MQ=60)
AGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCT < SRR4302533.986248/94‑1 (MQ=60)
GCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTG < SRR4302533.4310623/94‑1 (MQ=60)
GCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTG > SRR4302533.2726282/1‑94 (MQ=60)
GCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTG > SRR4302533.1848970/1‑94 (MQ=60)
CGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGGCCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGG > SRR4302533.4976488/1‑94 (MQ=60)
GGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGC > SRR4302533.5185321/1‑94 (MQ=60)
GGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGC > SRR4302533.4178390/1‑94 (MQ=60)
GACAAAGCCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCT < SRR4302533.4077635/94‑1 (MQ=60)
GACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCT > SRR4302533.1215920/1‑94 (MQ=60)
CAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGC > SRR4302533.823338/1‑94 (MQ=60)
CAAAACCTCAGCCTGCGGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCGCGCAATCGTGGCTGGCTGC < SRR4302533.4210578/94‑1 (MQ=60)
AAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCT < SRR4302533.735503/94‑1 (MQ=60)
AAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCT < SRR4302533.5399995/94‑1 (MQ=60)
AAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGGTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCCGCT > SRR4302533.3431155/1‑94 (MQ=60)
ACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGGT > SRR4302533.3912422/1‑94 (MQ=60)
ACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCT < SRR4302533.3760979/94‑1 (MQ=60)
ACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCT < SRR4302533.4861374/94‑1 (MQ=60)
CCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTA < SRR4302533.1296968/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCC < SRR4302533.585700/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCA > SRR4302533.1868943/1‑94 (MQ=60)
GCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCAT < SRR4302533.6231950/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGGTTCTAACCATT > SRR4302533.3125911/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATT < SRR4302533.5975265/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATT < SRR4302533.1037789/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATT < SRR4302533.454571/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTG < SRR4302533.2637854/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTG < SRR4302533.4148912/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTG > SRR4302533.2864041/1‑94 (MQ=60)
TGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGT < SRR4302533.36508/94‑1 (MQ=60)
CTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCCTTGTCT > SRR4302533.5798747/1‑94 (MQ=60)
TGAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTT > SRR4302533.3831909/1‑94 (MQ=60)
GAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAT > SRR4302533.2672601/1‑94 (MQ=60)
GAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAT > SRR4302533.5850953/1‑94 (MQ=60)
GAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAT < SRR4302533.5495795/94‑1 (MQ=60)
GAACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTAT > SRR4302533.756679/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCCTTGTCTATC > SRR4302533.1807149/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATG > SRR4302533.3119698/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCC > SRR4302533.1429999/1‑94 (MQ=60)
CGTTGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCC < SRR4302533.5150234/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTT > SRR4302533.1512885/1‑94 (MQ=60)
TGGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTT < SRR4302533.6186921/94‑1 (MQ=60)
GGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTG > SRR4302533.5228238/1‑94 (MQ=60)
GGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTG < SRR4302533.3380400/94‑1 (MQ=60)
GGTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTG < SRR4302533.2936677/94‑1 (MQ=60)
GTTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGC < SRR4302533.1636923/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTCCCCATTGTCTATGCCTTTGCG < SRR4302533.2145717/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCG < SRR4302533.4174293/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCG < SRR4302533.4853190/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGAACATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTTCTACCCATTGTCTATTGCTTTGCG > SRR4302533.2634891/1‑94 (MQ=60)
TCATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGC > SRR4302533.533034/1‑94 (MQ=60)
CATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCCATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCT < SRR4302533.3399449/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCT < SRR4302533.1876408/94‑1 (MQ=60)
CATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCT > SRR4302533.2852267/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTT < SRR4302533.4928682/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTGCCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTAT < SRR4302533.2232366/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTAT > SRR4302533.1102816/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATC < SRR4302533.3083481/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATC < SRR4302533.5298505/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCA < SRR4302533.22058/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAA < SRR4302533.5448918/94‑1 (MQ=60)
CAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAAC > SRR4302533.3158136/1‑94 (MQ=60)
CAGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAAC < SRR4302533.761475/94‑1 (MQ=60)
AGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACC < SRR4302533.6069638/94‑1 (MQ=60)
AGCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACC < SRR4302533.4380787/94‑1 (MQ=60)
GCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCT > SRR4302533.3670870/1‑94 (MQ=60)
GCTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCT < SRR4302533.5394342/94‑1 (MQ=60)
CTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTG < SRR4302533.1552761/94‑1 (MQ=60)
|
GGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTG > NC_000913/2746107‑2746293
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
