Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,793,230 |
T→C |
G319G (GGT→GGC) |
gabP → |
GabP |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,793,230 | 0 | T | C | 100.0%
| 655.4
/ NA
| 205 | G319G (GGT→GGC) | gabP | GabP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/99); total (106/99) |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGT > NC_000913/2793140‑2793319
|
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGa < 2:5979198/93‑1 (MQ=255)
ggACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGa < 1:2279010/93‑1 (MQ=255)
cTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGc < 1:3101980/93‑1 (MQ=255)
tGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCt > 2:3640598/1‑93 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTcc < 1:1095349/93‑1 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTcc > 2:612991/1‑93 (MQ=255)
cGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTcc > 2:1064175/1‑93 (MQ=255)
gTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTccc > 1:1752456/1‑93 (MQ=255)
gTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTccc > 1:4176291/1‑93 (MQ=255)
gATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCcgc > 2:4856471/1‑93 (MQ=255)
gATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCcgc > 1:4217914/1‑93 (MQ=255)
atatTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCcgcg > 2:3478650/1‑93 (MQ=255)
tatTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCgg > 2:925412/1‑93 (MQ=255)
tatTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCgg < 1:4466507/93‑1 (MQ=255)
tatTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCgg < 1:2916202/93‑1 (MQ=255)
atTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGt < 2:1202164/93‑1 (MQ=255)
ttACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTa > 2:4529122/1‑93 (MQ=255)
tACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTaa > 2:3147939/1‑93 (MQ=255)
tACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTaa < 1:556309/93‑1 (MQ=255)
tACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGAGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTaa > 1:4438377/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATg < 2:4680795/93‑1 (MQ=255)
ttCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATggg > 2:5687335/1‑93 (MQ=255)
tCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGt > 2:1543884/1‑93 (MQ=255)
ccGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTa < 1:655817/93‑1 (MQ=255)
cGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTaa < 1:5744501/93‑1 (MQ=255)
gTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTaaa > 1:3595920/1‑93 (MQ=255)
gTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTaaa > 2:1665087/1‑93 (MQ=255)
tAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTaaaa > 2:4207238/1‑93 (MQ=255)
aaCCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAAt < 2:1918923/93‑1 (MQ=255)
aCCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATc > 1:1404839/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCa < 1:3456169/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGCCTGAGCTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCaa < 2:5224470/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCaa < 2:3726754/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCaa > 2:3628810/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCaa > 1:398743/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAAc < 2:2118998/93‑1 (MQ=255)
aGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAAc < 1:6070724/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAAcc > 1:689776/1‑93 (MQ=255)
ttGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCg < 1:4878204/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGc < 1:5014115/93‑1 (MQ=255)
gcgtGAGCTCGGCGGTGTATACCGCGTTAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGACGCGGCGAGGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCa < 1:5827830/90‑1 (MQ=255)
gCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCa > 2:4386091/1‑93 (MQ=255)
ccTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAg > 2:2623517/1‑93 (MQ=255)
ccTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAg < 1:2165584/93‑1 (MQ=255)
tGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTa > 1:242504/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTaaa < 2:139570/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTaaaa > 1:2476365/1‑93 (MQ=255)
aCTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTaaaa > 2:4291783/1‑93 (MQ=255)
cTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAc > 1:3068483/1‑93 (MQ=255)
tCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAcc < 2:2068598/93‑1 (MQ=255)
cGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAccc < 1:964144/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTATACCGGGTCAAGAATGCTCTACTCCTTAAGGCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAcccc < 1:4597577/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCg > 2:2489220/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCg > 1:5242978/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGTAGTAAAACCCCGt < 2:6193043/93‑1 (MQ=255)
cgcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGt < 2:1447989/93‑1 (MQ=255)
gcTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTa < 1:1007080/93‑1 (MQ=255)
cTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTAc > 1:876261/1‑93 (MQ=255)
tGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACg > 2:4778020/1‑93 (MQ=255)
tGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACg > 1:2666110/1‑93 (MQ=255)
gTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACGCCGTACGt > 2:5658840/1‑93 (MQ=255)
ataCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTgg < 2:6239792/93‑1 (MQ=255)
taCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGc > 2:2186953/1‑93 (MQ=255)
taCCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGc < 2:2792596/93‑1 (MQ=255)
cgcgTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgt < 1:3725859/93‑1 (MQ=255)
gcgTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGgtg > 1:2737522/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGtt < 2:5771356/93‑1 (MQ=255)
gTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGtt < 1:6183995/93‑1 (MQ=255)
tCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTa > 2:2907967/1‑93 (MQ=255)
tCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTa > 1:2516299/1‑93 (MQ=255)
tCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTa > 1:1525290/1‑93 (MQ=255)
tCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTa < 2:1966024/93‑1 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTAc > 2:821532/1‑93 (MQ=255)
cAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTAc < 1:5846384/93‑1 (MQ=255)
aGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTActc > 2:5323432/1‑93 (MQ=255)
ggATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTActct < 1:2796302/93‑1 (MQ=255)
tGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCa > 2:3350926/1‑93 (MQ=255)
tGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCa < 1:3804618/93‑1 (MQ=255)
gCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAc > 2:4439080/1‑93 (MQ=255)
gCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAc > 2:721660/1‑93 (MQ=255)
ctctACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAcc < 1:2575912/93‑1 (MQ=255)
ctctACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAcc < 1:1857546/93‑1 (MQ=255)
tctACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCg < 2:3232710/93‑1 (MQ=255)
tctACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCg > 2:382347/1‑93 (MQ=255)
ctACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCgg > 2:2374824/1‑93 (MQ=255)
tACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGgc > 1:6029189/1‑93 (MQ=255)
tACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGgc > 1:3321900/1‑93 (MQ=255)
tCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGcgcg > 1:1312327/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAGTCGTCGCGGCGATGGTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCgg > 2:4007296/1‑93 (MQ=255)
ccTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCgg < 1:1776633/93‑1 (MQ=255)
cTTAAGTCGTCGCGGCGATGCGCCCGCGGTAATGGGTAAAATCACCCGGAGTAAAGCCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCTCCGGCGCGGc < 2:5101885/93‑1 (MQ=255)
aaGTCGTCGCTGCGATGCTCCCGCGATAATGGTTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCAtt < 1:2833921/93‑1 (MQ=255)
gtcgtcGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCt > 1:4246104/1‑93 (MQ=255)
gtcgCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTaa < 2:530204/93‑1 (MQ=255)
gtcgCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTaa > 1:490215/1‑93 (MQ=255)
gtcgCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGCGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCttta > 2:4480934/1‑91 (MQ=255)
cgcgGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACg > 2:582397/1‑93 (MQ=255)
gcggcgATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACgg > 2:1582670/1‑93 (MQ=255)
cgGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggt < 1:2650647/93‑1 (MQ=255)
cgGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACggt < 2:3126780/93‑1 (MQ=255)
|
GGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGT > NC_000913/2793140‑2793319
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTG > NC_000913/2793137‑2793323
|
CATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGC > SRR4302533.2647315/1‑94 (MQ=60)
ATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCG > SRR4302533.948741/1‑94 (MQ=60)
ATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCG < SRR4302533.1228987/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCG < SRR4302533.3544156/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCG < SRR4302533.1786373/94‑1 (MQ=60)
GGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGAT < SRR4302533.908112/94‑1 (MQ=60)
GGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGAT < SRR4302533.2293122/94‑1 (MQ=60)
GACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATG > SRR4302533.4856022/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCT > SRR4302533.2752896/1‑94 (MQ=60)
CTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCT < SRR4302533.3121051/94‑1 (MQ=60)
CGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCC < SRR4302533.1101832/94‑1 (MQ=60)
CGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCC > SRR4302533.4201595/1‑94 (MQ=60)
CGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCC > SRR4302533.1763131/1‑94 (MQ=60)
GTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCG > SRR4302533.5717374/1‑94 (MQ=60)
TGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGC > SRR4302533.4243426/1‑94 (MQ=60)
GATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCG > SRR4302533.3009280/1‑94 (MQ=60)
GATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCG > SRR4302533.1037441/1‑94 (MQ=60)
TATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGT < SRR4302533.2934083/94‑1 (MQ=60)
TATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGT < SRR4302533.4493520/94‑1 (MQ=60)
TTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAA > SRR4302533.455188/1‑94 (MQ=60)
TTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGAGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAA > SRR4302533.4465206/1‑94 (MQ=60)
TACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAAT < SRR4302533.3096611/94‑1 (MQ=60)
TACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAAT < SRR4302533.559610/94‑1 (MQ=60)
TACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAAATCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAAT < SRR4302533.4189109/94‑1 (MQ=60)
ACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATG < SRR4302533.4347727/94‑1 (MQ=60)
ACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATG < SRR4302533.6097234/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGG < SRR4302533.1780028/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGG < SRR4302533.2888084/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGG > SRR4302533.2066094/1‑94 (MQ=60)
TCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTA < SRR4302533.699340/94‑1 (MQ=60)
CCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAA < SRR4302533.659686/94‑1 (MQ=60)
CCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAA < SRR4302533.2497197/94‑1 (MQ=60)
CCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAA > SRR4302533.1551492/1‑94 (MQ=60)
CGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAA > SRR4302533.3618043/1‑94 (MQ=60)
CGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAA < SRR4302533.5779162/94‑1 (MQ=60)
GTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAA > SRR4302533.1868570/1‑94 (MQ=60)
AACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATC > SRR4302533.3698760/1‑94 (MQ=60)
AACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATC > SRR4302533.1413339/1‑94 (MQ=60)
AACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATC > SRR4302533.3191225/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCA > SRR4302533.6278445/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAA < SRR4302533.3477502/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAA > SRR4302533.401152/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACC < SRR4302533.6107455/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACC > SRR4302533.693855/1‑94 (MQ=60)
TTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGC < SRR4302533.4907757/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGAACTCGGGGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCA > SRR4302533.3426021/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCA < SRR4302533.5044493/94‑1 (MQ=60)
GCGTGAGCTCGGCGGTGTATACCGCGTTAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGACGCGGCGAGGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAG < SRR4302533.5863045/94‑1 (MQ=60)
GCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAG > SRR4302533.1412659/1‑94 (MQ=60)
CCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGT < SRR4302533.2178906/94‑1 (MQ=60)
CCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGT < SRR4302533.5790148/94‑1 (MQ=60)
CTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTA > SRR4302533.244007/1‑94 (MQ=60)
GAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAA > SRR4302533.69272/1‑94 (MQ=60)
GAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAA > SRR4302533.2015137/1‑94 (MQ=60)
AACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAA > SRR4302533.2491638/1‑94 (MQ=60)
ACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAC > SRR4302533.3087325/1‑94 (MQ=60)
CGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCC < SRR4302533.969806/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGTATACCGGGTCAAGAATGCTCTACTCCTTAAGGCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCG < SRR4302533.4625428/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCG > SRR4302533.5274492/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTA < SRR4302533.3791160/94‑1 (MQ=60)
GCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTAC < SRR4302533.1012972/94‑1 (MQ=60)
GCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTAC > SRR4302533.881407/1‑94 (MQ=60)
CTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACG > SRR4302533.2682467/1‑94 (MQ=60)
TGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGT > SRR4302533.2717744/1‑94 (MQ=60)
TATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGG < SRR4302533.263114/94‑1 (MQ=60)
TATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGG < SRR4302533.4467950/94‑1 (MQ=60)
ATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGC < SRR4302533.5106529/94‑1 (MQ=60)
ATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGC < SRR4302533.4265895/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGT < SRR4302533.5296416/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTG < SRR4302533.3748717/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTG > SRR4302533.2754309/1‑94 (MQ=60)
GCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGT < SRR4302533.2681497/94‑1 (MQ=60)
GTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTA > SRR4302533.1534473/1‑94 (MQ=60)
GTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTA > SRR4302533.5948759/1‑94 (MQ=60)
GTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTA < SRR4302533.6221124/94‑1 (MQ=60)
GTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTA > SRR4302533.2531804/1‑94 (MQ=60)
TCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTAC < SRR4302533.350551/94‑1 (MQ=60)
CAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACT < SRR4302533.5881729/94‑1 (MQ=60)
GGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTC < SRR4302533.2813498/94‑1 (MQ=60)
GGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTC < SRR4302533.4217597/94‑1 (MQ=60)
GGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAAACACGTACGTGGCGGTGTTACTCTC > SRR4302533.6108279/1‑94 (MQ=60)
TGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAC < SRR4302533.3827898/94‑1 (MQ=60)
TGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAC > SRR4302533.2197634/1‑94 (MQ=60)
TGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACACCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCAC > SRR4302533.491750/1‑94 (MQ=60)
CTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCG < SRR4302533.1868875/94‑1 (MQ=60)
CTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCG < SRR4302533.2591759/94‑1 (MQ=60)
CTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACAGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCG > SRR4302533.2562903/1‑94 (MQ=60)
TCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGG > SRR4302533.1125939/1‑94 (MQ=60)
CTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGC > SRR4302533.5870159/1‑94 (MQ=60)
CTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGC > SRR4302533.3342418/1‑94 (MQ=60)
CTACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGC > SRR4302533.6065730/1‑94 (MQ=60)
ACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGC > SRR4302533.2761139/1‑94 (MQ=60)
ACTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGC > SRR4302533.4314435/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCG > SRR4302533.1320202/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCG < SRR4302533.1431245/94‑1 (MQ=60)
CCTTAAGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGC < SRR4302533.1787447/94‑1 (MQ=60)
AAGTCGTCGCTGCGATGCTCCCGCGATAATGGTTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTC < SRR4302533.2851368/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCT > SRR4302533.497453/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCT > SRR4302533.4271735/1‑94 (MQ=60)
GTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTT > SRR4302533.2452907/1‑94 (MQ=60)
GTCGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTT < SRR4302533.6153127/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAA > SRR4302533.493146/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAA < SRR4302533.2369290/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAA > SRR4302533.4008328/1‑94 (MQ=60)
TCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACG < SRR4302533.5645836/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACG < SRR4302533.795649/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGT < SRR4302533.3583445/94‑1 (MQ=60)
CGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTG < SRR4302533.2666929/94‑1 (MQ=60)
CGGCGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTG < SRR4302533.2839289/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTG > SRR4302533.5587267/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTG > SRR4302533.3181214/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTG > SRR4302533.326934/1‑94 (MQ=60)
|
CATGGACTGCGTGATATTACTTTCCGTAACCAGTTGCCTGAACTCGGCGCTGTATACCGCGTCAAGGATGCTCTACTCCTTAAGTCGTCGCGGTGATGCTCCCGCGGTAATGGGTAAAATCAACCGCAGTAAAACCCCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTG > NC_000913/2793137‑2793323
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
