Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,811,545 |
G→A |
A303A (GCG→GCA) |
emrB → |
EmrB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,811,545 | 0 | G | A | 100.0%
| 733.7
/ NA
| 201 | A303A (GCG→GCA) | emrB | EmrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (104/97); total (104/97) |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CTGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATAT > NC_000913/2811455‑2811634
|
ctgctTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAAc < 2:5274146/93‑1 (MQ=255)
tgctTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAAcc < 1:1261411/93‑1 (MQ=255)
gctTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCTGAGCTATTATTCTGCTGGCGCAGTTGTTGTAGGGGGTCTACGGTTACACGGCAACCt > 2:5623144/1‑93 (MQ=255)
gctTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCt > 1:6091525/1‑93 (MQ=255)
ctTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTg < 1:5253742/93‑1 (MQ=255)
ttGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTgg > 1:3265202/1‑93 (MQ=255)
gtATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAg > 1:3301783/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAgg > 1:1771896/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAgg < 2:2129125/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGt < 1:248957/93‑1 (MQ=255)
aGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTg < 2:1091164/93‑1 (MQ=255)
gCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCGGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTgg > 1:3375158/1‑93 (MQ=255)
gCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTgg > 1:1580933/1‑93 (MQ=255)
cTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGcc > 2:5151844/1‑93 (MQ=255)
cTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGcc > 2:3669793/1‑93 (MQ=255)
tCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCct > 2:5194477/1‑93 (MQ=255)
cgcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCctc > 1:4009309/1‑93 (MQ=255)
cgcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCctc < 2:5708961/93‑1 (MQ=255)
cgcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCctc < 2:3715495/93‑1 (MQ=255)
cgcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGCGCAGGTTTGGCctc > 1:4869664/1‑93 (MQ=255)
gcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGTGCAGGGTTGGCctct > 2:5860893/1‑93 (MQ=255)
gcgTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCctct < 1:4757557/93‑1 (MQ=255)
gTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgc < 2:2327450/93‑1 (MQ=255)
gTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgc < 1:1524003/93‑1 (MQ=255)
tataTGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgcg > 2:3110303/1‑93 (MQ=255)
tataTGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgcg > 2:689244/1‑93 (MQ=255)
tataTGCTCTACTTAGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgcg > 2:464908/1‑93 (MQ=255)
atatGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTgcgc < 1:5744457/93‑1 (MQ=255)
tatGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGcc > 1:3872087/1‑93 (MQ=255)
tGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCgg > 2:3925851/1‑93 (MQ=255)
tGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCgg > 1:1165551/1‑93 (MQ=255)
gCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGt > 2:3021972/1‑93 (MQ=255)
ctctACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTa > 2:5745171/1‑93 (MQ=255)
ctctACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTa < 1:1085382/93‑1 (MQ=255)
tctACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAg < 2:572434/93‑1 (MQ=255)
tctACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAg < 2:4397267/93‑1 (MQ=255)
ctgcTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAgg < 2:2312921/90‑1 (MQ=255)
ctACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAgg > 2:6086074/1‑93 (MQ=255)
ttcTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAggg < 1:4190285/91‑1 (MQ=255)
tACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAggg < 1:395933/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGat < 1:5384955/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGat < 1:5552398/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGatta > 2:288394/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGCTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGattat > 2:6219167/1‑93 (MQ=255)
gcgcTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTc > 2:4217119/1‑93 (MQ=255)
gcgcTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTc < 2:4594006/93‑1 (MQ=255)
gcTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCg > 1:5210278/1‑93 (MQ=255)
gcTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCg > 1:146511/1‑93 (MQ=255)
cTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCgg < 2:2071583/93‑1 (MQ=255)
tATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGt > 1:1000249/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTg > 1:5905126/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTg > 1:3727252/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGa < 1:3759539/93‑1 (MQ=255)
gTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATc > 2:3979172/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATc > 1:3184974/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATc > 2:5132357/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTTTTTCGGGGGTcc > 2:1181309/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATcc > 1:2706610/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATcc > 2:3352386/1‑93 (MQ=255)
tcctgctgCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATcc < 2:3080822/91‑1 (MQ=255)
tgctgcCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGt > 1:4932324/1‑93 (MQ=255)
tgctgcCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGt > 1:825048/1‑93 (MQ=255)
gctgcCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTc < 2:4478072/93‑1 (MQ=255)
tgcCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGc < 2:233355/93‑1 (MQ=255)
ccGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCg > 1:2171351/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGAt < 1:5972883/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCGGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGAtt < 2:552050/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGact < 2:5010758/93‑3 (MQ=255)
cAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGAtt < 1:4462458/93‑1 (MQ=255)
cAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGAtt > 2:1789298/1‑93 (MQ=255)
aGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTa < 2:2692852/93‑1 (MQ=255)
gttgttGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTAt < 1:5053714/93‑1 (MQ=255)
ttgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATc > 1:1877231/1‑93 (MQ=255)
ttgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATc > 2:4983376/1‑93 (MQ=255)
ttgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATc < 1:2325417/93‑1 (MQ=255)
ttgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATc < 1:2064749/93‑1 (MQ=255)
ttgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATc < 2:714181/93‑1 (MQ=255)
tgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCg < 2:1283376/93‑1 (MQ=255)
tgttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCg < 1:2244920/93‑1 (MQ=255)
gttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCgg > 1:2830025/1‑93 (MQ=255)
gttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCgg < 2:1676647/93‑1 (MQ=255)
ttgCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGc > 2:5591384/1‑93 (MQ=255)
gaggTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTc < 1:1951731/93‑1 (MQ=255)
gaggTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTc < 1:3057/93‑1 (MQ=255)
gaggTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTc < 2:4114807/93‑1 (MQ=255)
ggTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTcgc > 2:547342/1‑93 (MQ=255)
ggTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTcgc > 1:4657558/1‑93 (MQ=255)
gTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTcgcg > 2:3467630/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCa > 1:1181879/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGCCCGCTTCGCGCa > 2:1896998/1‑93 (MQ=255)
tACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCAt > 1:728555/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATa < 1:935371/93‑1 (MQ=255)
cGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATaa > 1:3564171/1‑93 (MQ=255)
ttACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACt < 1:2308226/93‑1 (MQ=255)
acacGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTgg < 2:1842508/93‑1 (MQ=255)
acacGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGACGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTgg > 1:2741976/1‑93 (MQ=255)
cacGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGa < 2:817747/93‑1 (MQ=255)
cacGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGa < 2:4006329/93‑1 (MQ=255)
cGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGata < 2:1429660/93‑1 (MQ=255)
ggCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCAGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGatat < 1:4573226/93‑1 (MQ=255)
|
CTGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATAT > NC_000913/2811455‑2811634
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATGCGG > NC_000913/2811455‑2811638
|
CTGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACC < SRR4302533.2732535/94‑1 (MQ=60)
TGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCT > SRR4302533.6128340/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCT > SRR4302533.1352111/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCT < SRR4302533.1268954/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGG > SRR4302533.1171741/1‑94 (MQ=60)
CTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGG < SRR4302533.5285307/94‑1 (MQ=60)
CTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGG > SRR4302533.3285349/1‑94 (MQ=60)
TTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGG > SRR4302533.4101895/1‑94 (MQ=60)
TGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGC > SRR4302533.3657638/1‑94 (MQ=60)
GTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCA > SRR4302533.384048/1‑94 (MQ=60)
TGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAG < SRR4302533.375685/94‑1 (MQ=60)
TGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAG > SRR4302533.3322171/1‑94 (MQ=60)
GTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGG < SRR4302533.4623219/94‑1 (MQ=60)
GTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGG > SRR4302533.1782684/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGT < SRR4302533.4525770/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGT > SRR4302533.154843/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTT < SRR4302533.250493/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTT < SRR4302533.3301314/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCGGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGG > SRR4302533.3396003/1‑94 (MQ=60)
AGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGG > SRR4302533.1590452/1‑94 (MQ=60)
CCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCC < SRR4302533.2858184/94‑1 (MQ=60)
CTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCT > SRR4302533.3559564/1‑94 (MQ=60)
TCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTC > SRR4302533.4033720/1‑94 (MQ=60)
TCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGCGCAGGTTTGGCCTC > SRR4302533.4899171/1‑94 (MQ=60)
GCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTG < SRR4302533.4786423/94‑1 (MQ=60)
CGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTACAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGC > SRR4302533.2097864/1‑94 (MQ=60)
GTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCG < SRR4302533.2828421/94‑1 (MQ=60)
GTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCG < SRR4302533.1533177/94‑1 (MQ=60)
GTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCG > SRR4302533.5374378/1‑94 (MQ=60)
ATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCC < SRR4302533.1997781/94‑1 (MQ=60)
ATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCC < SRR4302533.5779118/94‑1 (MQ=60)
ATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCC > SRR4302533.3895720/1‑94 (MQ=60)
TATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCG > SRR4302533.6099618/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGG > SRR4302533.1172539/1‑94 (MQ=60)
TGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGT < SRR4302533.3216873/94‑1 (MQ=60)
TGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGT > SRR4302533.5283404/1‑94 (MQ=60)
GCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTA > SRR4302533.2414405/1‑94 (MQ=60)
CTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAG < SRR4302533.1091782/94‑1 (MQ=60)
CTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAG < SRR4302533.3150018/94‑1 (MQ=60)
CTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGG < SRR4302533.3984443/94‑1 (MQ=60)
CTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGG < SRR4302533.1868232/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGA < SRR4302533.4215649/94‑1 (MQ=60)
TACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGA > SRR4302533.1180576/1‑94 (MQ=60)
TACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGA < SRR4302533.398332/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATT < SRR4302533.5417308/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATT < SRR4302533.5585927/94‑1 (MQ=60)
TCGGCGCTATTGTTGTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTAT < SRR4302533.5703287/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTC > SRR4302533.5119837/1‑94 (MQ=60)
CGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCG > SRR4302533.5241662/1‑94 (MQ=60)
CGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCG > SRR4302533.147450/1‑94 (MQ=60)
CTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGT > SRR4302533.1006086/1‑94 (MQ=60)
CTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGT > SRR4302533.767400/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTG > SRR4302533.5940789/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTG > SRR4302533.3750116/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTG > SRR4302533.4272318/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGA > SRR4302533.1241265/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGA < SRR4302533.2335395/94‑1 (MQ=60)
TTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGAT > SRR4302533.4833397/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGAT < SRR4302533.3782584/94‑1 (MQ=60)
TGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATC > SRR4302533.3204564/1‑94 (MQ=60)
GTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCC > SRR4302533.2723215/1‑94 (MQ=60)
TCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTG > SRR4302533.1913471/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGT > SRR4302533.829891/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGT > SRR4302533.4962193/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTC > SRR4302533.5515054/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTC < SRR4302533.4901254/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCG < SRR4302533.6003767/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCC > SRR4302533.1018942/1‑94 (MQ=60)
GCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCG > SRR4302533.2184705/1‑94 (MQ=60)
CCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGA < SRR4302533.6217281/94‑1 (MQ=60)
GCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATT < SRR4302533.3945167/94‑1 (MQ=60)
GCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATT < SRR4302533.6009036/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTA < SRR4302533.4489450/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTA > SRR4302533.2699913/1‑94 (MQ=60)
AGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTAT > SRR4302533.528009/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATC > SRR4302533.1888673/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATC > SRR4302533.3065491/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATC < SRR4302533.5084267/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCG < SRR4302533.2339815/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCG < SRR4302533.2077475/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGG < SRR4302533.2258793/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGG > SRR4302533.2847442/1‑94 (MQ=60)
GAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCG < SRR4302533.3081/94‑1 (MQ=60)
GAGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCG < SRR4302533.1963627/94‑1 (MQ=60)
AGGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGC > SRR4302533.4685781/1‑94 (MQ=60)
GGTCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCG > SRR4302533.882351/1‑94 (MQ=60)
TCTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCA > SRR4302533.1188979/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGTTCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCAT < SRR4302533.1488970/94‑1 (MQ=60)
CTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCAT > SRR4302533.732858/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCAT > SRR4302533.4717902/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATTA > SRR4302533.3324766/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAA < SRR4302533.940861/94‑1 (MQ=60)
ACGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAA > SRR4302533.3586135/1‑94 (MQ=60)
CGGTTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAA < SRR4302533.2313024/94‑1 (MQ=60)
TTACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTG < SRR4302533.2322523/94‑1 (MQ=60)
TACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGG < SRR4302533.5856569/94‑1 (MQ=60)
TACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGG < SRR4302533.2189117/94‑1 (MQ=60)
TACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGG < SRR4302533.1639226/94‑1 (MQ=60)
TACACGGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGACGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGG > SRR4302533.2758789/1‑94 (MQ=60)
GGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATG < SRR4302533.5062907/94‑1 (MQ=60)
GGCAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCAGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATG < SRR4302533.4600941/94‑1 (MQ=60)
CAACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATGCG > SRR4302533.5416996/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATGCGG < SRR4302533.1351717/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATGCGG < SRR4302533.3220478/94‑1 (MQ=60)
|
CTGCTTGTGTATCAGCCTCGCGTATATGCTCTACTTCGGCGCTATTGTTCTGCTGCCGCAGTTGTTGCAGGAGGTCTACGGTTACACGGCGACCTGGGCAGGTTTGGCCTCTGCGCCGGTAGGGATTATTCCGGTGATCCTGTCGCCGATTATCGGCCGCTTCGCGCATAAACTGGATATGCGG > NC_000913/2811455‑2811638
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
