Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,838,044 |
+G |
coding (498/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,838,043 | 1 | . | G | 100.0%
| 683.2
/ NA
| 209 | A166G (GCG→GGG) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (106/103); total (106/103) |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > NC_000913/2837951‑2838130
|
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc > 1:3770422/1‑93 (MQ=255)
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc > 1:654301/1‑93 (MQ=255)
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc > 2:625505/1‑93 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑gg > 2:3565830/1‑92 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑gg > 2:4960952/1‑92 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑gg > 2:4930450/1‑92 (MQ=255)
gcggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggcat < 1:1750720/93‑5 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCt < 2:4903697/93‑1 (MQ=255)
ggcgTGCGGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCt < 2:3275468/93‑1 (MQ=255)
cgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGc < 2:5663102/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGcc > 2:30777/1‑93 (MQ=255)
tGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCcg > 2:4359114/1‑93 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCcgcca > 1:1192370/1‑91 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCcgcca < 1:4731609/93‑3 (MQ=255)
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCcgccat < 2:5118801/93‑4 (MQ=255)
aCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCcgccatc < 2:4083272/93‑5 (MQ=255)
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCaa > 2:4705851/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 1:1912059/1‑93 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaa > 2:646154/1‑93 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaaa < 2:788293/93‑1 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc > 2:615776/1‑93 (MQ=255)
ccGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc < 1:3164161/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCTTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGACGCTTATGGGCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACaaa > 2:3029876/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:1899506/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 2:4022762/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 1:2041958/93‑1 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 2:2789203/93‑1 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 1:3972607/93‑1 (MQ=255)
ccTTACCCATGCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:3159256/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 2:5501278/1‑93 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 1:726925/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 2:4613661/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 1:825379/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 2:53116/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:2743108/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:264691/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:5156375/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:3872271/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCATGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 1:3380738/1‑93 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:6099118/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:2882156/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 1:4282860/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:836896/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:3706982/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:4160955/93‑1 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGCTGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 2:3496329/1‑93 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGc > 1:4018944/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 1:3884705/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTGCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 2:5830832/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 2:5809297/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg > 1:2540006/1‑93 (MQ=255)
cTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCg > 1:5796256/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 1:520099/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 1:4796980/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:2587263/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:2709729/1‑93 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg < 1:626144/93‑1 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg > 1:235655/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgc > 1:1322070/1‑93 (MQ=255)
gTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg < 2:874237/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg < 2:2397950/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtg < 2:626537/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt > 2:6214019/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGtgtg > 2:2814413/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt < 1:3201325/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt < 1:4848150/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt > 1:5429935/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTgg > 1:1086777/1‑93 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 2:1209010/93‑1 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:3537411/93‑1 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:4171290/93‑1 (MQ=255)
cttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa > 1:2221950/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt < 2:48456/93‑1 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 2:5748652/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc > 1:6008132/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc > 2:3608667/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 2:2086104/93‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 2:443406/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa > 2:2255698/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAg > 1:5651278/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGt > 1:6148413/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGt < 2:2116030/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt > 1:4134093/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGttt < 2:2983285/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGttt < 2:5883669/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGttt < 1:665098/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAATCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa < 2:3373744/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa < 1:3472410/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa > 1:5544623/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa < 2:1032237/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCAGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 2:5094162/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAtt < 1:138429/93‑1 (MQ=255)
cTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAtt < 2:4544075/93‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:1763020/93‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 1:5748027/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa > 1:5096034/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa > 2:2183663/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc > 1:6081838/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 1:4056827/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 1:4548843/1‑93 (MQ=255)
|
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > NC_000913/2837951‑2838130
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > NC_000913/2837951‑2838138
|
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑G < SRR4302533.2175620/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATC < SRR4302533.1761380/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCT < SRR4302533.4094994/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCT < SRR4302533.1619025/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTG > SRR4302533.5357754/1‑94 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTG < SRR4302533.4167680/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGC < SRR4302533.5073429/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGTCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCC < SRR4302533.3397518/94‑1 (MQ=60)
TGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC > SRR4302533.400747/1‑94 (MQ=60)
CTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGCca > SRR4302533.1199536/1‑92 (MQ=60)
CTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑Ggcatctgtcgtca > SRR4302533.1331816/1‑81 (MQ=60)
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CAT < SRR4302533.4760295/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302533.2838921/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302533.3947010/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302533.5567494/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTCCCTCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGCtatcatat > SRR4302533.22220/1‑86 (MQ=60)
AGGATCGCCGTCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGGG‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTT < SRR4302533.1535671/94‑1 (MQ=60)
GGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTA > SRR4302533.274669/1‑94 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA > SRR4302533.1923724/1‑94 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302533.1264942/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAA < SRR4302533.895071/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTTGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAC > SRR4302533.6277215/1‑94 (MQ=60)
CCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA < SRR4302533.3183636/94‑1 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302533.201557/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302533.2054543/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302533.486148/94‑1 (MQ=60)
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ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302533.3996799/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302533.4086819/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302533.731218/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302533.4554842/94‑1 (MQ=60)
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CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302533.830223/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302533.2588852/1‑94 (MQ=60)
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CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCATGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302533.3401608/1‑94 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302533.5187509/94‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302533.2759926/94‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302533.649294/94‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC > SRR4302533.1839962/1‑94 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302533.4308599/94‑1 (MQ=60)
ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGC > SRR4302533.4043416/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302533.3908406/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302533.3056576/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302533.992076/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG > SRR4302533.2555641/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG > SRR4302533.4881605/1‑94 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCCTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302533.718977/1‑94 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG > SRR4302533.5831277/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302533.523187/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302533.4826037/1‑94 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT > SRR4302533.4224242/1‑94 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302533.2726359/1‑94 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302533.2603169/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302533.6084894/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302533.237106/1‑94 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGC < SRR4302533.629820/94‑1 (MQ=60)
TGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC > SRR4302533.3832095/1‑94 (MQ=60)
GTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302533.229660/1‑94 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC < SRR4302533.3436816/94‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC > SRR4302533.4770970/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302533.5698730/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302533.5195394/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATCTCGCTCGCGATTGCCATCG > SRR4302533.3725585/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC > SRR4302533.1330003/1‑94 (MQ=60)
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GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTG < SRR4302533.1659127/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302533.2503930/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT > SRR4302533.5455205/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302533.5932129/1‑94 (MQ=60)
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TGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTG < SRR4302533.4877531/94‑1 (MQ=60)
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TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA < SRR4302533.3559212/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA < SRR4302533.4196567/94‑1 (MQ=60)
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TTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATC > SRR4302533.5182619/1‑94 (MQ=60)
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TCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG < SRR4302533.222087/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG < SRR4302533.4060593/94‑1 (MQ=60)
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CTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302533.1172266/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302533.669025/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302533.5791124/94‑1 (MQ=60)
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TGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302533.5126826/1‑94 (MQ=60)
ATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC > SRR4302533.6118615/1‑94 (MQ=60)
TGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > SRR4302533.4081523/1‑94 (MQ=60)
TGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > SRR4302533.4576428/1‑94 (MQ=60)
TC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302533.682397/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.5486153/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.910730/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.3988297/94‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.4306619/91‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.3088936/91‑1 (MQ=60)
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cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.1195570/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302533.850845/3‑94 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.5062/92‑1 (MQ=60)
G‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302533.414791/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > SRR4302533.3546313/1‑94 (MQ=60)
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GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > NC_000913/2837951‑2838138
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
