Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,977,707 |
T→C |
V222A (GTA→GCA) |
lysR → |
LysR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,977,707 | 0 | T | C | 99.5%
| 661.0
/ ‑4.5
| 206 | V222A (GTA→GCA) | lysR | LysR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (114/91); total (115/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.89e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATG > NC_000913/2977618‑2977796
|
gaACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGa > 1:1002249/1‑93 (MQ=255)
aaCTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGaa > 2:1139272/1‑93 (MQ=255)
aaCTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGaa < 2:3360436/93‑1 (MQ=255)
aCTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGaaa < 2:6153530/93‑1 (MQ=255)
cTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAAc < 2:3226287/93‑1 (MQ=255)
cTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGGTAAACGACGCATGATCGCAGAAAc > 2:2522850/1‑93 (MQ=255)
tACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAAcc > 1:4917520/1‑93 (MQ=255)
tACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTAATTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAAcc < 1:829104/93‑1 (MQ=255)
cATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCca < 1:1670887/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCcac < 2:426487/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCcac < 1:4095120/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCcaca > 1:79413/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAg < 1:4507243/93‑1 (MQ=255)
cAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAg < 2:4620316/93‑1 (MQ=255)
aGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAgc > 2:3622752/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAgcgc < 1:2352630/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGcgcc > 2:6209551/1‑93 (MQ=255)
tttCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGcgccg > 2:353940/1‑93 (MQ=255)
cccGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGt > 2:3020617/1‑93 (MQ=255)
cccGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATGTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGt < 2:3197528/93‑1 (MQ=255)
cGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTTAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGGCa > 2:2129819/1‑93 (MQ=255)
cGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCa < 1:2526417/93‑1 (MQ=255)
tACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGt < 1:1292485/93‑1 (MQ=255)
tACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGt > 1:1504104/1‑93 (MQ=255)
aCTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTc < 2:3784313/93‑1 (MQ=255)
cttaCAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCt < 1:1934911/90‑1 (MQ=255)
cTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCt > 1:2654807/1‑93 (MQ=255)
cTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCt > 1:4943168/1‑93 (MQ=255)
cAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTgcgc > 1:3481423/1‑93 (MQ=255)
cAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTgcgc > 2:6139504/1‑93 (MQ=255)
gCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCaa < 2:2876812/93‑1 (MQ=255)
gCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCaa < 1:1387575/93‑1 (MQ=255)
tATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATg > 2:3833342/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATgg > 2:277020/1‑93 (MQ=255)
cGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTa < 2:4439295/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAc < 1:3042884/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcg > 2:2683565/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcg < 1:1549101/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcg > 1:5088010/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcg > 1:3753500/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgg < 1:5863048/93‑1 (MQ=255)
aGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcggg < 1:6104609/93‑1 (MQ=255)
aGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcggg < 2:4859786/93‑1 (MQ=255)
aGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcggg < 1:3982531/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggg > 2:3985492/1‑92 (MQ=255)
gTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggc > 1:5879249/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggc > 1:2134352/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggc < 1:219648/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggcg < 2:5940549/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggcg < 1:2400005/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTAcgggcggg < 2:3292531/93‑1 (MQ=255)
tGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAACCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCggggg < 1:4834724/93‑1 (MQ=255)
gATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGggta < 1:5320224/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGggtagg > 1:991535/1‑93 (MQ=255)
tCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGggtagc > 1:4144225/1‑92 (MQ=255)
tCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGgggagg > 2:1932966/1‑93 (MQ=255)
aGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGggtaggta > 2:4618043/1‑93 (MQ=255)
gCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTAt > 2:1307824/1‑93 (MQ=255)
cTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTAtt > 2:432967/1‑93 (MQ=255)
cTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGGAGGTAtt > 1:6070447/1‑93 (MQ=255)
tATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTCGGTAttt > 2:5416587/1‑93 (MQ=255)
tATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTAttt > 2:4451839/1‑93 (MQ=255)
tATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTAttt < 1:5183960/93‑1 (MQ=255)
aTTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTc < 2:3659927/93‑1 (MQ=255)
aTTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGCATTTc > 1:3015512/1‑93 (MQ=255)
tttACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCg > 2:5803342/1‑93 (MQ=255)
ttACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCgg < 2:5640479/93‑1 (MQ=255)
ttACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCgg > 2:3715197/1‑93 (MQ=255)
tACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCggt > 2:5820674/1‑93 (MQ=255)
aaCATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTa > 2:3095709/1‑93 (MQ=255)
aaCATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTa < 1:3165083/93‑1 (MQ=255)
aCATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTaa > 2:1094532/1‑93 (MQ=255)
cATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAc < 1:2836414/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAcc > 2:3903625/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAccc > 1:554137/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAccc < 2:3963156/93‑1 (MQ=255)
cAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCg > 2:1170977/1‑93 (MQ=255)
aGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGc > 2:480515/1‑93 (MQ=255)
aGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGc < 2:736826/93‑1 (MQ=255)
gTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGCATTTCGGTGGTTAACCCGCTc > 1:6167394/1‑93 (MQ=255)
tAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAc > 2:2564884/1‑93 (MQ=255)
tAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAc < 1:4010801/93‑1 (MQ=255)
tAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAc > 2:1228574/1‑93 (MQ=255)
aaaCGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAcc < 2:4489352/93‑1 (MQ=255)
aaaCGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAcc > 2:5172719/1‑93 (MQ=255)
aaaCGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGAGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAcc < 1:4762360/93‑1 (MQ=255)
aaCGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCg > 1:2936687/1‑93 (MQ=255)
acgacgCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGc > 1:1810088/1‑93 (MQ=255)
acgCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACt > 2:5055557/1‑93 (MQ=255)
acgCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACt > 2:1622721/1‑93 (MQ=255)
cgCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTa < 2:5786354/93‑1 (MQ=255)
gCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAg > 1:3279333/1‑93 (MQ=255)
gCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATAGTACGGGCGGGGGAAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAg > 1:5705990/1‑93 (MQ=255)
cATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGa > 2:4536128/1‑93 (MQ=255)
cATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGa > 2:6097860/1‑93 (MQ=255)
tGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGAtt > 2:5247976/1‑93 (MQ=255)
tGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGAtt > 2:1432670/1‑93 (MQ=255)
gATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTa < 1:855996/93‑1 (MQ=255)
gATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTa < 2:1334757/93‑1 (MQ=255)
tCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATg > 1:3820085/1‑93 (MQ=255)
|
GAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATG > NC_000913/2977618‑2977796
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGC > NC_000913/2977614‑2977800
|
GTGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGC < SRR4302533.4328563/94‑1 (MQ=60)
GTGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGC > SRR4302533.1480788/1‑94 (MQ=60)
GTGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGC > SRR4302533.5889360/1‑94 (MQ=60)
TGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCA < SRR4302533.895587/94‑1 (MQ=60)
AGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGA > SRR4302533.1008100/1‑94 (MQ=60)
AAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAA < SRR4302533.4864246/94‑1 (MQ=60)
CTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACC > SRR4302533.4947303/1‑94 (MQ=60)
TACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTAATTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCC < SRR4302533.833967/94‑1 (MQ=60)
ACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCA > SRR4302533.4083701/1‑94 (MQ=60)
CATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCAC < SRR4302533.1680987/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACA > SRR4302533.79920/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACA < SRR4302533.3642787/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACA < SRR4302533.4120052/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACA > SRR4302533.5280975/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGC < SRR4302533.4534539/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGAACAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGC > SRR4302533.5318922/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCG > SRR4302533.4141062/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCG < SRR4302533.3988447/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCC < SRR4302533.2517001/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCC < SRR4302533.2367182/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGAAGAAACCCACAGCGCCC > SRR4302533.541443/1‑94 (MQ=60)
CCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTC > SRR4302533.2264494/1‑94 (MQ=60)
CGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAG < SRR4302533.3789449/94‑1 (MQ=60)
CGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAG < SRR4302533.2541971/94‑1 (MQ=60)
GTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGT > SRR4302533.1513175/1‑94 (MQ=60)
TACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTC < SRR4302533.1300270/94‑1 (MQ=60)
ACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCT > SRR4302533.4973092/1‑94 (MQ=60)
ACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCT < SRR4302533.5123575/94‑1 (MQ=60)
ACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCT > SRR4302533.2671114/1‑94 (MQ=60)
CTTACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTG < SRR4302533.1946715/94‑1 (MQ=60)
ACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGC > SRR4302533.3502898/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCA < SRR4302533.2988987/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAAT > SRR4302533.2192187/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAAT < SRR4302533.1395925/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGG < SRR4302533.1550419/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGT < SRR4302533.2510540/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACG < SRR4302533.1345650/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACG < SRR4302533.3061512/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACG > SRR4302533.5118754/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACG > SRR4302533.3776507/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGG < SRR4302533.1558439/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGG > SRR4302533.5899593/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGG < SRR4302533.5898494/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGG < SRR4302533.864056/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGG > SRR4302533.1196459/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC > SRR4302533.294432/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC > SRR4302533.5650023/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC > SRR4302533.2147513/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC > SRR4302533.5914782/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC < SRR4302533.6141455/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC < SRR4302533.4006777/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACACACAGCGCAGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGC > SRR4302533.4948308/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCG < SRR4302533.4783212/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCG < SRR4302533.221022/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCG < SRR4302533.1747098/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGG < SRR4302533.2414825/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAACCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGG < SRR4302533.78169/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGG < SRR4302533.5033048/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGG < SRR4302533.3980764/94‑1 (MQ=60)
TGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAACCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGT < SRR4302533.4864027/94‑1 (MQ=60)
TGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGACGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGG > SRR4302533.2637184/1‑94 (MQ=60)
GGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTA > SRR4302533.4528345/1‑94 (MQ=60)
GATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAG < SRR4302533.5352110/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGG > SRR4302533.997331/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGC > SRR4302533.4169344/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTA > SRR4302533.3250133/1‑94 (MQ=60)
GCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCGCAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATT < SRR4302533.3101803/94‑1 (MQ=60)
GCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGGAGGTATT > SRR4302533.6107178/1‑94 (MQ=60)
CTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTT > SRR4302533.837859/1‑94 (MQ=60)
TATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTC < SRR4302533.1926732/94‑1 (MQ=60)
TATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTC < SRR4302533.5215254/94‑1 (MQ=60)
TATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGCATTTC > SRR4302533.3033954/1‑94 (MQ=60)
ATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCG < SRR4302533.4022641/94‑1 (MQ=60)
TACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAGCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCTCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTG < SRR4302533.6015511/94‑1 (MQ=60)
ACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGG < SRR4302533.1500851/94‑1 (MQ=60)
CTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGT > SRR4302533.614699/1‑94 (MQ=60)
AACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAA < SRR4302533.3184561/94‑1 (MQ=60)
CATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACC < SRR4302533.2853870/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCC > SRR4302533.557422/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCC > SRR4302533.5895400/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCG < SRR4302533.4832313/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGC > SRR4302533.3043698/1‑94 (MQ=60)
GGTTAAACGACGCATGATCTCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTC < SRR4302533.6285619/94‑1 (MQ=60)
GGTTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGCATTTCGGTGGTTAACCCGCTC > SRR4302533.6204471/1‑94 (MQ=60)
GTTAAACGACGCATGATCACAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCA < SRR4302533.1981320/94‑1 (MQ=60)
TTAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCAC > SRR4302533.800126/1‑94 (MQ=60)
TAAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACC < SRR4302533.4035217/94‑1 (MQ=60)
AAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCG > SRR4302533.2954639/1‑94 (MQ=60)
AAACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGAGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCG < SRR4302533.4791245/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGC > SRR4302533.1821145/1‑94 (MQ=60)
ACGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTA > SRR4302533.2723981/1‑94 (MQ=60)
CGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAG > SRR4302533.3299579/1‑94 (MQ=60)
CGCATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATAGTACGGGCGGGGGAAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAG > SRR4302533.5740453/1‑94 (MQ=60)
CATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGAT > SRR4302533.2394624/1‑94 (MQ=60)
CATGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGAT > SRR4302533.1594571/1‑94 (MQ=60)
TGATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTA < SRR4302533.98833/94‑1 (MQ=60)
GATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTAT < SRR4302533.6120485/94‑1 (MQ=60)
GATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTAT < SRR4302533.861011/94‑1 (MQ=60)
ATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATG < SRR4302533.3473743/94‑1 (MQ=60)
ATCGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATG > SRR4302533.3843444/1‑94 (MQ=60)
CGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTGGATTATGCG < SRR4302533.1522141/94‑1 (MQ=60)
CGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCG > SRR4302533.3737715/1‑94 (MQ=60)
CGCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCG < SRR4302533.3638538/94‑1 (MQ=60)
GCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGG < SRR4302533.3811608/94‑1 (MQ=60)
GCAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGG < SRR4302533.312459/94‑1 (MQ=60)
CAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGC < SRR4302533.1575345/94‑1 (MQ=60)
|
GTGAGAACTACATCAGCCTTTCCCGTACTGACAGCTATCGCCAGTTGCTGGATCAGCTATTTACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGC > NC_000913/2977614‑2977800
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
