Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,128,011 |
C→T |
A199A (GCC→GCT) |
metL → |
aspartokinase II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,128,011 | 0 | C | T | 100.0%
| 959.1
/ NA
| 257 | A199A (GCC→GCT) | metL | aspartokinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (115/142); total (115/142) |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
aGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTgg < 2:2963664/93‑1 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt > 2:4244319/1‑93 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt < 1:1763967/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa > 2:5706158/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa > 1:2240177/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGa > 2:6237564/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTTGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaa > 1:2486323/1‑93 (MQ=255)
ttttttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 2:4813697/93‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 1:4656289/93‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 1:6064003/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 2:2073982/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc < 2:3361628/93‑1 (MQ=255)
tCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACg > 2:4533455/1‑93 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg > 1:526463/1‑93 (MQ=255)
cTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACgg > 1:4383805/1‑93 (MQ=255)
ttccccGTTACTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:5050464/90‑1 (MQ=255)
aCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 2:5273189/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGCGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgct > 1:276105/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 1:901004/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTgctgct < 2:6009494/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGCTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGctgctg > 2:4822373/1‑93 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgg < 2:5898315/93‑1 (MQ=255)
tgctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgg < 2:2442789/93‑1 (MQ=255)
gctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTggg > 2:2897338/1‑93 (MQ=255)
ctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTgggg < 2:2498140/93‑1 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc > 1:4210706/1‑93 (MQ=255)
tgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGc > 1:3209002/1‑93 (MQ=255)
gcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCg > 2:3503970/1‑93 (MQ=255)
gcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCg > 1:4751288/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTa > 2:3994035/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:4122683/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:6165989/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACg < 2:3899275/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg > 2:74408/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGt < 2:631888/93‑1 (MQ=255)
ctgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGt < 1:2535121/93‑1 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt > 1:2099207/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt > 1:1380272/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt > 2:4417387/1‑93 (MQ=255)
tgctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGtt < 2:2356369/93‑1 (MQ=255)
ctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGCGAAACGGTGCTGCTGGGGCGGAACGGGTcc > 2:4875088/1‑93 (MQ=255)
tgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCg > 2:3810251/1‑93 (MQ=255)
ggTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGa < 2:3212734/93‑1 (MQ=255)
gTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAc > 2:1603012/1‑93 (MQ=255)
gTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAc < 2:1114674/93‑1 (MQ=255)
cAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAt < 1:3938863/93‑1 (MQ=255)
cAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAt < 1:3332963/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt > 2:3988306/1‑93 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt > 1:2404645/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcg > 1:5124596/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:5452020/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:5080371/1‑93 (MQ=255)
cGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTAGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGa > 2:3923861/1‑93 (MQ=255)
cGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGAGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGa < 2:4369613/93‑1 (MQ=255)
gggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGac < 1:1499149/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGaca > 2:3421630/1‑93 (MQ=255)
aaaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaa < 1:619195/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaa < 2:2036444/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTCCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaa < 1:4549793/93‑1 (MQ=255)
agcGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:5524771/91‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:792267/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa > 1:2943640/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 1:5719774/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 2:5349935/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc > 1:1238174/1‑93 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 1:967375/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGAATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 2:553060/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 2:1664842/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCAGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 1:2057183/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGt > 2:2140425/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 1:4506577/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg > 1:1868395/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg > 2:2723442/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 2:2632761/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt > 2:2741842/1‑93 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt < 2:555187/93‑1 (MQ=255)
gtgACCGGCTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTg > 2:6119813/1‑93 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg < 2:3649144/93‑1 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg < 2:5171580/93‑1 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc > 1:3389293/1‑93 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc < 2:1125522/93‑1 (MQ=255)
aCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCg > 1:6251990/1‑93 (MQ=255)
ccGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCgg < 1:5838807/93‑1 (MQ=255)
cGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCggg > 1:1835280/1‑93 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACCAATCGGTGCGCTGGCgggccat > 1:306051/1‑89 (MQ=255)
ttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGttt > 1:2848822/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtc < 2:2244250/93‑1 (MQ=255)
tATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtc < 2:4782275/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGTtct > 1:1046369/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGCGTTtct > 2:1251187/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc < 2:5426421/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTcgcg < 1:4629146/93‑1 (MQ=255)
ccGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGt < 1:1198551/93‑1 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTa < 2:1826678/93‑1 (MQ=255)
gCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTaa < 2:5733535/93‑1 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc < 2:1438433/93‑1 (MQ=255)
caacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAt < 1:5785149/93‑1 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 1:1877114/93‑1 (MQ=255)
aacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATc < 1:107979/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt > 1:563586/1‑93 (MQ=255)
|
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > NC_000913/4127918‑4128103
|
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT < SRR4302533.2552454/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT > SRR4302533.3481777/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG > SRR4302533.4672696/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302533.1271326/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG > SRR4302533.3252463/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT < SRR4302533.831483/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGT < SRR4302533.1406636/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302533.1774708/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302533.1435465/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302533.6102984/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302533.2254019/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA > SRR4302533.190376/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGA < SRR4302533.4055889/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTTGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAA > SRR4302533.2501642/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAA < SRR4302533.6325679/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302533.6100710/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302533.4684505/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302533.5769995/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302533.5112362/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302533.3831421/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302533.1827351/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG > SRR4302533.4410273/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG > SRR4302533.529584/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302533.2266645/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302533.5731865/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT > SRR4302533.2121392/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGCGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT > SRR4302533.277787/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGC > SRR4302533.4575965/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302533.906288/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302533.5788128/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302533.4236175/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC > SRR4302533.3228767/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC < SRR4302533.4604640/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCG > SRR4302533.5629336/1‑94 (MQ=60)
TGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCG > SRR4302533.4780095/1‑94 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA < SRR4302533.1880870/94‑1 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA > SRR4302533.5470406/1‑94 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA > SRR4302533.4264908/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAC > SRR4302533.1871407/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302533.6203050/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302533.4147713/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG > SRR4302533.2486986/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG > SRR4302533.3168562/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG < SRR4302533.2205044/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT < SRR4302533.2550726/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302533.1388584/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302533.549318/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTT > SRR4302533.2112158/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTC > SRR4302533.5232916/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGTCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302533.2643732/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGCGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC > SRR4302533.2531240/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG > SRR4302533.1847165/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC < SRR4302533.2833048/94‑1 (MQ=60)
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TGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTA > SRR4302533.4136954/1‑94 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAT < SRR4302533.331460/94‑1 (MQ=60)
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CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT > SRR4302533.2419495/1‑94 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT > SRR4302533.952933/1‑94 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT < SRR4302533.3962903/94‑1 (MQ=60)
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CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG < SRR4302533.4706982/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302533.5484861/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302533.4667924/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302533.5111077/1‑94 (MQ=60)
CCCGGGAAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCG < SRR4302533.129690/94‑1 (MQ=60)
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GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA < SRR4302533.1508185/94‑1 (MQ=60)
GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA < SRR4302533.776344/94‑1 (MQ=60)
CAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAA > SRR4302533.2688910/1‑94 (MQ=60)
CAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAA > SRR4302533.627352/1‑94 (MQ=60)
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AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302533.4167184/1‑94 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA < SRR4302533.622833/94‑1 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTCCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA < SRR4302533.4577382/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAT < SRR4302533.5558124/94‑1 (MQ=60)
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AACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAT < SRR4302533.5754312/94‑1 (MQ=60)
AACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAT < SRR4302533.796929/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC < SRR4302533.584709/94‑1 (MQ=60)
ACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC > SRR4302533.1245572/1‑94 (MQ=60)
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CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG < SRR4302533.973048/94‑1 (MQ=60)
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CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG > SRR4302533.1879786/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGC < SRR4302533.4533872/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGC < SRR4302533.2403049/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGC > SRR4302533.3209820/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGC < SRR4302533.5588055/94‑1 (MQ=60)
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GACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCG > SRR4302533.6289388/1‑94 (MQ=60)
GACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCG > SRR4302533.5861239/1‑94 (MQ=60)
CCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGG > SRR4302533.1846477/1‑94 (MQ=60)
CCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGG < SRR4302533.5874107/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGT < SRR4302533.1816796/94‑1 (MQ=60)
CGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGT < SRR4302533.1075850/94‑1 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302533.5389490/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACCAATCGGTGCGCTGGCGGGccat > SRR4302533.307921/1‑90 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT > SRR4302533.2866349/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGGTTCT > SRR4302533.1052517/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTC > SRR4302533.6149344/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTC > SRR4302533.4648434/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCG < SRR4302533.4420155/94‑1 (MQ=60)
GCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGT < SRR4302533.4657203/94‑1 (MQ=60)
CCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTA < SRR4302533.1205752/94‑1 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC < SRR4302533.4710059/94‑1 (MQ=60)
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ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGAGGTTCTCGCGGAAGCAT > SRR4302533.175507/1‑94 (MQ=60)
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CAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATC < SRR4302533.5820088/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATC > SRR4302533.2978717/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAATGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302533.1323770/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGATACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302533.2901498/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT > SRR4302533.566925/1‑94 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302533.1888555/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302533.2098101/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302533.108658/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302533.4352050/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG < SRR4302533.4090731/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > SRR4302533.5731351/1‑94 (MQ=60)
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TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > NC_000913/4127918‑4128103
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
