Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,128,011 |
C→T |
A199A (GCC→GCT) |
metL → |
aspartokinase II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,128,011 | 0 | C | T | 99.6%
| 1005.2
/ ‑5.6
| 274 | A199A (GCC→GCT) | metL | aspartokinase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (131/142); total (132/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.53e-01 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt < 2:2355569/93‑1 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt < 1:8329024/93‑1 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt > 2:5380840/1‑93 (MQ=255)
gggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGt > 2:60160/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTg > 1:3190876/1‑93 (MQ=255)
tttctttcCCGTTGGTGTAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGCGCAAAGGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 1:9543532/93‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 1:9643250/93‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 2:8750821/93‑1 (MQ=255)
tttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAAAATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGCTTTATCAGCCGCAAAAACGCTTGTGaaa > 1:5094011/1‑93 (MQ=255)
tttCTTACCCGTGGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGaaa < 2:961169/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAc > 1:8104001/1‑93 (MQ=255)
tCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACg < 2:8345105/93‑1 (MQ=255)
ttACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGt < 2:4882872/93‑1 (MQ=255)
ccccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCATCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgc < 1:351660/92‑1 (MQ=255)
ccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctg < 2:979772/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctg > 2:5634836/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 1:6539652/93‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 1:5861897/93‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGtgctgc < 1:5509908/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGctgctg < 2:242270/93‑1 (MQ=255)
gctgcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTggg < 2:9390877/93‑1 (MQ=255)
gcAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCg < 1:9975170/93‑1 (MQ=255)
aCAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTaa < 2:4527932/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:3737185/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc > 2:3523971/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAc < 1:7721198/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACg > 2:3889452/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCTGGTGAAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGCCCTGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACg < 1:4403586/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGTTGCTGCTGGGGCGTAACgg < 1:472424/93‑1 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg > 2:369086/1‑93 (MQ=255)
gctgctGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACgg < 1:369404/93‑1 (MQ=255)
cttgTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTcc < 2:4664629/90‑1 (MQ=255)
ctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTcc < 1:8898958/93‑1 (MQ=255)
ctgGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTcc < 1:3974996/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGa < 1:8304587/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGa > 1:4141838/1‑93 (MQ=255)
tGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGAAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCCACt > 1:2934814/1‑93 (MQ=255)
gCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACtg < 1:8357836/93‑2 (MQ=255)
gCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTa < 1:377736/93‑1 (MQ=255)
caccATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAt < 2:1427857/90‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 1:7133154/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 2:3009357/93‑1 (MQ=255)
aaCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAtt < 2:2407649/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTc > 2:5738742/1‑93 (MQ=255)
cATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTcc < 1:2444618/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcg < 1:9013547/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcg < 2:7433042/93‑1 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:1931904/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCcgc > 1:1626007/1‑93 (MQ=255)
cGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGa > 1:9676495/1‑93 (MQ=255)
cGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGa < 2:8259168/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGaca > 1:5194323/1‑93 (MQ=255)
ggCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGaca < 1:217701/93‑1 (MQ=255)
gCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGacac < 1:2687979/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 2:1861131/93‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa > 1:335837/1‑93 (MQ=255)
aaCGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACaaa < 2:7142020/93‑1 (MQ=255)
aCGTCGGGTGGTGACCGGATTGAGCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAt < 1:1494767/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 2:2552031/93‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATc < 2:503462/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg > 1:2073335/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCg < 1:4875089/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg > 2:4063038/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCgg > 1:9820868/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg > 2:6486526/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg > 2:1601985/1‑93 (MQ=255)
tggtggTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTg < 1:9343736/93‑1 (MQ=255)
tggtggTGACCAGATCTATCAGCCGCAAGAACGCTGGTGAACCGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACCCAAATCGGTg < 2:8504260/93‑1 (MQ=255)
gtggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcg > 2:326778/1‑93 (MQ=255)
gtggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTgcg < 1:8827785/93‑1 (MQ=255)
ggtgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCt < 1:4099818/93‑1 (MQ=255)
tgcccGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg < 2:86878/90‑1 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg < 2:1273562/93‑1 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTgg > 2:6368419/1‑93 (MQ=255)
tgACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGCGCGCAACGGATCGGACTATTCCCCGTCACTAATCGGTGCGCTgg > 2:6111320/1‑93 (MQ=255)
gACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGc > 1:1130212/1‑93 (MQ=255)
aCCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCg > 1:7274481/1‑93 (MQ=255)
ccGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTCGGCTGgggg > 2:5888183/1‑93 (MQ=255)
cGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGcgggcggg > 2:2810336/1‑93 (MQ=255)
ggATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgt < 2:7238263/93‑1 (MQ=255)
gATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg > 2:6775585/1‑93 (MQ=255)
gATTTACCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtg < 2:9204063/93‑1 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtgt < 2:2710307/93‑1 (MQ=255)
aTTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGgtgt > 1:3905312/1‑93 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt < 1:2350715/93‑1 (MQ=255)
tttATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGtt > 1:2671603/1‑93 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc < 1:6952697/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc < 2:8131509/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTtctc > 1:7980014/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTcgc > 1:5683468/1‑93 (MQ=255)
ccGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGt > 2:6897333/1‑93 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTa < 2:833490/93‑1 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTa < 1:6493732/93‑1 (MQ=255)
cGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTcgcgga > 2:2163792/1‑91 (MQ=255)
caacaaCGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAc > 2:4020136/1‑93 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAAcc < 1:2473256/93‑1 (MQ=255)
aacaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTCGCGTAAcc > 2:8857135/1‑93 (MQ=255)
acaacGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCa > 1:10033331/1‑93 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt < 1:2495458/93‑1 (MQ=255)
acGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCt < 2:3376493/93‑1 (MQ=255)
|
AGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG > NC_000913/4127921‑4128100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
|
TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCT > SRR4302540.7314186/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGCTTTCTTGCCGGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGAGTTATCAGCCGCAACAACGCTG < SRR4302540.883120/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGG < SRR4302540.2982842/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGGTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302540.6951180/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAACCGTCTGGTGGTGACCGTATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302540.8425692/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302540.9116243/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG > SRR4302540.3225536/1‑94 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302540.8425691/94‑1 (MQ=60)
GGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTG < SRR4302540.2155202/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAA < SRR4302540.5706601/94‑1 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA > SRR4302540.5148416/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAA > SRR4302540.7308311/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAAAATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGCTTTATCAGCCGCAAAAACGCTTGTGAAA > SRR4302540.5149129/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTTCCCGTTGGTGTAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGCGCAAAGGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302540.9656455/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302540.497445/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC < SRR4302540.9756834/94‑1 (MQ=60)
TTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAAC > SRR4302540.8198056/1‑94 (MQ=60)
TTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACG < SRR4302540.7099461/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG > SRR4302540.2202509/1‑94 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG < SRR4302540.9714355/94‑1 (MQ=60)
TCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGG > SRR4302540.2715467/1‑94 (MQ=60)
CTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGT > SRR4302540.6052199/1‑94 (MQ=60)
TTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTG < SRR4302540.5714194/94‑1 (MQ=60)
TACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGC < SRR4302540.269527/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCATCATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCT < SRR4302540.355266/94‑1 (MQ=60)
CCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTG > SRR4302540.6567500/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGC > SRR4302540.8294595/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGGTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302540.8404424/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302540.5570592/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302540.5926719/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCT < SRR4302540.6612222/94‑1 (MQ=60)
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TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302540.3708387/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302540.2478905/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG > SRR4302540.998329/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302540.2503466/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302540.7166867/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACAGCTGCGTGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGG < SRR4302540.2527418/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGG > SRR4302540.8384554/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGC < SRR4302540.1875738/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCG < SRR4302540.251745/94‑1 (MQ=60)
GCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGT > SRR4302540.7770362/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGT < SRR4302540.10091508/94‑1 (MQ=60)
CAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTA > SRR4302540.7245598/1‑94 (MQ=60)
AACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAA > SRR4302540.5204065/1‑94 (MQ=60)
AACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAA > SRR4302540.4656491/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAC < SRR4302540.904615/94‑1 (MQ=60)
ACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAAC > SRR4302540.9777613/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302540.7810812/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACG < SRR4302540.3777958/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG < SRR4302540.8933457/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG < SRR4302540.8933458/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCTGGTGAAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGCCCTGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGG < SRR4302540.4451336/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGTTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302540.477484/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302540.373214/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGT < SRR4302540.8124493/94‑1 (MQ=60)
gcgggtgacgcatccgggcaatgtTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302540.2462095/70‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC > SRR4302540.759947/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCC < SRR4302540.2462101/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG < SRR4302540.8404673/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG < SRR4302540.9001978/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCG < SRR4302540.4017833/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGA > SRR4302540.8080568/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGA > SRR4302540.4186656/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGA > SRR4302540.4186653/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC < SRR4302540.8401019/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGAC < SRR4302540.2073010/94‑1 (MQ=60)
GTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACT > SRR4302540.2967023/1‑94 (MQ=60)
GTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGAAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCCACT > SRR4302540.2967022/1‑94 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTGT < SRR4302540.8454823/94‑1 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAT < SRR4302540.381641/94‑1 (MQ=60)
GCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTAT < SRR4302540.2808015/94‑1 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT < SRR4302540.8829734/94‑1 (MQ=60)
CAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATT > SRR4302540.3425966/1‑94 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC < SRR4302540.7212615/94‑1 (MQ=60)
AACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTC < SRR4302540.3341106/94‑1 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG < SRR4302540.2470947/94‑1 (MQ=60)
CATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCG < SRR4302540.477687/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302540.1952957/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC > SRR4302540.1643815/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGC < SRR4302540.9121688/94‑1 (MQ=60)
CCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGA > SRR4302540.380496/1‑94 (MQ=60)
CCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGA > SRR4302540.9790349/1‑94 (MQ=60)
CGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGAC > SRR4302540.3778536/1‑94 (MQ=60)
GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA > SRR4302540.5250887/1‑94 (MQ=60)
GGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACA > SRR4302540.5250888/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAC < SRR4302540.4180646/94‑1 (MQ=60)
GGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACAC < SRR4302540.219817/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACA < SRR4302540.2717030/94‑1 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302540.339217/1‑94 (MQ=60)
AAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAA > SRR4302540.339218/1‑94 (MQ=60)
AACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAAT > SRR4302540.2110478/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC < SRR4302540.1511219/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGGGTGGTGACCGGATTGAGCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATC < SRR4302540.1511220/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG > SRR4302540.2095629/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCG > SRR4302540.2869439/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACACATCGG > SRR4302540.1908051/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG > SRR4302540.9508816/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGG < SRR4302540.4927407/94‑1 (MQ=60)
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CTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTG > SRR4302540.4011834/1‑94 (MQ=60)
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GGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCG > SRR4302540.3838502/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCG > SRR4302540.3754060/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGC < SRR4302540.8929874/94‑1 (MQ=60)
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TGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGC > SRR4302540.1141970/1‑94 (MQ=60)
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GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGAG > SRR4302540.334625/1‑94 (MQ=60)
GGATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACAATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTG > SRR4302540.9792064/1‑94 (MQ=60)
GATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGT > SRR4302540.3947657/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTT > SRR4302540.2700537/1‑94 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT < SRR4302540.2376025/94‑1 (MQ=60)
TTTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTT > SRR4302540.1066565/1‑94 (MQ=60)
TTATGAGCCGCAACAACGCGGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTC < SRR4302540.3751832/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTC < SRR4302540.2247628/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTGTC > SRR4302540.4075693/1‑94 (MQ=60)
TTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTC > SRR4302540.4183967/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCT > SRR4302540.5565356/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCT > SRR4302540.4414590/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTC > SRR4302540.8072965/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCG < SRR4302540.7030054/94‑1 (MQ=60)
CAGCCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGGGTTTCTCGC > SRR4302540.5746043/1‑94 (MQ=60)
CCGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTA > SRR4302540.5341593/1‑94 (MQ=60)
CGCAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAA < SRR4302540.6565947/94‑1 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC < SRR4302540.2054932/94‑1 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302540.7888558/1‑94 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302540.5840587/1‑94 (MQ=60)
CAACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACC > SRR4302540.5840591/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTTGCGTAACCA > SRR4302540.9387406/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCA > SRR4302540.10150035/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCA > SRR4302540.6610074/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCA < SRR4302540.2499883/94‑1 (MQ=60)
ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAT < SRR4302540.3983744/94‑1 (MQ=60)
ACAACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCAT < SRR4302540.9705273/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGTTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT < SRR4302540.6287987/94‑1 (MQ=60)
AACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCT > SRR4302540.1260625/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTG < SRR4302540.2522351/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302540.9849734/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCGGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGG < SRR4302540.9759929/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTGCGGGAAACAAATCGGTGCGTTGCCGGGTGTcttctgctgcccccttctgg > SRR4302540.2853060/1‑74 (MQ=58)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGA > SRR4302540.2853061/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGA < SRR4302540.7438648/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGA < SRR4302540.2897592/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG < SRR4302540.6555088/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAG > SRR4302540.381791/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > SRR4302540.6857704/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC < SRR4302540.1727912/94‑1 (MQ=60)
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TGAAGGGCTTTCTTACCCGTTGCTGCAACAGCTGCTGGTGCAACATCCGGGCAAACGTCTGGTGGTGACCGGATTTATCAGCCGCAACAACGCCGGTGAAACGGTGCTGCTGGGGCGTAACGGTTCCGACTATTCCGCGACACAAATCGGTGCGCTGGCGGGTGTTTCTCGCGTAACCATCTGGAGC > NC_000913/4127918‑4128104
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
