Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,215,052 |
A→G |
E122G (GAG→GGG) |
aceA → |
isocitrate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,215,052 | 0 | A | G | 100.0%
| 698.2
/ NA
| 219 | E122G (GAG→GGG) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (120/99); total (120/99) |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg > 1:5015227/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg < 2:3720474/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa < 2:524228/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt < 1:3231962/93‑1 (MQ=255)
aGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATca > 2:745993/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAtgca > 1:3740803/1‑90 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa > 1:6149462/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa > 2:1649724/1‑93 (MQ=255)
gTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATGCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaac < 1:1644137/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCaacaac > 2:5353440/1‑93 (MQ=255)
cggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAacaaca < 1:5998615/93‑1 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc > 1:94759/1‑93 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc < 2:3630764/93‑1 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc < 1:4212555/93‑1 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc > 1:1346167/1‑93 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt < 1:1873377/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCtt > 1:688478/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCtt < 2:1317011/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCtt < 1:4608663/93‑1 (MQ=255)
gACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTc > 1:4343333/1‑93 (MQ=255)
aCGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTcc < 1:3899028/93‑1 (MQ=255)
gCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgt < 1:3124731/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 1:3416480/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 2:1772347/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 2:3330364/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcgt < 2:4278208/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 2:3790205/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc < 1:5907170/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 1:985497/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 2:3587790/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg > 2:736147/1‑93 (MQ=255)
ggcggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa < 2:4849253/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa < 1:1547867/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa > 2:1440305/1‑93 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa > 2:3771924/1‑93 (MQ=255)
gcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAg > 2:2256068/1‑93 (MQ=255)
gcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAg > 2:59778/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGa < 2:2714483/93‑1 (MQ=255)
cAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAt < 2:2052788/93‑1 (MQ=255)
gCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATcc > 1:938820/1‑93 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa > 2:2735251/1‑93 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa > 2:2905625/1‑93 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa < 2:4815990/93‑1 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 1:5304689/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 1:5154645/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt < 1:4880941/93‑1 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 1:2747017/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt < 2:1210279/93‑1 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg > 1:576927/1‑93 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg > 1:1796046/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATgg > 2:5506100/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGt < 2:5018450/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAATCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc < 2:2561308/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 1:4066055/1‑93 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 2:2340484/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:311788/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc > 2:828429/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 1:866346/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 1:4658777/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg > 1:4763994/1‑93 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg > 1:2973143/1‑93 (MQ=255)
ggATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgc > 1:268047/1‑93 (MQ=255)
ggATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgc > 2:605197/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 2:3207874/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg > 2:3877117/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 2:4707534/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 1:1174099/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCgg < 1:1027077/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCggg > 2:1732362/1‑93 (MQ=255)
aGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCa < 2:5914231/93‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCa > 1:2393231/1‑93 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 2:472141/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 1:1846148/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa > 1:2459216/1‑93 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa > 2:4066448/1‑93 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg > 2:5774297/1‑93 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGc > 2:4615243/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 1:5985466/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 2:1926300/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 2:5836734/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg < 2:2800615/93‑1 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 2:4525909/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg > 1:5585587/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCgg > 1:2417842/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg < 1:3255942/93‑1 (MQ=255)
cGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCg > 1:361680/1‑93 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 1:4704018/93‑1 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 1:2781239/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg > 1:2207029/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg > 2:6201254/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg < 2:4323761/93‑1 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc < 1:2576854/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt < 1:4473719/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt > 2:1242197/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCg > 2:5460253/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGa < 2:1140501/93‑1 (MQ=255)
gCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAt > 1:5539653/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTa < 1:2071364/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTa > 1:2011235/1‑93 (MQ=255)
tggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTcc < 2:1022671/93‑1 (MQ=255)
|
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG < SRR4302533.3811615/94‑1 (MQ=60)
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG > SRR4302533.1385004/1‑94 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGCCGGACGCTAACCTGGCGGCGAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC < SRR4302533.1168640/94‑1 (MQ=60)
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCG > SRR4302533.3240777/1‑94 (MQ=60)
ATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGG < SRR4302533.713137/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGG > SRR4302533.5045612/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGGCAGCATGTAGCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGTGCGGA > SRR4302533.5878879/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302533.3251880/94‑1 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATgca > SRR4302533.3763744/1‑91 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAA > SRR4302533.6186478/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAAC < SRR4302533.630567/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAAA > SRR4302533.3475675/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATGCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACA < SRR4302533.1654091/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATGCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGAGGAGCAAAAACAC > SRR4302533.2802676/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAC < SRR4302533.6034947/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC > SRR4302533.95356/1‑94 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC > SRR4302533.1354267/1‑94 (MQ=60)
GCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCT < SRR4302533.724371/94‑1 (MQ=60)
GCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCT < SRR4302533.4238037/94‑1 (MQ=60)
CGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTT > SRR4302533.692549/1‑94 (MQ=60)
CGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTT < SRR4302533.1884795/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC > SRR4302533.2782594/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC > SRR4302533.265149/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC > SRR4302533.4369507/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC < SRR4302533.4636574/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC > SRR4302533.4724477/1‑94 (MQ=60)
GACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTAGCCGGCAAACGCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCC < SRR4302533.1605952/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG < SRR4302533.3922817/94‑1 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTC < SRR4302533.3143937/94‑1 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTC < SRR4302533.1782982/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG > SRR4302533.3437588/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG > SRR4302533.4740902/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT < SRR4302533.5879523/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCC > SRR4302533.991267/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCG < SRR4302533.5942842/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGAT < SRR4302533.5578006/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302533.1557194/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCAAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACCCCTTCCGTCGTGCCGATCAG > SRR4302533.2092689/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA > SRR4302533.4190214/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA > SRR4302533.5213001/1‑94 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302533.944335/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT > SRR4302533.2763858/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT > SRR4302533.5185774/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT > SRR4302533.5336476/1‑94 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG > SRR4302533.4298405/1‑94 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG < SRR4302533.4910511/94‑1 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG > SRR4302533.1806975/1‑94 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG > SRR4302533.580330/1‑94 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302533.2538199/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302533.5112605/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCAGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAACCAATGG > SRR4302533.958315/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC > SRR4302533.4090805/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302533.6089235/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302533.2991336/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302533.871421/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302533.4792886/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302533.4687010/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302533.1982651/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302533.2068662/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302533.3886097/1‑94 (MQ=60)
CGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGC > SRR4302533.269677/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG < SRR4302533.1181147/94‑1 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG > SRR4302533.4387134/1‑94 (MQ=60)
agaatgctccCTATCCGGCACACTCGGGGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAGCACCTTCCCTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG < SRR4302533.96454/84‑1 (MQ=60)
ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG < SRR4302533.1033109/94‑1 (MQ=60)
AGCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACACCGCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG < SRR4302533.2576411/94‑1 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCA > SRR4302533.2408005/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCCATGGGCCGCGGGCAT > SRR4302533.2965290/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATT > SRR4302533.5753681/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATT < SRR4302533.945880/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA < SRR4302533.1195720/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA > SRR4302533.2474390/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCCGGCATTGA > SRR4302533.1512899/1‑94 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG < SRR4302533.1857406/94‑1 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG > SRR4302533.408800/1‑94 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG > SRR4302533.4909855/1‑94 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG > SRR4302533.4276771/1‑94 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG > SRR4302533.1160079/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC > SRR4302533.2112475/1‑94 (MQ=60)
CTCTACCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACTCCTTCCGTCGTGCCGACCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC < SRR4302533.1324592/94‑1 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATGCAATGGTCCGCGGGCATTGCGCCG > SRR4302533.6031981/1‑94 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG > SRR4302533.5619337/1‑94 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG > SRR4302533.6021714/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGGTCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302533.2174472/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302533.2432775/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302533.496538/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGG > SRR4302533.1877101/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGC < SRR4302533.3276019/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCG > SRR4302533.363878/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAT < SRR4302533.4635371/94‑1 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC < SRR4302533.2798325/94‑1 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC < SRR4302533.4732532/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG > SRR4302533.2220638/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG < SRR4302533.601351/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302533.2592709/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302533.165822/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG > SRR4302533.921544/1‑94 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302533.3640145/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGC > SRR4302533.3284998/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTA > SRR4302533.5265719/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTA < SRR4302533.4728763/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTA < SRR4302533.4500776/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAT < SRR4302533.3545462/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302533.1829009/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGT < SRR4302533.2424356/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCG < SRR4302533.2377540/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT > SRR4302533.5573104/1‑94 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT > SRR4302533.3107604/1‑94 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT < SRR4302533.5385570/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA > SRR4302533.2744357/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA > SRR4302533.2023626/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTAC < SRR4302533.5817221/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTAC < SRR4302533.2084122/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACT > SRR4302533.244267/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC < SRR4302533.4637148/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302533.3128888/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302533.3252438/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG < SRR4302533.3004333/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGC > SRR4302533.6122739/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGC < SRR4302533.1798424/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGC > SRR4302533.3452147/1‑94 (MQ=60)
GGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC < SRR4302533.549668/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
