Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,450,334 |
G→A |
A64T (GCT→ACT) |
ytfT → |
putative transport system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,450,334 | 0 | G | A | 100.0%
| 818.0
/ NA
| 233 | A64T (GCT→ACT) | ytfT | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (116/117); total (116/117) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423
|
gTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACt < 2:1852960/93‑1 (MQ=255)
gATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTccc < 2:487793/93‑1 (MQ=255)
aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg < 2:4959630/93‑1 (MQ=255)
aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 2:2590859/1‑93 (MQ=255)
aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 2:1518137/1‑93 (MQ=255)
aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 1:370802/1‑93 (MQ=255)
aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 1:2606511/1‑93 (MQ=255)
tAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGt > 2:2900283/1‑93 (MQ=255)
tAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGt < 1:4509292/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 1:607263/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTg > 1:6250869/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGtt > 2:710280/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGtt < 2:5302175/93‑1 (MQ=255)
gTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTa > 1:3990131/1‑93 (MQ=255)
tAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTAc < 2:3311714/93‑1 (MQ=255)
gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 2:5494949/1‑93 (MQ=255)
gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 2:3156870/1‑93 (MQ=255)
gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 2:16771/1‑93 (MQ=255)
ccccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTgg < 2:3789540/93‑1 (MQ=255)
cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc < 1:5014032/93‑1 (MQ=255)
cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc < 2:3747502/93‑1 (MQ=255)
cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 2:5719395/1‑93 (MQ=255)
cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 2:1879548/1‑93 (MQ=255)
cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc < 1:2000055/93‑1 (MQ=255)
ccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCg > 1:2677868/1‑93 (MQ=255)
cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt > 1:252665/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg > 1:105904/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 1:2121130/93‑1 (MQ=255)
tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 1:3682924/1‑93 (MQ=255)
tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 1:5756202/1‑93 (MQ=255)
tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg < 2:4010167/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGc < 1:1379443/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 2:4112624/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTGGTGTTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGa < 1:35328/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGa > 1:5968243/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAc < 2:2182882/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACg > 1:3957737/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGc > 2:2244922/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTCCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGc < 2:5088999/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt > 2:4648505/1‑93 (MQ=255)
ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt < 2:2781803/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt < 1:4300278/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTg > 2:625945/1‑93 (MQ=255)
gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCATTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTg > 2:6192320/1‑93 (MQ=255)
ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 1:5370481/93‑1 (MQ=255)
gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGTCATGACGCTGGTg > 1:5586239/1‑93 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:1160012/93‑1 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:983242/93‑1 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:1285135/93‑1 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:3515296/93‑1 (MQ=255)
tcTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt < 2:3040865/92‑1 (MQ=255)
gCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt > 1:680790/1‑93 (MQ=255)
cTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATc > 2:2477157/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCg > 1:1583531/1‑93 (MQ=255)
ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCGCGATGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATTGCCAc > 1:4425798/1‑93 (MQ=255)
ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAc < 1:6123597/93‑1 (MQ=255)
aTGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCg < 1:3303980/93‑1 (MQ=255)
gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt < 2:1139368/93‑1 (MQ=255)
gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt > 2:1695083/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGa < 1:477815/93‑1 (MQ=255)
tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 1:5933305/1‑93 (MQ=255)
tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 1:1482859/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAt < 1:2960667/93‑1 (MQ=255)
ttCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAt > 2:5843217/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 2:4337807/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 1:811627/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 1:4618646/93‑1 (MQ=255)
gTAGCCCCTTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 2:6116653/1‑93 (MQ=255)
gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 1:1355611/1‑93 (MQ=255)
gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct < 2:4252498/93‑1 (MQ=255)
tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc > 2:5669609/1‑93 (MQ=255)
tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc > 1:794808/1‑93 (MQ=255)
aGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc > 1:5880721/1‑93 (MQ=255)
gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg > 2:763567/1‑93 (MQ=255)
gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg > 2:5960607/1‑93 (MQ=255)
gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg < 1:4820945/93‑1 (MQ=255)
gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg < 2:4568315/93‑1 (MQ=255)
cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa < 2:3228452/93‑1 (MQ=255)
cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAGTGATCTCTCCGTa > 1:2586473/1‑93 (MQ=255)
ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg < 2:880898/93‑1 (MQ=255)
ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:1252045/1‑93 (MQ=255)
ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:1441675/1‑93 (MQ=255)
ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg < 1:5412273/93‑1 (MQ=255)
cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:3435780/93‑1 (MQ=255)
tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg > 1:4103856/1‑93 (MQ=255)
atcATTCTGAACCGTGCAGCCCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCg < 2:1788476/91‑1 (MQ=255)
aCATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCgg < 2:2336921/93‑1 (MQ=255)
cATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATGGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGt > 2:6039646/1‑93 (MQ=255)
cATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGt < 1:4673565/93‑1 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTgg > 2:1149077/1‑92 (MQ=255)
ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 1:5108625/1‑93 (MQ=255)
tAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 1:939415/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGCTTGATCTCTCCGTAGGCGCGGTGATGGCt > 1:1728710/1‑93 (MQ=255)
aaCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCt > 1:658612/1‑93 (MQ=255)
aCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTa < 2:3827256/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTAt < 1:5508138/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTAt < 2:1573616/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTAt < 1:3194883/93‑1 (MQ=255)
gcgCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGCCGGTGGTGGCTATCg > 2:1342857/3‑93 (MQ=255)
gTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg > 1:1778679/1‑93 (MQ=255)
|
GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAG > NC_000913/4450241‑4450427
|
CTGGTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAA > SRR4302533.2420437/1‑94 (MQ=60)
TCGATAGCCTGGTAGCCACGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCC < SRR4302533.3498218/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCC < SRR4302533.4732832/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCC > SRR4302533.5909381/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCC < SRR4302533.795615/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCC > SRR4302533.161867/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCC > SRR4302533.6306285/1‑94 (MQ=60)
GATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCG > SRR4302533.2622520/1‑94 (MQ=60)
GATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCG > SRR4302533.373041/1‑94 (MQ=60)
GATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCG > SRR4302533.65005/1‑94 (MQ=60)
ATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGT > SRR4302533.4414569/1‑94 (MQ=60)
TAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTT < SRR4302533.4536602/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTG > SRR4302533.6288264/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTG < SRR4302533.1761521/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTG < SRR4302533.610838/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGT > SRR4302533.948101/1‑94 (MQ=60)
TGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTT < SRR4302533.5088860/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTT < SRR4302533.816027/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTT < SRR4302533.923289/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTT < SRR4302533.2573670/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTA > SRR4302533.4014434/1‑94 (MQ=60)
TAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACT > SRR4302533.4636709/1‑94 (MQ=60)
TAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACT < SRR4302533.5160397/94‑1 (MQ=60)
AGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTG > SRR4302533.6033821/1‑94 (MQ=60)
AGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTG < SRR4302533.260759/94‑1 (MQ=60)
CCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGC > SRR4302533.1433991/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGC < SRR4302533.5966548/94‑1 (MQ=60)
CCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGC < SRR4302533.258842/94‑1 (MQ=60)
CCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCG > SRR4302533.2694284/1‑94 (MQ=60)
CCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCG < SRR4302533.5044409/94‑1 (MQ=60)
CCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCG < SRR4302533.2012367/94‑1 (MQ=60)
CCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCG > SRR4302533.4575635/1‑94 (MQ=60)
GCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATT < SRR4302533.5789934/94‑1 (MQ=60)
GCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATT > SRR4302533.254218/1‑94 (MQ=60)
CATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTG > SRR4302533.5867440/1‑94 (MQ=60)
CATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTG > SRR4302533.106563/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCTCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGG < SRR4302533.1155574/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGG > SRR4302533.3947018/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGG > SRR4302533.3705560/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGG < SRR4302533.2134205/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGG > SRR4302533.5790940/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCA < SRR4302533.3079072/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCA < SRR4302533.1387742/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGA > SRR4302533.6004375/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGA < SRR4302533.1620535/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGAATGA > SRR4302533.623663/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTGGTGTTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAC < SRR4302533.35565/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAC < SRR4302533.666006/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGGTGCTTCAGGATTGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACG < SRR4302533.968504/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACG > SRR4302533.3981857/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCT > SRR4302533.3985695/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTG < SRR4302533.4326140/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTTCAGGATGGGTGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTATCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTGCTGGCGATTGGCATGACGCTGGT < SRR4302533.604384/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGTCATGACGCTGGTG > SRR4302533.5619993/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTG < SRR4302533.5402749/94‑1 (MQ=60)
TGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAT > SRR4302533.684820/1‑94 (MQ=60)
TGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAT < SRR4302533.989005/94‑1 (MQ=60)
TGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAT < SRR4302533.1166973/94‑1 (MQ=60)
TGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAT < SRR4302533.1292865/94‑1 (MQ=60)
TGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAT < SRR4302533.3536962/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATC < SRR4302533.3688263/94‑1 (MQ=60)
CTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCG > SRR4302533.1593074/1‑94 (MQ=60)
CTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCG > SRR4302533.4060395/1‑94 (MQ=60)
TCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCC > SRR4302533.3272701/1‑94 (MQ=60)
CAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCA > SRR4302533.3717805/1‑94 (MQ=60)
CAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCA > SRR4302533.2670196/1‑94 (MQ=60)
AGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCGCGATGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATTGCCAC > SRR4302533.4452549/1‑94 (MQ=60)
AGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAC > SRR4302533.742005/1‑94 (MQ=60)
AGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAC > SRR4302533.4909060/1‑94 (MQ=60)
GGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACC < SRR4302533.1288475/94‑1 (MQ=60)
GGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACC > SRR4302533.4248344/1‑94 (MQ=60)
GGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACC < SRR4302533.6160512/94‑1 (MQ=60)
ATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGG < SRR4302533.3324384/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGT < SRR4302533.341609/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGG > SRR4302533.5548486/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGG > SRR4302533.1558396/1‑94 (MQ=60)
GGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTG < SRR4302533.2848935/94‑1 (MQ=60)
GGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGG < SRR4302533.211896/94‑1 (MQ=60)
GGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGG < SRR4302533.1427653/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGG > SRR4302533.2537994/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGG > SRR4302533.1265047/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGA > SRR4302533.4288058/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGA > SRR4302533.1377565/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAT < SRR4302533.480668/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAT > SRR4302533.5969174/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAT > SRR4302533.1491812/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAT > SRR4302533.4673338/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATT > SRR4302533.4832821/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTG > SRR4302533.4807994/1‑94 (MQ=60)
TTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATC < SRR4302533.2978765/94‑1 (MQ=60)
TTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATC > SRR4302533.2062769/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTC < SRR4302533.1483698/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCT < SRR4302533.4646635/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCT > SRR4302533.1363759/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCT < SRR4302533.816382/94‑1 (MQ=60)
GTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTC > SRR4302533.799483/1‑94 (MQ=60)
GTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTC < SRR4302533.1797077/94‑1 (MQ=60)
TAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCC < SRR4302533.4494726/94‑1 (MQ=60)
TAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCC > SRR4302533.5916257/1‑94 (MQ=60)
AGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCG < SRR4302533.3691201/94‑1 (MQ=60)
GCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGT > SRR4302533.5362451/1‑94 (MQ=60)
GCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGT < SRR4302533.4850157/94‑1 (MQ=60)
CCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTA > SRR4302533.5976160/1‑94 (MQ=60)
CCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAGTGATCTCTCCGTA > SRR4302533.2602374/1‑94 (MQ=60)
CCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAG > SRR4302533.1259528/1‑94 (MQ=60)
CCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAG > SRR4302533.6110392/1‑94 (MQ=60)
CCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAG > SRR4302533.1450375/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGG < SRR4302533.5444817/94‑1 (MQ=60)
CCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGCGGGATTGATCTCTCCGTAGG > SRR4302533.5474726/1‑94 (MQ=60)
CATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGG < SRR4302533.5452022/94‑1 (MQ=60)
CATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGG < SRR4302533.3457007/94‑1 (MQ=60)
ATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGG > SRR4302533.5416140/1‑94 (MQ=60)
ATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGG > SRR4302533.4128820/1‑94 (MQ=60)
TAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGC > SRR4302533.2946376/1‑94 (MQ=60)
AGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCG > SRR4302533.1233483/1‑94 (MQ=60)
GACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGG > SRR4302533.3372873/1‑94 (MQ=60)
ACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGT > SRR4302533.3905851/1‑94 (MQ=60)
CATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTG < SRR4302533.4701884/94‑1 (MQ=60)
ATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGA > SRR4302533.5139492/1‑94 (MQ=60)
TAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGCTTGATCTCTCCGTAGGCGCGGTGATGGCT > SRR4302533.1739195/1‑94 (MQ=60)
TAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCT > SRR4302533.662493/1‑94 (MQ=60)
TAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCT < SRR4302533.944935/94‑1 (MQ=60)
CCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATC < SRR4302533.5541383/94‑1 (MQ=60)
CCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATC < SRR4302533.3214539/94‑1 (MQ=60)
CGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCG < SRR4302533.3548379/94‑1 (MQ=60)
CGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCG > SRR4302533.1789508/1‑94 (MQ=60)
GCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCG < SRR4302533.1358900/94‑1 (MQ=60)
CAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGG < SRR4302533.718806/94‑1 (MQ=60)
CAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGG > SRR4302533.5858271/1‑94 (MQ=60)
AACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGA > SRR4302533.4556539/1‑94 (MQ=60)
AACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGA < SRR4302533.3816254/94‑1 (MQ=60)
ACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAG > SRR4302533.2763354/1‑94 (MQ=60)
ACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAG < SRR4302533.5354594/94‑1 (MQ=60)
|
CTGGTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAG > NC_000913/4450241‑4450427
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
