Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
782,054 |
T→C |
A249A (GCT→GCC) |
nadA → |
quinolinate synthetase A protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 782,054 | 0 | T | C | 98.8%
| 868.9
/ ‑2.4
| 255 | A249A (GCT→GCC) | nadA | quinolinate synthetase A protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base C (120/132); total (120/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTA > NC_000913/781963‑782144
|
cGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCtgccgc > 1:919705/1‑94 (MQ=255)
ggATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCcgcg < 2:7607538/94‑1 (MQ=255)
ggATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCcgcg < 1:2487284/94‑1 (MQ=255)
ggATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCcgcg > 2:2491295/1‑94 (MQ=255)
gctgcCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGaaaa < 1:9896675/94‑1 (MQ=255)
ctgcCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAAc < 1:3879918/94‑1 (MQ=255)
ctgcCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAAc < 1:1232869/94‑1 (MQ=255)
tgcCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGAGGCGGTCGGTTCAACAAGTCAAATGATCGCTGGCGCGCAAACa > 1:7799528/1‑94 (MQ=255)
cATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTg < 2:6412649/94‑1 (MQ=255)
cATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTg < 1:8288254/94‑1 (MQ=255)
cATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTg < 1:4396893/94‑1 (MQ=255)
aTACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGc > 2:7516317/1‑94 (MQ=255)
tACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGcc < 2:5561913/94‑1 (MQ=255)
aCTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCca > 2:6965375/1‑94 (MQ=255)
gTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCAGTTCCCCCAGTCACCTGATCGCTCCCGCGAAAAAATGGCCACAta > 1:3215651/1‑93 (MQ=255)
gCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCag < 2:132492/94‑1 (MQ=255)
gCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCag < 1:5213083/94‑1 (MQ=255)
cATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCaga > 1:663854/1‑94 (MQ=255)
aTCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCagag < 2:10492962/94‑1 (MQ=255)
tCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAgg > 1:9019898/1‑94 (MQ=255)
tCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAgg > 1:9544192/1‑94 (MQ=255)
aGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCCCGAAAACATTGCCACCTCAGAGGCtt > 2:3152471/1‑94 (MQ=255)
gAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa < 1:6305639/94‑1 (MQ=255)
gAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa < 1:413076/94‑1 (MQ=255)
gAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa < 1:3161654/94‑1 (MQ=255)
aaTCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTAt < 2:887857/94‑1 (MQ=255)
aTCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTAtt < 2:6209531/94‑1 (MQ=255)
aTCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTAtt > 1:5460859/1‑94 (MQ=255)
tCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATtg < 2:3651994/94‑1 (MQ=255)
caccacAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATtgt > 2:6784215/1‑94 (MQ=255)
accacAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATtgtg > 1:1599526/1‑94 (MQ=255)
ccacAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTgg > 1:1070113/1‑94 (MQ=255)
ccacAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGGCGGTTACACCAGGCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTgg > 1:4869342/1‑94 (MQ=255)
ccacAAGCTATTGTCGATACGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTgg > 1:1354990/1‑94 (MQ=255)
cacaAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGc > 2:10611156/1‑94 (MQ=255)
caAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCac > 1:3461046/1‑93 (MQ=255)
caAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCaa < 1:8320647/94‑1 (MQ=255)
aaGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAAc > 2:3054448/1‑94 (MQ=255)
aGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAAcc > 2:8375858/1‑94 (MQ=255)
gCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCg < 2:9642917/94‑1 (MQ=255)
cTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGa > 2:4643184/1‑94 (MQ=255)
tATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAt > 1:6145070/1‑94 (MQ=255)
tATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAt < 2:3495871/94‑1 (MQ=255)
aTTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATc < 1:4611665/94‑1 (MQ=255)
aTTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATc < 1:2810132/94‑1 (MQ=255)
ttGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCGCCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCg < 1:1778447/94‑1 (MQ=255)
ttGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCg < 1:528204/94‑1 (MQ=255)
tGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGGCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCgg < 2:10398991/94‑1 (MQ=255)
gTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCggg < 1:6238053/94‑1 (MQ=255)
tCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCgggg < 1:8032761/94‑1 (MQ=255)
ctatatGGCGTATGCGGTCATTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGGTGCGAAAACATTGCCACAGCAGAGGCTTATTGTGACAACCGATCGGGGt < 1:4504986/92‑1 (MQ=255)
gATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTa > 1:273918/1‑94 (MQ=255)
atatGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAt < 1:2637763/94‑1 (MQ=255)
atGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAttt > 2:4766272/1‑94 (MQ=255)
tGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAtttt < 2:7920832/94‑1 (MQ=255)
tGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAtttt > 1:1834679/1‑94 (MQ=255)
tGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAtttt > 1:6939439/1‑94 (MQ=255)
gcgcATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCt < 2:5448621/94‑1 (MQ=255)
gCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCt > 1:7029212/1‑94 (MQ=255)
gCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCt > 1:5676822/1‑94 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 1:9983869/1‑94 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 1:10009425/1‑94 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 2:2107583/1‑94 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 2:9597229/1‑94 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc < 2:9218129/94‑1 (MQ=255)
ggATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 1:3047860/1‑94 (MQ=255)
cggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAAt < 1:10343665/94‑1 (MQ=255)
cggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAAt < 1:3736791/94‑1 (MQ=255)
ggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATg > 2:3680836/1‑94 (MQ=255)
ggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATg > 2:333665/1‑94 (MQ=255)
ggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATg > 1:7438350/1‑94 (MQ=255)
ggtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATg < 2:1906789/94‑1 (MQ=255)
gtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgc < 1:7123983/94‑1 (MQ=255)
gtcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgc < 2:1716941/94‑1 (MQ=255)
tcggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgca < 1:4903451/94‑1 (MQ=255)
tggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcag > 1:9234103/2‑94 (MQ=255)
ggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcagc > 2:3878186/1‑94 (MQ=255)
ggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcagc > 1:2016145/1‑94 (MQ=255)
ggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcagc > 1:8846101/1‑94 (MQ=255)
ggtTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcaga > 2:4323078/1‑93 (MQ=255)
ttCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGcagcag > 2:7335401/1‑94 (MQ=255)
tCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAgg < 2:3179302/94‑1 (MQ=255)
tCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAgg < 1:10429853/94‑1 (MQ=255)
ccaccaGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGc < 2:10245702/94‑1 (MQ=255)
accaGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCgg > 2:2606770/1‑94 (MQ=255)
accaGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCgg > 2:87877/1‑94 (MQ=255)
ccaGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGt < 1:10167787/94‑1 (MQ=255)
ccaGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGt < 2:7447480/94‑1 (MQ=255)
cAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAg < 2:2325359/94‑1 (MQ=255)
aaCTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGa < 2:1536646/94‑1 (MQ=255)
aaCTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGa > 2:7844614/1‑94 (MQ=255)
cTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATa > 1:8385991/1‑94 (MQ=255)
cTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATa > 2:1933522/1‑94 (MQ=255)
cTGATCGCTGCCGCGAAAAAATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGAATTTTCTACAAAATGAACCAGGCGGTGCCAGTTa > 2:9178805/1‑94 (MQ=255)
tGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATaa > 2:2970987/1‑94 (MQ=255)
gATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATaaa > 1:4184782/1‑94 (MQ=255)
tCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAaga < 1:3307588/94‑1 (MQ=255)
cGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAagag < 2:2745966/94‑1 (MQ=255)
ctgccgCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGtt > 2:647655/1‑94 (MQ=255)
tgccgcGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTa > 1:8054027/1‑94 (MQ=255)
|
CGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTA > NC_000913/781963‑782144
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTG > NC_000913/781961‑782147
|
CCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCC < SRR4302545.10085804/94‑1 (MQ=60)
CGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGC > SRR4302545.940343/1‑94 (MQ=60)
GGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCG < SRR4302545.2547428/94‑1 (MQ=60)
GATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGA > SRR4302545.7490813/1‑94 (MQ=60)
GATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGA > SRR4302545.1438889/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGGA > SRR4302545.1166729/1‑94 (MQ=60)
tccgatctctgatctCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAA > SRR4302545.10710572/16‑94 (MQ=60)
GCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAA < SRR4302545.10190703/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAA > SRR4302545.2235494/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAA > SRR4302545.9223628/1‑94 (MQ=60)
CTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAAC < SRR4302545.3976765/94‑1 (MQ=60)
CTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAAC > SRR4302545.2728355/1‑94 (MQ=60)
CTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAAC < SRR4302545.1260729/94‑1 (MQ=60)
TGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACA < SRR4302545.10612313/94‑1 (MQ=60)
TGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGAGGCGGTCGGTTCAACAAGTCAAATGATCGCTGGCGCGCAAACA > SRR4302545.8020346/1‑94 (MQ=60)
GCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACAT < SRR4302545.78975/94‑1 (MQ=60)
CCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATT > SRR4302545.8056425/1‑94 (MQ=60)
CATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTG < SRR4302545.5361695/94‑1 (MQ=60)
CATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTG < SRR4302545.8528346/94‑1 (MQ=60)
CATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTG < SRR4302545.4508355/94‑1 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCATTCAACTGATCGCTGCCGCGAACACAATGC > SRR4302545.1852855/1‑94 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAAGATTGC > SRR4302545.10509339/1‑94 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGC > SRR4302545.5176141/1‑94 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGC < SRR4302545.8443128/94‑1 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGC < SRR4302545.5407838/94‑1 (MQ=60)
ATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGGTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGC > SRR4302545.1852854/1‑94 (MQ=60)
TACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCC < SRR4302545.2725059/94‑1 (MQ=60)
TACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGAACGCTGCCGCGAAAACATTGCC < SRR4302545.4455232/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCAC < SRR4302545.10699853/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCAC < SRR4302545.6201734/94‑1 (MQ=60)
GGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACAT > SRR4302545.131468/1‑94 (MQ=60)
GTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCAGTTCCCCCAGTCACCTGATCGCTCCCGCGAAAAAATGGCCACATA > SRR4302545.3294474/1‑94 (MQ=60)
GGCATCCAGAATCACCAAAAGCTATTTTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCA < SRR4302545.8562498/94‑1 (MQ=60)
TCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAG < SRR4302545.9481309/94‑1 (MQ=60)
GCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAG < SRR4302545.9481310/94‑1 (MQ=60)
GCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAG < SRR4302545.5347398/94‑1 (MQ=60)
CATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGA > SRR4302545.678640/1‑94 (MQ=60)
ATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCCCATCAGAG > SRR4302545.2021371/1‑94 (MQ=60)
ATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAG < SRR4302545.5685220/94‑1 (MQ=60)
ATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAG > SRR4302545.3729302/1‑94 (MQ=60)
TCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGG > SRR4302545.9825342/1‑94 (MQ=60)
TCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGG > SRR4302545.9282609/1‑94 (MQ=60)
TCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGG < SRR4302545.7154198/94‑1 (MQ=60)
CAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGCAAACATTGCCACCTCAGAGGCT > SRR4302545.3019531/1‑94 (MQ=60)
CAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCT < SRR4302545.3274276/94‑1 (MQ=60)
AGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTT > SRR4302545.9844536/1‑94 (MQ=60)
AGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGGTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTT > SRR4302545.9528656/1‑94 (MQ=60)
GAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTT > SRR4302545.9082895/1‑94 (MQ=60)
GAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTA < SRR4302545.422249/94‑1 (MQ=60)
GAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTA < SRR4302545.6477566/94‑1 (MQ=60)
GAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTA < SRR4302545.3239355/94‑1 (MQ=60)
AATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTAT > SRR4302545.10651346/1‑94 (MQ=60)
CTCACCCCAAGCTATTGTCGATTTGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAACCATTGCCCCATCCGAGGCTTATT < SRR4302545.8275000/94‑1 (MQ=60)
ATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATT > SRR4302545.5603997/1‑94 (MQ=60)
TCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTG < SRR4302545.4577786/94‑1 (MQ=60)
TCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTG < SRR4302545.7890081/94‑1 (MQ=60)
TCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTG < SRR4302545.10365256/94‑1 (MQ=60)
CACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGTCTTATTGT < SRR4302545.6317972/94‑1 (MQ=60)
ACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTG > SRR4302545.1637429/1‑94 (MQ=60)
CCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGG > SRR4302545.4993201/1‑94 (MQ=60)
CCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGG > SRR4302545.647411/1‑94 (MQ=60)
CCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGG > SRR4302545.1093383/1‑94 (MQ=60)
CCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGGCGGTTACACCAGGCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGG > SRR4302545.4993200/1‑94 (MQ=60)
CCACAAGCTATTGTCGATACGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGG > SRR4302545.1385274/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAC > SRR4302545.3545772/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAA > SRR4302545.5575195/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAA < SRR4302545.8561766/94‑1 (MQ=60)
CAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAA < SRR4302545.8561765/94‑1 (MQ=60)
CAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAA > SRR4302545.932310/1‑94 (MQ=60)
AGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACC < SRR4302545.3158850/94‑1 (MQ=60)
AGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACC > SRR4302545.9445859/1‑94 (MQ=60)
AGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACC < SRR4302545.4688673/94‑1 (MQ=60)
GCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCG > SRR4302545.1804830/1‑94 (MQ=60)
CTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGA > SRR4302545.5792244/1‑94 (MQ=60)
CTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGA > SRR4302545.3207457/1‑94 (MQ=60)
TATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAT > SRR4302545.4882759/1‑94 (MQ=60)
TATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAT > SRR4302545.9861557/1‑94 (MQ=60)
TATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAT > SRR4302545.6312204/1‑94 (MQ=60)
TATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAT < SRR4302545.3478633/94‑1 (MQ=60)
TATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAT < SRR4302545.400711/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATC < SRR4302545.2878153/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATC < SRR4302545.4729648/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATC > SRR4302545.9119123/1‑94 (MQ=60)
TTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCGCCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCG < SRR4302545.1821133/94‑1 (MQ=60)
TTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCG < SRR4302545.3301923/94‑1 (MQ=60)
TTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCG < SRR4302545.539986/94‑1 (MQ=60)
TGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGG > SRR4302545.8627148/1‑94 (MQ=60)
GTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGG < SRR4302545.6408076/94‑1 (MQ=60)
GTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGG < SRR4302545.6408075/94‑1 (MQ=60)
GTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGG > SRR4302545.4272187/1‑94 (MQ=60)
GTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGG < SRR4302545.8324023/94‑1 (MQ=60)
gcgtTATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCCACTGATCGCTGCCGCGAAACCATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCACCCGATCGGGG < SRR4302545.8261632/90‑1 (MQ=60)
TCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGG < SRR4302545.8261631/94‑1 (MQ=60)
CTATATGGCGTATGCGGTCATTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGGTGCGAAAACATTGCCACAGCAGAGGCTTATTGTGACAACCGATCGGGGT < SRR4302545.4620240/94‑1 (MQ=60)
GATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTA > SRR4302545.279597/1‑94 (MQ=60)
GATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTA < SRR4302545.10741949/94‑1 (MQ=60)
GAGATGGCGGATACGGTTGGTTCCGCCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTA < SRR4302545.1610128/94‑1 (MQ=60)
ATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAT < SRR4302545.5444212/94‑1 (MQ=60)
ATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAT < SRR4302545.2701239/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATT > SRR4302545.4641798/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTT < SRR4302545.81904/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTT < SRR4302545.2858919/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTT > SRR4302545.1879281/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTT > SRR4302545.1879279/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTT > SRR4302545.7130734/1‑94 (MQ=60)
GGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTC > SRR4302545.2622639/1‑94 (MQ=60)
GCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCT > SRR4302545.7223277/1‑94 (MQ=60)
GCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCT < SRR4302545.2508932/94‑1 (MQ=60)
GCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCT > SRR4302545.7223276/1‑94 (MQ=60)
GCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCT > SRR4302545.5828498/1‑94 (MQ=60)
CGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTAATTGTGGCAACAGTTCGGGGGATCTTCTA > SRR4302545.2447580/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAC > SRR4302545.3122574/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAC > SRR4302545.10279960/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAC > SRR4302545.10306142/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGCATTTTCTAC > SRR4302545.459019/1‑94 (MQ=60)
ATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAA > SRR4302545.6009799/1‑94 (MQ=60)
GCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAA < SRR4302545.3854684/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAAT < SRR4302545.10648565/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAAT < SRR4302545.3828721/94‑1 (MQ=60)
GGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATG > SRR4302545.7648863/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGC < SRR4302545.4023488/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGC < SRR4302545.7321461/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCA < SRR4302545.3871102/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCA < SRR4302545.5027922/94‑1 (MQ=60)
TGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAG > SRR4302545.9504829/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAG < SRR4302545.4369933/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGC < SRR4302545.6861749/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGC < SRR4302545.6861750/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGC > SRR4302545.9103016/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGC > SRR4302545.8859177/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGC > SRR4302545.2065937/1‑94 (MQ=60)
GTTCCACCAGTCAACAGATCGCTGCCGCGAAATCATTGCCACAACAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCA < SRR4302545.491519/94‑1 (MQ=60)
TCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGG < SRR4302545.10737257/94‑1 (MQ=60)
TCCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGG < SRR4302545.1403137/94‑1 (MQ=60)
CCACCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGC > SRR4302545.7205583/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAGCCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGT < SRR4302545.10261210/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGT < SRR4302545.10468383/94‑1 (MQ=60)
GTCAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCC > SRR4302545.3794098/1‑94 (MQ=60)
CAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAG < SRR4302545.10269224/94‑1 (MQ=60)
CAACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAG < SRR4302545.1139120/94‑1 (MQ=60)
CAACTGATCGCAGCCGAGATAACATTGTCACAGTAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAACGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAG > SRR4302545.1243743/1‑94 (MQ=60)
ACTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGAT < SRR4302545.7562545/94‑1 (MQ=60)
CTGATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATA > SRR4302545.8628762/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAA < SRR4302545.3514690/94‑1 (MQ=60)
GATCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAA > SRR4302545.4289223/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGA < SRR4302545.3388481/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGA < SRR4302545.640407/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAG < SRR4302545.3336482/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGT > SRR4302545.2838546/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATCAAGAGTT > SRR4302545.2929530/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTT < SRR4302545.10801620/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTA > SRR4302545.8284148/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTA > SRR4302545.5149385/1‑94 (MQ=60)
GCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTAC < SRR4302545.4946308/94‑1 (MQ=60)
GCCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTAC < SRR4302545.7678695/94‑1 (MQ=60)
CCGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACT < SRR4302545.5938914/94‑1 (MQ=60)
CGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTG < SRR4302545.8294813/94‑1 (MQ=60)
|
CCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTG > NC_000913/781961‑782147
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
