Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,075,220 |
(T)5→6 |
coding (256/357 nt) |
yggP ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,075,215 | 1 | . | T | 98.6%
| 1692.1
/ 9.6
| 435 | coding (261/357 nt) | yggP | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base T (218/211); total (222/213) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
TATAAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑TTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTAAAT > NC_000913/3075122‑3075303
|
ataAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑t > 1:5297280/1‑94 (MQ=255)
ataAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑t < 1:4218862/94‑1 (MQ=255)
ataAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑t > 1:2989676/1‑94 (MQ=255)
taAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tt < 1:9015104/94‑1 (MQ=255)
taAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tt < 1:3094006/94‑1 (MQ=255)
aaGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑ttt < 1:1156247/94‑1 (MQ=255)
aGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttt < 1:8686641/94‑1 (MQ=255)
aGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttt < 2:8770939/94‑1 (MQ=255)
aGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttt > 1:3964057/1‑94 (MQ=255)
tGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttttt > 2:7437974/1‑93 (MQ=255)
tGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttttt > 1:2637536/1‑93 (MQ=255)
tGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttttt < 1:1977013/94‑2 (MQ=255)
gggCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑tttttt < 2:3655680/93‑2 (MQ=255)
cATTGCCCCCCAAATATTCGTAGCTGGAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑ttttttata < 2:5198075/94‑5 (MQ=255)
ttGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATAtt < 1:5468063/94‑1 (MQ=255)
gccgccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTg < 1:3736031/94‑1 (MQ=255)
gccgccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTg > 2:937703/1‑94 (MQ=255)
ccgccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGc > 2:2559425/1‑94 (MQ=255)
cgccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGcc > 1:2520194/1‑94 (MQ=255)
cgccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGcc > 1:3539782/1‑94 (MQ=255)
ccAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAg < 1:4826012/94‑1 (MQ=255)
cAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGt > 2:7719793/1‑94 (MQ=255)
aaaaTATTCGTAGCTGTAGCCCGCTAAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTg < 1:10326279/94‑1 (MQ=255)
aaaTATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTga < 2:9832149/94‑1 (MQ=255)
aaaTATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTga > 2:3404143/1‑94 (MQ=255)
aaaTATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTga < 1:211899/94‑1 (MQ=255)
aaaGATTCGTAGCTTTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGCAT‑TTTTTATATTTGCCAGTga < 2:8129280/94‑1 (MQ=255)
aaTATTCGTAGCTGTAGCCCGCTTAATAGCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTgag < 2:6716770/94‑1 (MQ=255)
atatTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTgaga < 1:8475337/94‑1 (MQ=255)
tatTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAt > 1:5780085/1‑94 (MQ=255)
tatTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAt < 2:6336981/94‑1 (MQ=255)
tatTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAt < 1:7154728/94‑1 (MQ=255)
atTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAtt > 2:700352/1‑94 (MQ=255)
atTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAtt > 2:9893588/1‑94 (MQ=255)
ttCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAttt < 2:1745833/94‑1 (MQ=255)
tCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAtttt < 2:1010803/94‑1 (MQ=255)
tCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGAtttt < 2:4056425/94‑1 (MQ=255)
gaGCTGGAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTAc < 1:6274243/93‑1 (MQ=255)
cTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCa > 2:2932163/1‑94 (MQ=255)
tGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCAc < 1:6566328/94‑1 (MQ=255)
tGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCAc > 1:8931013/1‑94 (MQ=255)
tGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCAc > 1:7732857/1‑94 (MQ=255)
gTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACt < 1:5900879/94‑1 (MQ=255)
tAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACtt < 2:10610753/94‑1 (MQ=255)
tAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACtt > 2:7522527/1‑94 (MQ=255)
aGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTc < 2:9246522/94‑1 (MQ=255)
aGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTc > 1:3357514/1‑94 (MQ=255)
aGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGCTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTc > 1:2923059/1‑94 (MQ=255)
gCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCg > 2:3131172/1‑94 (MQ=255)
gCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCg < 1:8262263/94‑1 (MQ=255)
cccGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGa > 1:1809520/1‑94 (MQ=255)
cttttGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATATTTACCCACTTCGAc > 1:9394281/5‑94 (MQ=255)
ccGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGAc > 1:1324275/1‑94 (MQ=255)
ccGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGAc < 1:2344128/94‑1 (MQ=255)
cGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACa > 2:5082151/1‑94 (MQ=255)
cGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACa > 1:7429520/1‑94 (MQ=255)
gCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACaa > 2:4253340/1‑94 (MQ=255)
gCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACaa > 2:6797214/1‑94 (MQ=255)
cTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAAt < 2:2175261/94‑1 (MQ=255)
tGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATa < 2:2101087/94‑1 (MQ=255)
tGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATa < 2:7151952/94‑1 (MQ=255)
tGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATa > 2:8631586/1‑94 (MQ=255)
atCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAAcccc < 1:4482545/94‑1 (MQ=255)
atCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAAcccc < 1:5362639/94‑1 (MQ=255)
cGCTTGGTAACCCCATCGCCAGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGc < 2:2376047/94‑1 (MQ=255)
cTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGcac < 2:10503012/94‑1 (MQ=255)
ttGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGcaca > 2:800275/1‑94 (MQ=255)
tGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACAt < 1:6814610/94‑1 (MQ=255)
ggTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCGCTTCGACAATAACCCCGGCACAtt < 2:123556/94‑1 (MQ=255)
gTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTc < 1:10020175/94‑1 (MQ=255)
tAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCa > 2:10374686/1‑94 (MQ=255)
aaCCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCAt < 1:10167390/94‑1 (MQ=255)
aCCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATg > 2:9103228/1‑94 (MQ=255)
cATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACACTAACCCCGGCACATTCATGCCCg > 2:6030388/1‑94 (MQ=255)
aTCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCgg > 2:6257080/1‑94 (MQ=255)
gCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTaa < 1:7849913/94‑1 (MQ=255)
ccGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAAt < 2:5515055/94‑1 (MQ=255)
ccGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAAt < 2:2018752/94‑1 (MQ=255)
cGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATg < 1:730336/94‑1 (MQ=255)
gTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGAc > 1:4727044/1‑94 (MQ=255)
gTTGCAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGAc > 2:8504013/1‑94 (MQ=255)
cAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTCATGACCGga > 1:9952537/1‑94 (MQ=255)
cAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGga > 2:5303785/1‑94 (MQ=255)
cAATACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGga > 2:4337812/1‑94 (MQ=255)
aaTACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGgat > 1:5671370/1‑94 (MQ=255)
aTACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGgatg < 1:9720761/94‑1 (MQ=255)
tACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGgatgt > 1:2810843/1‑93 (MQ=255)
tACAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGgatga > 2:4903553/1‑94 (MQ=255)
cAAAACGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGAtt < 1:6643234/94‑1 (MQ=255)
aaaaCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGAttt > 2:6517956/1‑94 (MQ=255)
aaaCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGAtttt > 1:7798303/1‑94 (MQ=255)
aaaCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGAtttt < 1:6997612/94‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTc > 2:5930648/1‑94 (MQ=255)
aCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCt > 2:7092726/1‑94 (MQ=255)
aCGCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCt < 2:4662339/94‑1 (MQ=255)
gCTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTaa > 1:1515853/1‑94 (MQ=255)
cTGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTaaa > 1:5589209/1‑94 (MQ=255)
tGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTAAAt < 2:8976043/94‑1 (MQ=255)
tGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTAAAt < 2:5581354/94‑1 (MQ=255)
tGGC‑CTTTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTAAAt > 1:6402158/1‑94 (MQ=255)
|
TATAAGTGGCATTGCCGCCAAAATATTCGTAGCTGTAGCCCGCTGAATATCCGCTTGGTAACCCCATCGCCGGTTGCAATACAAAACGCTGGC‑C‑TTTTTATATTTGCCAGTGAGATTTTTACCCACTTCGACAATAACCCCGGCACATTCATGCCCGGTAATGACCGGATGATTTTCTAAAT > NC_000913/3075122‑3075303
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > NC_000913/3077424‑3077607
|
atctctgatctAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCAT < SRR4302545.1231845/83‑1 (MQ=60)
ATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCAT < SRR4302545.3613956/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATAT < SRR4302545.1075957/94‑1 (MQ=60)
GAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATC < SRR4302545.9712806/94‑1 (MQ=60)
CAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTG > SRR4302545.3144200/1‑94 (MQ=60)
GGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGAT > SRR4302545.5266436/1‑94 (MQ=60)
GGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGAT < SRR4302545.1341378/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATG < SRR4302545.2187399/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATG > SRR4302545.8613484/1‑94 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATG < SRR4302545.59474/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATA < SRR4302545.9411066/94‑1 (MQ=60)
GAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGC < SRR4302545.4585700/94‑1 (MQ=60)
GAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGC < SRR4302545.9258817/94‑1 (MQ=60)
AAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCA < SRR4302545.1589664/94‑1 (MQ=60)
AACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCAT > SRR4302545.10536412/1‑94 (MQ=60)
AACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCAT < SRR4302545.8883339/94‑1 (MQ=60)
AACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCAT > SRR4302545.2831962/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATAT > SRR4302545.7002462/1‑94 (MQ=60)
CCGGTATTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATAT < SRR4302545.964170/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATT < SRR4302545.592266/94‑1 (MQ=60)
CGGGGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATTGTGATGCATATT > SRR4302545.9667355/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTA > SRR4302545.7521164/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTA > SRR4302545.7521163/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACA < SRR4302545.9268931/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACA < SRR4302545.9268930/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACA < SRR4302545.7276917/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACAT < SRR4302545.7731489/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACAT < SRR4302545.7731488/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACAT < SRR4302545.6515126/94‑1 (MQ=60)
TTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATA < SRR4302545.6807854/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAA < SRR4302545.4461841/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAA < SRR4302545.2721586/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAA < SRR4302545.6854732/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAA < SRR4302545.3914393/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAA < SRR4302545.6784296/94‑1 (MQ=60)
TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAAT < SRR4302545.5386558/94‑1 (MQ=60)
GAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTG < SRR4302545.7004155/94‑1 (MQ=60)
GAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTG < SRR4302545.6889528/94‑1 (MQ=60)
GAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTG < SRR4302545.3630881/94‑1 (MQ=60)
AAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCATTA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGA > SRR4302545.9564640/1‑94 (MQ=60)
AAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGA < SRR4302545.10550126/94‑1 (MQ=60)
AAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAT > SRR4302545.3662651/1‑94 (MQ=60)
AAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAT < SRR4302545.7760013/94‑1 (MQ=60)
AAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGAT > SRR4302545.8280617/1‑94 (MQ=60)
AACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATA < SRR4302545.3799339/94‑1 (MQ=60)
AACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATA < SRR4302545.3628988/94‑1 (MQ=60)
AACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATA < SRR4302545.6113339/94‑1 (MQ=60)
ACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATAT < SRR4302545.7996248/94‑1 (MQ=60)
CAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATT > SRR4302545.2511014/1‑94 (MQ=60)
CAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATT > SRR4302545.10460046/1‑94 (MQ=60)
AAGTGAATTCTTACTTTCTTATATAACATTGAGCTTTAGATATAACAACCAATGACAATA‑CGCATCTCGCGATGAACATTTCATAATTGATATT > SRR4302545.4574004/1‑94 (MQ=18)
AGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTT < SRR4302545.10085895/94‑1 (MQ=60)
AGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTT < SRR4302545.1153697/94‑1 (MQ=60)
AGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTT > SRR4302545.6566824/1‑94 (MQ=60)
AGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTT > SRR4302545.2049885/1‑94 (MQ=60)
GTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTA > SRR4302545.5706661/1‑94 (MQ=60)
GTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTA > SRR4302545.5447267/1‑94 (MQ=60)
GTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTA > SRR4302545.7361054/1‑94 (MQ=60)
GTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTA > SRR4302545.3590721/1‑94 (MQ=60)
GAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATT < SRR4302545.1599414/94‑1 (MQ=60)
GAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATT > SRR4302545.3040183/1‑94 (MQ=60)
AATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTG < SRR4302545.3240474/94‑1 (MQ=60)
AATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTG < SRR4302545.1078168/94‑1 (MQ=60)
ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC > SRR4302545.3964552/1‑94 (MQ=60)
ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC < SRR4302545.1278272/94‑1 (MQ=60)
ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC > SRR4302545.1368194/1‑94 (MQ=60)
ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC > SRR4302545.3964555/1‑94 (MQ=60)
ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC < SRR4302545.2317556/94‑1 (MQ=60)
TTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCA < SRR4302545.1374673/94‑1 (MQ=60)
TTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCA < SRR4302545.4318143/94‑1 (MQ=60)
TATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAT < SRR4302545.6317660/94‑1 (MQ=60)
TATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAT < SRR4302545.2577580/94‑1 (MQ=60)
TATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAT < SRR4302545.2112912/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATA < SRR4302545.7304182/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATA < SRR4302545.10612437/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATAT > SRR4302545.736998/1‑94 (MQ=60)
AATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAA < SRR4302545.7223943/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAA > SRR4302545.478984/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAA < SRR4302545.5030210/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAA < SRR4302545.9327016/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAA > SRR4302545.478982/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAA < SRR4302545.38072/94‑1 (MQ=60)
TTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATA > SRR4302545.1074002/1‑94 (MQ=60)
TTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATA > SRR4302545.3343938/1‑94 (MQ=60)
TTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATA > SRR4302545.2819046/1‑94 (MQ=60)
TTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATA > SRR4302545.4363904/1‑94 (MQ=60)
TTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTT > SRR4302545.10884231/1‑94 (MQ=60)
TTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTT > SRR4302545.4076802/1‑94 (MQ=60)
TATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTG > SRR4302545.1860850/1‑94 (MQ=60)
TATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTG > SRR4302545.6216685/1‑94 (MQ=60)
TATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTG > SRR4302545.1860849/1‑94 (MQ=60)
TATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTG < SRR4302545.10272114/94‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTG < SRR4302545.1605546/94‑1 (MQ=60)
ATATACCATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATAT‑AATATTTGCG > SRR4302545.4899660/1‑94 (MQ=60)
ATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGT > SRR4302545.5794844/1‑94 (MQ=60)
ATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGG > SRR4302545.4899661/1‑94 (MQ=60)
TATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTG > SRR4302545.10874208/1‑94 (MQ=60)
TATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTG < SRR4302545.813056/94‑1 (MQ=60)
ATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGA > SRR4302545.3778960/1‑94 (MQ=60)
TAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAT > SRR4302545.9067833/1‑94 (MQ=60)
TAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAT < SRR4302545.10419916/94‑1 (MQ=60)
AACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATC > SRR4302545.4656129/1‑94 (MQ=60)
AACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATC > SRR4302545.833895/1‑94 (MQ=60)
AACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATC > SRR4302545.9744895/1‑94 (MQ=60)
AACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATC < SRR4302545.9036491/94‑1 (MQ=60)
ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCT < SRR4302545.10521178/94‑1 (MQ=60)
ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCT > SRR4302545.898899/1‑94 (MQ=60)
ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCT < SRR4302545.81526/94‑1 (MQ=60)
ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCT < SRR4302545.589636/94‑1 (MQ=60)
ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCT < SRR4302545.10521177/94‑1 (MQ=60)
CATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTA < SRR4302545.8050069/94‑1 (MQ=60)
CATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTA < SRR4302545.8050068/94‑1 (MQ=60)
CATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTA > SRR4302545.627408/1‑94 (MQ=60)
CATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTA > SRR4302545.3912543/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTAC > SRR4302545.7959899/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTCATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACA < SRR4302545.676915/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAA > SRR4302545.1699056/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAA > SRR4302545.7602029/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAA > SRR4302545.7602030/1‑94 (MQ=60)
GAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAAC > SRR4302545.5759070/1‑94 (MQ=60)
AGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACA > SRR4302545.3983069/1‑94 (MQ=60)
AGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACA > SRR4302545.9826387/1‑94 (MQ=60)
AGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACA > SRR4302545.5213093/1‑94 (MQ=60)
AGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACA < SRR4302545.3160738/94‑1 (MQ=60)
GTTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACAC < SRR4302545.1816874/94‑1 (MQ=60)
TTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTTTTTCATATTAATATTTttttttttaaaaaat > SRR4302545.8572697/1‑79 (MQ=60)
TTATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACG < SRR4302545.10747601/94‑1 (MQ=60)
TATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGC > SRR4302545.1701533/1‑94 (MQ=60)
TATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGC > SRR4302545.5617080/1‑94 (MQ=60)
ATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCC > SRR4302545.719784/1‑94 (MQ=60)
ATAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCC > SRR4302545.6524629/1‑94 (MQ=60)
TAGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCT > SRR4302545.7921150/1‑94 (MQ=60)
AGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTT > SRR4302545.9343109/1‑94 (MQ=60)
AGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTT > SRR4302545.9378201/1‑94 (MQ=60)
AGATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTT < SRR4302545.2016719/94‑1 (MQ=60)
GATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTA > SRR4302545.4225213/1‑94 (MQ=60)
ATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACGACACGCCTTAT < SRR4302545.4513715/94‑1 (MQ=60)
ATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTAT > SRR4302545.4734407/1‑94 (MQ=60)
ATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTAT > SRR4302545.6101402/1‑94 (MQ=60)
ATATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTAT > SRR4302545.259296/1‑94 (MQ=60)
TATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATC > SRR4302545.9623403/1‑94 (MQ=60)
TATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATC > SRR4302545.9153120/1‑94 (MQ=60)
TATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATC < SRR4302545.7322853/94‑1 (MQ=60)
ATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCT < SRR4302545.7629893/94‑1 (MQ=60)
ATAACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCT > SRR4302545.3533431/1‑94 (MQ=60)
AACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAT < SRR4302545.5205539/94‑1 (MQ=60)
AACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTAT > SRR4302545.3591789/1‑94 (MQ=60)
ACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATT < SRR4302545.6503684/94‑1 (MQ=60)
ACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATT > SRR4302545.9213436/1‑94 (MQ=60)
ACAACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATT < SRR4302545.1293997/94‑1 (MQ=60)
AACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGC > SRR4302545.7923089/1‑94 (MQ=60)
AACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGC > SRR4302545.8921143/1‑94 (MQ=60)
ACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATTTAAATATTTGTGATGTACAACACGCCTTATCTATTGCT > SRR4302545.5983416/1‑94 (MQ=60)
ACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCT > SRR4302545.9939785/1‑94 (MQ=60)
ACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCT < SRR4302545.7727140/94‑1 (MQ=60)
ACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCT > SRR4302545.1442585/1‑94 (MQ=60)
ACAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCT > SRR4302545.10665873/1‑94 (MQ=60)
CAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTT > SRR4302545.6730908/1‑94 (MQ=60)
CAAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTT > SRR4302545.7993247/1‑94 (MQ=60)
AAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTG < SRR4302545.8519120/94‑1 (MQ=60)
AAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTG < SRR4302545.8519119/94‑1 (MQ=60)
AAATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTG > SRR4302545.1866795/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTC > SRR4302545.10552636/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTC > SRR4302545.3251887/1‑94 (MQ=60)
TGTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCC > SRR4302545.8263245/1‑94 (MQ=60)
GTCAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCG > SRR4302545.8457008/1‑94 (MQ=60)
CAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCA > SRR4302545.7857080/1‑94 (MQ=60)
CAATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCA > SRR4302545.9257454/1‑94 (MQ=60)
AATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAA > SRR4302545.10131752/1‑94 (MQ=60)
AATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAA > SRR4302545.8746592/1‑94 (MQ=60)
ATA‑CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAA < SRR4302545.6473336/94‑1 (MQ=60)
taCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAAC < SRR4302545.7481280/92‑1 (MQ=60)
taCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAAC < SRR4302545.1790467/92‑1 (MQ=60)
taCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAAC < SRR4302545.1790466/92‑1 (MQ=60)
ACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACG > SRR4302545.8912576/1‑94 (MQ=60)
ACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACG > SRR4302545.5268595/1‑94 (MQ=60)
ACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACG > SRR4302545.3994071/1‑94 (MQ=60)
ACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACG > SRR4302545.3375816/1‑94 (MQ=60)
CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > SRR4302545.4605552/1‑94 (MQ=60)
CGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGA > SRR4302545.9303775/1‑94 (MQ=60)
|
ATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACCGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > NC_000913/3077424‑3077607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
