Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,979,546 |
Δ1 bp |
coding (1047/1386 nt) |
yifK → |
putative amino acid/amine transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,979,545 | 0 | G | . | 99.9%
| 2962.1
/ ‑3.2
| 646 | coding (1046/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (376/269); minor base T (0/1); total (376/270) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01 |
Only 100 of 697 total aligned reads displayed.
GTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAT > NC_000913/3979453‑3979634
|
gTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTg < 2:6210955/94‑1 (MQ=255)
tACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaa > 2:1689679/1‑92 (MQ=255)
tACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaa > 1:4626065/1‑92 (MQ=255)
aCCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaac < 2:4915444/94‑4 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaact < 2:2391610/94‑5 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaact < 2:5071559/94‑5 (MQ=255)
cggcggCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCCCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 1:2607598/1‑94 (MQ=255)
cggcggCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 2:1311195/1‑94 (MQ=255)
cggcggCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 1:55243/1‑94 (MQ=255)
cggcggCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa < 2:7589300/94‑1 (MQ=255)
ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAc > 1:7194873/1‑94 (MQ=255)
cggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat > 2:3221936/1‑94 (MQ=255)
gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGGGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatct > 2:9346372/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatcatc > 2:3494934/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc > 2:4668443/1‑94 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc < 1:912452/94‑1 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc < 2:2729621/94‑1 (MQ=255)
ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTccc < 1:2879183/94‑1 (MQ=255)
gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa < 2:6476202/94‑1 (MQ=255)
cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa > 1:10213862/1‑94 (MQ=255)
cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa > 1:3491868/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt > 1:3924581/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt > 2:10380561/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt > 2:4316129/1‑94 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt < 1:8747400/94‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCGTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc > 2:5778023/1‑94 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 1:4201694/94‑1 (MQ=255)
gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc > 1:6051799/1‑94 (MQ=255)
tttCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa > 1:10452750/1‑94 (MQ=255)
ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgt < 1:9815825/94‑1 (MQ=255)
cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTTCTAATTGGCTCATGCCT‑TAACTACTTCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 1:9684745/1‑94 (MQ=255)
cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 2:6897622/1‑94 (MQ=255)
cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 2:2822917/1‑94 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgt > 1:2355564/1‑94 (MQ=255)
cACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 1:5638753/94‑1 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt > 1:796580/1‑94 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt > 1:622818/1‑94 (MQ=255)
ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTg > 2:3073959/1‑94 (MQ=255)
gCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt > 1:778410/1‑94 (MQ=255)
cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc < 1:928947/94‑1 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 2:8434359/94‑1 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 1:8605518/94‑1 (MQ=255)
aCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac > 2:9770385/1‑94 (MQ=255)
cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgt > 2:4487621/1‑94 (MQ=255)
cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgt > 1:2510579/1‑94 (MQ=255)
cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgt > 2:3612489/1‑94 (MQ=255)
ggTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc > 2:8017875/1‑94 (MQ=255)
gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct > 1:1819720/1‑94 (MQ=255)
gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct > 2:1949006/1‑94 (MQ=255)
ttGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtcta < 1:5346230/94‑1 (MQ=255)
gCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACa < 1:956557/94‑1 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg > 1:10605423/1‑94 (MQ=255)
gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGt < 2:639876/94‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTCCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGcc < 2:4094635/94‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa > 2:9027/1‑94 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa < 1:4854092/94‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa > 1:6535610/1‑94 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg > 1:4081619/1‑94 (MQ=255)
cAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 1:7006186/1‑94 (MQ=255)
cAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt < 2:6091675/94‑1 (MQ=255)
aGTATCTATTTCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg < 2:3805492/94‑1 (MQ=255)
gTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGc > 2:8159910/1‑94 (MQ=255)
gTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGc > 2:1392185/1‑94 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt < 1:10059988/94‑1 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt < 2:1123408/94‑1 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt > 2:2213807/1‑94 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc > 1:1034563/1‑94 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATACCT‑GTACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc > 2:257473/1‑94 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg > 2:3446130/1‑94 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg < 1:5169935/94‑1 (MQ=255)
aTTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 1:1441443/1‑94 (MQ=255)
tGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgggg > 1:136730/1‑94 (MQ=255)
cTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 2:859701/94‑1 (MQ=255)
cTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 2:5313398/94‑1 (MQ=255)
tATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 1:3371651/94‑1 (MQ=255)
tATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg > 2:5560252/1‑94 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg > 1:3750778/1‑94 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg > 2:4002151/1‑94 (MQ=255)
ttCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GTACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGt < 1:7583748/94‑1 (MQ=255)
ttCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATggc < 1:8937783/94‑2 (MQ=255)
cTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGCTGGTGc > 1:8100264/1‑94 (MQ=255)
tGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 1:1272181/1‑94 (MQ=255)
tGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 2:10044837/1‑94 (MQ=255)
gCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGTAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa < 1:6442435/94‑1 (MQ=255)
gtAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 2:9531424/93‑1 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCag > 2:8740798/1‑93 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt > 2:7286343/1‑94 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt > 1:7437860/1‑94 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt > 1:3242742/1‑94 (MQ=255)
tAATTGGCTCATGCCT‑GACCTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg < 2:920296/94‑1 (MQ=255)
tAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg > 1:5893351/1‑94 (MQ=255)
tAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg < 2:7152978/94‑1 (MQ=255)
attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGCGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGCGCCATGGt > 2:7846991/5‑94 (MQ=255)
gCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgt > 1:3064991/1‑94 (MQ=255)
cTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg > 1:2692376/1‑94 (MQ=255)
tCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGa > 1:8446987/1‑94 (MQ=255)
tCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGa > 1:6716650/1‑94 (MQ=255)
tCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGa < 1:2063254/94‑1 (MQ=255)
aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGata < 1:1659083/94‑1 (MQ=255)
aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCCCACGGGGGGTTTTTTTACGCTTAC‑GTGGCAGCCGGCCTCCGGGGGTGGGGCCCTTGTTTGTTattt > 2:8847324/1‑92 (MQ=255)
|
GTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAT > NC_000913/3979453‑3979634
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 279 total aligned reads displayed.
AGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAG > NC_000913/3980204‑3980390
|
AGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑C > SRR4302545.1163716/1‑94 (MQ=34)
AGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑C < SRR4302545.9596656/94‑1 (MQ=34)
AAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cct > SRR4302545.7289796/1‑92 (MQ=29)
AGTTGTGACAATGCGCAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTAAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctc > SRR4302545.1445947/1‑91 (MQ=24)
AGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctc < SRR4302545.8669083/94‑4 (MQ=27)
AGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctc < SRR4302545.10785793/94‑4 (MQ=27)
GTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCG < SRR4302545.9112148/94‑1 (MQ=23)
GTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCG > SRR4302545.7011295/1‑94 (MQ=22)
GTTGTGACAATGCGAAGGGGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCG < SRR4302545.2988679/94‑1 (MQ=22)
TTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGC > SRR4302545.9269912/1‑94 (MQ=20)
TGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCA > SRR4302545.8759659/1‑94 (MQ=14)
GTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCAC > SRR4302545.3527609/1‑94 (MQ=10)
TGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACC > SRR4302545.9063176/1‑94 (MQ=7)
TGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACC > SRR4302545.10485273/1‑94 (MQ=7)
ACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCAC < SRR4302545.1316349/94‑1 (MQ=5)
ACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCAC > SRR4302545.7102502/1‑94 (MQ=5)
ACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCAC > SRR4302545.3483336/1‑94 (MQ=5)
ACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGAGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCCTCTCGCACCAC > SRR4302545.8849844/1‑94 (MQ=4)
ACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTCACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCAC > SRR4302545.1905343/1‑94 (MQ=4)
CAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACG < SRR4302545.7315458/94‑1 (MQ=5)
CAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctcccaccccg > SRR4302545.4904680/1‑83 (MQ=1)
CAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctcccaccccg > SRR4302545.573897/1‑83 (MQ=1)
AATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGA > SRR4302545.3330045/1‑94 (MQ=5)
AATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGA > SRR4302545.2961484/1‑94 (MQ=5)
AATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGA > SRR4302545.7619379/1‑94 (MQ=5)
AATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC > SRR4302545.2868101/1‑94 (MQ=8)
AATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cccccccccccgc > SRR4302545.9707969/1‑82 (MQ=0)
ATGCTAAGGTGGCGGAATGGGTAGGCGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC < SRR4302545.9908430/94‑1 (MQ=3)
ATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC < SRR4302545.4293314/94‑1 (MQ=5)
ATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC < SRR4302545.2040916/94‑1 (MQ=5)
ATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC < SRR4302545.4925522/94‑1 (MQ=5)
ATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctcccaccccgcc > SRR4302545.8160140/1‑81 (MQ=0)
ATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGCTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGAC > SRR4302545.4830100/1‑94 (MQ=4)
TGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACT < SRR4302545.6948160/94‑1 (MQ=7)
TGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACT < SRR4302545.4356982/94‑1 (MQ=7)
GCGAGGGTGGAGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGCACGTGGGGGTTGAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCCCCACGACTT < SRR4302545.3737574/94‑1 (MQ=0)
GCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCCA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctcccaccaccacct > SRR4302545.211266/1‑79 (MQ=0)
GCGAAGGGGGGTGAATTGGTAGACGGGCTAGTTTCAGGTGTTAGTTTCTTTACGGACGTGGGGTTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTT < SRR4302545.7639322/94‑1 (MQ=42)
CGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTT > SRR4302545.5509667/1‑94 (MQ=9)
CGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTT > SRR4302545.7349930/1‑94 (MQ=12)
CGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CCCGCACCACGACTTT > SRR4302545.6821691/1‑94 (MQ=2)
GAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTA < SRR4302545.4572346/94‑1 (MQ=20)
GAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cccggccccattatcttt > SRR4302545.9443028/1‑77 (MQ=0)
GAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctccccccccaacttta > SRR4302545.2593980/1‑77 (MQ=0)
GAAGGGGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTA < SRR4302545.8710477/94‑1 (MQ=19)
AGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAA < SRR4302545.1190498/94‑1 (MQ=25)
GGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGA < SRR4302545.1268650/94‑1 (MQ=31)
GTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAG < SRR4302545.8392151/94‑1 (MQ=26)
TGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CCCGCACCACGACTTTAAAAAA > SRR4302545.2832302/1‑94 (MQ=8)
CGGAATTGGTAGACGCGGTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTGACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTG < SRR4302545.5543190/94‑1 (MQ=36)
CGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTG < SRR4302545.2989321/94‑1 (MQ=39)
CGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTG > SRR4302545.1070500/1‑94 (MQ=39)
CGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTG < SRR4302545.4825774/94‑1 (MQ=39)
GGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CCCGCACCCCGACTTTAAAAAATTGA > SRR4302545.323804/1‑94 (MQ=1)
GAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAA < SRR4302545.5521161/94‑1 (MQ=44)
AATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAC > SRR4302545.1003923/1‑94 (MQ=47)
AATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAC < SRR4302545.2257661/94‑1 (MQ=47)
ATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAAAATTGAACT > SRR4302545.1872822/1‑94 (MQ=35)
TTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑A < SRR4302545.2955055/94‑1 (MQ=51)
TTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑A‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AA > SRR4302545.10603841/1‑94 (MQ=55)
TTGGTAGACCCCCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTGCGGACGTGGGGTTTCAA‑GA‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑A < SRR4302545.10444738/94‑1 (MQ=41)
GGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAA < SRR4302545.7706695/94‑1 (MQ=56)
GGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAA < SRR4302545.406581/94‑1 (MQ=56)
GTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAA < SRR4302545.3459093/94‑1 (MQ=59)
GTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAA > SRR4302545.675683/1‑94 (MQ=59)
GTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAA > SRR4302545.5066164/1‑94 (MQ=59)
AGACGGGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAAT < SRR4302545.4971339/94‑1 (MQ=60)
GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATT < SRR4302545.10619947/94‑1 (MQ=60)
GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATT > SRR4302545.3136157/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTC < SRR4302545.5098955/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCA < SRR4302545.3829207/94‑1 (MQ=60)
GCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAA > SRR4302545.3177247/1‑94 (MQ=60)
CGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAA > SRR4302545.1918057/1‑94 (MQ=60)
CGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAA > SRR4302545.7382568/1‑94 (MQ=60)
CGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATAGAACT‑AAAAATTCAAA < SRR4302545.10785866/94‑1 (MQ=60)
CGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑CACCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAA < SRR4302545.8834241/94‑1 (MQ=60)
CGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTTAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cctcccaccccgccttttaaaaaattaaataaaaaattaaa > SRR4302545.344704/1‑54 (MQ=0)
CGCTAGCTTCAGGTGTAAGTCGCCTTGCGGGCGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAA < SRR4302545.8556026/94‑1 (MQ=60)
GCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAACA > SRR4302545.10343172/1‑94 (MQ=60)
GCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTAGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAA > SRR4302545.9329495/1‑94 (MQ=60)
CTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGCCTTTTAAGAATTGAACTAAAAAATTCAAAA > SRR4302545.372673/1‑94 (MQ=31)
CTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAA < SRR4302545.6613471/94‑1 (MQ=60)
CTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAA < SRR4302545.7532711/94‑1 (MQ=60)
cagatcaaggtgctagcGTCCTTGCGGACGTGGCGGTACAA‑G‑‑A‑‑‑C‑CAC‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGCATTGAGCT‑AAAAATTCAAAAAG < SRR4302545.6964375/77‑1 (MQ=38)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAG < SRR4302545.4723657/94‑1 (MQ=60)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAG < SRR4302545.8443964/94‑1 (MQ=60)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAG < SRR4302545.7632524/94‑1 (MQ=60)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAG > SRR4302545.964494/1‑94 (MQ=60)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATCCAAAAAG < SRR4302545.2418481/94‑1 (MQ=60)
TAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGC < SRR4302545.5830595/94‑1 (MQ=60)
gcgcgagcgtcagttggtatttgccgtacgtacgtggtgtttcaagtcC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACG‑AAAAATTCAA < SRR4302545.8366440/46‑1 (MQ=60)
agtagtattgtattttgttgttgtcatccggggggggttttaaaagccC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAA < SRR4302545.9477317/46‑1 (MQ=60)
TGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGC < SRR4302545.4606848/94‑1 (MQ=60)
AGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGC > SRR4302545.3182329/1‑94 (MQ=60)
AGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCA > SRR4302545.10267651/1‑94 (MQ=60)
GCTTCAGGTTTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCA < SRR4302545.8825072/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCA < SRR4302545.5846141/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCA < SRR4302545.170784/94‑1 (MQ=60)
GCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAATAAAAAATTCAAAAAca > SRR4302545.9967755/1‑92 (MQ=46)
CTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT < SRR4302545.1102966/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT < SRR4302545.9642587/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT < SRR4302545.5642066/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT > SRR4302545.10938382/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT < SRR4302545.10349743/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTA < SRR4302545.6479985/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCGA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cccccccccacaattttttttttcttttttttttttttttttttttttt > SRR4302545.2085792/1‑46 (MQ=0)
CAGGTGTTAGTTTCCTTCCGGCCGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTAT < SRR4302545.2392989/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTAT > SRR4302545.9242226/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCCA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑Cccccccccaatatcttttttttctttcttttttttttctttgttttttt > SRR4302545.9885125/1‑45 (MQ=0)
AGGTTTTAGTTTCCTTACGGACGGTGGGGTTCAA‑GGCC‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTAT < SRR4302545.7963417/94‑1 (MQ=60)
AGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCGCGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATT < SRR4302545.3499320/94‑1 (MQ=60)
GGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTT < SRR4302545.4159687/94‑1 (MQ=60)
GGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTT < SRR4302545.9007905/94‑1 (MQ=60)
cttcggtgtttatgttcctaacggcgttggggattaaagaC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGT < SRR4302545.9077579/54‑1 (MQ=60)
GTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTC < SRR4302545.8045450/94‑1 (MQ=60)
GTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTC > SRR4302545.7434194/1‑94 (MQ=60)
GTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑CGCCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTC > SRR4302545.1265908/1‑94 (MQ=60)
gtTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTC < SRR4302545.5878434/92‑1 (MQ=60)
TGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCG < SRR4302545.5631978/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCG < SRR4302545.3417072/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCG < SRR4302545.2388324/94‑1 (MQ=60)
TGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TA‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAAGTCAACAAGCAGTATTTCG > SRR4302545.1891971/1‑94 (MQ=60)
TGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CCCGCACCACGACTTTAAAAAAATTAACT‑AAAAAATCAAAAAACAGGATTTTG > SRR4302545.404501/1‑94 (MQ=15)
GGTTAGTGTCCTTACGGGCGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCG < SRR4302545.4280685/94‑1 (MQ=60)
taggtgtgagtatcattacgggctgggggtttcaaggcC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATACAAAAAGCAGTAT < SRR4302545.4363277/56‑1 (MQ=60)
GTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCG < SRR4302545.639002/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGG > SRR4302545.9020417/1‑94 (MQ=60)
TTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGG‑‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGC < SRR4302545.6596458/94‑1 (MQ=60)
TTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGC < SRR4302545.6520461/94‑1 (MQ=60)
AGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCCCC‑C‑C‑CCCC‑CCCCCACCAGGACCTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGGATTTCGGC > SRR4302545.5253681/1‑94 (MQ=38)
AGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGA < SRR4302545.4036410/94‑1 (MQ=60)
GTGTCCTTACGGACGTGTGGGTTCAA‑G‑‑TG‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCCCACCACTAGTTTAAAAAATTGAACT‑AAAAATTTAAAAAGCAGTATTTCGGCGAG > SRR4302545.10702543/1‑94 (MQ=60)
TGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGT > SRR4302545.3556652/1‑94 (MQ=60)
GTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTA > SRR4302545.597461/1‑94 (MQ=60)
GTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTA > SRR4302545.3943795/1‑94 (MQ=60)
GTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTA < SRR4302545.3605391/94‑1 (MQ=60)
TCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGC < SRR4302545.6301528/94‑1 (MQ=60)
CCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGC < SRR4302545.2102605/94‑1 (MQ=60)
CCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGC < SRR4302545.2814203/94‑1 (MQ=60)
CTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑GCCC‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGC < SRR4302545.5972828/94‑1 (MQ=60)
TTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGC > SRR4302545.4828788/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCA < SRR4302545.6080838/94‑1 (MQ=60)
ACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAG < SRR4302545.1312997/94‑1 (MQ=60)
ACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAG > SRR4302545.9403610/1‑94 (MQ=60)
ACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAG < SRR4302545.6548460/94‑1 (MQ=60)
CGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGC > SRR4302545.10628756/1‑94 (MQ=60)
GGACGTGGGGGTTCAA‑GC‑C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCT < SRR4302545.8304873/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCCGC > SRR4302545.7021824/1‑94 (MQ=60)
GGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCT < SRR4302545.9782356/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCT > SRR4302545.1737933/1‑94 (MQ=60)
GACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTT > SRR4302545.3327020/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTG < SRR4302545.471030/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTG < SRR4302545.9361393/94‑1 (MQ=60)
CGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGG < SRR4302545.8073480/94‑1 (MQ=60)
CGTGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGG > SRR4302545.5379046/1‑94 (MQ=60)
CGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTTAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCTGCGAGTAGCGCAGCTTGGT > SRR4302545.3147195/1‑94 (MQ=60)
GTGGGTGTTCAA‑GACC‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAACGCAGCTTGG < SRR4302545.7238278/94‑1 (MQ=60)
TGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTA > SRR4302545.10075747/1‑94 (MQ=60)
TGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTA < SRR4302545.2215463/94‑1 (MQ=60)
TGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTA < SRR4302545.3950474/94‑1 (MQ=60)
TGGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAACAGTATTTTGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTA > SRR4302545.4151430/1‑94 (MQ=60)
GGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAG < SRR4302545.8279881/94‑1 (MQ=60)
GGGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAG < SRR4302545.8279880/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCACACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGC < SRR4302545.144965/94‑1 (MQ=60)
gtcgtgttggtttaagtttC‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAATT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTACTGTGATTAGCGCAGCTTG > SRR4302545.9683754/20‑94 (MQ=60)
GGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGC > SRR4302545.6380271/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGC < SRR4302545.1377679/94‑1 (MQ=60)
GTTCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCA > SRR4302545.1195005/1‑94 (MQ=60)
TCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAAC < SRR4302545.2550797/94‑1 (MQ=60)
TCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAAC < SRR4302545.8579616/94‑1 (MQ=60)
TCAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAAATCAAAAAGCAGTATTTTGGCGAGTAGCGCAGCTTTGTAGCGCAAC > SRR4302545.3957310/1‑94 (MQ=60)
TCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACT < SRR4302545.7918460/94‑1 (MQ=60)
CAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACT < SRR4302545.681147/94‑1 (MQ=60)
CAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACT < SRR4302545.4363333/94‑1 (MQ=60)
CAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACT < SRR4302545.5357453/94‑1 (MQ=60)
CAA‑G‑‑TC‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCACACCCCGACTTTAAAGAATTGAACT‑CAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGAGCAGCTTGGTAGCGgcact > SRR4302545.4629885/1‑89 (MQ=60)
CAA‑G‑‑T‑‑‑CGC‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACT < SRR4302545.3145133/94‑1 (MQ=60)
AA‑G‑‑TCC‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTTAAAC‑AAAAATTCAAAAAGCAGCATTTCGGCCAGTAGCGCcggcttgtagcgcaacc > SRR4302545.717579/1‑77 (MQ=55)
aggcC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGG < SRR4302545.7986263/90‑1 (MQ=60)
agccC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGG < SRR4302545.9390772/90‑1 (MQ=60)
C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTT < SRR4302545.1666990/94‑1 (MQ=60)
C‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTT < SRR4302545.1691868/94‑1 (MQ=60)
tcC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTGTTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTT < SRR4302545.3862955/92‑1 (MQ=60)
tcC‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTT < SRR4302545.9775773/92‑1 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTTAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG > SRR4302545.630953/1‑94 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG < SRR4302545.2012641/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG < SRR4302545.8290313/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG > SRR4302545.9210219/1‑94 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGCATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG < SRR4302545.932872/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACC‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTG < SRR4302545.8523376/94‑1 (MQ=60)
C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGG < SRR4302545.504232/94‑1 (MQ=60)
C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGG > SRR4302545.7499790/1‑94 (MQ=60)
C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGA > SRR4302545.2291890/1‑94 (MQ=60)
CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGA < SRR4302545.7709598/94‑1 (MQ=60)
CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGGTTGGGA > SRR4302545.8859073/1‑94 (MQ=60)
CCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGAC > SRR4302545.6808883/1‑94 (MQ=60)
CCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGAC > SRR4302545.10867440/1‑94 (MQ=60)
CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTGGCGCAACTGGTTTGGGACCAG < SRR4302545.5354983/94‑1 (MQ=60)
CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAG > SRR4302545.5280860/1‑94 (MQ=60)
CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAG > SRR4302545.10090138/1‑94 (MQ=60)
|
AGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAA‑G‑‑T‑‑‑C‑C‑C‑CCCC‑CTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACT‑AAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAG > NC_000913/3980204‑3980390
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |