Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,620,440 |
T→C |
M368T (ATG→ACG) |
yjjJ → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,620,440 | 0 | T | C | 98.9%
| 1781.4
/ 1.6
| 526 | M368T (ATG→ACG) | yjjJ | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/2); new base C (268/252); total (272/254) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
Only 100 of 533 total aligned reads displayed.
ATCGCCAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGATGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGTTAAC > NC_000913/4620349‑4620530
|
tCGCCAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGt > 1:2141562/1‑94 (MQ=255)
tCGCCAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGt < 1:8347410/94‑1 (MQ=255)
ccAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTa < 1:4071293/94‑1 (MQ=255)
ccAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTa < 1:2762711/94‑1 (MQ=255)
cAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTAt < 2:6761008/94‑1 (MQ=255)
cAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTAt < 2:4060370/94‑1 (MQ=255)
cAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTAt < 2:2948953/94‑1 (MQ=255)
cAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTAt > 2:2043386/1‑94 (MQ=255)
caCAGCTATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACCCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATg < 2:3078983/93‑1 (MQ=255)
aaCAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATg > 1:3633398/1‑94 (MQ=255)
aaCAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATg < 1:2462161/94‑1 (MQ=255)
aCAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGc > 2:3173480/1‑94 (MQ=255)
cAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCa > 1:8566027/1‑94 (MQ=255)
aGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCAc > 2:1806188/1‑94 (MQ=255)
cGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCa < 2:9146465/94‑1 (MQ=255)
atatGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCaaa > 1:3075880/1‑94 (MQ=255)
atatGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCaaa > 1:10033739/1‑94 (MQ=255)
atGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACa > 2:10361018/1‑94 (MQ=255)
atGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACa > 2:5217085/1‑94 (MQ=255)
tGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAg > 2:7503666/1‑94 (MQ=255)
cACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAgcg > 1:10316542/1‑94 (MQ=255)
aCGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAgcgc > 2:8042009/1‑94 (MQ=255)
cGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCt > 1:4820374/1‑94 (MQ=255)
gCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTg > 2:6137029/1‑94 (MQ=255)
aGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGa > 2:8876743/1‑94 (MQ=255)
aGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGa < 1:7788570/94‑1 (MQ=255)
aGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGa > 1:7004513/1‑94 (MQ=255)
aGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGa > 1:1748053/1‑94 (MQ=255)
ggTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGaa > 2:158115/1‑94 (MQ=255)
gTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGCAt > 2:4335214/1‑94 (MQ=255)
aaTTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgc > 2:7258589/1‑94 (MQ=255)
aaTTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgc > 2:5129122/1‑94 (MQ=255)
aTTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgct > 1:5223136/1‑94 (MQ=255)
tttATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgctg < 2:2360825/94‑1 (MQ=255)
ttATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgctgc < 2:2699722/94‑1 (MQ=255)
cGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCCAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGa > 1:5846572/1‑94 (MQ=255)
cGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGa < 1:79140/94‑1 (MQ=255)
cttttATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAt < 2:1374833/93‑1 (MQ=255)
ttttATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtg > 1:10573871/1‑94 (MQ=255)
ttatttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGATGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgct < 1:2033584/94‑1 (MQ=255)
ttatttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgct < 1:769584/94‑1 (MQ=255)
ttatttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgct < 2:8687713/94‑1 (MQ=255)
ttatttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgct > 2:4490378/1‑94 (MQ=255)
tatttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgctg < 2:6941/94‑1 (MQ=255)
ttttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgctgc < 2:7705366/93‑1 (MQ=255)
atttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgctgc > 2:2522780/1‑94 (MQ=255)
atttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGAtgctgc > 1:6255240/1‑94 (MQ=255)
tttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGcc < 2:5745635/94‑1 (MQ=255)
ttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCa < 1:883592/94‑1 (MQ=255)
ttatCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCa < 1:6581750/94‑1 (MQ=255)
atCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAAtgctg < 1:3351697/79‑1 (MQ=255)
atCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCAtt < 1:8892472/94‑1 (MQ=255)
atCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCAtt < 1:4228457/94‑1 (MQ=255)
cTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGa < 2:3911443/94‑1 (MQ=255)
tGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAg > 2:8567366/1‑94 (MQ=255)
gAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAgg < 1:6462743/94‑1 (MQ=255)
aCCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTg > 1:6847902/1‑94 (MQ=255)
aCCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTg < 1:2321739/94‑1 (MQ=255)
ccGGCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGGCGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGa < 2:3836111/94‑1 (MQ=255)
ccGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGGACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGa > 1:5429246/1‑94 (MQ=255)
ccGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGa > 2:2735974/1‑94 (MQ=255)
ccGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGa > 2:9298868/1‑94 (MQ=255)
ccGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGa > 1:6611652/1‑94 (MQ=255)
cGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGaa > 2:2180825/1‑94 (MQ=255)
cGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGaa > 2:10241775/1‑94 (MQ=255)
gCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAg > 2:5577080/1‑94 (MQ=255)
ccATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGt > 2:6453742/1‑94 (MQ=255)
ccATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGt > 1:3510193/1‑94 (MQ=255)
cATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGtt > 2:10510315/1‑94 (MQ=255)
aTTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGttt > 1:5968747/1‑94 (MQ=255)
aTTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGttt > 1:9047323/1‑94 (MQ=255)
tttGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTg < 2:4816035/94‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTg < 1:1852592/94‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGACCCCCGTCTACGACATGCTGGCGACGGTCGATGCACCAAACAGCTCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGa < 1:5060136/94‑1 (MQ=255)
tGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGAt < 1:7330437/94‑1 (MQ=255)
cgcTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCt > 1:5316605/1‑94 (MQ=255)
gcTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGACTGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCtt > 1:3822090/1‑94 (MQ=255)
gcTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCtt < 2:3508527/94‑1 (MQ=255)
gACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAAc < 1:9850401/94‑1 (MQ=255)
cGCCCGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGt < 1:2887404/94‑1 (MQ=255)
ccGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAg < 1:753393/94‑1 (MQ=255)
ccGTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAg > 2:9732248/1‑94 (MQ=255)
gTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTa > 2:5360999/1‑94 (MQ=255)
gTCTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTa > 1:5639971/1‑94 (MQ=255)
cTACGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTaaa > 1:1205920/1‑94 (MQ=255)
aCGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAg < 1:9560179/94‑1 (MQ=255)
aCGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAg < 2:6349147/94‑1 (MQ=255)
cGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgc < 2:4951969/94‑1 (MQ=255)
cGACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgc < 2:8223733/94‑1 (MQ=255)
gACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgcg > 1:10198987/1‑94 (MQ=255)
gACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgcg < 2:4656389/94‑1 (MQ=255)
gACATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgcg < 1:9253511/94‑1 (MQ=255)
aCATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgcgc > 1:7200063/1‑94 (MQ=255)
aCATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAgcgc > 2:9619078/1‑94 (MQ=255)
cATGCTGCCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCt < 1:9696769/94‑1 (MQ=255)
ctgcCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGt > 1:8738936/1‑94 (MQ=255)
tgcCGCCGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGtt < 2:6617473/94‑1 (MQ=255)
tgcCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGtt < 2:3587250/94‑1 (MQ=255)
gcCGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGTTa < 1:4454154/94‑1 (MQ=255)
cGACGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGTTAAc < 1:1525775/94‑1 (MQ=255)
|
ATCGCCAACAGCGATATGCACGCAGGTAATTTATCGTTTTATTTATCTGAACCGCCATTTGCGCTGACGCCCGTCTACGACATGCTGCCGATGGTCTATGCACCAAACAGCGCTGGAATGCTGCGTGATGCTGCCATTGAGGTGAAGTTTGATCTTAACGTCAGTAAAAGCGCTTGGTTAAC > NC_000913/4620349‑4620530
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
