Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 285 total aligned reads displayed.
GCAGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCCGCTTCGCCAGAGGCCACTTTCGTTGAACGAATGTAGT > NC_000913/3312244‑3312430
|
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AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTC > SRR4302545.4448290/1‑94 (MQ=60)
AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTC < SRR4302545.10850144/94‑1 (MQ=60)
AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTC < SRR4302545.9314318/94‑1 (MQ=60)
AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTC < SRR4302545.6649395/94‑1 (MQ=60)
AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTC < SRR4302545.9314321/94‑1 (MQ=60)
AGCAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATC > SRR4302545.746024/1‑94 (MQ=60)
CAACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAATGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCAT < SRR4302545.6876063/94‑1 (MQ=60)
AACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATG > SRR4302545.2570397/1‑94 (MQ=60)
AACAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATG < SRR4302545.2410587/94‑1 (MQ=60)
CAACCAGGCCTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCC < SRR4302545.2902958/94‑1 (MQ=60)
CAACCAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCC < SRR4302545.10892036/94‑1 (MQ=60)
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CCAGGACTACCATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGCGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTT > SRR4302545.5162345/1‑94 (MQ=60)
CAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTT > SRR4302545.8335984/1‑94 (MQ=60)
CAGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCAAGGAAGGTGGTCATGCCGTTT < SRR4302545.4095603/94‑1 (MQ=60)
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AGGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTT > SRR4302545.8414656/1‑94 (MQ=60)
GGACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGGGGTCATGCCGTTTTC > SRR4302545.8366033/1‑94 (MQ=60)
GACTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCA < SRR4302545.9259711/94‑1 (MQ=60)
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CTACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGT < SRR4302545.4240973/94‑1 (MQ=60)
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TACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTT < SRR4302545.1647345/94‑1 (MQ=60)
TACGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTT > SRR4302545.5943580/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTC < SRR4302545.7266101/94‑1 (MQ=60)
GATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCA > SRR4302545.9139826/1‑94 (MQ=60)
GATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCA > SRR4302545.2251684/1‑94 (MQ=60)
GATGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCA < SRR4302545.1827784/94‑1 (MQ=60)
GAAGTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGCAAACGCGGCGTGCCCCGTGGCGTCCAGGAAAGTGATCATGGCGTTTTCAGTTTCA > SRR4302545.6750168/1‑94 (MQ=60)
GTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACG < SRR4302545.7421146/94‑1 (MQ=60)
GTCCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACG > SRR4302545.6949145/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGCCTGCGCACCACGATCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTG < SRR4302545.7416669/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTG < SRR4302545.7416674/94‑1 (MQ=60)
CCGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGGCCATGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTG > SRR4302545.1958540/1‑94 (MQ=60)
CCGTTGCCTGCCCCCCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTG < SRR4302545.9492855/94‑1 (MQ=60)
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CGTTGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGG > SRR4302545.6345424/1‑94 (MQ=60)
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TGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTAT > SRR4302545.4496591/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTAT < SRR4302545.31101/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGCTTTCAGTTTCAACGTGGTAT > SRR4302545.4496593/1‑94 (MQ=60)
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GCCTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATG > SRR4302545.4217124/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCA < SRR4302545.7546962/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCA > SRR4302545.9150529/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCA < SRR4302545.2365055/94‑1 (MQ=60)
TGCGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCAC < SRR4302545.658529/94‑1 (MQ=60)
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CGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCA > SRR4302545.1497550/1‑94 (MQ=60)
CGCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCA > SRR4302545.6808959/1‑94 (MQ=60)
GCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAA > SRR4302545.3463267/1‑94 (MQ=60)
GCACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGAGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGCAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAA > SRR4302545.1891402/1‑94 (MQ=60)
CACCACGAGCACGGATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAAT < SRR4302545.3199735/94‑1 (MQ=60)
ACCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATG < SRR4302545.3507400/94‑1 (MQ=60)
CCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGT > SRR4302545.444009/1‑94 (MQ=60)
CCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGT > SRR4302545.2546018/1‑94 (MQ=60)
CCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGATTCAACGTGGTATGCACCAATaa > SRR4302545.8356863/1‑92 (MQ=60)
CCACGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGT > SRR4302545.4918937/1‑94 (MQ=60)
CGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCT < SRR4302545.4806487/94‑1 (MQ=60)
CGAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCT > SRR4302545.9177229/1‑94 (MQ=60)
GAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTG > SRR4302545.5694712/1‑94 (MQ=60)
GAGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGGGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGCTTTCAGTTTCCACGTGGTATGCACgaaggtggtg > SRR4302545.2452221/1‑84 (MQ=60)
AGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGG < SRR4302545.6981369/94‑1 (MQ=60)
AGCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGG < SRR4302545.1717736/94‑1 (MQ=60)
GCACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGG < SRR4302545.9422657/94‑1 (MQ=60)
CACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGT > SRR4302545.1125041/1‑94 (MQ=60)
CACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGT > SRR4302545.9788406/1‑94 (MQ=60)
ACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTA < SRR4302545.10782303/94‑1 (MQ=60)
ACGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTA < SRR4302545.2912600/94‑1 (MQ=60)
CGCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAA > SRR4302545.361479/1‑94 (MQ=60)
GCATTGAAGTACACGCGACGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCCCCAATGTGCTGGGTAAT < SRR4302545.9607773/94‑1 (MQ=60)
GCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAAT < SRR4302545.3858553/94‑1 (MQ=60)
GCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAAT < SRR4302545.9844263/94‑1 (MQ=60)
GCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAAT < SRR4302545.9607775/94‑1 (MQ=60)
GCATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAG‑TTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG > SRR4302545.5811734/1‑94 (MQ=60)
CATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG > SRR4302545.1867459/1‑94 (MQ=60)
CATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG < SRR4302545.6891202/94‑1 (MQ=60)
CATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG < SRR4302545.4747939/94‑1 (MQ=60)
CATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG < SRR4302545.4071001/94‑1 (MQ=60)
CATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATG > SRR4302545.8292089/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGC < SRR4302545.10305746/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGC < SRR4302545.102866/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGTAAACGCGTGGTGCCCCGGGGTGGACAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGC < SRR4302545.9194294/94‑1 (MQ=60)
TTGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCC < SRR4302545.10551710/94‑1 (MQ=60)
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TGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCG < SRR4302545.3633827/94‑1 (MQ=60)
TGAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGACG > SRR4302545.6694388/1‑94 (MQ=60)
TGAAGTAAACGCGGCGTGACCCAGGGAGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGATTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCG > SRR4302545.4546889/1‑94 (MQ=60)
GAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGC > SRR4302545.5665591/1‑94 (MQ=60)
GAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGC > SRR4302545.3448617/1‑94 (MQ=60)
GAAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGC > SRR4302545.2276461/1‑94 (MQ=60)
AAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCC < SRR4302545.6225062/94‑1 (MQ=60)
AAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCC < SRR4302545.6225063/94‑1 (MQ=60)
AAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCC < SRR4302545.10177866/94‑1 (MQ=60)
AAGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCC < SRR4302545.5580762/94‑1 (MQ=60)
AAGTAAACGCGGCGGGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCC < SRR4302545.8615221/94‑1 (MQ=60)
AGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCC < SRR4302545.3661909/94‑1 (MQ=60)
AGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGGTCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCAC > SRR4302545.5799974/1‑94 (MQ=60)
AGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCC < SRR4302545.3823643/94‑1 (MQ=60)
AGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCC < SRR4302545.8877811/94‑1 (MQ=60)
AGTAAACGCGGCGTGCCCCGGGGTGTCCAGGAAGGTGATCATGCCGTTTTCAGTTTCAACGTGGTATGCACCAATGTGCTGGGTAATGCCGCCC < SRR4302545.8877809/94‑1 (MQ=60)
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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
