Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
129,639 |
A→G |
V541A (GTG→GCG) |
yacH ← |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 129,639 | 0 | A | G | 100.0%
| 956.8
/ NA
| 276 | V541A (GTG→GCG) | yacH | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (142/134); total (142/134) |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
CGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCG > NC_000913/129549‑129728
|
cGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGcc < 1:1676935/93‑1 (MQ=255)
ttgttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTg < 2:1419333/93‑1 (MQ=255)
ttgttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTg > 1:1876455/1‑93 (MQ=255)
ttgttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTg < 1:1327242/93‑1 (MQ=255)
ttggtCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTg < 2:4390922/93‑1 (MQ=255)
tgttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTgg < 1:4173971/93‑1 (MQ=255)
tgttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTgg < 2:73337/93‑1 (MQ=255)
gttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGgc > 1:6379953/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGgcg > 1:6148117/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGgcgc < 1:3897001/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGATGACGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGGTGATTCAGGGGGCGCTGCTGTAGTTTTTCCTTAAACGCCTGgcgc > 1:2482608/1‑93 (MQ=255)
ggTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCgctgc < 2:5467501/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGctc < 2:3288545/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGctc < 1:2580946/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGctct < 2:6420472/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGctct < 1:5204616/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGGTGATTCAGTTGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGctct > 2:3455447/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTg < 1:126957/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTTAGTGGGCGCTGCTGTAGTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTgg < 2:2078926/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTgg < 1:2909920/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGt > 1:2659920/1‑93 (MQ=255)
gCCGATTGAACACGCTGGAGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGt > 1:5933603/1‑93 (MQ=255)
cGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGa < 2:1128138/93‑1 (MQ=255)
cGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGa > 1:4965023/1‑93 (MQ=255)
gATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGag > 1:6163422/1‑92 (MQ=255)
gATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGag > 1:1199295/1‑92 (MQ=255)
gATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGAt < 2:2150649/93‑1 (MQ=255)
aTTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATg > 2:2743956/1‑93 (MQ=255)
aTTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATg > 2:1789666/1‑93 (MQ=255)
ttGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGc < 1:889959/93‑1 (MQ=255)
tGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCg > 2:1865634/1‑93 (MQ=255)
aaCACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGa < 2:4723644/93‑1 (MQ=255)
aaCACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTCATGCGGa < 2:6362611/93‑1 (MQ=255)
acacGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGAc > 2:4207639/1‑93 (MQ=255)
acacGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGAc < 1:2228737/93‑1 (MQ=255)
cacGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACt < 1:5091011/93‑1 (MQ=255)
cacGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACt < 1:3572918/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGaa < 2:5587657/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGaa > 2:5232564/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGaa > 1:203031/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATa < 1:4696867/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATa < 2:3184722/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATa < 2:2570119/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATa > 2:2943508/1‑93 (MQ=255)
ggcgggcgTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATAc < 2:2461179/93‑1 (MQ=255)
ggcgTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTc > 2:6232182/1‑93 (MQ=255)
ggcgTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTc < 2:2634579/93‑1 (MQ=255)
gcgTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCa > 1:3823346/1‑93 (MQ=255)
cgTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCAc < 2:1482194/93‑1 (MQ=255)
gTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCAcg < 1:3064602/93‑1 (MQ=255)
gTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCAcg < 2:6099057/93‑1 (MQ=255)
tCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACgcgcg > 1:3200853/1‑92 (MQ=255)
aCGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGAGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGc > 1:4876945/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCg > 1:5804858/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGtc > 2:3040376/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGtctc < 1:5606673/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGtctc > 1:6469607/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTctct > 2:1606606/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTctct < 1:3622470/93‑1 (MQ=255)
tGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCtt < 2:1036306/93‑1 (MQ=255)
gTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTc < 2:2256488/93‑1 (MQ=255)
ttGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCg > 1:4622439/1‑93 (MQ=255)
tGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgc < 2:769326/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgct < 1:5346545/93‑1 (MQ=255)
gATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgct < 1:1476837/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGGGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgctg > 2:5846433/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTGGGCTCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCACTGCTCTGGTGATGGTGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgctgc < 2:3017111/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgctgc < 1:1440517/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgctgc > 2:3920269/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCAAGCGCTGCCTCTCTTCgctgc > 2:5374000/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCACACGCGCTGCGTCTCTTCgctgc < 2:4332835/93‑1 (MQ=255)
tCAGTGGGCGCTGCTGTTCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCgctgct < 1:5154005/93‑1 (MQ=255)
cAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGctgctg > 2:5922952/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTgg > 2:1918742/1‑93 (MQ=255)
aGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTgg > 2:2406835/1‑93 (MQ=255)
gggCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTc < 2:3635378/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCt > 1:275074/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTg < 1:2380457/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTg < 2:1295218/93‑1 (MQ=255)
gctgctGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCg > 2:871601/1‑93 (MQ=255)
gctgctGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCg < 2:4127353/93‑1 (MQ=255)
gctgctGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCg < 2:3775687/93‑1 (MQ=255)
ctgctgTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCgg < 2:5638611/93‑1 (MQ=255)
gctgTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGt > 1:5466847/1‑93 (MQ=255)
ctgTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGtt < 1:1950819/93‑1 (MQ=255)
tgTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTa > 1:1704404/1‑93 (MQ=255)
gTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAg > 2:5355829/1‑93 (MQ=255)
gTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAg > 1:4019923/1‑93 (MQ=255)
tACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGAGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTCCTGGATCTCCGGGTTAGt > 2:5047067/1‑93 (MQ=18)
aCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTc > 2:3992548/1‑93 (MQ=255)
aCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTc > 1:2440123/1‑93 (MQ=255)
tttttCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTg > 1:1030734/1‑93 (MQ=255)
ttttCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGc > 1:4123138/1‑93 (MQ=255)
tttCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCa < 1:1785896/93‑1 (MQ=255)
ttCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAt > 1:4777282/1‑93 (MQ=255)
cTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAtttt > 1:1006510/1‑93 (MQ=255)
cTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAtttt < 1:4349352/93‑1 (MQ=255)
ttAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTtc > 1:522564/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTtctc < 2:4876494/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTtctc < 2:4039770/93‑1 (MQ=255)
|
CGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCG > NC_000913/129549‑129728
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG > NC_000913/129546‑129730
|
TGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACG < SRR4302537.359118/94‑1 (MQ=60)
GACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGC > SRR4302537.2943649/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCT < SRR4302537.1688673/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTG > SRR4302537.4183869/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTG > SRR4302537.1889508/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTG < SRR4302537.2655555/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTG > SRR4302537.4020284/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTG < SRR4302537.2726812/94‑1 (MQ=60)
TTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGG < SRR4302537.1336496/94‑1 (MQ=60)
TGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGC < SRR4302537.4203117/94‑1 (MQ=60)
TGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGC > SRR4302537.6423452/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCG > SRR4302537.6190404/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGTGATGACGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGGTGATTCAGGGGGCGCTGCTGTAGTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGC > SRR4302537.2500062/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGTTTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCT < SRR4302537.4587688/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCT < SRR4302537.3924245/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCT < SRR4302537.4980645/94‑1 (MQ=60)
GTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTC > SRR4302537.2068469/1‑94 (MQ=60)
GTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTC > SRR4302537.6204726/1‑94 (MQ=60)
TGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCT < SRR4302537.2599015/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCNNTAAACGCCTGGCGNNGCTNTG > SRR4302537.6499904/1‑94 (MQ=60)
GATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTG < SRR4302537.5240418/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGG < SRR4302537.127866/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGG > SRR4302537.6425646/1‑94 (MQ=60)
TGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGT < SRR4302537.2930366/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGT > SRR4302537.2678503/1‑94 (MQ=60)
TGCCGATTGAACACGCTGGAGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGT > SRR4302537.5974321/1‑94 (MQ=60)
gcccattgaacacccttggcggcgtttaccCGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG < SRR4302537.2001848/64‑1 (MQ=60)
GCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG < SRR4302537.3438286/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG < SRR4302537.1275285/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG < SRR4302537.525257/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG > SRR4302537.913751/1‑94 (MQ=60)
GCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTG < SRR4302537.2409304/94‑1 (MQ=60)
CCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGA > SRR4302537.4999247/1‑94 (MQ=60)
CGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGAT > SRR4302537.1034874/1‑94 (MQ=60)
CGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGAT < SRR4302537.1262592/94‑1 (MQ=60)
CGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGAG > SRR4302537.1207630/1‑94 (MQ=60)
CGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGAG > SRR4302537.6205841/1‑94 (MQ=60)
ATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGC < SRR4302537.2024853/94‑1 (MQ=60)
TTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCG < SRR4302537.896087/94‑1 (MQ=60)
TTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCG > SRR4302537.721536/1‑94 (MQ=60)
TTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGATGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCG > SRR4302537.3589301/1‑94 (MQ=60)
AACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGAC < SRR4302537.4830252/94‑1 (MQ=60)
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ACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACT < SRR4302537.2332025/94‑1 (MQ=60)
ACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACT < SRR4302537.2244452/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAA > SRR4302537.204485/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATA > SRR4302537.1289423/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATAC < SRR4302537.1050936/94‑1 (MQ=60)
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GCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGC > SRR4302537.4192830/1‑94 (MQ=60)
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GGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCA > SRR4302537.6287734/1‑94 (MQ=60)
GTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGC < SRR4302537.3680003/94‑1 (MQ=60)
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TTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCG < SRR4302537.3640559/94‑1 (MQ=60)
ATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCT < SRR4302537.1344920/94‑1 (MQ=60)
ATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCG > SRR4302537.3223356/1‑94 (MQ=60)
ATCACGTTGCTGTTGATGCAGTGGGCGCGGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCCGGCGCGGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCT < SRR4302537.4789735/94‑1 (MQ=60)
TCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTG < SRR4302537.605962/94‑1 (MQ=60)
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ACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCG > SRR4302537.2395454/1‑94 (MQ=60)
ACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCG > SRR4302537.1803056/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGT > SRR4302537.6218006/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCT > SRR4302537.5177586/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTC > SRR4302537.6513457/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCT < SRR4302537.2457203/94‑1 (MQ=60)
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GCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCT < SRR4302537.3958010/94‑1 (MQ=60)
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GTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCG > SRR4302537.2490827/1‑94 (MQ=60)
GTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCG < SRR4302537.3074749/94‑1 (MQ=60)
GTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCG > SRR4302537.4654437/1‑94 (MQ=60)
GTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCG < SRR4302537.1741687/94‑1 (MQ=60)
TTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGC < SRR4302537.405189/94‑1 (MQ=60)
TGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCT > SRR4302537.5955677/1‑94 (MQ=60)
GATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTG < SRR4302537.1487103/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTG < SRR4302537.5383175/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTG > SRR4302537.2820170/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGC > SRR4302537.4794637/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCT < SRR4302537.1450556/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGGGCGCTGCTGTTCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTG < SRR4302537.5189519/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTG > SRR4302537.4048197/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTACTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGCTGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGG > SRR4302537.1683701/1‑94 (MQ=60)
AGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGT > SRR4302537.2187062/1‑94 (MQ=60)
GTGGGCGCTGCTGTTCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTT < SRR4302537.1628216/94‑1 (MQ=60)
GGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCT < SRR4302537.2732885/94‑1 (MQ=60)
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GGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTG < SRR4302537.4315419/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTG < SRR4302537.3776802/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGC < SRR4302537.2397232/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGC < SRR4302537.3641816/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCG > SRR4302537.2893065/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGG < SRR4302537.5714263/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGG > SRR4302537.1454859/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGG > SRR4302537.3289487/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGG > SRR4302537.2543961/1‑94 (MQ=60)
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CTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGG > SRR4302537.3885124/1‑94 (MQ=60)
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CTGCTGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGG < SRR4302537.5268930/94‑1 (MQ=60)
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TGTACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAG > SRR4302537.5579425/1‑94 (MQ=60)
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TACTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTC > SRR4302537.2457305/1‑94 (MQ=60)
TCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCT < SRR4302537.5244916/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCT < SRR4302537.5879014/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCT < SRR4302537.1904539/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTG > SRR4302537.1298934/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTG > SRR4302537.1037833/1‑94 (MQ=60)
TTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGC > SRR4302537.5314674/1‑94 (MQ=60)
TTTTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGC > SRR4302537.4151917/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAT < SRR4302537.2643594/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAT < SRR4302537.1798352/94‑1 (MQ=60)
TTTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAT > SRR4302537.4810264/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATT > SRR4302537.5549500/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATT > SRR4302537.60306/1‑94 (MQ=60)
TCCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTT > SRR4302537.5192660/1‑94 (MQ=60)
CCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTT > SRR4302537.1013457/1‑94 (MQ=60)
CCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTT > SRR4302537.4263621/1‑94 (MQ=60)
CCTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTT > SRR4302537.2534981/1‑94 (MQ=60)
CTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTC > SRR4302537.526153/1‑94 (MQ=60)
CTTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTC < SRR4302537.4379488/94‑1 (MQ=60)
TTAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCT > SRR4302537.890870/1‑94 (MQ=60)
TAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGTTTAGTCTGCATTTTCTC > SRR4302537.5474062/1‑94 (MQ=60)
TAAACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTC < SRR4302537.116535/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGC > SRR4302537.4759463/1‑94 (MQ=60)
AACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGC > SRR4302537.3777535/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG < SRR4302537.6209705/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG < SRR4302537.294729/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG < SRR4302537.2597918/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG > SRR4302537.2291659/1‑94 (MQ=60)
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TGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCG > NC_000913/129546‑129730
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
