Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
352,299 |
A→G |
T124A (ACT→GCT) |
prpE → |
putative propionyl‑CoA synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 352,299 | 0 | A | G | 97.3%
| 742.4
/ 4.0
| 223 | T124A (ACT→GCT) | prpE | putative propionyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/1); new base G (107/110); total (112/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.55e-01 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
AACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > NC_000913/352209‑352388
|
aCGCGGTGACATCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTtctc < 2:3184612/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGctct < 1:5970894/93‑1 (MQ=255)
cgGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTctgc > 1:1744965/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTctgct < 2:6154724/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTctgct < 1:6335473/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTgg < 2:188505/93‑1 (MQ=255)
ggCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGc > 2:231998/1‑93 (MQ=255)
ggCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGc > 2:5563570/1‑93 (MQ=255)
gCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGcc < 1:1552832/93‑1 (MQ=255)
gCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGcc < 1:2663246/93‑1 (MQ=255)
ccTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCt < 1:3921145/93‑1 (MQ=255)
cTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTg > 1:3913475/1‑93 (MQ=255)
tCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgc > 1:4309468/1‑93 (MQ=255)
cAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcg < 2:606363/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcgc < 1:877592/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcgc > 2:5527221/1‑93 (MQ=255)
aTGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcgcg > 2:3114186/1‑93 (MQ=255)
aTGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcgcg > 1:337803/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTgcgcgcg > 1:1962673/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCa > 2:3550950/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCa < 1:1430912/93‑1 (MQ=255)
cGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCAtt < 2:3029479/93‑1 (MQ=255)
ttCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTgg > 1:1882073/1‑93 (MQ=255)
ttCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTgg > 2:4665421/1‑93 (MQ=255)
tCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgc < 2:6178786/93‑1 (MQ=255)
cATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcg < 1:3646025/93‑1 (MQ=255)
cATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGCGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcg > 2:4633642/1‑93 (MQ=255)
aTTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcgc > 2:4327140/1‑93 (MQ=255)
aTTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcgc < 1:3842678/93‑1 (MQ=255)
aTTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcgc < 2:314544/93‑1 (MQ=255)
aTTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGgcgc < 1:702596/93‑1 (MQ=255)
ttGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCt > 1:562372/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTa > 2:378732/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTAGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTa < 1:6471159/93‑1 (MQ=255)
ggTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTAtt > 1:2335340/1‑93 (MQ=255)
gtgtGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTc < 1:1647951/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCa < 2:5875975/93‑1 (MQ=255)
tgCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACt < 2:2182040/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTc < 2:2031207/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTc > 2:6086645/1‑93 (MQ=255)
cAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCg < 1:2049127/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATGTTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCggt < 2:3099871/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCggt > 2:5773198/1‑93 (MQ=255)
ggcgATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGgtggtg < 2:769938/93‑1 (MQ=255)
aTCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTtg < 2:1150126/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTtgg > 2:2483313/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTtgg < 1:357583/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTtggt < 1:639179/93‑1 (MQ=255)
gggTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTtggtg < 2:877144/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAt > 1:3122594/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAt > 1:3541902/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAtt < 2:6433156/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAttt < 1:194605/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAttt < 2:2452313/93‑1 (MQ=255)
tGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGCTTGGTGGATTTg > 1:5185958/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTAACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTg > 1:2963259/1‑93 (MQ=255)
gtgtATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGcc < 2:191318/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCt < 2:109788/93‑1 (MQ=255)
tgtATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCt < 2:4013495/93‑1 (MQ=255)
gtATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTc < 2:1328790/93‑1 (MQ=255)
tataTGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCg > 1:4232859/1‑93 (MQ=255)
tatGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGca < 2:6279920/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGcaca < 2:4425098/93‑1 (MQ=255)
tGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGcaca < 2:3952095/93‑1 (MQ=255)
gCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAg < 2:2636776/93‑1 (MQ=255)
cGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCg > 1:108059/1‑93 (MQ=255)
cGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCg > 2:5639989/1‑93 (MQ=255)
cGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCg > 1:5888372/1‑93 (MQ=255)
gatgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGt < 1:3320709/93‑1 (MQ=255)
gatgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGt < 1:5199772/93‑1 (MQ=255)
gatgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGt < 2:1767453/93‑1 (MQ=255)
atgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTg > 2:5487386/1‑93 (MQ=255)
tgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGGCTCGCACAGCGTgg > 1:5489828/1‑93 (MQ=255)
tgatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTgg > 2:528872/1‑93 (MQ=255)
gatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTggc > 1:2756721/1‑93 (MQ=255)
gatTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTggc < 2:4723527/93‑1 (MQ=255)
gCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGgcggcg < 1:3951541/93‑1 (MQ=255)
gCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGgcggcg > 1:4325049/1‑93 (MQ=255)
ccGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGgcgc < 2:1199974/93‑1 (MQ=255)
ccGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGgcgc < 1:5079031/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGcgcg > 1:6191127/1‑93 (MQ=255)
cGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGcgcg > 2:1021892/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGa > 1:5722043/1‑93 (MQ=255)
aaGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGaa > 1:2365670/1‑93 (MQ=255)
aaGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGaa < 1:2215607/93‑1 (MQ=255)
aGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAt > 1:4567864/1‑93 (MQ=255)
gcgcATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAtt < 1:2739124/93‑1 (MQ=255)
gcgcATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAtt < 1:2492434/93‑1 (MQ=255)
gcgcATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAtt > 1:1343445/1‑93 (MQ=255)
gcATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtga > 1:540358/1‑93 (MQ=255)
cATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgat > 2:3439653/1‑93 (MQ=255)
cATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgat < 1:1217655/93‑1 (MQ=255)
atatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatg > 1:4143847/1‑93 (MQ=255)
tatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatga < 2:894334/93‑1 (MQ=255)
tatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatga > 2:2059751/1‑93 (MQ=255)
tatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatga > 2:1694574/1‑93 (MQ=255)
tatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatga > 1:4609088/1‑93 (MQ=255)
tatTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATtgatga > 1:1178073/1‑93 (MQ=255)
atTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAc > 1:5773091/1‑93 (MQ=255)
atTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAc > 1:345155/1‑93 (MQ=255)
|
AACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > NC_000913/352209‑352388
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACGCTA > NC_000913/352206‑352392
|
GTGAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTG < SRR4302537.6283241/94‑1 (MQ=60)
GTGAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTG > SRR4302537.2360209/1‑94 (MQ=60)
TGAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGC < SRR4302537.2925341/94‑1 (MQ=60)
GAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCT > SRR4302537.668960/1‑94 (MQ=60)
ACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCT < SRR4302537.5795443/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCT < SRR4302537.2242639/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTG < SRR4302537.6011877/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTG < SRR4302537.614936/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGC > SRR4302537.1757129/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCT > SRR4302537.6007713/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTG < SRR4302537.4265362/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTG < SRR4302537.6378784/94‑1 (MQ=60)
GTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGG > SRR4302537.5230036/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGC < SRR4302537.180115/94‑1 (MQ=60)
tgctTCAATGTTGCGTTCATTTGGTGTTCAGCGCGGCGATCGTGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCC < SRR4302537.3966464/90‑1 (MQ=60)
GGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCC > SRR4302537.1405467/1‑94 (MQ=60)
GCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCT < SRR4302537.2681849/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCT < SRR4302537.1563663/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCT < SRR4302537.5684386/94‑1 (MQ=60)
GCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCT < SRR4302537.97379/94‑1 (MQ=60)
CCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTG < SRR4302537.3948551/94‑1 (MQ=60)
CCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTG > SRR4302537.3940834/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGC > SRR4302537.5709123/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGC > SRR4302537.4339421/1‑94 (MQ=60)
CTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGC > SRR4302537.3386670/1‑94 (MQ=60)
CAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGC < SRR4302537.1465616/94‑1 (MQ=60)
AATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCG > SRR4302537.340145/1‑94 (MQ=60)
AATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCG < SRR4302537.883628/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCG > SRR4302537.1976320/1‑94 (MQ=60)
TGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCAT < SRR4302537.1440874/94‑1 (MQ=60)
GTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGG > SRR4302537.197030/1‑94 (MQ=60)
GTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGG > SRR4302537.1895161/1‑94 (MQ=60)
TTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGC > SRR4302537.257441/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGC > SRR4302537.30851/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGC < SRR4302537.3671692/94‑1 (MQ=60)
CATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGC > SRR4302537.2201136/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCT > SRR4302537.566240/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCT > SRR4302537.2391800/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCT < SRR4302537.3869588/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCT < SRR4302537.707406/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTAGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTAT < SRR4302537.6515035/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATT > SRR4302537.2351800/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGGGCGCGCATTGGCGCTATTCA > SRR4302537.5204783/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCA < SRR4302537.1659489/94‑1 (MQ=60)
GTGTACAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCA < SRR4302537.3826183/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTC < SRR4302537.4204230/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGG < SRR4302537.2063498/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGG > SRR4302537.1768501/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTG < SRR4302537.5355696/94‑1 (MQ=60)
ATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGG < SRR4302537.649627/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGT < SRR4302537.360064/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTG < SRR4302537.4919088/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTG < SRR4302537.2591239/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTG > SRR4302537.2683943/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTG < SRR4302537.643531/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTG < SRR4302537.434458/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGA < SRR4302537.3940592/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGA > SRR4302537.3588536/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAT > SRR4302537.3566925/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGAT > SRR4302537.3144439/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATT > SRR4302537.120787/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTT > SRR4302537.4049084/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTT > SRR4302537.1183605/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTG < SRR4302537.195988/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGCTTGGTGGATTTG > SRR4302537.5221628/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTAACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTG > SRR4302537.2984058/1‑94 (MQ=60)
GTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCT < SRR4302537.805817/94‑1 (MQ=60)
TGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTC < SRR4302537.3941312/94‑1 (MQ=60)
GTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCG > SRR4302537.3604140/1‑94 (MQ=60)
GTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCG > SRR4302537.4262319/1‑94 (MQ=60)
ATATTCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGCGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCA > SRR4302537.398128/1‑94 (MQ=60)
ATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTTGATTTGCCTCGCA > SRR4302537.1683304/1‑94 (MQ=60)
TATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCAC < SRR4302537.5916960/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACA < SRR4302537.2032246/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAG < SRR4302537.3426096/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAG < SRR4302537.6438402/94‑1 (MQ=60)
GCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGC > SRR4302537.2195141/1‑94 (MQ=60)
GCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGC < SRR4302537.1572728/94‑1 (MQ=60)
GCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGC > SRR4302537.444584/1‑94 (MQ=60)
CCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCG > SRR4302537.108849/1‑94 (MQ=60)
CCGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCG > SRR4302537.5928774/1‑94 (MQ=60)
CCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCG > SRR4302537.3560479/1‑94 (MQ=60)
CGATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGT > SRR4302537.2961251/1‑94 (MQ=60)
GATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTG < SRR4302537.3344195/94‑1 (MQ=60)
GATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTG < SRR4302537.1410877/94‑1 (MQ=60)
GATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTG < SRR4302537.5235542/94‑1 (MQ=60)
ATGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGGCTCGCACAGCGTGG > SRR4302537.5527303/1‑94 (MQ=60)
TGATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGC > SRR4302537.2775964/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCG < SRR4302537.4389502/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGC < SRR4302537.5228510/94‑1 (MQ=60)
TGCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCG > SRR4302537.4355119/1‑94 (MQ=60)
GCCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGC < SRR4302537.3979179/94‑1 (MQ=60)
CCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCG > SRR4302537.2758251/1‑94 (MQ=60)
CCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCG > SRR4302537.6233780/1‑94 (MQ=60)
CCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCG < SRR4302537.5113997/94‑1 (MQ=60)
CCGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCG < SRR4302537.3237124/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGA > SRR4302537.5614753/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGA > SRR4302537.5761213/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAA < SRR4302537.3087504/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAA > SRR4302537.2382347/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAT > SRR4302537.6307818/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAT < SRR4302537.3849669/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAT < SRR4302537.2231229/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAAT > SRR4302537.4599477/1‑94 (MQ=60)
AGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATT < SRR4302537.6129061/94‑1 (MQ=60)
AGCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATT > SRR4302537.1352803/1‑94 (MQ=60)
GCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTG < SRR4302537.2509984/94‑1 (MQ=60)
GCGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTG < SRR4302537.2758238/94‑1 (MQ=60)
CGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGA > SRR4302537.548327/1‑94 (MQ=60)
CGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGA > SRR4302537.544077/1‑94 (MQ=60)
CGCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGA < SRR4302537.6403070/94‑1 (MQ=60)
GCATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGAT < SRR4302537.2376781/94‑1 (MQ=60)
CATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATG > SRR4302537.4172753/1‑94 (MQ=60)
CATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATG < SRR4302537.1226121/94‑1 (MQ=60)
CATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATG > SRR4302537.1278048/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGA > SRR4302537.1186265/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGA < SRR4302537.1897366/94‑1 (MQ=60)
ATATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGA > SRR4302537.4641001/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > SRR4302537.5812659/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > SRR4302537.3506029/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > SRR4302537.347555/1‑94 (MQ=60)
TATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGAC > SRR4302537.4602480/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACG > SRR4302537.56504/1‑94 (MQ=60)
TGCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACGCT < SRR4302537.3882381/94‑1 (MQ=60)
GCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCTCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACGCTA < SRR4302537.3332708/94‑1 (MQ=60)
GCTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACGCTA > SRR4302537.6373541/1‑94 (MQ=60)
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GTGAACGCGGTGGCCTCAATGTTGCGTTCATTGGGTGTGCAGCGCGGCGATCGGGTGCTGGTGTATATGCCGATGATTGCCGAAGCGCATATTACTCTGCTGGCCTGCGCGCGCATTGGCGCTATTCACTCGGTGGTGTTTGGTGGATTTGCCTCGCACAGCGTGGCGGCGCGAATTGATGACGCTA > NC_000913/352206‑352392
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
