Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
476,113 |
A→G |
Y73C (TAC→TGC) |
ybaA → |
hypothetical protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 476,113 | 0 | A | G | 100.0%
| 955.5
/ NA
| 271 | Y73C (TAC→TGC) | ybaA | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (141/130); total (141/130) |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATACCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACG > NC_000913/476023‑476202
|
cAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGccc < 1:4960718/93‑1 (MQ=255)
cAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGccc < 2:1749553/93‑1 (MQ=255)
cAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGccc > 2:2847422/1‑93 (MQ=255)
cAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAAAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGccc < 1:1414828/93‑1 (MQ=255)
aGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCt < 2:2653168/93‑1 (MQ=255)
gCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCtt > 2:2554268/1‑93 (MQ=255)
gATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCa > 2:399846/1‑93 (MQ=255)
aTGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCaa > 2:2138928/1‑93 (MQ=255)
tGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCaaa < 1:4460216/93‑1 (MQ=255)
tGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCaaa > 1:277082/1‑93 (MQ=255)
tACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAag < 1:5807068/93‑1 (MQ=255)
tACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAag > 2:3115066/1‑93 (MQ=255)
ccGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAagag > 2:1629360/1‑93 (MQ=255)
ccGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAagag < 2:6193538/93‑1 (MQ=255)
cGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAgg < 1:4162750/93‑1 (MQ=255)
cGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAgg > 2:1950763/1‑93 (MQ=255)
cGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAgg > 2:599567/1‑93 (MQ=255)
ggATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGt > 2:5141558/1‑93 (MQ=255)
gagggCAAAGGGACCGATTTTCGTATGGCGGCGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGGTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTc > 2:1470538/4‑93 (MQ=255)
aTGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTcc < 1:1084259/93‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCcg > 2:3478498/1‑93 (MQ=255)
tGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGCCcg < 1:3036895/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCcgc < 2:4452519/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGa < 1:1004678/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAc < 2:2994364/93‑1 (MQ=255)
aaGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACg > 1:1889756/1‑93 (MQ=255)
aGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACgc < 1:2036312/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCGATTTTCGTATGGAGGTGAAAGTGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACgct < 1:2931889/93‑1 (MQ=255)
gTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACgct < 1:1870251/93‑1 (MQ=255)
tGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACgctg < 1:3652610/93‑1 (MQ=255)
gACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACgctgc > 2:366696/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTa > 2:2050590/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTa > 1:6295077/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTa > 1:3164304/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTa > 1:3075772/1‑93 (MQ=255)
ccGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTa > 2:5552590/1‑93 (MQ=255)
cGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTaa > 2:6394113/1‑93 (MQ=255)
cGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTaa > 1:506793/1‑93 (MQ=255)
gATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAAt < 1:2556309/93‑1 (MQ=255)
aTTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATc > 1:5457797/1‑93 (MQ=255)
ttCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCaaa < 1:3993102/93‑1 (MQ=255)
cGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAg > 1:3754589/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAga < 1:891465/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAga < 1:1484161/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAgat > 1:3424673/1‑93 (MQ=255)
tATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAgat < 1:2713046/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAgatga < 2:1548801/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAgatgat > 1:2870989/1‑93 (MQ=255)
ggCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAgatgat < 2:4146700/93‑1 (MQ=255)
gTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAAGCTGCTAATCAAAAGATGATGtag > 2:2926494/1‑91 (MQ=255)
tGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCgg > 2:380096/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGGTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCgg > 1:2092119/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAc < 1:3527086/93‑1 (MQ=255)
aaGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAcc > 2:5450914/1‑93 (MQ=255)
aaGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGa > 2:3399112/1‑93 (MQ=255)
agagAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCGAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGTACCCACggtt > 1:3506966/1‑91 (MQ=255)
agagAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGAt < 1:4631622/93‑1 (MQ=255)
gaATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGaa < 2:2425150/93‑1 (MQ=255)
gaATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGAATGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGaa > 1:5935166/1‑93 (MQ=255)
aaTGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGaaa < 1:6436895/93‑1 (MQ=255)
aTGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAag < 1:5742514/93‑1 (MQ=255)
tGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAaga < 1:2305375/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAagag < 2:2720951/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGt > 1:4745238/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt > 1:2390400/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt < 2:374807/93‑1 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt > 2:3884095/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt < 2:737373/93‑1 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt > 2:2235000/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGtt > 2:1186868/1‑93 (MQ=255)
gagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTc < 2:1591975/93‑1 (MQ=255)
gagGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTc < 1:198727/93‑1 (MQ=255)
agGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCg > 1:1291851/1‑93 (MQ=255)
ggTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCgg < 1:1384715/93‑1 (MQ=255)
gTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGc > 2:2284532/1‑93 (MQ=255)
ttGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCg > 1:1183527/1‑93 (MQ=255)
tCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGt > 2:5866944/1‑93 (MQ=255)
tCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGt > 2:3349944/1‑93 (MQ=255)
tCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGt > 1:89790/1‑93 (MQ=255)
cTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTc < 2:4384557/93‑1 (MQ=255)
cTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTc > 1:6112277/1‑93 (MQ=255)
cTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTc > 1:1605421/1‑93 (MQ=255)
tttAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTcc > 1:2210514/1‑93 (MQ=255)
ttAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCa < 1:5566577/93‑1 (MQ=255)
ttAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCa < 2:5695480/93‑1 (MQ=255)
ttAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCa < 1:1261991/93‑1 (MQ=255)
tatgtGGATTGAATCCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCCGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGCATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCAt < 2:1362367/89‑1 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGCTGAAAGATGTCGGCGAGTCCATGc > 2:4832526/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc > 2:407709/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc > 2:1069778/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc < 2:4954103/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc < 2:5247313/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc > 1:3446866/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGc < 2:6043664/93‑1 (MQ=255)
gATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGtt > 1:261172/1‑93 (MQ=255)
ttGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTg < 1:5136887/93‑1 (MQ=255)
tGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGa < 1:5617237/93‑1 (MQ=255)
tGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGa < 2:1826643/93‑1 (MQ=255)
tGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGa < 1:790856/93‑1 (MQ=255)
tGAATGCCCTACAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCTGCGAGTCCATGCCGTTTGa < 2:6303863/93‑1 (MQ=255)
|
CCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATACCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACG > NC_000913/476023‑476202
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGGCCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATACCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGCAA > NC_000913/476020‑476206
|
GGGCCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATG > SRR4302537.558435/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGC < SRR4302537.960540/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGCCGGTTTTAGCTGGAAAAAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGC > SRR4302537.232508/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTTAATGCCC > SRR4302537.2614688/1‑94 (MQ=60)
CAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCT > SRR4302537.1484452/1‑94 (MQ=60)
CAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCT < SRR4302537.3776694/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCT < SRR4302537.4994911/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAAAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCT < SRR4302537.1424675/94‑1 (MQ=60)
AGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGTAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGGCCTT > SRR4302537.1543786/1‑94 (MQ=60)
AGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTT > SRR4302537.1271465/1‑94 (MQ=60)
GCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTC < SRR4302537.1269251/94‑1 (MQ=60)
GCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTC < SRR4302537.2309587/94‑1 (MQ=60)
CGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCA > SRR4302537.2390962/1‑94 (MQ=60)
GATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAA > SRR4302537.861200/1‑94 (MQ=60)
ATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAA > SRR4302537.279021/1‑94 (MQ=60)
TGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAA < SRR4302537.4491052/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAG > SRR4302537.4766646/1‑94 (MQ=60)
TACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGA < SRR4302537.5846890/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAG < SRR4302537.3975244/94‑1 (MQ=60)
CGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGT > SRR4302537.2095161/1‑94 (MQ=60)
CGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGT < SRR4302537.4191822/94‑1 (MQ=60)
CGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGT < SRR4302537.5980663/94‑1 (MQ=60)
GATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCC < SRR4302537.4706864/94‑1 (MQ=60)
GATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCC < SRR4302537.1637531/94‑1 (MQ=60)
GATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCATCAAAAGAGGTCC < SRR4302537.4545479/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCG < SRR4302537.1091741/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCG < SRR4302537.1981272/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGCCGGTTTAAGCTGAAAAAAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCG > SRR4302537.2706901/1‑94 (MQ=60)
TGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGCCCGC < SRR4302537.3058062/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAC < SRR4302537.5342376/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAC > SRR4302537.2432619/1‑94 (MQ=60)
CAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAC < SRR4302537.594668/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGAC < SRR4302537.1011612/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGATGTCCGCGACG > SRR4302537.3579580/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACG > SRR4302537.1902892/1‑94 (MQ=60)
AGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCT < SRR4302537.2050505/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGATTTTCGTATGGAGGTGAAAGTGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTG < SRR4302537.2952475/94‑1 (MQ=60)
GTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTG < SRR4302537.1883267/94‑1 (MQ=60)
TGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGC < SRR4302537.3678319/94‑1 (MQ=60)
TGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGC > SRR4302537.3534241/1‑94 (MQ=60)
GACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCT > SRR4302537.3574557/1‑94 (MQ=60)
ACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTA > SRR4302537.3186522/1‑94 (MQ=60)
ACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTA > SRR4302537.6338203/1‑94 (MQ=60)
ACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTA > SRR4302537.3097198/1‑94 (MQ=60)
CCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAA > SRR4302537.510271/1‑94 (MQ=60)
CCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAA < SRR4302537.895346/94‑1 (MQ=60)
CGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAAT < SRR4302537.1287735/94‑1 (MQ=60)
CGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAAT > SRR4302537.2780671/1‑94 (MQ=60)
CGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAAT < SRR4302537.2777217/94‑1 (MQ=60)
CGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAAT > SRR4302537.3880592/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATC < SRR4302537.2574229/94‑1 (MQ=60)
GATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATC > SRR4302537.5495024/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATC > SRR4302537.3453221/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATC > SRR4302537.3061703/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATC > SRR4302537.3548875/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCA > SRR4302537.1980217/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCA < SRR4302537.2821095/94‑1 (MQ=60)
TTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAA < SRR4302537.4021058/94‑1 (MQ=60)
TCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAG < SRR4302537.5833196/94‑1 (MQ=60)
TCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAG > SRR4302537.3780956/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGAT > SRR4302537.3448913/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGAT < SRR4302537.1494490/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGAT < SRR4302537.897607/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAAAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGAT < SRR4302537.3499061/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATG < SRR4302537.2044354/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATG < SRR4302537.2731994/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAGTGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGA > SRR4302537.3724200/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGA > SRR4302537.1383263/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGAT > SRR4302537.2891138/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGAT < SRR4302537.2656617/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGAT < SRR4302537.3449236/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTC < SRR4302537.1493081/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTC < SRR4302537.1093109/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTC < SRR4302537.5078576/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCG > SRR4302537.140824/1‑94 (MQ=60)
GTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGGTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGG > SRR4302537.2106872/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGC > SRR4302537.3095771/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGTGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAC > SRR4302537.5508059/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAACAGATGATGTCGGAC > SRR4302537.2242951/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAC < SRR4302537.5744172/94‑1 (MQ=60)
GAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAC > SRR4302537.6447510/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGAC < SRR4302537.5633752/94‑1 (MQ=60)
AAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACC < SRR4302537.3552033/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGG > SRR4302537.4403928/1‑94 (MQ=60)
AAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCGAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGTACCCACGGTT > SRR4302537.3531777/1‑94 (MQ=60)
AAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGAT < SRR4302537.6252195/94‑1 (MQ=60)
AAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGAT < SRR4302537.3119299/94‑1 (MQ=60)
AAGAGAATGAAGACGTTGTCTTTAGGTGCATTTAATGCCCTTCAAAAGAGGTACGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGAT < SRR4302537.3119298/94‑1 (MQ=60)
AGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATG > SRR4302537.944019/1‑94 (MQ=60)
AGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATG < SRR4302537.4663663/94‑1 (MQ=60)
AGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATG > SRR4302537.6116667/1‑94 (MQ=60)
AGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATG < SRR4302537.3203816/94‑1 (MQ=60)
AGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGAATGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAA > SRR4302537.5975896/1‑94 (MQ=60)
AATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAG < SRR4302537.6480598/94‑1 (MQ=60)
AATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAG > SRR4302537.2922564/1‑94 (MQ=60)
ATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGA < SRR4302537.5781833/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGA > SRR4302537.1133338/1‑94 (MQ=60)
TGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAG < SRR4302537.2321646/94‑1 (MQ=60)
TGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAG > SRR4302537.1894731/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGT > SRR4302537.1607369/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGT > SRR4302537.4778026/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTT > SRR4302537.2407233/1‑94 (MQ=60)
AGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTC < SRR4302537.1694100/94‑1 (MQ=60)
AGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTC < SRR4302537.712699/94‑1 (MQ=60)
AGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTC < SRR4302537.5652097/94‑1 (MQ=60)
AGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTC > SRR4302537.4141147/1‑94 (MQ=60)
GAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCG < SRR4302537.2923109/94‑1 (MQ=60)
GAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCG > SRR4302537.1300834/1‑94 (MQ=60)
GAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCG < SRR4302537.200143/94‑1 (MQ=60)
GAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCG < SRR4302537.2106820/94‑1 (MQ=60)
AGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGG > SRR4302537.2989904/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGC > SRR4302537.2599562/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGC < SRR4302537.1394373/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGC < SRR4302537.2829904/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCG > SRR4302537.1191756/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCG > SRR4302537.490601/1‑94 (MQ=60)
TGTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAG > SRR4302537.900400/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGT > SRR4302537.90445/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTC > SRR4302537.1616649/1‑94 (MQ=60)
TCTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTC > SRR4302537.6154282/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCC < SRR4302537.5066349/94‑1 (MQ=60)
CTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCC > SRR4302537.2226103/1‑94 (MQ=60)
CTTTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCC < SRR4302537.1240100/94‑1 (MQ=60)
TTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCAT < SRR4302537.5604624/94‑1 (MQ=60)
TTAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCAT < SRR4302537.1270766/94‑1 (MQ=60)
TAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATG < SRR4302537.1350742/94‑1 (MQ=60)
TAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATG > SRR4302537.3140066/1‑94 (MQ=60)
TAGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATG > SRR4302537.5116023/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGC > SRR4302537.4648771/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGC > SRR4302537.3471244/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGC > SRR4302537.4947721/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGC > SRR4302537.756010/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCC < SRR4302537.2344699/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCC < SRR4302537.2204033/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCG > SRR4302537.5714250/1‑94 (MQ=60)
GGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTT > SRR4302537.263012/1‑94 (MQ=60)
GGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTT > SRR4302537.4121563/1‑94 (MQ=60)
GGATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTT < SRR4302537.6388352/94‑1 (MQ=60)
ATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTG > SRR4302537.5574087/1‑94 (MQ=60)
ATTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTG > SRR4302537.5192582/1‑94 (MQ=60)
TTGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGA < SRR4302537.5172286/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGAC < SRR4302537.796286/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGAC > SRR4302537.1001240/1‑94 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGAC > SRR4302537.211094/1‑94 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGAC > SRR4302537.5823740/1‑94 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGAC < SRR4302537.5655645/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGCTTGAC > SRR4302537.1037499/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGGTTGACG > SRR4302537.6331892/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGTTGTCGGACCCCCGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGG > SRR4302537.2526235/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGG < SRR4302537.3373527/94‑1 (MQ=60)
AATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGG < SRR4302537.188665/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGC < SRR4302537.3914269/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGC > SRR4302537.4834245/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGCA > SRR4302537.3269923/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGCAA > SRR4302537.3628552/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGCAA < SRR4302537.5855497/94‑1 (MQ=60)
|
GGGCCAGCGATGTACCGGATGGCAAAGTGACCGATTTTCGTATGGCGGTGAAAGCGGAAGAGAATGAAGAGGTTGTCTTTAGCTGGATTGAATACCCTTCAAAAGAGGTCCGCGACGCTGCTAATCAAAAGATGATGTCGGACCCACGGATGAAAGAGTTCGGCGAGTCCATGCCGTTTGACGGCAA > NC_000913/476020‑476206
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |