Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.

ALE, Flask, Isolate	Predicted Mutations	Mean Coverage	Total Reads	Percent Mapped	Mapped Reads	Average Read Length
A1 F1 I2 R1	882	254.4	12957588	98.0%	12698436	93.0

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	520,856	C→T	A406V (GCG→GTG)	ybbP →	putative oxidoreductase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	520,856	0	C	T	96.7%	736.9 / 6.1	216	A406V (GCG→GTG)	ybbP	putative oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/2); new base T (99/109); total (104/112)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.67e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.97e-01

Only 100 of 223 total aligned reads displayed.

TCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAAT  >  NC_000913/520766‑520945

tCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTgg                                                                                         >  2:3085836/1‑93 (MQ=255)

 cTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGggtggt                                                                                        <  2:1886973/93‑1 (MQ=255)

  tGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGgtggtg                                                                                       <  2:4353364/93‑1 (MQ=255)

   ggCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGc                                                                                      <  2:2894114/93‑1 (MQ=255)

   ggCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGc                                                                                      <  1:3135020/93‑1 (MQ=255)

    gCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGCGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGCTTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCt                                                                                     >  1:6164676/1‑93 (MQ=255)

     ccGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTg                                                                                    >  1:1062995/1‑93 (MQ=255)

      cGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTgg                                                                                   >  1:971868/1‑93 (MQ=255)

      cGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTgg                                                                                   <  2:2470919/93‑1 (MQ=255)

       gCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggc                                                                                  <  2:5452263/93‑1 (MQ=255)

       gCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggc                                                                                  <  2:1045507/93‑1 (MQ=255)

       gCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGATGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggc                                                                                  <  1:3698717/93‑1 (MQ=255)

       acTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATAAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggc                                                                                  <  1:4068578/92‑1 (MQ=255)

        cTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcg                                                                                 >  2:6343824/1‑93 (MQ=255)

         tGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcgg                                                                                >  1:494512/1‑93 (MQ=255)

          gAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcggg                                                                               <  1:4878204/93‑1 (MQ=255)

          gAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcggg                                                                               <  2:5925458/93‑1 (MQ=255)

           aaGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcgggc                                                                              >  1:6112508/1‑93 (MQ=255)

            aGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcggggg                                                                             >  1:2136842/1‑91 (MQ=255)

             gTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTggcgggcgg                                                                            >  2:452833/1‑92 (MQ=255)

             gTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGgcgc                                                                            <  1:5151802/93‑1 (MQ=255)

              ttttATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGcgcg                                                                           >  2:2644745/1‑93 (MQ=255)

              ttttATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGcgcg                                                                           >  1:6440204/1‑93 (MQ=255)

               tttATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCgg                                                                          <  1:801986/93‑1 (MQ=255)

                 tATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGgta                                                                        <  2:1429304/93‑1 (MQ=255)

                  aTCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGgtag                                                                       <  2:4147581/93‑1 (MQ=255)

                  aTCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGgtag                                                                       <  1:2237166/93‑1 (MQ=255)

                  aTCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGgtag                                                                       >  2:3237846/1‑93 (MQ=255)

                     tGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTAc                                                                    <  1:3329519/93‑1 (MQ=255)

                      gCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACt                                                                   <  2:1287901/93‑1 (MQ=255)

                       ccGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTg                                                                  <  1:1264168/93‑1 (MQ=255)

                       ccGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTg                                                                  <  2:6884/93‑1 (MQ=255)

                        cGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGGACTgg                                                                 >  1:1276469/1‑93 (MQ=255)

                         gATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGc                                                                >  2:2946599/1‑93 (MQ=255)

                         gATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGGACTGGc                                                                >  2:1803638/1‑93 (MQ=255)

                          aTTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCt                                                               >  2:441656/1‑93 (MQ=255)

                          aTTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCt                                                               >  1:4089414/1‑93 (MQ=255)

                          aTTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCt                                                               <  2:4591979/93‑1 (MQ=255)

                           ttGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCtt                                                              <  1:4982914/93‑1 (MQ=255)

                           ttGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCtt                                                              >  1:1872734/1‑93 (MQ=255)

                             gTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGGGGGAGTACTGGCTTTg                                                            >  1:4461273/1‑93 (MQ=255)

                              tCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGc                                                           >  2:5176413/1‑93 (MQ=255)

                              tCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGc                                                           <  1:4167765/93‑1 (MQ=255)

                              tCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGc                                                           >  2:5067336/1‑93 (MQ=255)

                               cAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCt                                                          <  1:2029705/93‑1 (MQ=255)

                                 gtgtGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGTGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCtgt                                                        <  1:4793216/93‑1 (MQ=255)

                                 gtgtGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCtgt                                                        >  2:4982218/1‑93 (MQ=255)

                                  tgtgGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCtgtg                                                       <  1:2482069/93‑1 (MQ=255)

                                  tgtgGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGGAGTACTGGCTTTGCtgtg                                                       >  2:1014865/1‑93 (MQ=255)

                                    tggtggTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCg                                                     <  2:2396379/93‑1 (MQ=255)

                                      gtggtTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGgt                                                   <  2:2028039/93‑1 (MQ=255)

                                      gtggtTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGgt                                                   <  1:4246336/93‑1 (MQ=255)

                                         gtTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGtgtg                                                >  2:6185639/1‑93 (MQ=255)

                                           tgtgCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgct                                              <  2:5845503/93‑1 (MQ=255)

                                           tgtgCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgct                                              >  2:2181881/1‑93 (MQ=255)

                                            gtgCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctg                                             <  2:6264695/93‑1 (MQ=255)

                                            gtgCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctg                                             >  1:3525703/1‑93 (MQ=255)

                                            gtgCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctg                                             <  1:628880/93‑1 (MQ=255)

                                             tgctgctgcTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctgg                                            <  2:3857633/93‑1 (MQ=255)

                                             tgctgctgcTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGGGTgctgg                                            >  2:1154445/1‑93 (MQ=255)

                                               ctgctgctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGGGCGGTAGTACTGGCCTTGCTGTGCGGTGTggtgggc                                          >  1:239742/1‑93 (MQ=255)

                                               ctgctgctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctgggc                                          <  2:3596417/93‑1 (MQ=255)

                                               ctgctgctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctgggc                                          <  2:2226886/93‑1 (MQ=255)

                                               ctgctgctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctgggc                                          <  1:2568864/93‑1 (MQ=255)

                                                 gctgctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTgctgggctg                                        >  1:1825367/1‑93 (MQ=255)

                                                    gctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGGAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAt                                     >  1:1144962/1‑93 (MQ=255)

                                                     ctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAtg                                    >  2:478206/1‑93 (MQ=255)

                                                     ctCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAtg                                    <  2:778177/93‑1 (MQ=255)

                                                      tCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAtgc                                   <  2:6466954/93‑1 (MQ=255)

                                                      tCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAtgc                                   <  2:867770/93‑1 (MQ=255)

                                                          ctgATTTATTGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATgctgct                               <  1:3094515/91‑1 (MQ=255)

                                                            gATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGGTGCTGCTGa                             >  1:5247487/1‑93 (MQ=255)

                                                            gATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGa                             >  1:2608630/1‑93 (MQ=255)

                                                             aTTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGaa                            >  1:1405688/1‑93 (MQ=255)

                                                               tAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATg                          <  2:1834392/93‑1 (MQ=255)

                                                               tAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATg                          >  1:5998173/1‑93 (MQ=255)

                                                                aaTGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGt                         <  1:3831476/93‑1 (MQ=255)

                                                                aaTGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGt                         >  1:541226/1‑93 (MQ=255)

                                                                aaTGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGt                         <  2:3152360/93‑1 (MQ=255)

                                                                 aTGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTa                        <  2:3946044/93‑1 (MQ=255)

                                                                 aTGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTa                        >  2:5589287/1‑93 (MQ=255)

                                                                  tGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTAc                       <  1:5099093/93‑1 (MQ=255)

                                                                  tGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGATGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTAc                       <  1:4314432/93‑1 (MQ=255)

                                                                          agcaTGCTGCTTTGGGTGGTTCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTcgccgc               >  1:4345920/1‑93 (MQ=255)

                                                                          agcaTGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTcgccgc               <  2:406534/93‑1 (MQ=255)

                                                                            caTGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCAt             >  2:1100688/1‑93 (MQ=255)

                                                                             aTGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATg            >  1:1723794/1‑93 (MQ=255)

                                                                              tgctgcTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGa           <  1:2803747/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgctgcTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACCGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGa           >  2:5746809/1‑93 (MQ=255)

                                                                              tgctgcTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGa           >  1:2061068/1‑93 (MQ=255)

                                                                               gctgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGAc          >  2:4128409/1‑93 (MQ=255)

                                                                               gctgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGAc          <  2:1383126/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gctgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGAc          <  2:172091/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gctgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTACTGAATGTACTTCGCCGCATGAc          <  1:1107790/93‑1 (MQ=255)

                                                                                ctgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACg         >  2:2285948/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 tgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGc        >  1:923758/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 tgctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGc        <  1:5586732/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  gctTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCt       <  2:1955003/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     ttGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGaa    >  1:5895517/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       gggTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAAt  <  2:5710470/93‑1 (MQ=255)

TCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAAT  >  NC_000913/520766‑520945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 20 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`

GATK/CNVnator alignment

BRESEQ :: bam2aln output

ACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCT  >  NC_000913/520763‑520949

ACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGT                                                                                               >  SRR4302537.1163932/1‑94 (MQ=60)

 CGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTG                                                                                              <  SRR4302537.6077750/94‑1 (MQ=60)

  GTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGG                                                                                             <  SRR4302537.3648833/94‑1 (MQ=60)

  GTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGG                                                                                             >  SRR4302537.3102837/1‑94 (MQ=60)

  GTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGG                                                                                             <  SRR4302537.5316909/94‑1 (MQ=60)

    CTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTG                                                                                           >  SRR4302537.411291/1‑94 (MQ=60)

      GGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCT                                                                                         <  SRR4302537.3157021/94‑1 (MQ=60)

      GGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGCGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGCTTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCT                                                                                         >  SRR4302537.6207114/1‑94 (MQ=60)

       GCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTG                                                                                        >  SRR4302537.1070322/1‑94 (MQ=60)

        CCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGG                                                                                       >  SRR4302537.978567/1‑94 (MQ=60)

         CGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGC                                                                                      >  SRR4302537.5952236/1‑94 (MQ=60)

          GCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGATGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCG                                                                                     <  SRR4302537.3724743/94‑1 (MQ=60)

          ACTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATAAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCG                                                                                     <  SRR4302537.4097000/94‑1 (MQ=60)

           CTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGG                                                                                    >  SRR4302537.497915/1‑94 (MQ=60)

            TGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGG                                                                                   >  SRR4302537.973353/1‑94 (MQ=60)

             GAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGC                                                                                  >  SRR4302537.6154514/1‑94 (MQ=60)

             GAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGC                                                                                  <  SRR4302537.4911904/94‑1 (MQ=60)

              AAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGGG                                                                                 >  SRR4302537.2151887/1‑94 (MQ=60)

                GTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCG                                                                               >  SRR4302537.6483915/1‑94 (MQ=60)

                GTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCG                                                                               <  SRR4302537.5187303/94‑1 (MQ=60)

                  TTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGT                                                                             <  SRR4302537.807493/94‑1 (MQ=60)

                  TTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGG                                                                             >  SRR4302537.3204980/1‑94 (MQ=60)

                    TATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAG                                                                           <  SRR4302537.5287405/94‑1 (MQ=60)

                    TATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAG                                                                           <  SRR4302537.1908089/94‑1 (MQ=60)

                    TATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAG                                                                           >  SRR4302537.653225/1‑94 (MQ=60)

                     ATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGT                                                                          <  SRR4302537.3069422/94‑1 (MQ=60)

                     ATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGT                                                                          <  SRR4302537.2252944/94‑1 (MQ=60)

                     ATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGT                                                                          <  SRR4302537.4655978/94‑1 (MQ=60)

                       CTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTAC                                                                        <  SRR4302537.4943076/94‑1 (MQ=60)

                        TGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACT                                                                       <  SRR4302537.3353077/94‑1 (MQ=60)

                        TGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACT                                                                       >  SRR4302537.4351406/1‑94 (MQ=60)

                        TGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCGCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCTCGGTAGTACT                                                                       <  SRR4302537.205371/94‑1 (MQ=60)

                          CCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGG                                                                     <  SRR4302537.1272959/94‑1 (MQ=60)

                          CCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGGACTGG                                                                     >  SRR4302537.1285343/1‑94 (MQ=60)

                           CGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGC                                                                    >  SRR4302537.1122235/1‑94 (MQ=60)

                            GATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCT                                                                   >  SRR4302537.4117971/1‑94 (MQ=60)

                             ATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTT                                                                  <  SRR4302537.4281/94‑1 (MQ=60)

                             ATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTT                                                                  >  SRR4302537.1885765/1‑94 (MQ=60)

                              TTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTT                                                                 <  SRR4302537.5017258/94‑1 (MQ=60)

                               TGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGGGGGAGTACTGGCTTTG                                                                >  SRR4302537.4492115/1‑94 (MQ=60)

                                GTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGC                                                               <  SRR4302537.5893804/94‑1 (MQ=60)

                                 TCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCT                                                              <  SRR4302537.4196875/94‑1 (MQ=60)

                                  CAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTG                                                             <  SRR4302537.2043856/94‑1 (MQ=60)

                                    GTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGTGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTG                                                           <  SRR4302537.4826297/94‑1 (MQ=60)

                                    GTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTG                                                           >  SRR4302537.931385/1‑94 (MQ=60)

                                    GTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCCGTG                                                           >  SRR4302537.2800522/1‑94 (MQ=60)

                                     TGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGG                                                          >  SRR4302537.5180141/1‑94 (MQ=60)

                                     TGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGC                                                          <  SRR4302537.2499517/94‑1 (MQ=60)

                                       TGGTGGTTGTTCTGCTGGTCGCCGGATTAATGGCTGGCAGCATGCTGCTTTGCGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGG                                                        <  SRR4302537.1950337/94‑1 (MQ=60)

                                        GGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGT                                                       <  SRR4302537.6177484/94‑1 (MQ=60)

                                        GGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGT                                                       >  SRR4302537.1831383/1‑94 (MQ=60)

                                         GTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTG                                                      <  SRR4302537.4275848/94‑1 (MQ=60)

                                         GTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTG                                                      >  SRR4302537.2430468/1‑94 (MQ=60)

                                              TGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTG                                                 <  SRR4302537.1106417/94‑1 (MQ=60)

                                              TGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTG                                                 >  SRR4302537.3550642/1‑94 (MQ=60)

                                               GTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGG                                                <  SRR4302537.633161/94‑1 (MQ=60)

                                                TGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGG                                               <  SRR4302537.2237513/94‑1 (MQ=60)

                                                 GCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGGGCGGTAGTACTGGCCTTGCTGTGCGGTGTGGTGGGC                                              >  SRR4302537.241440/1‑94 (MQ=60)

                                                 GCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGC                                              >  SRR4302537.4336340/1‑94 (MQ=60)

                                                  CTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCT                                             >  SRR4302537.645276/1‑94 (MQ=60)

                                                  CTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCT                                             <  SRR4302537.2586860/94‑1 (MQ=60)

                                                   TGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTG                                            >  SRR4302537.1838089/1‑94 (MQ=60)

                                                      TGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAT                                         <  SRR4302537.5527450/94‑1 (MQ=60)

                                                      TGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGGAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGAT                                         >  SRR4302537.1152924/1‑94 (MQ=60)

                                                       GCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATG                                        <  SRR4302537.3120952/94‑1 (MQ=60)

                                                       GCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATG                                        >  SRR4302537.6210672/1‑94 (MQ=60)

                                                           GCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGC                                    >  SRR4302537.2526757/1‑94 (MQ=60)

                                                            CCGAATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGGAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGACTGGATGCTACT                                   <  SRR4302537.1275787/94‑1 (MQ=60)

                                                             ctgatttattGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTG                                  <  SRR4302537.3116101/84‑1 (MQ=60)

                                                              GGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGGTGCTGCTGA                                 >  SRR4302537.5283595/1‑94 (MQ=60)

                                                              GGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGA                                 >  SRR4302537.2626875/1‑94 (MQ=60)

                                                               GATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAA                                <  SRR4302537.3682550/94‑1 (MQ=60)

                                                               GATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAA                                >  SRR4302537.1415477/1‑94 (MQ=60)

                                                                ATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAAT                               >  SRR4302537.1389375/1‑94 (MQ=60)

                                                                ATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAAT                               >  SRR4302537.185410/1‑94 (MQ=60)

                                                                ATTAATGGGTGGCAGCATGCTCCTTTGGGTGGTGCTGGCGTGCGCCGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGGTGGATGCTGGTGAAA                               >  SRR4302537.3701870/1‑94 (MQ=60)

                                                                 TTAATGGGTGGTATCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATG                              <  SRR4302537.3809967/94‑1 (MQ=60)

                                                                 TTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATG                              <  SRR4302537.4865897/94‑1 (MQ=60)

                                                                 TTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATG                              >  SRR4302537.6039380/1‑94 (MQ=60)

                                                                  TAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGT                             <  SRR4302537.4807084/94‑1 (MQ=60)

                                                                  TAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGT                             <  SRR4302537.5886407/94‑1 (MQ=60)

                                                                  TAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGT                             >  SRR4302537.544956/1‑94 (MQ=60)

                                                                   AATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTA                            <  SRR4302537.3858334/94‑1 (MQ=60)

                                                                   AATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTA                            >  SRR4302537.5120499/1‑94 (MQ=60)

                                                                     TGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACT                          <  SRR4302537.139079/94‑1 (MQ=60)

                                                                     TGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACT                          <  SRR4302537.5134217/94‑1 (MQ=60)

                                                                     TGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGATGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACT                          <  SRR4302537.4344420/94‑1 (MQ=60)

                                                                      GGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTT                         <  SRR4302537.5262073/94‑1 (MQ=60)

                                                                       GGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTC                        <  SRR4302537.2459911/94‑1 (MQ=60)

                                                                       GGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTC                        <  SRR4302537.4445671/94‑1 (MQ=60)

                                                                       GGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTC                        <  SRR4302537.261700/94‑1 (MQ=60)

                                                                        GTGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCG                       <  SRR4302537.877509/94‑1 (MQ=60)

                                                                         TGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGC                      <  SRR4302537.3367553/94‑1 (MQ=60)

                                                                         TGGCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGC                      >  SRR4302537.4160759/1‑94 (MQ=60)

                                                                           GCAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCG                    <  SRR4302537.1227466/94‑1 (MQ=60)

                                                                            CAGCATGCTGCTTTGGGTGGTTCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGC                   >  SRR4302537.4376048/1‑94 (MQ=60)

                                                                            CAGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGC                   >  SRR4302537.5076785/1‑94 (MQ=60)

                                                                             AGCATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCA                  <  SRR4302537.5013687/94‑1 (MQ=60)

                                                                               CATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATG                >  SRR4302537.1735839/1‑94 (MQ=60)

                                                                                ATGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGA               >  SRR4302537.624166/1‑94 (MQ=60)

                                                                                ATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGA               >  SRR4302537.2075538/1‑94 (MQ=60)

                                                                                 TGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGAC              <  SRR4302537.2019694/94‑1 (MQ=60)

                                                                                 TGCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGAC              <  SRR4302537.2823343/94‑1 (MQ=60)

                                                                                  GCTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTACTGAATGTACTTCGCCGCATGACG             <  SRR4302537.1115446/94‑1 (MQ=60)

                                                                                   CTGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGC            >  SRR4302537.930134/1‑94 (MQ=60)

                                                                                    TGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCT           <  SRR4302537.228616/94‑1 (MQ=60)

                                                                                    TGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCT           >  SRR4302537.2149468/1‑94 (MQ=60)

                                                                                    TGCTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCT           <  SRR4302537.5624929/94‑1 (MQ=60)

                                                                                      CTTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGA         <  SRR4302537.4012537/94‑1 (MQ=60)

                                                                                       TTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAA        <  SRR4302537.6113831/94‑1 (MQ=60)

                                                                                       TTTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAA        >  SRR4302537.5935968/1‑94 (MQ=60)

                                                                                        TTGGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAA       >  SRR4302537.161784/1‑94 (MQ=60)

                                                                                          GGGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATC     >  SRR4302537.4969493/1‑94 (MQ=60)

                                                                                           GGTGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCG    >  SRR4302537.201413/1‑94 (MQ=60)

                                                                                             TGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCT  <  SRR4302537.2740601/94‑1 (MQ=60)

ACGTCTGGCCGCTGAAGTTTTATCTGCCGATTGTCAGTGTGGTGGTTGTGCTGCTGCTCGCCGGATTAATGGGTGGCAGCATGCTGCTTTGGGCGGTGCTGGCGGGCGCGGTAGTACTGGCTTTGCTGTGCGGTGTGCTGGGCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCT  >  NC_000913/520763‑520949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 0 ≤` `ATCG/ATCG` `< 2 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`