Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
575,662 |
A→G |
T149T (ACT→ACC) |
nmpC ← |
outer membrane porin protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 575,662 | 0 | A | G | 100.0%
| 888.8
/ NA
| 254 | T149T (ACT→ACC) | nmpC | outer membrane porin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (127/127); total (127/127) |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAG > NC_000913/575572‑575751
|
gttACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGt > 2:5052793/1‑93 (MQ=255)
gttACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGt > 1:2740090/1‑93 (MQ=255)
ttACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTc > 1:3280398/1‑93 (MQ=255)
ttACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTc > 1:2869621/1‑93 (MQ=255)
tACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTcc > 2:3543600/1‑93 (MQ=255)
tACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCAACACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTcc > 2:1480662/1‑93 (MQ=255)
aCGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCa < 2:1050000/93‑1 (MQ=255)
cGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCAc < 2:6058301/93‑1 (MQ=255)
cGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCAc < 1:4987279/93‑1 (MQ=255)
aTAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGc < 1:100887/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCAcc < 2:4283541/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCAcc < 2:720387/93‑1 (MQ=255)
ttGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGa < 1:3108869/93‑1 (MQ=255)
ttGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGa > 1:5487537/1‑93 (MQ=255)
ttGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGa < 1:5281723/93‑1 (MQ=255)
gCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATg > 2:5145646/1‑93 (MQ=255)
aaCACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTc > 1:3844045/1‑93 (MQ=255)
acacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCg > 2:1286377/1‑93 (MQ=255)
acacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCg < 2:1961213/93‑1 (MQ=255)
acacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCg > 1:284140/1‑93 (MQ=255)
acacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCg < 2:319108/93‑1 (MQ=255)
acacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCg > 2:6405482/1‑93 (MQ=255)
cacCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGt > 2:868430/1‑93 (MQ=255)
acCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTa > 1:4991558/1‑93 (MQ=255)
acCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTa < 1:4485933/93‑1 (MQ=255)
acCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTa > 1:5433101/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTAt < 2:4002750/93‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTAt > 2:334785/1‑93 (MQ=255)
cAGTTGCACGTTGAGTCATGAACATGTTGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTTGCAGGACGTATGTCCACGCACCGATGTCTTATg > 1:1231177/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGc > 1:3598210/1‑93 (MQ=255)
gTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCt > 1:4403974/1‑93 (MQ=255)
gTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCt > 2:3381677/1‑93 (MQ=255)
gTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGGACACGCATCGATGTCGTATGCt > 1:3523663/1‑93 (MQ=38)
ttGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTa > 2:5406482/1‑93 (MQ=255)
gCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTaca > 1:4303820/1‑93 (MQ=255)
gCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTaca < 2:1220895/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGAGTCATGAACACTTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACAcc < 1:2818143/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACAcc < 2:6160304/93‑1 (MQ=255)
cGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCg > 2:4508825/1‑93 (MQ=255)
gTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGt > 1:3887947/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTCATGATCACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTa < 2:4045182/93‑1 (MQ=255)
ttGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTa > 2:3486332/1‑93 (MQ=255)
gTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTa < 2:5825276/93‑1 (MQ=255)
tCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTAc < 1:620192/93‑1 (MQ=255)
cATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACg < 2:1337569/93‑1 (MQ=255)
aTGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACgg < 1:849272/93‑1 (MQ=255)
tGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGc > 1:2593363/1‑93 (MQ=255)
tGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGc > 1:2058366/1‑93 (MQ=255)
tGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACCGc > 1:1122242/1‑93 (MQ=255)
tGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACAGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGc > 1:6309797/1‑93 (MQ=255)
gAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGcc < 2:4620448/93‑1 (MQ=255)
gAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGGCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGcc < 1:2950664/93‑1 (MQ=255)
aaCACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGTCCg > 1:6465986/1‑93 (MQ=255)
aaCACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCg < 1:5776787/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTGTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTCCACCGTAGTTACGGCCGTAATc < 1:4806947/93‑1 (MQ=255)
ggTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGAt > 1:129586/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGa > 1:1820851/1‑93 (MQ=255)
tGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAg > 2:4184613/1‑93 (MQ=255)
gAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGc < 1:3661184/93‑1 (MQ=255)
gTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCg > 2:1491376/1‑93 (MQ=255)
ccAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTa < 2:2575021/93‑1 (MQ=255)
cAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAg < 2:2685234/93‑1 (MQ=255)
aaGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGt < 1:5461636/93‑1 (MQ=255)
tgtCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCAc < 2:1887564/93‑1 (MQ=255)
gtCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCAcg > 1:5246420/1‑92 (MQ=255)
caccacCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGa < 2:4885678/93‑1 (MQ=255)
accaccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGGCGTAGTCACCGaa > 2:5898332/1‑93 (MQ=255)
accaccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGaa < 2:2026215/93‑1 (MQ=255)
accaccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGaa > 2:4858172/1‑93 (MQ=255)
ccaccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAt > 1:4553838/1‑93 (MQ=255)
ccaccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAt > 1:948709/1‑93 (MQ=255)
caccGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAtt > 1:494908/1‑93 (MQ=255)
accGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAttt < 2:3844046/93‑1 (MQ=255)
accGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAttt > 2:2528612/1‑93 (MQ=255)
cGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCa > 1:5636036/1‑93 (MQ=255)
cGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCa < 1:2662317/93‑1 (MQ=255)
gAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAg > 1:1480436/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGc < 2:4128379/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGc < 2:3088510/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAggac < 1:5946142/93‑3 (MQ=255)
ttCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGcc < 1:721169/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGcc > 1:4722244/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCa < 2:766363/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCa > 2:5738779/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAg < 2:1573855/93‑1 (MQ=255)
tGGGAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGc < 1:1899061/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAACTTCCGGACAgg > 2:357346/1‑92 (MQ=38)
gCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGa < 1:1796745/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTTAGGCCAGCGaa < 2:5561634/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGaa < 2:4318563/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGaa < 1:2133723/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGaa < 2:2508574/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGaa < 1:4670984/93‑1 (MQ=255)
aGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAg > 2:3273699/1‑93 (MQ=255)
aGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAg > 1:4575420/1‑93 (MQ=255)
aGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAg > 2:30084/1‑93 (MQ=255)
ggACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCCCCGAATTTCAGGCCAGCGAAgg < 2:1772195/93‑1 (MQ=255)
gACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGc < 2:47285/93‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCa < 1:3757213/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAg > 1:4051265/1‑93 (MQ=255)
|
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAG > NC_000913/575572‑575751
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGG > NC_000913/575571‑575755
|
TGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGT > SRR4302537.2759210/1‑94 (MQ=60)
TGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGT < SRR4302537.5459149/94‑1 (MQ=60)
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTC > SRR4302537.391469/1‑94 (MQ=60)
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTC > SRR4302537.3303558/1‑94 (MQ=60)
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTC > SRR4302537.2889762/1‑94 (MQ=60)
GTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTC > SRR4302537.2037865/1‑94 (MQ=60)
TACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCA > SRR4302537.2894228/1‑94 (MQ=60)
TACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCA > SRR4302537.5475525/1‑94 (MQ=60)
TACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGCGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCC > SRR4302537.1458556/1‑94 (MQ=60)
CGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACG > SRR4302537.2849013/1‑94 (MQ=60)
CGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACG < SRR4302537.5021649/94‑1 (MQ=60)
CGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACG > SRR4302537.5479845/1‑94 (MQ=60)
ATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCA > SRR4302537.2804463/1‑94 (MQ=60)
ATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCA < SRR4302537.101612/94‑1 (MQ=60)
TAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCAC < SRR4302537.4732820/94‑1 (MQ=60)
TAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCAC < SRR4302537.3576682/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCG < SRR4302537.3746562/94‑1 (MQ=60)
GTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGA > SRR4302537.5524997/1‑94 (MQ=60)
TTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGAT > SRR4302537.5694660/1‑94 (MQ=60)
TTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGAT < SRR4302537.5318054/94‑1 (MQ=60)
TTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGAT < SRR4302537.3130579/94‑1 (MQ=60)
TGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATG < SRR4302537.4532584/94‑1 (MQ=60)
CAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTC > SRR4302537.3870964/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCG < SRR4302537.679945/94‑1 (MQ=60)
AACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCG > SRR4302537.4748635/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCG > SRR4302537.87256/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCG > SRR4302537.286122/1‑94 (MQ=60)
AACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCG > SRR4302537.111659/1‑94 (MQ=60)
CACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTA > SRR4302537.5470157/1‑94 (MQ=60)
CACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTA < SRR4302537.1847759/94‑1 (MQ=60)
CACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTA > SRR4302537.5025956/1‑94 (MQ=60)
ACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTAT < SRR4302537.4516965/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACATGTTGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTTGCAGGACGTATGTCCACGCACCGATGTCTTATG > SRR4302537.1239738/1‑94 (MQ=60)
CCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATG < SRR4302537.4457863/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATG < SRR4302537.1145229/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATG > SRR4302537.744231/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGC > SRR4302537.3623572/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGC > SRR4302537.4844827/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCT > SRR4302537.531006/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCT > SRR4302537.4434364/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCT > SRR4302537.4017168/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGGACACGCATCGATGTCGTATGCT > SRR4302537.3548592/1‑94 (MQ=60)
TGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACA > SRR4302537.4333730/1‑94 (MQ=60)
CACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGCTGTCGTATGCTACACC > SRR4302537.5208235/1‑94 (MQ=60)
ACGTTGAGTCATGAACACTTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCG < SRR4302537.2837847/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCG > SRR4302537.3792761/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGT > SRR4302537.1181732/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGT > SRR4302537.3915144/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGT > SRR4302537.4755917/1‑94 (MQ=60)
TTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAG < SRR4302537.6330733/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAG < SRR4302537.5024380/94‑1 (MQ=60)
TGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGT < SRR4302537.4559046/94‑1 (MQ=60)
GAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCNCCGAATTCTGGCANGANGTCGGTCCNCGCACCGATGNCGTATNCNACNCNNNANTT > SRR4302537.467164/1‑94 (MQ=60)
GAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTT < SRR4302537.2649837/94‑1 (MQ=60)
GAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTT < SRR4302537.1436593/94‑1 (MQ=60)
AGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTA < SRR4302537.2575213/94‑1 (MQ=60)
TCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACG < SRR4302537.902873/94‑1 (MQ=60)
TCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACG < SRR4302537.624413/94‑1 (MQ=60)
CATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGG > SRR4302537.273607/1‑94 (MQ=60)
ATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGC > SRR4302537.2611505/1‑94 (MQ=60)
ATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGC > SRR4302537.2072817/1‑94 (MQ=60)
ATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGC < SRR4302537.855090/94‑1 (MQ=60)
ATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACCGC > SRR4302537.1130022/1‑94 (MQ=60)
ATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACAGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGC > SRR4302537.6352997/1‑94 (MQ=60)
TGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCC > SRR4302537.997835/1‑94 (MQ=60)
GAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGTCCG > SRR4302537.6509786/1‑94 (MQ=60)
GAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCG > SRR4302537.3014965/1‑94 (MQ=60)
GAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGGCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCG < SRR4302537.2971365/94‑1 (MQ=60)
AACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGT > SRR4302537.2923111/1‑94 (MQ=60)
AACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGT < SRR4302537.5816385/94‑1 (MQ=60)
ACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGCA > SRR4302537.1287104/1‑94 (MQ=60)
CACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAA > SRR4302537.4039702/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAAT > SRR4302537.5646538/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTGTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTCCACCGTAGTTACGGCCGTAATCG < SRR4302537.4840100/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGA > SRR4302537.3285329/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGAT > SRR4302537.130505/1‑94 (MQ=60)
GTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGG > SRR4302537.2870887/1‑94 (MQ=60)
GTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGG > SRR4302537.4992257/1‑94 (MQ=60)
TTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGA > SRR4302537.1833541/1‑94 (MQ=60)
TTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGA < SRR4302537.3488913/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAG < SRR4302537.6347186/94‑1 (MQ=60)
GAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCC < SRR4302537.3686953/94‑1 (MQ=60)
GAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCC < SRR4302537.5283576/94‑1 (MQ=60)
AGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCG > SRR4302537.3505498/1‑94 (MQ=60)
TCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTA > SRR4302537.3710833/1‑94 (MQ=60)
CCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAG < SRR4302537.3117879/94‑1 (MQ=60)
AAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTC > SRR4302537.5047866/1‑94 (MQ=60)
AAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTC < SRR4302537.5498891/94‑1 (MQ=60)
AAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTC < SRR4302537.1885717/94‑1 (MQ=60)
AGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCA > SRR4302537.4700229/1‑94 (MQ=60)
TGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACG > SRR4302537.5282520/1‑94 (MQ=60)
TGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACG > SRR4302537.4199077/1‑94 (MQ=60)
GTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCG < SRR4302537.2155523/94‑1 (MQ=60)
CACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTGCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAA > SRR4302537.5895068/1‑94 (MQ=60)
CACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAA > SRR4302537.2112042/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAT > SRR4302537.4201136/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAT > SRR4302537.5808291/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAT > SRR4302537.955272/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAAT > SRR4302537.4585346/1‑94 (MQ=60)
CCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATT < SRR4302537.4689329/94‑1 (MQ=60)
CCACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATT > SRR4302537.498314/1‑94 (MQ=60)
CACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTT < SRR4302537.4597037/94‑1 (MQ=60)
CACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTT > SRR4302537.3791315/1‑94 (MQ=60)
CACCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTT < SRR4302537.1574688/94‑1 (MQ=60)
CCGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCA > SRR4302537.5674607/1‑94 (MQ=60)
CGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAG > SRR4302537.1490732/1‑94 (MQ=60)
CGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAG < SRR4302537.2680917/94‑1 (MQ=60)
CGAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAG < SRR4302537.826502/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGG < SRR4302537.6371253/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGG < SRR4302537.4398526/94‑1 (MQ=60)
GAATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGG > SRR4302537.4902063/1‑94 (MQ=60)
AATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGC < SRR4302537.2777961/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCC > SRR4302537.4754886/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCA < SRR4302537.726093/94‑1 (MQ=60)
TTCTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGACA < SRR4302537.5986954/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGC > SRR4302537.5386938/1‑94 (MQ=60)
TGGGAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCG < SRR4302537.1912251/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCG > SRR4302537.2844499/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCG < SRR4302537.5504374/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCG > SRR4302537.1833011/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGA < SRR4302537.5020152/94‑1 (MQ=60)
GCAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAA < SRR4302537.1809287/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG < SRR4302537.6384309/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG < SRR4302537.4437905/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG > SRR4302537.1745729/1‑94 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG < SRR4302537.2148742/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG > SRR4302537.4607085/1‑94 (MQ=60)
CAGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAG < SRR4302537.4703304/94‑1 (MQ=60)
AGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCGGGCCAGCGAAGG < SRR4302537.5945867/94‑1 (MQ=60)
AGGACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGG > SRR4302537.5512530/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAA < SRR4302537.3783588/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAA < SRR4302537.6077475/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAA < SRR4302537.3658169/94‑1 (MQ=60)
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CGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAG < SRR4302537.2644223/94‑1 (MQ=60)
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CGTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAG > SRR4302537.4079592/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGGCAGCGAAGGCAAGA > SRR4302537.3356707/1‑94 (MQ=60)
TCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGAC < SRR4302537.692729/94‑1 (MQ=60)
TCGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGAC < SRR4302537.5216782/94‑1 (MQ=60)
CGGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACG < SRR4302537.5589126/94‑1 (MQ=60)
GGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGG < SRR4302537.4414408/94‑1 (MQ=60)
GGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGG > SRR4302537.444874/1‑94 (MQ=60)
GGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGG > SRR4302537.1489885/1‑94 (MQ=60)
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TGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGG > NC_000913/575571‑575755
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
