Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
601,951 |
A→G |
Y257C (TAC→TGC) |
pheP → |
phenylalanine‑specific transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 601,951 | 0 | A | G | 100.0%
| 789.7
/ NA
| 226 | Y257C (TAC→TGC) | pheP | phenylalanine‑specific transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (122/104); total (122/104) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATC > NC_000913/601861‑602040
|
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gATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCAt > 2:1079396/1‑93 (MQ=255)
gATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCAt > 1:2966764/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCAt < 2:2001126/92‑1 (MQ=255)
gATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTc < 1:1093862/93‑1 (MQ=255)
gATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTc < 2:779378/93‑1 (MQ=255)
ttACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCAc < 1:1441855/93‑1 (MQ=255)
tACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACt > 1:5036671/1‑93 (MQ=255)
tACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACt > 1:239175/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCTGAAGCGCGCTATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACtgg < 1:2109557/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACtggt > 1:4588478/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACtggtg > 1:1012474/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACtggtgg < 2:4322185/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACtggtgg > 1:5066588/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGtt > 2:2505216/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGtt < 2:5050927/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTa < 2:2595322/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTa > 1:4761780/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTa > 1:4841058/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTa > 2:1910416/1‑93 (MQ=255)
aGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACt < 2:4901825/93‑1 (MQ=255)
gcgcgATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGgc < 2:5448138/93‑1 (MQ=255)
cgcgATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGGAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGgcg > 2:3972624/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGctc > 1:3090697/1‑93 (MQ=255)
gATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGctc < 2:3315563/93‑1 (MQ=255)
gATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGctc > 1:2036169/1‑93 (MQ=255)
tCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTa > 1:3936082/1‑93 (MQ=255)
gAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCg > 1:1665865/1‑93 (MQ=255)
gAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCg > 2:2862002/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgg > 2:6154213/1‑92 (MQ=255)
aaaaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtg > 2:1379002/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtg > 1:201128/1‑93 (MQ=255)
aaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtggg > 2:4094603/1‑93 (MQ=255)
aaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtggg < 2:5567801/93‑1 (MQ=255)
aaaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtggg > 1:4111611/1‑93 (MQ=255)
aaGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtgggt < 2:2382193/93‑1 (MQ=255)
aGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCgtgggtg > 2:5338236/1‑93 (MQ=255)
aGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGGTTTACTGGCGCTCTATCCgtgggtg > 2:4593523/1‑93 (MQ=255)
aTTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGaa > 2:6362650/1‑93 (MQ=255)
aTTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGaa > 1:3418754/1‑93 (MQ=255)
aTTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGaa > 1:3724940/1‑93 (MQ=255)
ttCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAg > 2:47676/1‑93 (MQ=255)
tCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAgg > 1:4089591/1‑92 (MQ=255)
cAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGa > 2:5952636/1‑93 (MQ=255)
cAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGa > 1:686421/1‑93 (MQ=255)
cAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGa > 2:5923054/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaa > 2:3571987/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaaa < 1:6135881/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaaa > 2:866985/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaaa > 1:2615099/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaaa > 2:3659274/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGaaa > 2:3948892/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAAt > 2:6246122/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATc < 2:5865105/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATc < 2:4542499/93‑1 (MQ=255)
gCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATcc < 1:2276283/93‑1 (MQ=255)
gCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATcc > 1:3666786/1‑93 (MQ=255)
gCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATcc < 1:5458842/93‑1 (MQ=255)
tAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACa < 1:6283779/93‑1 (MQ=255)
aaaTCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAg > 2:2856869/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAg < 2:3367986/93‑1 (MQ=255)
aaaTCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAg > 2:1180484/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGt < 2:4222434/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTa < 2:932108/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAg > 2:2663943/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAg > 2:4411909/1‑93 (MQ=255)
ggtggtGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGccc > 1:2536618/1‑93 (MQ=255)
tggtgTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGt > 1:5844879/1‑93 (MQ=255)
ggtgTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGtt < 2:1417123/93‑1 (MQ=255)
gtATCCCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTtgt < 2:2150790/93‑1 (MQ=255)
tATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTtgtg < 2:2926798/93‑1 (MQ=255)
aTCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGtga < 1:1209593/93‑1 (MQ=255)
tCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTtgtgtt < 2:5135190/93‑3 (MQ=255)
tCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGtgat < 2:3441094/93‑1 (MQ=255)
tCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGtgat < 1:6210962/93‑1 (MQ=255)
gCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGtgatga < 1:851657/93‑1 (MQ=255)
cATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTgatgat > 2:3139790/1‑93 (MQ=255)
cATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTgatgat > 1:6025870/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGCtt > 1:4565784/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGAtt > 1:4972156/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGAtt > 1:2214759/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGAttt > 2:5017397/1‑93 (MQ=255)
ctgctgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTc < 1:5392937/93‑1 (MQ=255)
ctgctgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTc > 1:5875962/1‑93 (MQ=255)
tgctgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTcc > 2:5901375/1‑93 (MQ=255)
ctgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGTAGTGAAGTCCAACAGTAGACCGTTTGTGATGTTTTTCCAt > 1:1296933/1‑93 (MQ=255)
ctgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCAt < 1:5791976/93‑1 (MQ=255)
tgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTGCATa > 1:2494643/1‑93 (MQ=255)
tgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATa > 1:5478631/1‑93 (MQ=255)
tgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATa < 2:1743169/93‑1 (MQ=255)
tgTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATa > 2:1852296/1‑93 (MQ=255)
tttttGCATCGGTTCACTTGTTGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATaa < 1:5640597/92‑1 (MQ=255)
gTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTTGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATaa < 2:3737510/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATaa < 1:3643186/93‑1 (MQ=255)
ttttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAt < 2:2167425/93‑1 (MQ=255)
ttttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAt > 1:4155413/1‑93 (MQ=255)
ttttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAt < 1:5182610/93‑1 (MQ=255)
ttttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAt < 1:5512730/93‑1 (MQ=255)
tttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAtc < 1:3327499/93‑1 (MQ=255)
tttGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAtc < 1:1856664/93‑1 (MQ=255)
|
TGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATC > NC_000913/601861‑602040
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGCTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGA > NC_000913/601858‑602044
|
AGCTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTG < SRR4302537.497403/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTG > SRR4302537.5990640/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTGGTATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGC < SRR4302537.4154354/94‑1 (MQ=60)
CTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCA > SRR4302537.4274839/1‑94 (MQ=60)
CTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCA < SRR4302537.2796437/94‑1 (MQ=60)
TGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCAT > SRR4302537.2987573/1‑94 (MQ=60)
GATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATC < SRR4302537.1154194/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCG < SRR4302537.615320/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGT < SRR4302537.2401785/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGT < SRR4302537.5515253/94‑1 (MQ=60)
GATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCA > SRR4302537.4064834/1‑94 (MQ=60)
GATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCA < SRR4302537.1101416/94‑1 (MQ=60)
ATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCAC > SRR4302537.5074117/1‑94 (MQ=60)
TTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACT > SRR4302537.240865/1‑94 (MQ=60)
TTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACT > SRR4302537.5071344/1‑94 (MQ=60)
TTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACT < SRR4302537.1451904/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGG < SRR4302537.5616524/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGAAGCGCGCTATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGT < SRR4302537.2124427/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGT > SRR4302537.4620210/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTG > SRR4302537.1019452/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTG < SRR4302537.2515985/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGG > SRR4302537.1320421/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGG > SRR4302537.5101465/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGT > SRR4302537.2257410/1‑94 (MQ=60)
GCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTT < SRR4302537.2153304/94‑1 (MQ=60)
TGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTA > SRR4302537.4794669/1‑94 (MQ=60)
TGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTA > SRR4302537.4874471/1‑94 (MQ=60)
GCTCGCGATCCGGAAAAAAGCATCCCAAAAGCGGTAAATCAGGTTGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGG < SRR4302537.5909917/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGC < SRR4302537.3697171/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGC < SRR4302537.705281/94‑1 (MQ=60)
GCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCG > SRR4302537.1872976/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCT > SRR4302537.4504069/1‑94 (MQ=60)
GCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCT > SRR4302537.305776/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTC > SRR4302537.2050361/1‑94 (MQ=60)
CGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTC > SRR4302537.3112253/1‑94 (MQ=60)
gagaCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCT < SRR4302537.2069941/90‑1 (MQ=60)
ATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTA > SRR4302537.3963593/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGAAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTA > SRR4302537.6204711/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTAT > SRR4302537.6353911/1‑94 (MQ=60)
CCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATC > SRR4302537.4597401/1‑94 (MQ=60)
CGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCC > SRR4302537.2472740/1‑94 (MQ=60)
GGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCG > SRR4302537.1677538/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGT < SRR4302537.2711177/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTG > SRR4302537.202568/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTG > SRR4302537.3210301/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCATTCCAAAAGCTGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGG < SRR4302537.3475224/94‑1 (MQ=60)
AAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGG > SRR4302537.4140330/1‑94 (MQ=60)
CATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAA > SRR4302537.3751111/1‑94 (MQ=60)
CATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAA > SRR4302537.3442954/1‑94 (MQ=60)
TTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGG > SRR4302537.4118150/1‑94 (MQ=60)
TCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTG < SRR4302537.4795444/94‑1 (MQ=60)
TCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTG > SRR4302537.6292169/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGA > SRR4302537.950790/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGA > SRR4302537.691127/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGA > SRR4302537.4764668/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAA > SRR4302537.2633390/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAAT < SRR4302537.6178063/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATC > SRR4302537.4775110/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCC < SRR4302537.4135230/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCC > SRR4302537.5870043/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCC > SRR4302537.3692592/1‑94 (MQ=60)
GCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCA < SRR4302537.2292354/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCA < SRR4302537.4244029/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCA < SRR4302537.5496079/94‑1 (MQ=60)
GCGGTAAATCAGCTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCA < SRR4302537.4244030/94‑1 (MQ=60)
GTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACA < SRR4302537.5075663/94‑1 (MQ=60)
GTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACA < SRR4302537.3692433/94‑1 (MQ=60)
TAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAG < SRR4302537.6326866/94‑1 (MQ=60)
TAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAG < SRR4302537.5281915/94‑1 (MQ=60)
TAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAG < SRR4302537.1449734/94‑1 (MQ=60)
GAAATCAGGTGGTGTATCTCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCGCTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAG < SRR4302537.2134832/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAG < SRR4302537.5929005/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAG > SRR4302537.4165162/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCC > SRR4302537.2554416/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCC < SRR4302537.2553022/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCG < SRR4302537.3059453/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGT > SRR4302537.5884956/1‑94 (MQ=60)
GGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTT > SRR4302537.5669262/1‑94 (MQ=60)
GTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTG < SRR4302537.5496023/94‑1 (MQ=60)
GTGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTG < SRR4302537.6315906/94‑1 (MQ=60)
TGTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGT > SRR4302537.2028123/1‑94 (MQ=60)
GTATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTG > SRR4302537.5112551/1‑94 (MQ=60)
TATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGA > SRR4302537.5003898/1‑94 (MQ=60)
ATCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGAT < SRR4302537.1218008/94‑1 (MQ=60)
TCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATG < SRR4302537.1098847/94‑1 (MQ=60)
TCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATG < SRR4302537.2578424/94‑1 (MQ=60)
TCGCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATG < SRR4302537.6253749/94‑1 (MQ=60)
GCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGAT > SRR4302537.6067277/1‑94 (MQ=60)
GCATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGAT < SRR4302537.857492/94‑1 (MQ=60)
CATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGCTT > SRR4302537.4597387/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATT > SRR4302537.2230379/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATT > SRR4302537.5006428/1‑94 (MQ=60)
CATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATT < SRR4302537.3667746/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTT > SRR4302537.1743723/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTT > SRR4302537.5921735/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTC > SRR4302537.5916277/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCC > SRR4302537.1531759/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCC < SRR4302537.5429772/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCCACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCA > SRR4302537.3870447/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCA > SRR4302537.5479375/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGTAGTGAAGTCCAACAGTAGACCGTTTGTGATGTTTTTCCAT > SRR4302537.1305950/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTGCATA > SRR4302537.2512206/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATA > SRR4302537.5695424/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATA < SRR4302537.5831686/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATA < SRR4302537.5026250/94‑1 (MQ=60)
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CTGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATACGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATA > SRR4302537.3412121/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAA > SRR4302537.128731/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGCATCGGTTCACTTGTTGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAT < SRR4302537.5679199/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAT < SRR4302537.5518963/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAT < SRR4302537.3668844/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAAT > SRR4302537.4184433/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATC < SRR4302537.5218271/94‑1 (MQ=60)
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GCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGA > SRR4302537.1331164/1‑94 (MQ=60)
GCATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGA > SRR4302537.4601221/1‑94 (MQ=60)
|
AGCTGATTGGGATTACTGCCGCTGAAGCGCGCGATCCGGAAAAAAGCATTCCAAAAGCGGTAAATCAGGTGGTGTATCGCATCCTGCTGTTTTACATCGGTTCACTGGTGGTTTTACTGGCGCTCTATCCGTGGGTGGAAGTGAAATCCAACAGTAGCCCGTTTGTGATGATTTTCCATAATCTCGA > NC_000913/601858‑602044
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
