Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
743,618 |
(C)5→6 |
coding (153/933 nt) |
ybgK → |
putative carboxylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 743,613 | 1 | . | C | 97.0%
| 550.6
/ 8.9
| 167 | coding (148/933 nt) | ybgK | putative carboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base C (85/77); total (87/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.73e-01 |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
ACGGTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑C‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCG > NC_000913/743521‑743704
|
aCGGTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATg > 1:5902019/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATg > 1:2590977/1‑93 (MQ=255)
gTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cc < 2:4622643/93‑1 (MQ=255)
gTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cc > 1:666530/1‑93 (MQ=255)
gTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cc > 1:407940/1‑93 (MQ=255)
tttCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cccc < 2:455025/93‑1 (MQ=255)
tttCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTAGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cccc > 1:4903689/1‑93 (MQ=255)
tCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cccccg < 2:388756/93‑3 (MQ=255)
tCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cccccg < 1:570447/93‑3 (MQ=255)
cGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑c‑cccccgc > 2:4942807/1‑90 (MQ=255)
aGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTg < 2:484165/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTg > 2:2440574/1‑93 (MQ=255)
cGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGgag < 1:4847130/93‑1 (MQ=255)
ggTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGAt < 1:2439318/93‑1 (MQ=255)
ggTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGAt < 2:211060/93‑1 (MQ=255)
ggTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGAt > 2:6018689/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATc > 2:1644345/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCa < 1:5302877/93‑1 (MQ=255)
tATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCa > 2:580331/1‑93 (MQ=255)
tATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCa > 1:4636736/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCAc < 1:634070/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCAc < 1:3861444/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCAc < 2:5287254/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACg < 1:2676470/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACg < 1:3562757/93‑1 (MQ=255)
cAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGc < 2:3324099/93‑1 (MQ=255)
aGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCt < 2:3198853/93‑1 (MQ=255)
ccACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCg < 1:6234988/93‑1 (MQ=255)
cACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAGCCTACTGGTGGGTAATGACGCCATTGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCgg < 2:2524194/93‑1 (MQ=255)
cACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCgg < 2:2174882/93‑1 (MQ=255)
ccgcggcgCACTGGATATGCCTGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTc < 2:179366/91‑1 (MQ=255)
cTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTc < 2:1388693/93‑1 (MQ=255)
gcACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAAc < 2:34041/93‑1 (MQ=255)
gcACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAAc < 1:3112372/93‑1 (MQ=255)
cACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACt < 1:3983236/93‑1 (MQ=255)
cACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACt < 1:6208785/93‑1 (MQ=255)
cACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACt > 2:5438160/1‑93 (MQ=255)
cTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGCTCACGCTCGGTCAGTTAAATGt > 2:6210702/1‑93 (MQ=255)
tGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGGTCACGCTCGGTCAGTTAACTGtt > 1:3284860/1‑93 (MQ=255)
tGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGtt < 2:28685/93‑1 (MQ=255)
tGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGtt < 1:5634415/93‑1 (MQ=255)
tGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGtt > 2:2810362/1‑93 (MQ=255)
tGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGtt < 2:6097654/93‑1 (MQ=255)
gATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGa < 1:5116970/93‑1 (MQ=255)
atatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAg > 1:5330599/1‑93 (MQ=255)
atatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAg < 2:4353715/93‑1 (MQ=255)
atatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAg < 2:1999428/93‑1 (MQ=255)
atatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAg < 2:27957/93‑1 (MQ=255)
tatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGt > 2:3449060/1‑93 (MQ=255)
tatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGt < 2:1395753/93‑1 (MQ=255)
tatGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGt > 1:4353285/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTc > 2:6053279/1‑93 (MQ=255)
cccGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGa > 2:4345452/1‑93 (MQ=255)
cccGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGa < 1:4785977/93‑1 (MQ=255)
gcgTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAAc < 2:2985178/93‑1 (MQ=255)
gcgTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAAc > 1:5054369/1‑93 (MQ=255)
gcgTTACGCATTGCTAACCTACTAGCGGGTACTGACGCCACTG‑CACACCGCGCTGGAGCTCACGCTCGGTCAGTTAACTGCTGAGTTCGaaat > 2:5201976/1‑92 (MQ=255)
cgTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACt < 1:2825923/93‑1 (MQ=255)
gTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑C‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGa < 1:1147018/93‑1 (MQ=255)
ttACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGa > 1:373693/1‑93 (MQ=255)
tACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGAt > 1:2925362/1‑93 (MQ=255)
tACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGAt < 1:4732170/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATg < 2:4891437/93‑1 (MQ=255)
aCGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATg < 2:4712535/93‑1 (MQ=255)
gCATTGCTATCCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATggg < 2:2537701/93‑1 (MQ=255)
cATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggt < 2:3797941/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTAACCTGCTGGTGGGTAATGACGCTAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggtg < 1:4996037/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggtg > 2:6156229/1‑93 (MQ=255)
ttGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggtgg > 2:2901355/1‑93 (MQ=255)
gCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggtgggt > 2:538167/1‑91 (MQ=255)
gCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGggtgggt > 2:404296/1‑91 (MQ=255)
gCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGtt > 2:220230/1‑93 (MQ=255)
gCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGGGGtt > 2:2698695/1‑93 (MQ=255)
cTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGttt < 2:3745428/93‑1 (MQ=255)
cTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGttt > 1:2150323/1‑93 (MQ=255)
aaCCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGc > 1:3786511/1‑93 (MQ=255)
ccTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGctc < 1:795369/93‑1 (MQ=255)
ccTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGctc > 2:1211304/1‑93 (MQ=255)
tACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTg > 1:2461224/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGa < 2:661401/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGGGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGAc < 2:1457361/93‑1 (MQ=255)
tggtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCCGGCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACg > 2:5029677/1‑93 (MQ=255)
ggtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACgg > 2:5401135/1‑93 (MQ=255)
ggtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACgg > 2:777029/1‑93 (MQ=255)
gtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACggg < 2:1010598/93‑1 (MQ=255)
gtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACggg < 1:3416624/93‑1 (MQ=255)
gtggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACggg < 1:2870412/93‑1 (MQ=255)
gggtgTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACggg < 2:2753533/89‑1 (MQ=255)
tggGTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGt < 2:1993665/93‑1 (MQ=255)
gggTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTg > 1:3307590/1‑93 (MQ=255)
gggTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTg > 2:636634/1‑93 (MQ=255)
gTAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGcc < 1:4141710/93‑1 (MQ=255)
tAATGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCg > 1:182374/1‑93 (MQ=255)
aTGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGt > 2:5160055/1‑93 (MQ=255)
aTGACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGt < 2:1085223/93‑1 (MQ=255)
gACGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTg > 2:3169467/1‑93 (MQ=255)
aCGCCAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGc < 1:1059207/93‑1 (MQ=255)
ccAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGaa < 1:4261367/93‑1 (MQ=255)
cAATGCC‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGTGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAg > 1:6421916/1‑93 (MQ=255)
aTG‑C‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAgcgc > 1:1047054/1‑93 (MQ=255)
|
ACGGTTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑C‑CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCG > NC_000913/743521‑743704
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCTGG > NC_000913/743525‑743709
|
TTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTAGTGGGTAATGACGCCAATG‑CCCCC > SRR4302537.4937534/1‑94 (MQ=60)
TCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑CCCCC‑CGC < SRR4302537.574364/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCT < SRR4302537.2922494/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCGGGTATCAGCCACTGAGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCT > SRR4302537.4886844/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGAAATAAGCCCAATG‑CCCCCGCccctg > SRR4302537.3402080/1‑89 (MQ=60)
TCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAG < SRR4302537.2041133/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGA > SRR4302537.3990153/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGA < SRR4302537.4880579/94‑1 (MQ=60)
GGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATC < SRR4302537.2456498/94‑1 (MQ=60)
GTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCA > SRR4302537.2604780/1‑94 (MQ=60)
GTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCA > SRR4302537.4668807/1‑94 (MQ=60)
TATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCAC < SRR4302537.5339331/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACG < SRR4302537.638379/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACG < SRR4302537.3888472/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGC < SRR4302537.2695159/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGC < SRR4302537.3587886/94‑1 (MQ=60)
CCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGG < SRR4302537.6277870/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTC > SRR4302537.511664/1‑94 (MQ=60)
GGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTA > SRR4302537.5234149/1‑94 (MQ=60)
GCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACT < SRR4302537.3134111/94‑1 (MQ=60)
CACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTG > SRR4302537.6369459/1‑94 (MQ=60)
CACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTG < SRR4302537.6251560/94‑1 (MQ=60)
CACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTG < SRR4302537.4011123/94‑1 (MQ=60)
CACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTG < SRR4302537.2626637/94‑1 (MQ=60)
ACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGT > SRR4302537.6258698/1‑94 (MQ=60)
ACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGT > SRR4302537.5922201/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGGTCACGCTCGGTCAGTTAACTGTT > SRR4302537.3308062/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTT > SRR4302537.3710931/1‑94 (MQ=60)
TGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTACCCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTG < SRR4302537.6012498/94‑1 (MQ=60)
TGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTG < SRR4302537.5672971/94‑1 (MQ=60)
GGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGA > SRR4302537.5078633/1‑94 (MQ=60)
GGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGA < SRR4302537.4559553/94‑1 (MQ=60)
GGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGA > SRR4302537.5361576/1‑94 (MQ=60)
GATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAG < SRR4302537.5402433/94‑1 (MQ=60)
GATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAG > SRR4302537.5367165/1‑94 (MQ=60)
GATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAG < SRR4302537.2171132/94‑1 (MQ=60)
GATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAG < SRR4302537.5152235/94‑1 (MQ=60)
ATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGT > SRR4302537.4383430/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTT < SRR4302537.3887619/94‑1 (MQ=60)
CCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAA < SRR4302537.4819012/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAA > SRR4302537.89017/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAAC > SRR4302537.5089165/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAAC > SRR4302537.4077398/1‑94 (MQ=60)
GCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACT < SRR4302537.3571307/94‑1 (MQ=60)
CGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTG > SRR4302537.117272/1‑94 (MQ=60)
CGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTG < SRR4302537.2845677/94‑1 (MQ=60)
GTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGA > SRR4302537.376280/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGAT < SRR4302537.1154993/94‑1 (MQ=60)
TTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGAT < SRR4302537.4251035/94‑1 (MQ=60)
TTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGAT > SRR4302537.2945907/1‑94 (MQ=60)
TACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATG < SRR4302537.4764866/94‑1 (MQ=60)
TACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATG < SRR4302537.4797329/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTAACCTGCTGGTGGGTAATGACGCTAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGG < SRR4302537.5030468/94‑1 (MQ=60)
GCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTT > SRR4302537.2165480/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTG > SRR4302537.4833501/1‑94 (MQ=60)
TAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGC > SRR4302537.3813098/1‑94 (MQ=60)
CCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCT < SRR4302537.800824/94‑1 (MQ=60)
CTACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTG > SRR4302537.2478531/1‑94 (MQ=60)
TACTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGA < SRR4302537.3271168/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACG < SRR4302537.471662/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACG > SRR4302537.2833769/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGAGGTTTGCTCTGACG > SRR4302537.2882212/1‑94 (MQ=60)
GTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGT < SRR4302537.2890559/94‑1 (MQ=60)
GTGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGT < SRR4302537.3440814/94‑1 (MQ=60)
TGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTG < SRR4302537.6384067/94‑1 (MQ=60)
TGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTG > SRR4302537.3330982/1‑94 (MQ=60)
TGGGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTG > SRR4302537.3320092/1‑94 (MQ=60)
GGTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCC > SRR4302537.115043/1‑94 (MQ=60)
GTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCG > SRR4302537.183669/1‑94 (MQ=60)
GTAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCG < SRR4302537.4170604/94‑1 (MQ=60)
TAATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGG > SRR4302537.787274/1‑94 (MQ=60)
AATGACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGT > SRR4302537.2936436/1‑94 (MQ=60)
ACGCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCG < SRR4302537.1066509/94‑1 (MQ=60)
GCCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGGTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAA > SRR4302537.3408739/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGTGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAG > SRR4302537.6465568/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAG < SRR4302537.4290977/94‑1 (MQ=60)
AATG‑CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGC > SRR4302537.1054277/1‑94 (MQ=60)
ATG‑CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCG > SRR4302537.4130631/1‑94 (MQ=60)
tgcCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCG < SRR4302537.698743/91‑1 (MQ=60)
gcCCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGG > SRR4302537.2553760/3‑94 (MQ=60)
CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCT > SRR4302537.5053739/1‑94 (MQ=60)
CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCT > SRR4302537.4623368/1‑94 (MQ=60)
CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGGTGCGAAGCGCGGCT > SRR4302537.6475893/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCTG > SRR4302537.910447/1‑94 (MQ=60)
CCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCTGG > SRR4302537.5598937/1‑94 (MQ=60)
CCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCTGG > SRR4302537.4668682/1‑94 (MQ=60)
|
TTTTCGCCAGTCGGGTATCAGCCACTGCGGCGCACTGGATATGCCCGCGTTACGCATTGCTAACCTACTGGTGGGTAATGACGCCAATG‑CCCCCGCGCTGGAGATCACGCTCGGTCAGTTAACTGTTGAGTTCGAAACTGATGGGTGGTTTGCTCTGACGGGTGCCGGTTGCGAAGCGCGGCTGG > NC_000913/743525‑743709
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
