Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,960,559 |
A→G |
intergenic (+75/+45) |
b1877 → / ← flhE |
hypothetical protein/flagellar protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,960,559 | 0 | A | G | 96.5%
| 825.3
/ 12.8
| 254 | intergenic (+75/+45) | b1877/flhE | hypothetical protein/flagellar protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/5); new base G (132/113); total (136/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.37e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGG > NC_000913/1960469‑1960648
|
tttGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCt > 2:3215418/1‑93 (MQ=255)
gACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAg < 2:4636151/93‑1 (MQ=255)
gACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAg < 2:2390727/93‑1 (MQ=255)
aCAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGt < 1:4023084/93‑1 (MQ=255)
cAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGATGAGtt > 2:5075171/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGtta > 1:680695/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGtta > 2:1685370/1‑93 (MQ=255)
agagGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGttat > 2:2089428/1‑93 (MQ=255)
agagGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGttat > 1:5755728/1‑93 (MQ=255)
ggATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTaa < 2:4060804/93‑1 (MQ=255)
gATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTaaa > 2:5767785/1‑93 (MQ=255)
tAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACa < 2:1766039/93‑1 (MQ=255)
tAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACa < 1:5205806/93‑1 (MQ=255)
tAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACa < 2:4157359/93‑1 (MQ=255)
tAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACa > 1:2897712/1‑93 (MQ=255)
aaTTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACAt < 2:1406478/93‑1 (MQ=255)
aaTTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACAt > 2:941533/1‑93 (MQ=255)
aTTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATa > 2:1654721/1‑93 (MQ=255)
aTTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATa > 2:3100287/1‑93 (MQ=255)
ttCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATAc < 2:2453397/93‑1 (MQ=255)
ttCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATAc > 2:2193670/1‑93 (MQ=255)
aTCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTcgcg > 2:403184/1‑93 (MQ=255)
tttttGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAgc < 1:5285789/93‑1 (MQ=255)
ttttGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAgcg > 2:626909/1‑93 (MQ=255)
tGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGt > 1:2089828/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAtt > 2:5549496/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAtt > 1:1633494/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAtt > 1:1759986/1‑93 (MQ=255)
aTGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATAATCGCGAGCGCGTAAtt > 2:5662440/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt > 1:6385931/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt > 1:614714/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt < 2:3408626/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt > 1:3169949/1‑93 (MQ=255)
tGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt > 1:5492913/1‑93 (MQ=255)
cgTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttt > 1:2110821/2‑93 (MQ=255)
ttttGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAttttt > 2:4857104/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAtttttt < 1:2583050/93‑1 (MQ=255)
tgttgCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTg < 1:4778568/93‑1 (MQ=255)
tgttgCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTg < 2:6149242/93‑1 (MQ=255)
tgCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCATTTTTTTGTcc > 1:492948/1‑93 (MQ=255)
tgCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTcc > 2:796179/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCt < 1:5519777/93‑1 (MQ=255)
cAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCtt > 2:6009213/1‑93 (MQ=255)
aaGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTc < 2:1506689/93‑1 (MQ=255)
aaGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTc > 1:99065/1‑93 (MQ=255)
aaGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTc > 2:3328870/1‑93 (MQ=255)
aaGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTc < 2:1046406/93‑1 (MQ=255)
aGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCa < 2:4019155/93‑1 (MQ=255)
aGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCa < 2:1730948/93‑1 (MQ=255)
gCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATGGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAg < 1:4326850/93‑1 (MQ=255)
aTTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGa > 2:4679424/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGAt < 1:318699/93‑1 (MQ=255)
ttCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGAt < 1:1205735/93‑1 (MQ=255)
ccTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATaa < 1:787041/93‑1 (MQ=255)
ccTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATaa < 2:3186218/93‑1 (MQ=255)
tGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAAtt < 1:2688348/93‑1 (MQ=255)
tGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAAtt > 1:5808454/1‑93 (MQ=255)
ataaataaTTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTca > 1:1500421/1‑93 (MQ=255)
taaataaTTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTcac < 1:1052279/93‑1 (MQ=255)
aataatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACaa < 1:5641054/93‑1 (MQ=255)
aataatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACaa > 1:4506369/1‑93 (MQ=255)
aataatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACaa < 2:3114967/93‑1 (MQ=255)
taatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATc > 1:3586843/1‑93 (MQ=255)
taatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATc > 2:3455008/1‑93 (MQ=255)
taatTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATc > 2:3552595/1‑93 (MQ=255)
atTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCTCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCAc < 1:5367281/93‑1 (MQ=255)
atTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCAc > 2:4549207/1‑93 (MQ=255)
atTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCAc < 1:1644799/93‑1 (MQ=255)
ttGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACt > 1:1952945/1‑93 (MQ=255)
caacaaGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCa > 1:3000191/1‑93 (MQ=255)
caacaaGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCa < 1:2181479/93‑1 (MQ=255)
caaGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTACACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTATCCTTCACCGATAATTCACAATCACTTCAGTa > 2:421198/1‑93 (MQ=255)
aaGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCATCGATAATTCACAATCACTTCATTAc < 2:1363187/93‑1 (MQ=255)
aaGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTAc < 1:4885702/93‑1 (MQ=255)
aGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACg < 2:4495420/93‑1 (MQ=255)
aGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACg < 2:6093116/93‑1 (MQ=255)
aCATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGtt > 2:1930737/1‑93 (MQ=255)
aCATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGtt < 2:845383/93‑1 (MQ=255)
aCATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTATCCTTCAGGGATAATCCACAATCACATCCTTACGtt > 2:3691504/1‑93 (MQ=255)
cATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTg < 1:1285375/93‑1 (MQ=255)
aTCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGt > 1:6316807/1‑93 (MQ=255)
aTCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGt > 1:892456/1‑93 (MQ=255)
aTCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGt < 1:3639699/93‑1 (MQ=255)
tCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTa < 1:349048/93‑1 (MQ=255)
tCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTa > 2:3288213/1‑93 (MQ=255)
cGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTAc < 2:5004295/93‑1 (MQ=255)
cGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTAc > 2:375511/1‑93 (MQ=255)
aGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACCATCACTTCATTACGTTGTACCt > 2:2184372/1‑93 (MQ=255)
aGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCt > 1:4405693/1‑93 (MQ=255)
aGCATTTTTCGGTGGGATATTATACATACTCGCGAGCGCGAAATTTTTGTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCt > 2:2745661/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCttt > 2:5291576/1‑93 (MQ=255)
cTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTa > 1:5967280/1‑93 (MQ=255)
tttttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAg > 2:4977545/1‑93 (MQ=255)
tttttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAg > 1:5007146/1‑93 (MQ=255)
tttttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAg < 1:4151358/93‑1 (MQ=255)
ttttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGc > 1:1476482/1‑93 (MQ=255)
ttttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGc < 1:4466748/93‑1 (MQ=255)
tttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCg > 1:1390627/1‑93 (MQ=255)
tttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCg < 1:3091076/93‑1 (MQ=255)
ttCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCgg < 1:3876424/93‑1 (MQ=255)
|
TTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGG > NC_000913/1960469‑1960648
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGA > NC_000913/1960466‑1960652
|
CCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCG > SRR4302537.4937676/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGC > SRR4302537.6380103/1‑94 (MQ=60)
TTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTG < SRR4302537.4526688/94‑1 (MQ=60)
TGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAG < SRR4302537.1796312/94‑1 (MQ=60)
GACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGT < SRR4302537.2913536/94‑1 (MQ=60)
ACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTT > SRR4302537.1177226/1‑94 (MQ=60)
ACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTT < SRR4302537.4051250/94‑1 (MQ=60)
ACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTT > SRR4302537.3063257/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA > SRR4302537.3997174/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA > SRR4302537.685361/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA > SRR4302537.4087414/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA < SRR4302537.2001008/94‑1 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA > SRR4302537.5966064/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGATAATTCACATCTTTTTCGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTA > SRR4302537.3855001/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTAT > SRR4302537.5795149/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTAT < SRR4302537.314392/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTAT < SRR4302537.212030/94‑1 (MQ=60)
GAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGCGCCTTTTTCGCTGAGTTATTA > SRR4302537.1491204/1‑94 (MQ=60)
AGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAA < SRR4302537.6375094/94‑1 (MQ=60)
GATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAAC > SRR4302537.89700/1‑94 (MQ=60)
GATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAAC < SRR4302537.5658129/94‑1 (MQ=60)
ATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACA > SRR4302537.1725452/1‑94 (MQ=60)
ATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACA > SRR4302537.2918069/1‑94 (MQ=60)
ATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACA < SRR4302537.5824336/94‑1 (MQ=60)
TAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACAT < SRR4302537.5241617/94‑1 (MQ=60)
TAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACAT > SRR4302537.5544386/1‑94 (MQ=60)
AATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATA < SRR4302537.5762729/94‑1 (MQ=60)
ATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATAC > SRR4302537.1482076/1‑94 (MQ=60)
ATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATAC < SRR4302537.4655798/94‑1 (MQ=60)
TTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACT > SRR4302537.5104874/1‑94 (MQ=60)
TTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACT > SRR4302537.2991162/1‑94 (MQ=60)
ACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGC > SRR4302537.2788741/1‑94 (MQ=60)
ACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGC < SRR4302537.965561/94‑1 (MQ=60)
CATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCG < SRR4302537.3194453/94‑1 (MQ=60)
CATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCG > SRR4302537.4997985/1‑94 (MQ=60)
ATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGA > SRR4302537.6021430/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCG < SRR4302537.5322133/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCG < SRR4302537.4424524/94‑1 (MQ=60)
TTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGT > SRR4302537.2104567/1‑94 (MQ=60)
TGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTA > SRR4302537.2414632/1‑94 (MQ=60)
GCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAAT > SRR4302537.5297446/1‑94 (MQ=60)
CATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATT > SRR4302537.1644940/1‑94 (MQ=60)
CATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATT > SRR4302537.1772256/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTT > SRR4302537.618903/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTT > SRR4302537.3192220/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTT > SRR4302537.6429454/1‑94 (MQ=60)
ATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTT > SRR4302537.5530411/1‑94 (MQ=60)
ACGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTT > SRR4302537.2125700/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTT < SRR4302537.4944764/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTT > SRR4302537.2134646/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTT > SRR4302537.4366571/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTT < SRR4302537.2601126/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGT < SRR4302537.4811559/94‑1 (MQ=60)
TTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCATTTTTTTGTCC > SRR4302537.496346/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTT < SRR4302537.5557462/94‑1 (MQ=60)
CAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTC > SRR4302537.99782/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTC > SRR4302537.1611839/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTC > SRR4302537.2300713/1‑94 (MQ=60)
GCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATGGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGC < SRR4302537.4356927/94‑1 (MQ=60)
GCTATTCCAGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGC > SRR4302537.1600155/1‑94 (MQ=60)
CTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCG < SRR4302537.4775676/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATA < SRR4302537.1214127/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATA < SRR4302537.320907/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATA > SRR4302537.5400096/1‑94 (MQ=60)
CCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAAT < SRR4302537.792445/94‑1 (MQ=60)
CCTGATAAATAATTGCAAAAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAAT < SRR4302537.1652966/94‑1 (MQ=60)
CTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATT < SRR4302537.1958899/94‑1 (MQ=60)
CTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATT > SRR4302537.349085/1‑94 (MQ=60)
CTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATT > SRR4302537.5848284/1‑94 (MQ=60)
TGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTC < SRR4302537.2707110/94‑1 (MQ=60)
TGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTC < SRR4302537.4505377/94‑1 (MQ=60)
GATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCA > SRR4302537.1510896/1‑94 (MQ=60)
GATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCA > SRR4302537.5347111/1‑94 (MQ=60)
ATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCAC < SRR4302537.5598037/94‑1 (MQ=60)
TAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACA < SRR4302537.1059537/94‑1 (MQ=60)
AAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAA > SRR4302537.4537529/1‑94 (MQ=60)
AAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAA < SRR4302537.3848813/94‑1 (MQ=60)
AATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAAT < SRR4302537.5679658/94‑1 (MQ=60)
AATAATTGCAAAAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAAT < SRR4302537.4057691/94‑1 (MQ=60)
ATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATC > SRR4302537.4940458/1‑94 (MQ=60)
ATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATC > SRR4302537.6356426/1‑94 (MQ=60)
ATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATC > SRR4302537.3612133/1‑94 (MQ=60)
AATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCAC > SRR4302537.4315660/1‑94 (MQ=60)
ATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCTCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACT < SRR4302537.5404005/94‑1 (MQ=60)
ATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACT > SRR4302537.1966530/1‑94 (MQ=60)
ATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACT < SRR4302537.1656325/94‑1 (MQ=60)
ATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACT < SRR4302537.5084026/94‑1 (MQ=60)
TTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTT < SRR4302537.3654906/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTC > SRR4302537.1661711/1‑94 (MQ=60)
TGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTC > SRR4302537.1327563/1‑94 (MQ=60)
GCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCA > SRR4302537.3021102/1‑94 (MQ=60)
CAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCAT < SRR4302537.1227076/94‑1 (MQ=60)
CAACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCAT > SRR4302537.2108904/1‑94 (MQ=60)
CAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCAT < SRR4302537.2196846/94‑1 (MQ=60)
ACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTA > SRR4302537.3587524/1‑94 (MQ=60)
ACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTA < SRR4302537.3626356/94‑1 (MQ=60)
ACAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTA < SRR4302537.1281766/94‑1 (MQ=60)
CAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTAC < SRR4302537.58293/94‑1 (MQ=60)
CAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTAC > SRR4302537.6438242/1‑94 (MQ=60)
CAAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTAC > SRR4302537.3181449/1‑94 (MQ=60)
AAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACG < SRR4302537.6355573/94‑1 (MQ=60)
AAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACG < SRR4302537.328674/94‑1 (MQ=60)
AAGACATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACG < SRR4302537.4919442/94‑1 (MQ=60)
CATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGT > SRR4302537.898613/1‑94 (MQ=60)
CATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGT > SRR4302537.6360035/1‑94 (MQ=60)
CATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGT < SRR4302537.1294317/94‑1 (MQ=60)
CATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGT > SRR4302537.6477690/1‑94 (MQ=60)
ATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTA < SRR4302537.3665331/94‑1 (MQ=60)
ATCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGCAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTA > SRR4302537.5439962/1‑94 (MQ=60)
TCGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTAC < SRR4302537.351473/94‑1 (MQ=60)
CGAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACC < SRR4302537.782703/94‑1 (MQ=60)
GAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCT > SRR4302537.4436094/1‑94 (MQ=60)
GAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCT > SRR4302537.29769/1‑94 (MQ=60)
GAGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCT > SRR4302537.1455129/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTT < SRR4302537.4858978/94‑1 (MQ=60)
CCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTA > SRR4302537.6008238/1‑94 (MQ=60)
CCTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTA > SRR4302537.6137201/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAG > SRR4302537.4486174/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAG > SRR4302537.5041634/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAG < SRR4302537.2602022/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAG < SRR4302537.5511627/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGC < SRR4302537.4180345/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGC > SRR4302537.1486747/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCG > SRR4302537.1400326/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCG < SRR4302537.4497639/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGG < SRR4302537.3112636/94‑1 (MQ=60)
TTTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGG < SRR4302537.818691/94‑1 (MQ=60)
TTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGT > SRR4302537.4465989/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGT < SRR4302537.3903537/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTG < SRR4302537.6025667/94‑1 (MQ=60)
CGCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGG < SRR4302537.4378436/94‑1 (MQ=60)
GCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGCGGA > SRR4302537.94546/1‑94 (MQ=60)
|
CCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGA > NC_000913/1960466‑1960652
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
