Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,012,638 |
T→C |
V463A (GTG→GCG) |
fliF → |
FliF |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,012,638 | 0 | T | C | 100.0%
| 543.6
/ NA
| 159 | V463A (GTG→GCG) | fliF | FliF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (76/83); total (76/83) |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCC > NC_000913/2012548‑2012727
|
gAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcg > 2:4578918/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgt > 2:150925/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgt < 1:496594/93‑1 (MQ=255)
aaaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgg > 1:517268/1‑92 (MQ=255)
aaGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgtg < 1:3769148/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgtggc < 1:4147271/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgtggc < 2:1481849/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGgcggcgtggc < 1:2276125/93‑1 (MQ=255)
cggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTTGTTTCTGGTACAGCTGGCGGCGTGgctgct < 1:3165717/93‑1 (MQ=255)
cggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGgctgct > 2:2125205/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGgtgctg > 2:5437158/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctg > 2:1882757/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctg > 2:4892807/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctg < 1:4178214/93‑1 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctg > 2:4695194/1‑93 (MQ=255)
ggAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctg > 1:712436/1‑93 (MQ=255)
gagaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGctgctgg > 2:3538390/1‑92 (MQ=255)
gaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTgg < 2:4191092/93‑1 (MQ=255)
gaACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTgg > 1:1938992/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGc < 2:2761447/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGc < 1:3378386/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGc < 1:84480/93‑1 (MQ=255)
tGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGa > 2:6129233/1‑93 (MQ=255)
gCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGaa > 2:2957996/1‑93 (MQ=255)
gCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGaa > 1:3247363/1‑93 (MQ=255)
ccATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGaaa < 2:2401836/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAg > 1:3309043/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGc > 1:1040053/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGc < 2:413114/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGc > 2:5261147/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCAACAGCAGGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCgg < 2:3932821/93‑1 (MQ=255)
cTGGCACGAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGt < 1:1845145/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGt < 2:3001913/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGt > 1:1477007/1‑93 (MQ=255)
tGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTa < 1:4679366/93‑1 (MQ=255)
tGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTa > 2:4510689/1‑93 (MQ=255)
ggCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAACTGGTAc > 1:5114301/1‑93 (MQ=255)
gCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCCGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGAAGCGGTAct > 2:5993050/1‑92 (MQ=255)
aaCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTc > 2:114668/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTc < 1:2627830/93‑1 (MQ=255)
cAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGGTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCg < 1:1988045/93‑1 (MQ=255)
gCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCa > 2:4806153/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGGACGTCCGCa > 2:5583031/1‑93 (MQ=255)
cAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAg > 2:3406135/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc < 2:3328494/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc < 1:5503700/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc > 2:3049524/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGc < 2:1771471/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCt > 1:3043542/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTa > 1:5199994/1‑93 (MQ=255)
gTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAac < 1:1110657/93‑1 (MQ=255)
tttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTTGCTGCTGTGGCGGCAAGCGGTACGTCCGCAGTTAaca > 2:5514085/1‑93 (MQ=255)
ttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAacac < 2:2569770/93‑1 (MQ=255)
ttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAacac < 2:4897996/93‑1 (MQ=255)
ttATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAacac < 1:4562322/93‑1 (MQ=255)
aTCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGt < 2:2445783/93‑1 (MQ=255)
tCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTc < 2:4660492/93‑1 (MQ=255)
tCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGCTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTc < 2:60816/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTcgcg > 1:4289709/1‑93 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg < 1:5775929/93‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAg < 2:5548465/93‑1 (MQ=255)
tACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAgg > 1:4993803/1‑93 (MQ=255)
aCTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAggg > 2:4421965/1‑92 (MQ=255)
ttGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGa > 1:5654090/1‑93 (MQ=255)
gctgcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATg > 1:302944/1‑93 (MQ=255)
ctgcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGa > 1:3375041/1‑93 (MQ=255)
ctgcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGa < 2:4981905/93‑1 (MQ=255)
ctgcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGa < 1:6364057/93‑1 (MQ=255)
gcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaaa < 1:4773931/93‑1 (MQ=255)
gcCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGaaa < 1:4600951/93‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGACAGCTg > 1:2533984/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGt < 2:1047669/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTa < 1:1803933/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAc < 2:727877/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACa < 1:1499967/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACa > 1:2102858/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACa < 1:2448186/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACa < 1:3957517/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGc > 2:702365/1‑93 (MQ=255)
ggTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGc > 1:5982959/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCa > 2:3711510/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCa > 1:1791923/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCaa > 1:2446017/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAAc < 1:1696125/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACa < 1:3923579/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACa < 2:6340410/93‑1 (MQ=255)
cTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAg > 1:5841580/1‑93 (MQ=255)
tGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAgg > 2:3363027/1‑93 (MQ=255)
tgTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGgc < 2:3631224/92‑1 (MQ=255)
ggTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAggg > 1:157102/1‑92 (MQ=255)
aCTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCa > 1:5530448/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAg < 1:1911838/93‑1 (MQ=255)
ctgctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAg > 2:5715788/1‑93 (MQ=255)
cggctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAg < 2:3000173/91‑1 (MQ=255)
tgctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAgg < 2:1532494/93‑1 (MQ=255)
gctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGc > 2:2214658/1‑93 (MQ=255)
gctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGc < 2:3280853/93‑1 (MQ=255)
ctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGcc < 1:6354726/93‑1 (MQ=255)
ctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGcc < 2:1799513/93‑1 (MQ=255)
ctgGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGcc < 2:1883288/93‑1 (MQ=255)
|
ACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCC > NC_000913/2012548‑2012727
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCCGC > NC_000913/2012545‑2012729
|
GTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGC > SRR4302537.5584036/1‑94 (MQ=60)
GTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCAATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGC < SRR4302537.3475040/94‑1 (MQ=60)
GTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCAATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGC < SRR4302537.3003766/94‑1 (MQ=60)
TGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCG > SRR4302537.1413845/1‑94 (MQ=60)
TGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCG < SRR4302537.3871584/94‑1 (MQ=60)
ACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGC > SRR4302537.4137898/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGT > SRR4302537.3312778/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGG > SRR4302537.520824/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTG < SRR4302537.500011/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGG > SRR4302537.3056768/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGG < SRR4302537.3795611/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCT < SRR4302537.5556957/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCT < SRR4302537.4176214/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCT < SRR4302537.2292196/94‑1 (MQ=60)
CGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTTGTTTCTGGTACAGCTGGCGGCGTGGCTGCTG < SRR4302537.3187949/94‑1 (MQ=60)
CGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTG > SRR4302537.717313/1‑94 (MQ=60)
GGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGT < SRR4302537.4207383/94‑1 (MQ=60)
AGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGG > SRR4302537.1952475/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCG < SRR4302537.3402326/94‑1 (MQ=60)
AACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCG < SRR4302537.85098/94‑1 (MQ=60)
ACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGG < SRR4302537.2543916/94‑1 (MQ=60)
CTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGA > SRR4302537.22828/1‑94 (MQ=60)
CTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGA > SRR4302537.1494586/1‑94 (MQ=60)
TGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAA > SRR4302537.3270249/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302537.1815583/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG > SRR4302537.3332447/1‑94 (MQ=60)
CCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAG < SRR4302537.4608035/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGC > SRR4302537.1047211/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGG < SRR4302537.3974985/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGT < SRR4302537.5206667/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGT < SRR4302537.3374586/94‑1 (MQ=60)
TCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGT > SRR4302537.1487274/1‑94 (MQ=60)
CTGGCACGAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTA < SRR4302537.1857986/94‑1 (MQ=60)
TGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTAC < SRR4302537.4711741/94‑1 (MQ=60)
TGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTAC < SRR4302537.6400499/94‑1 (MQ=60)
TGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAACTGGTAC > SRR4302537.5149553/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGT > SRR4302537.4708484/1‑94 (MQ=60)
AACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCC < SRR4302537.2646236/94‑1 (MQ=60)
CAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGGTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGC < SRR4302537.2001868/94‑1 (MQ=60)
AGCAAGCGTTTATCGATCAGTTGCTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTGCGTCCGCA < SRR4302537.5712137/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGC > SRR4302537.4310610/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTTGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGGAAGCGGTACGTCCGCcgcc > SRR4302537.3498247/1‑90 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT > SRR4302537.3064745/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT < SRR4302537.5651203/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT < SRR4302537.5541281/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCT < SRR4302537.503556/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTA > SRR4302537.5235764/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACA < SRR4302537.1118329/94‑1 (MQ=60)
TTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACG < SRR4302537.4593903/94‑1 (MQ=60)
GATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCG > SRR4302537.4319525/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCG > SRR4302537.2015674/1‑94 (MQ=60)
AGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGA > SRR4302537.5027140/1‑94 (MQ=60)
AGTTACTTGCTCCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTCACACGTCGCGCTGA > SRR4302537.5853351/1‑94 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG > SRR4302537.5028211/1‑94 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG < SRR4302537.834881/94‑1 (MQ=60)
TTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGG < SRR4302537.5815521/94‑1 (MQ=60)
ACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCG < SRR4302537.4518860/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGA > SRR4302537.5692783/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATG > SRR4302537.305053/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGA > SRR4302537.3398960/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAA < SRR4302537.6407470/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAA < SRR4302537.188959/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAA < SRR4302537.3211334/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAG < SRR4302537.4632797/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAG < SRR4302537.4806890/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGACAGCTG > SRR4302537.2551768/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGT > SRR4302537.1832474/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTA < SRR4302537.1956095/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTA < SRR4302537.5399047/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTAC < SRR4302537.1816520/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACA > SRR4302537.2117686/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG < SRR4302537.3985207/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG < SRR4302537.2465409/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG < SRR4302537.1510435/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAG < SRR4302537.626653/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGC > SRR4302537.6024025/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCA > SRR4302537.1804433/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAA > SRR4302537.6005284/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAA > SRR4302537.2463228/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACA < SRR4302537.1707991/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG > SRR4302537.1232910/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG < SRR4302537.3021392/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG < SRR4302537.3950994/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG < SRR4302537.3868814/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAG > SRR4302537.5881635/1‑94 (MQ=60)
TGGTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGG > SRR4302537.158221/1‑94 (MQ=60)
GTACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGC > SRR4302537.1575229/1‑94 (MQ=60)
TACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCA > SRR4302537.5568200/1‑94 (MQ=60)
GACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCA < SRR4302537.2455171/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAG < SRR4302537.2611208/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGG < SRR4302537.1925109/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCC < SRR4302537.497276/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCC < SRR4302537.1775355/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCC < SRR4302537.6398100/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCCGC < SRR4302537.3036346/94‑1 (MQ=60)
|
GTGACGAAAGCGGCGGAGAACTGCCATTCTGGCAACAGCAAGCGTTTATCGATCAGTTACTTGCTGCCGGTCGCTGGTTGCTGGTACTGCTGGTGGCGTGGCTGCTGTGGCGGAAAGCGGTACGTCCGCAGCTAACACGTCGCGCTGAGGCGATGAAAGCTGTACAGCAACAGGCGCAGGCCCGC > NC_000913/2012545‑2012729
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
