Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,555,475 |
A→G |
F409L (TTC→CTC) |
b2441 ← |
ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,555,475 | 0 | A | G | 97.7%
| 575.3
/ 2.3
| 176 | F409L (TTC→CTC) | b2441 | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base G (81/91); total (83/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.63e-01 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGG > NC_000913/2555385‑2555566
|
cATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggt < 2:204743/93‑1 (MQ=255)
cATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggt > 1:2910439/1‑93 (MQ=255)
aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggtg > 2:6271989/1‑93 (MQ=255)
aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggtg > 1:4990552/1‑93 (MQ=255)
tAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCCTGGGGTGCggggg > 1:3547997/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggtggt < 2:914148/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCggtggt < 2:2560785/93‑1 (MQ=255)
tGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCt > 1:4416976/1‑93 (MQ=255)
cccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTgg < 1:1567792/93‑1 (MQ=255)
cccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTgg < 2:5536264/93‑1 (MQ=255)
ccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGt > 1:1359025/1‑93 (MQ=255)
ccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGt > 2:266231/1‑93 (MQ=255)
ccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGt < 1:6300032/93‑1 (MQ=255)
cATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTa < 1:6153138/93‑1 (MQ=255)
aTGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAg < 2:3351690/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGt > 1:1679714/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGt > 2:2383283/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGGGCGGTGGTCTGGTAGt > 1:5605194/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTg < 2:1316140/93‑1 (MQ=255)
tttCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGa < 1:5587958/93‑1 (MQ=255)
tttCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGa > 1:1387060/1‑93 (MQ=255)
tttCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGa < 1:5297202/93‑1 (MQ=255)
tttCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGa < 2:2478854/93‑1 (MQ=255)
ccagccagCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCa < 1:3727937/93‑1 (MQ=255)
ccagccagCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCa < 2:2856004/93‑1 (MQ=255)
gccagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatga < 1:2954012/93‑1 (MQ=255)
cagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgatg < 2:2369351/93‑1 (MQ=255)
gcGTTCAAGCTCTGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtc < 2:6159178/93‑1 (MQ=255)
gcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtc > 1:4920115/1‑93 (MQ=255)
gcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtc > 2:4488447/1‑93 (MQ=255)
cGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtca < 2:3998734/93‑1 (MQ=255)
gTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTTGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat < 1:3744475/93‑1 (MQ=255)
gTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat < 1:3893842/93‑1 (MQ=255)
gTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat > 2:4249270/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcatc > 1:1813352/1‑93 (MQ=255)
ttCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcatc > 1:3870498/1‑93 (MQ=255)
cAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGTTAGTTGAGCATGATGTCATCAc < 2:4905563/93‑1 (MQ=255)
cAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAc > 2:5745436/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAcc < 1:3329282/93‑1 (MQ=255)
aaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAccc < 1:1803778/93‑1 (MQ=255)
aaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAccc < 1:5880393/93‑1 (MQ=255)
aaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAccc > 2:1987925/1‑93 (MQ=255)
aaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCAccc > 1:5352801/1‑93 (MQ=255)
aCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCa > 2:181299/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGc < 1:1974354/93‑1 (MQ=255)
cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCgg < 2:5725329/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGc > 1:2235287/1‑93 (MQ=255)
gTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCa > 1:6160320/1‑93 (MQ=255)
tGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCac > 1:4034139/1‑92 (MQ=255)
gACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATc < 2:6011344/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATccc < 2:2809041/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATccc > 2:726249/1‑93 (MQ=255)
gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATcccc > 1:2522974/1‑93 (MQ=255)
ggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCa < 1:2731326/93‑1 (MQ=255)
ggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCa > 2:1701110/1‑93 (MQ=255)
cgcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatg > 2:4768471/1‑93 (MQ=255)
gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTTGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatga < 2:1236134/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatga < 2:4906268/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatga < 2:369519/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatga < 2:5860749/93‑1 (MQ=255)
gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatga > 1:126761/1‑93 (MQ=255)
aGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCatgatg > 2:3631835/1‑93 (MQ=255)
ggTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGt > 1:4944419/1‑93 (MQ=255)
gTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTTCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGtg > 2:3289214/1‑92 (MQ=255)
ttGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAg < 2:2484930/93‑1 (MQ=255)
tGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGt < 1:6451226/93‑1 (MQ=255)
gAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGtt > 1:4227832/1‑93 (MQ=255)
gAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGtt > 1:4840480/1‑93 (MQ=255)
tAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCa < 1:2814916/93‑1 (MQ=255)
tAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCa < 2:6203091/93‑1 (MQ=255)
aCTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGc > 2:1669467/1‑93 (MQ=255)
cTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGcc < 2:2179573/93‑1 (MQ=255)
tGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCt < 1:4695174/93‑1 (MQ=255)
aCGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGc < 2:3473593/93‑1 (MQ=255)
cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCg > 2:3423028/1‑93 (MQ=255)
cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCg < 1:457491/93‑1 (MQ=255)
cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCg > 2:1126891/1‑93 (MQ=255)
cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCg < 1:726470/93‑1 (MQ=255)
cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCg > 2:6076129/1‑93 (MQ=255)
gCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCgg > 2:1616111/1‑93 (MQ=255)
cacaGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGt < 1:3016389/93‑1 (MQ=255)
caGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTgg < 1:3067713/93‑1 (MQ=255)
aGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGc > 1:4237009/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGGTATCGTGGAGTTCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCg < 1:603557/93‑1 (MQ=255)
gCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGc < 1:5860054/93‑1 (MQ=255)
gCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGc > 1:5479723/1‑93 (MQ=255)
ggTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAg < 2:3640049/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAg < 1:545705/93‑1 (MQ=255)
ggTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAg < 1:3950240/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGa < 1:3304427/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGa < 2:3983338/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGa < 2:5213055/93‑1 (MQ=255)
tATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGa < 2:4085998/93‑1 (MQ=255)
aTCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGat < 1:2889617/93‑1 (MQ=255)
tGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCCGGatcatc > 1:6173862/1‑93 (MQ=255)
tGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGatcatc < 1:4799066/93‑1 (MQ=255)
tGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGatcatc > 2:1938041/1‑93 (MQ=255)
tGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGatcatc < 1:799611/93‑1 (MQ=255)
ggAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGAtcatca > 2:290331/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAgg > 2:1002436/1‑93 (MQ=255)
|
TTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGG > NC_000913/2555385‑2555566
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGGT > NC_000913/2555382‑2555567
|
CGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAG < SRR4302537.2472874/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAG < SRR4302537.1133514/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGT < SRR4302537.672753/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTG < SRR4302537.1132900/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTG < SRR4302537.1041281/94‑1 (MQ=60)
TTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGC < SRR4302537.203547/94‑1 (MQ=60)
TGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCG < SRR4302537.4835242/94‑1 (MQ=60)
CCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGT > SRR4302537.2930887/1‑94 (MQ=60)
CCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGT < SRR4302537.1793650/94‑1 (MQ=60)
CATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTG > SRR4302537.5024945/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCT > SRR4302537.4447466/1‑94 (MQ=60)
TGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTG < SRR4302537.5358155/94‑1 (MQ=60)
CCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGT > SRR4302537.3339463/1‑94 (MQ=60)
CCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGT > SRR4302537.1368487/1‑94 (MQ=60)
CCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGT < SRR4302537.1578730/94‑1 (MQ=60)
CCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTA > SRR4302537.3908858/1‑94 (MQ=60)
CCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTA < SRR4302537.6343180/94‑1 (MQ=60)
CATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAG < SRR4302537.3279683/94‑1 (MQ=60)
CATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAG < SRR4302537.6195466/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGT > SRR4302537.1691465/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGGGCGGTGGTCTGGTAGT > SRR4302537.5643515/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGA > SRR4302537.1396731/1‑94 (MQ=60)
TTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAG < SRR4302537.5626169/94‑1 (MQ=60)
TTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAG < SRR4302537.5333592/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCAT < SRR4302537.3754125/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCAT > SRR4302537.4684643/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATG < SRR4302537.5173349/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGAT > SRR4302537.5768947/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGAT < SRR4302537.2974740/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTC < SRR4302537.6099111/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTC > SRR4302537.4954054/1‑94 (MQ=60)
GCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCA < SRR4302537.3952945/94‑1 (MQ=60)
GTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTTGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATC < SRR4302537.3770768/94‑1 (MQ=60)
GTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATC < SRR4302537.3921065/94‑1 (MQ=60)
GTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATC > SRR4302537.1825994/1‑94 (MQ=60)
GTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATC > SRR4302537.3897582/1‑94 (MQ=60)
CAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACC > SRR4302537.4732513/1‑94 (MQ=60)
CAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACC > SRR4302537.652949/1‑94 (MQ=60)
AAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCC < SRR4302537.3352839/94‑1 (MQ=60)
AAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCC > SRR4302537.5389463/1‑94 (MQ=60)
AACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCA < SRR4302537.5920736/94‑1 (MQ=60)
AACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCA < SRR4302537.1816365/94‑1 (MQ=60)
AACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCAAGGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGGGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCA > SRR4302537.6448872/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCG < SRR4302537.4018113/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCG > SRR4302537.1822850/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCG < SRR4302537.1988077/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCCCCCAGCGG < SRR4302537.5510536/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGG < SRR4302537.4389631/94‑1 (MQ=60)
CGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGC > SRR4302537.2251052/1‑94 (MQ=60)
GGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCA > SRR4302537.6202715/1‑94 (MQ=60)
GGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCA < SRR4302537.9836/94‑1 (MQ=60)
GTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCAT < SRR4302537.2844527/94‑1 (MQ=60)
GTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCAC > SRR4302537.4062376/1‑94 (MQ=60)
TGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATC < SRR4302537.6287301/94‑1 (MQ=60)
TGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATC < SRR4302537.5901967/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCC > SRR4302537.2540687/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCAT < SRR4302537.2750391/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGA > SRR4302537.127668/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGAT > SRR4302537.1511144/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATG < SRR4302537.2554623/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATG > SRR4302537.4907565/1‑94 (MQ=60)
AGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGT > SRR4302537.4978516/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTAACTGACGCGCAGTGGCTGTATCGTGGAGTGGGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGT < SRR4302537.1580852/94‑1 (MQ=60)
TGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTT < SRR4302537.6001216/94‑1 (MQ=60)
TGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTT > SRR4302537.4257268/1‑94 (MQ=60)
TGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTT > SRR4302537.4992544/1‑94 (MQ=60)
TGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTT > SRR4302537.4873890/1‑94 (MQ=60)
TGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTT < SRR4302537.6494969/94‑1 (MQ=60)
TAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAG < SRR4302537.2834597/94‑1 (MQ=60)
ACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCC < SRR4302537.4472800/94‑1 (MQ=60)
CTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCT > SRR4302537.13924/1‑94 (MQ=60)
TGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTG < SRR4302537.4727651/94‑1 (MQ=60)
TGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTG < SRR4302537.3018794/94‑1 (MQ=60)
GACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGCTGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGC < SRR4302537.3480681/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGTATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGG > SRR4302537.6197703/1‑94 (MQ=60)
CGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGG < SRR4302537.731428/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGG < SRR4302537.460646/94‑1 (MQ=60)
CACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTG < SRR4302537.3037415/94‑1 (MQ=60)
CACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTG > SRR4302537.2770853/1‑94 (MQ=60)
ACAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGG > SRR4302537.2912319/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGC < SRR4302537.3089084/94‑1 (MQ=60)
CAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGC > SRR4302537.6376944/1‑94 (MQ=60)
CAGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGC > SRR4302537.4266483/1‑94 (MQ=60)
AGTGGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCG > SRR4302537.753524/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGGTATCGTGGAGTTCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGA < SRR4302537.607684/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGC > SRR4302537.5517134/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGC < SRR4302537.3819220/94‑1 (MQ=60)
GCGGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCA < SRR4302537.5900238/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGTAGG > SRR4302537.2424268/1‑94 (MQ=60)
GGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGG < SRR4302537.3977868/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGG < SRR4302537.549458/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGGAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGGATCCCCATGATGGAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGG > SRR4302537.5466786/1‑94 (MQ=60)
TATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGAT < SRR4302537.3327790/94‑1 (MQ=60)
ATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATC < SRR4302537.2909897/94‑1 (MQ=60)
ATCGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATC > SRR4302537.4240010/1‑94 (MQ=60)
CGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCAT < SRR4302537.554026/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCAT > SRR4302537.3588636/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCCGGATCATC > SRR4302537.6216383/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCA < SRR4302537.805103/94‑1 (MQ=60)
TGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCA > SRR4302537.3059092/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCA < SRR4302537.4832176/94‑1 (MQ=60)
GGAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAG > SRR4302537.4045816/1‑94 (MQ=60)
GAGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGG > SRR4302537.2426857/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGGT < SRR4302537.3403207/94‑1 (MQ=60)
|
CGTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCCCATGATGTAGTTGCAGCCTGCGGTGGCGAGCAGGATCATCAGGT > NC_000913/2555382‑2555567
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
