Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,747,389 |
Δ1 bp |
coding (572/591 nt) |
b4540 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,747,388 | 0 | C | . | 100.0%
| 1020.7
/ NA
| 217 | coding (571/591 nt) | b4540 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (95/122); total (95/122) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGC > NC_000913/2747296‑2747476
|
ctTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATc < 2:1076409/93‑1 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCTCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct > 2:2046043/1‑92 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct > 1:5629759/1‑92 (MQ=255)
tttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATct > 2:2155032/1‑92 (MQ=255)
ttGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctg < 1:2030228/93‑3 (MQ=255)
gAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctgga < 1:5048854/93‑5 (MQ=255)
gAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATctgga > 1:887122/1‑89 (MQ=255)
gCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaa > 1:3006487/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaa > 1:2896227/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaa > 2:1816903/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa > 2:4040883/1‑93 (MQ=255)
aaaGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa < 1:3358832/93‑1 (MQ=255)
aaaGAAGAGTCGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaa < 1:1873198/93‑1 (MQ=255)
aagaagAGTTGCGCACTGTCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGaaaaaa > 1:2252533/1‑93 (MQ=255)
agaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAt < 2:3369991/93‑1 (MQ=255)
agaagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAAt > 2:2626074/1‑93 (MQ=255)
aagaGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGa > 1:2785660/1‑93 (MQ=255)
agagTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAc > 2:3678687/1‑93 (MQ=255)
agagTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAc < 2:240491/93‑1 (MQ=255)
gagTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAcc > 1:2062638/1‑93 (MQ=255)
agTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCg < 2:618986/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGt < 1:3397297/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGt > 2:3949438/1‑93 (MQ=255)
ttGCGCACAATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGCACGtt > 2:6288973/1‑93 (MQ=255)
cgcACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtgat < 1:4310432/93‑1 (MQ=255)
gcACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtgatg > 2:2709792/1‑93 (MQ=255)
cACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtgatga < 2:5468187/93‑1 (MQ=255)
cACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTtgatga > 1:4466324/1‑93 (MQ=255)
aCTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAc > 1:1446472/1‑93 (MQ=255)
tATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcat < 2:4460864/93‑1 (MQ=255)
cGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatcat < 2:4826387/93‑1 (MQ=255)
cGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatcat < 2:1870356/93‑1 (MQ=255)
cGTGCACGAATAACGCTCACAAATTTGGCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑ATGGAAAAAATGACCGTTGATGAcatcat > 2:1132739/1‑93 (MQ=255)
gCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGt > 1:6277819/1‑93 (MQ=255)
gCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGt > 1:4114254/1‑93 (MQ=255)
aCGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGc < 1:2696060/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGAACGTTGATGACATCATGGTGCcgcg > 2:6347897/1‑93 (MQ=255)
cACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCa > 1:5947476/1‑93 (MQ=255)
aCGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAg < 2:2463266/93‑1 (MQ=255)
cGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGt < 2:3068275/93‑1 (MQ=255)
gCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTg < 2:2988297/93‑1 (MQ=255)
gCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTg < 1:2271543/93‑1 (MQ=255)
cTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGa > 2:3814715/1‑93 (MQ=255)
cTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGa > 1:3563065/1‑93 (MQ=255)
tCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGaa > 1:4174149/1‑93 (MQ=255)
tCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGaa > 2:4387462/1‑93 (MQ=255)
cacaAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGaaa < 1:3959573/93‑1 (MQ=255)
acaAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAt > 2:1712689/1‑93 (MQ=255)
caAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAtt > 2:1089351/1‑93 (MQ=255)
caAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAtt < 2:713781/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAt > 2:4063392/1‑93 (MQ=255)
aaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAt < 1:697740/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAt < 1:4098314/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTAt < 2:6164867/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATc < 2:1447117/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATc < 1:1114745/93‑1 (MQ=255)
aTTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATc < 1:6100632/93‑1 (MQ=255)
ttCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCgg < 2:5240638/93‑1 (MQ=255)
tCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGt > 1:323373/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAt > 2:5126161/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAt > 2:2544029/1‑93 (MQ=255)
cGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAtt < 2:4719622/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAtt < 2:3801624/93‑1 (MQ=255)
cGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGat < 1:726232/93‑1 (MQ=255)
cGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGat < 1:214480/93‑1 (MQ=255)
gCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGata < 1:5911215/93‑1 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa > 2:362026/1‑93 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa < 1:3169829/93‑1 (MQ=255)
tCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCaa < 2:5970049/93‑1 (MQ=255)
aGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACg > 2:4188699/1‑93 (MQ=255)
ggATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGa < 2:3924295/93‑1 (MQ=255)
ggATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGa < 2:670744/93‑1 (MQ=255)
gATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAt < 1:5686966/93‑1 (MQ=255)
gATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAt > 1:5253790/1‑93 (MQ=255)
gATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAt > 1:6362098/1‑93 (MQ=255)
atatGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATg > 2:5852177/1‑93 (MQ=255)
tatGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGa > 1:5089089/1‑93 (MQ=255)
tatGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGa > 1:2577557/1‑93 (MQ=255)
atGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGAc < 2:6305032/93‑1 (MQ=255)
tgctgcTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACt > 2:2188859/1‑93 (MQ=255)
ctgctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTgg < 1:1957488/93‑1 (MQ=255)
ctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa > 2:1546668/1‑93 (MQ=255)
ctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa < 1:1593575/93‑1 (MQ=255)
ctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa < 2:4987016/93‑1 (MQ=255)
ctgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGaaa > 1:3416755/1‑93 (MQ=255)
tgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt < 2:4595851/93‑1 (MQ=255)
tgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt > 1:2417353/1‑93 (MQ=255)
tgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt < 2:1174651/93‑1 (MQ=255)
tgTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt > 1:1325654/1‑93 (MQ=255)
tgTCGGGGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGCGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAt > 1:575177/1‑93 (MQ=255)
gTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATc < 2:4536277/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATc < 2:3225010/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCg < 2:5332578/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 1:784898/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATCAACGTTGATGACATCATGGTGCCGGGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAt < 1:2115317/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTc < 2:2951157/93‑1 (MQ=255)
gCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCt < 2:4493666/93‑1 (MQ=255)
gCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCt > 1:3410267/1‑93 (MQ=255)
gCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCt < 2:1963455/93‑1 (MQ=255)
tCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTgc > 2:492462/1‑93 (MQ=255)
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGC > NC_000913/2747296‑2747476
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCA > NC_000913/2747296‑2747480
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCT > SRR4302537.5668275/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCT > SRR4302537.3285995/1‑94 (MQ=60)
TTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGG < SRR4302537.2044382/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGA > SRR4302537.893225/1‑94 (MQ=60)
TAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAA < SRR4302537.1920514/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAA < SRR4302537.5083618/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAA < SRR4302537.2933470/94‑1 (MQ=60)
AGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAA > SRR4302537.2916556/1‑94 (MQ=60)
AGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAA > SRR4302537.3027422/1‑94 (MQ=60)
GCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAA < SRR4302537.5673413/94‑1 (MQ=60)
CAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAA > SRR4302537.3699436/1‑94 (MQ=60)
AAAGAAGAGTTGCGCACTGTCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAA > SRR4302537.2268433/1‑94 (MQ=60)
AAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAA < SRR4302537.3382623/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAA < SRR4302537.1498696/94‑1 (MQ=60)
AAAGAAGAGTCGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAA < SRR4302537.1886231/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGA < SRR4302537.4178124/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGA > SRR4302537.2805135/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACC > SRR4302537.2077122/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCG < SRR4302537.3044376/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGT < SRR4302537.6114314/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGT > SRR4302537.865050/1‑94 (MQ=60)
GTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTT < SRR4302537.3421358/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTT < SRR4302537.5796129/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTG < SRR4302537.3684171/94‑1 (MQ=60)
GCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGAT < SRR4302537.6070976/94‑1 (MQ=60)
CGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATG < SRR4302537.4340388/94‑1 (MQ=60)
GCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGA > SRR4302537.4497215/1‑94 (MQ=60)
CACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAC > SRR4302537.1456551/1‑94 (MQ=60)
CACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAC > SRR4302537.6370528/1‑94 (MQ=60)
CACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAC > SRR4302537.2477705/1‑94 (MQ=60)
CACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGAC < SRR4302537.2352108/94‑1 (MQ=60)
CTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACAT > SRR4302537.3407196/1‑94 (MQ=60)
TATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATTACCGTTGATGACATC > SRR4302537.2058094/1‑94 (MQ=60)
ATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCA > SRR4302537.2026724/1‑94 (MQ=60)
CGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTACCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATG > SRR4302537.4047883/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGG > SRR4302537.2405728/1‑94 (MQ=60)
GTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGG > SRR4302537.321616/1‑94 (MQ=60)
TGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGT > SRR4302537.4142994/1‑94 (MQ=60)
TGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGT < SRR4302537.4163965/94‑1 (MQ=60)
TGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGT < SRR4302537.3021913/94‑1 (MQ=60)
TGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGT > SRR4302537.6320885/1‑94 (MQ=60)
TGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGT < SRR4302537.5128812/94‑1 (MQ=60)
ACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCC < SRR4302537.3436330/94‑1 (MQ=60)
ACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCC < SRR4302537.2714896/94‑1 (MQ=60)
GAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGC > SRR4302537.1599919/1‑94 (MQ=60)
TCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCA > SRR4302537.5988298/1‑94 (MQ=60)
CGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTG < SRR4302537.4141128/94‑1 (MQ=60)
GCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGA < SRR4302537.2287584/94‑1 (MQ=60)
GCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGA > SRR4302537.4448419/1‑94 (MQ=60)
GCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGA > SRR4302537.3588197/1‑94 (MQ=60)
CTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAA > SRR4302537.4203295/1‑94 (MQ=60)
TCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAATGAAA > SRR4302537.722309/1‑94 (MQ=60)
CACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAT < SRR4302537.3987277/94‑1 (MQ=60)
CACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAAT < SRR4302537.199876/94‑1 (MQ=60)
ACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATT > SRR4302537.3498418/1‑94 (MQ=60)
ACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATT < SRR4302537.5983215/94‑1 (MQ=60)
CAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTA > SRR4302537.5932702/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATC < SRR4302537.4126923/94‑1 (MQ=60)
AATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATC < SRR4302537.702519/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCG < SRR4302537.6142549/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCG < SRR4302537.2144435/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCG < SRR4302537.1122440/94‑1 (MQ=60)
TTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGG > SRR4302537.2747122/1‑94 (MQ=60)
TTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGG > SRR4302537.168417/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGT > SRR4302537.2286735/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGT > SRR4302537.325616/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTAT > SRR4302537.2623916/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCGGCGCAGTGAAATTATCGGTATT < SRR4302537.734777/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTG > SRR4302537.4327794/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTG > SRR4302537.1969620/1‑94 (MQ=60)
GTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGCT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGGGCAGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGA > SRR4302537.270226/1‑94 (MQ=60)
TCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGAT > SRR4302537.122929/1‑94 (MQ=60)
CGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATA < SRR4302537.216009/94‑1 (MQ=60)
CGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATA < SRR4302537.731188/94‑1 (MQ=60)
GCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATAT < SRR4302537.5951776/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCA < SRR4302537.2096498/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCA < SRR4302537.6201526/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCA < SRR4302537.5768419/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAA > SRR4302537.2244555/1‑94 (MQ=60)
TCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAAC < SRR4302537.3192099/94‑1 (MQ=60)
CAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACG < SRR4302537.6473945/94‑1 (MQ=60)
GGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAT > SRR4302537.6405504/1‑94 (MQ=60)
GGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGAT > SRR4302537.5289944/1‑94 (MQ=60)
GATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATG < SRR4302537.5086511/94‑1 (MQ=60)
GATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATG < SRR4302537.5725865/94‑1 (MQ=60)
GATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATG < SRR4302537.5348264/94‑1 (MQ=60)
ATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGA > SRR4302537.5124124/1‑94 (MQ=60)
ATATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGA > SRR4302537.2595601/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACT < SRR4302537.3343891/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGA < SRR4302537.855642/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGA > SRR4302537.676610/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGA > SRR4302537.4595649/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGA < SRR4302537.1971107/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAA > SRR4302537.3440945/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAA < SRR4302537.3439023/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT > SRR4302537.2434357/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT < SRR4302537.1604713/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT < SRR4302537.1432634/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT > SRR4302537.1334895/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGGGGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGCGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAAT > SRR4302537.579123/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATC < SRR4302537.4860439/94‑1 (MQ=60)
TGTCGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATC < SRR4302537.291252/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGAT > SRR4302537.5322196/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATT < SRR4302537.2145524/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATT < SRR4302537.790286/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTCGAT‑CTGGAAAAAATCAACGTTGATGACATCATGGTGCCGGGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATT < SRR4302537.2130219/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCT > SRR4302537.3434420/1‑94 (MQ=60)
CGAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGC > SRR4302537.935358/1‑94 (MQ=60)
GAT‑CTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCC < SRR4302537.1940126/94‑1 (MQ=60)
atCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCA > SRR4302537.4551633/3‑94 (MQ=60)
|
CTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAATCAGGATATGCTGCTGTCGGTGCTCGATCCTGGAAAAAATGACCGTTGATGACATCATGGTGCCGCGCAGTGAAATTATCGGTATTGATATCAACGATGACTGGAAATCGATTCTGCGCCA > NC_000913/2747296‑2747480
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
