Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,783,519 |
T→C |
intergenic (+147/+263) |
b2651 → / ← ileY |
hypothetical protein/tRNA‑Ile |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,783,519 | 0 | T | C | 100.0%
| 1031.0
/ NA
| 288 | intergenic (+147/+263) | b2651/ileY | hypothetical protein/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (147/141); total (147/141) |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT > NC_000913/2783429‑2783607
|
gtgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGacaa < 2:1368110/93‑1 (MQ=255)
tgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGacaat < 1:1178943/93‑1 (MQ=255)
ggTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGacaata > 1:2715854/1‑93 (MQ=255)
gTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGCGTAATTAACATGATTAAATGAAGGGGAATAATAAATGACAATAc > 2:1750595/1‑93 (MQ=255)
aCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATActc < 1:808685/93‑1 (MQ=255)
aCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATActc < 1:1595534/93‑1 (MQ=255)
aCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATActc < 2:6422944/93‑1 (MQ=255)
cTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATActct > 2:2144132/1‑93 (MQ=255)
ccTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGc < 1:1356323/92‑1 (MQ=255)
aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGc > 2:518993/1‑93 (MQ=255)
cTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAGCCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCt > 1:3701491/1‑93 (MQ=255)
cTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCt < 2:3438141/93‑1 (MQ=255)
atcatcAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTa > 2:4391825/1‑93 (MQ=255)
atcatcAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTa > 2:5064625/1‑93 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTAt > 1:2406609/1‑93 (MQ=255)
catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATc < 1:2010376/93‑1 (MQ=255)
catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATc < 1:5905398/93‑1 (MQ=255)
catcaGTGACCGAACATATAATAGTTCACTAATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGCGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATc < 1:1520725/93‑1 (MQ=255)
atcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCg > 2:256913/1‑93 (MQ=255)
atcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCg > 1:4484119/1‑93 (MQ=255)
tcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGt < 2:3378709/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 2:4288738/1‑93 (MQ=255)
tGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAAt < 2:4842775/93‑1 (MQ=255)
gAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAAtt > 1:4638030/1‑93 (MQ=255)
aGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTa < 1:513915/93‑1 (MQ=255)
cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt < 1:3376437/93‑1 (MQ=255)
cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt > 1:147875/1‑93 (MQ=255)
cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt < 1:4917896/93‑1 (MQ=255)
gAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt > 2:2293420/1‑93 (MQ=255)
aaCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTa < 2:459826/93‑1 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAt > 2:1875365/1‑93 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAt > 2:2694173/1‑93 (MQ=255)
agagAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt > 2:5909362/1‑93 (MQ=255)
agagAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 1:2211337/93‑1 (MQ=255)
agagAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 2:6134252/93‑1 (MQ=255)
gagaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 1:1795859/93‑1 (MQ=255)
gagaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc > 2:330116/1‑93 (MQ=255)
agaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTcc < 1:5768331/93‑1 (MQ=255)
gaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca > 2:2036242/1‑93 (MQ=255)
gaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca < 2:199445/93‑1 (MQ=255)
gaATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca > 2:4684124/1‑93 (MQ=255)
aaTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcac < 2:1649848/93‑1 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 2:4763989/1‑93 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 1:3747922/1‑93 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca < 2:4124595/93‑1 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 2:3975593/1‑93 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca < 1:3113985/93‑1 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 1:5333264/1‑93 (MQ=255)
tAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt < 1:64605/93‑1 (MQ=255)
aGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATg < 1:3274645/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 2:2830820/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa > 1:6379201/1‑93 (MQ=255)
tCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTaa < 2:6148084/93‑1 (MQ=255)
gTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCa > 2:6026565/1‑93 (MQ=255)
tGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCaa > 1:2794278/1‑93 (MQ=255)
aTTTGAGTAATTAACCTGATTAAACGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAtt > 1:6193854/1‑93 (MQ=255)
tttGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAttt > 1:746673/1‑93 (MQ=255)
tttGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAttt > 2:3207930/1‑93 (MQ=255)
tGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGc > 1:1839711/1‑93 (MQ=255)
aGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGccc > 1:236832/1‑93 (MQ=255)
tAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc > 2:2895600/1‑93 (MQ=255)
aaTTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCt > 1:3408728/1‑93 (MQ=255)
ttAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg > 1:2554739/1‑93 (MQ=255)
ttAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg < 2:561074/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTgg < 1:1693154/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGc > 1:5474390/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGc > 2:5693576/1‑93 (MQ=255)
aCCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCa < 1:5049712/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAt < 2:3259717/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAt > 1:4780815/1‑93 (MQ=255)
cTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATa < 2:2962727/93‑1 (MQ=255)
tGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAg > 2:1476206/1‑93 (MQ=255)
tGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAg > 2:3622322/1‑93 (MQ=255)
aTTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCa < 2:4058427/93‑1 (MQ=255)
ttAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAg < 2:2420529/93‑1 (MQ=255)
ttAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAg > 2:740700/1‑93 (MQ=255)
ttAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAg < 2:3821329/93‑1 (MQ=255)
aaTGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCa > 2:262413/1‑93 (MQ=255)
aaTGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCa < 1:4069793/93‑1 (MQ=255)
aTGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt > 2:914852/1‑93 (MQ=255)
tGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt < 1:4575247/93‑1 (MQ=255)
aaGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt < 2:1117614/93‑1 (MQ=255)
aGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 1:6110127/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 2:6478150/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 1:4128677/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt > 2:6074050/1‑93 (MQ=255)
ggggTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttttt > 1:875826/1‑93 (MQ=255)
gggTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTc < 1:2898100/93‑1 (MQ=255)
ggTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTcc > 2:5514424/1‑93 (MQ=255)
gTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 1:1011067/93‑1 (MQ=255)
gTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 2:3171226/93‑1 (MQ=255)
gTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 1:2977580/93‑1 (MQ=255)
gTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 1:3855178/93‑1 (MQ=255)
ataataAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAgg > 1:3779836/1‑93 (MQ=255)
ataataAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAgg < 1:1944825/93‑1 (MQ=255)
ataataAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAgg > 2:2244079/1‑93 (MQ=255)
taataaATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGt > 1:4360246/1‑93 (MQ=255)
taaATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt > 1:1250272/1‑93 (MQ=255)
aaaTGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtt > 2:494131/1‑93 (MQ=255)
aTGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtttt > 1:6044447/1‑93 (MQ=255)
|
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT > NC_000913/2783429‑2783607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > NC_000913/2783428‑2783612
|
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAA > SRR4302537.6339223/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAA > SRR4302537.1586073/1‑94 (MQ=60)
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAAT > SRR4302537.1838599/1‑94 (MQ=60)
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAAT < SRR4302537.4958000/94‑1 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATA < SRR4302537.4750219/94‑1 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATA < SRR4302537.1187151/94‑1 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATA < SRR4302537.1953672/94‑1 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATA > SRR4302537.2734819/1‑94 (MQ=60)
GGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATAC < SRR4302537.1506068/94‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCT < SRR4302537.814232/94‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCT < SRR4302537.4382430/94‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCT < SRR4302537.1606684/94‑1 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGG > SRR4302537.1527655/1‑94 (MQ=60)
CACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGC > SRR4302537.794234/1‑94 (MQ=60)
CCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCT < SRR4302537.1365773/94‑1 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAGCCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCT > SRR4302537.3727528/1‑94 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGCAGGGGTATAATAAATGACCATACTCTGGCT > SRR4302537.2230891/1‑94 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCT < SRR4302537.5554998/94‑1 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCT < SRR4302537.6487033/94‑1 (MQ=60)
TATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTA > SRR4302537.4722275/1‑94 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTAT > SRR4302537.2423550/1‑94 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGCATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTAT > SRR4302537.3783578/1‑94 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATC < SRR4302537.1203729/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCG < SRR4302537.5945921/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCG < SRR4302537.2024386/94‑1 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCG > SRR4302537.4515139/1‑94 (MQ=60)
CATCAGTGACCGAACATATAATAGTTCACTAATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGCGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCG < SRR4302537.1531347/94‑1 (MQ=60)
CAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTA < SRR4302537.4836598/94‑1 (MQ=60)
CAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTA < SRR4302537.1363251/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAA < SRR4302537.3938333/94‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAA < SRR4302537.5302120/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAAT > SRR4302537.3730526/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATT > SRR4302537.4670107/1‑94 (MQ=60)
GAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTA > SRR4302537.2141404/1‑94 (MQ=60)
AGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTAC < SRR4302537.517443/94‑1 (MQ=60)
GCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACT < SRR4302537.3791933/94‑1 (MQ=60)
GCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACT > SRR4302537.148933/1‑94 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.3746887/94‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT > SRR4302537.2516486/1‑94 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.2770803/94‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.3400368/94‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT > SRR4302537.3432678/1‑94 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.5809898/94‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT > SRR4302537.1731867/1‑94 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.4951824/94‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR4302537.4529316/94‑1 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR4302537.3029348/94‑1 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR4302537.6226380/94‑1 (MQ=60)
AACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAA > SRR4302537.1052335/1‑94 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT > SRR4302537.2355851/1‑94 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT < SRR4302537.5058021/94‑1 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT > SRR4302537.2913624/1‑94 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT < SRR4302537.2138129/94‑1 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT < SRR4302537.5904993/94‑1 (MQ=60)
CAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATT > SRR4302537.5102210/1‑94 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTC < SRR4302537.2226929/94‑1 (MQ=60)
GAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCC < SRR4302537.1808392/94‑1 (MQ=60)
AGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR4302537.2511759/1‑94 (MQ=60)
AGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA < SRR4302537.5807867/94‑1 (MQ=60)
AGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA < SRR4302537.3346480/94‑1 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR4302537.5369840/1‑94 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR4302537.3774246/1‑94 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA < SRR4302537.1362522/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT < SRR4302537.3135733/94‑1 (MQ=60)
ATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT > SRR4302537.1464438/1‑94 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATG < SRR4302537.3177454/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATG < SRR4302537.1554855/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATG < SRR4302537.65083/94‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR4302537.3297754/94‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT > SRR4302537.1638377/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR4302537.6101542/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR4302537.1848593/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR4302537.6422689/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAA < SRR4302537.6047467/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG > SRR4302537.2622721/1‑94 (MQ=60)
CAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGC < SRR4302537.4123790/94‑1 (MQ=60)
AGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCA > SRR4302537.3543369/1‑94 (MQ=60)
AGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCA < SRR4302537.1806590/94‑1 (MQ=60)
GTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAA > SRR4302537.293645/1‑94 (MQ=60)
GTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAA > SRR4302537.2813810/1‑94 (MQ=60)
TGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAT < SRR4302537.116861/94‑1 (MQ=60)
GATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATT > SRR4302537.5252123/1‑94 (MQ=60)
GATTTGAGTAATTAACCTGATTAAACGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATT > SRR4302537.6236534/1‑94 (MQ=60)
ATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT > SRR4302537.751769/1‑94 (MQ=60)
ATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT < SRR4302537.4645958/94‑1 (MQ=60)
ATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT < SRR4302537.3149352/94‑1 (MQ=60)
TTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGC > SRR4302537.1852510/1‑94 (MQ=60)
GAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCC > SRR4302537.3891584/1‑94 (MQ=60)
GAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCC < SRR4302537.76520/94‑1 (MQ=60)
GAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCC > SRR4302537.238500/1‑94 (MQ=60)
AGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCG < SRR4302537.6266838/94‑1 (MQ=60)
TAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCT > SRR4302537.3432877/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG > SRR4302537.6083272/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG > SRR4302537.2572653/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG > SRR4302537.699443/1‑94 (MQ=60)
ATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG < SRR4302537.6457666/94‑1 (MQ=60)
TTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGG < SRR4302537.2012311/94‑1 (MQ=60)
TTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGG < SRR4302537.4718289/94‑1 (MQ=60)
TTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGG < SRR4302537.870833/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC > SRR4302537.5511750/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC < SRR4302537.3105522/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC < SRR4302537.1705004/94‑1 (MQ=60)
ACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR4302537.2839489/1‑94 (MQ=60)
ACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR4302537.4813821/1‑94 (MQ=60)
ACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT < SRR4302537.5084478/94‑1 (MQ=60)
ACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT < SRR4302537.5389979/94‑1 (MQ=60)
ACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR4302537.73362/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATA < SRR4302537.6247595/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATA > SRR4302537.3432745/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTAAATGAAGGGGGATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATA > SRR4302537.1374180/1‑94 (MQ=60)
CTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAG > SRR4302537.1962987/1‑94 (MQ=60)
CTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAG > SRR4302537.3380696/1‑94 (MQ=60)
GATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA < SRR4302537.4851364/94‑1 (MQ=60)
ATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAG < SRR4302537.4316595/94‑1 (MQ=60)
TTAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGG < SRR4302537.3429337/94‑1 (MQ=60)
TAAATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGC > SRR4302537.5112257/1‑94 (MQ=60)
AATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAT < SRR4302537.5569932/94‑1 (MQ=60)
AATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAT < SRR4302537.4098218/94‑1 (MQ=60)
ATGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT < SRR4302537.4106859/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR4302537.4606912/94‑1 (MQ=60)
AAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTT > SRR4302537.4157493/1‑94 (MQ=60)
AAGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTT > SRR4302537.6152118/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT > SRR4302537.881848/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT > SRR4302537.4595963/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT > SRR4302537.4642091/1‑94 (MQ=60)
GGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC < SRR4302537.2918464/94‑1 (MQ=60)
GGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC < SRR4302537.3687762/94‑1 (MQ=60)
GGGTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC > SRR4302537.195810/1‑94 (MQ=60)
GTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG < SRR4302537.1018036/94‑1 (MQ=60)
GTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG > SRR4302537.2399634/1‑94 (MQ=60)
GTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG < SRR4302537.2998413/94‑1 (MQ=60)
GTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG < SRR4302537.3882163/94‑1 (MQ=60)
GTATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG < SRR4302537.3822384/94‑1 (MQ=60)
TATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGG < SRR4302537.2752994/94‑1 (MQ=60)
TATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGG > SRR4302537.868895/1‑94 (MQ=60)
TATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGG > SRR4302537.3806381/1‑94 (MQ=60)
ATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGT < SRR4302537.1958343/94‑1 (MQ=60)
ATAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGT > SRR4302537.4390419/1‑94 (MQ=60)
TAATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTA < SRR4302537.384299/94‑1 (MQ=60)
AATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC < SRR4302537.5482250/94‑1 (MQ=60)
AATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC > SRR4302537.1220684/1‑94 (MQ=60)
AATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC < SRR4302537.6220653/94‑1 (MQ=60)
AATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC > SRR4302537.61266/1‑94 (MQ=60)
ATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR4302537.1258976/1‑94 (MQ=60)
ATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR4302537.4449672/1‑94 (MQ=60)
ATAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR4302537.1623025/1‑94 (MQ=60)
TAAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTT < SRR4302537.27332/94‑1 (MQ=60)
AAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTT > SRR4302537.2217431/1‑94 (MQ=60)
AAATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTACAGGTACTTT > SRR4302537.4493237/1‑94 (MQ=60)
AATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT < SRR4302537.2408994/94‑1 (MQ=60)
AATGACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT > SRR4302537.6085962/1‑94 (MQ=60)
ATGACACTACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTG < SRR4302537.2943818/94‑1 (MQ=60)
GACAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAA > SRR4302537.2510644/1‑94 (MQ=60)
ACAATACTCTGTCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAT < SRR4302537.4120951/94‑1 (MQ=60)
CAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG < SRR4302537.2292662/94‑1 (MQ=60)
CAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR4302537.635581/1‑94 (MQ=60)
CAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR4302537.4165042/1‑94 (MQ=60)
CAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR4302537.1938742/1‑94 (MQ=60)
CAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR4302537.5146979/1‑94 (MQ=60)
|
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > NC_000913/2783428‑2783612
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
