Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,825,102 |
T→C |
F230L (TTC→CTC) |
srlE → |
PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,825,102 | 0 | T | C | 100.0%
| 817.1
/ NA
| 233 | F230L (TTC→CTC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (107/126); total (107/126) |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191
|
aTTGCCCACGTTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:619380/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 2:5087665/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 1:2265301/93‑1 (MQ=255)
gCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGc > 2:1448344/1‑93 (MQ=255)
ccaaCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGcc > 2:504293/4‑93 (MQ=255)
cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa > 2:4135354/1‑93 (MQ=255)
cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa < 2:5683556/93‑1 (MQ=255)
cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTACTTTCACCTTTCACCGGcccg > 1:1459281/1‑92 (MQ=255)
ccGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 1:4881975/92‑1 (MQ=255)
aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 2:4823261/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTACTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg > 1:5319368/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCACATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg < 1:4557618/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTCGCGCTCATCTGTTCCTTGCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 1:2154600/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcgc < 2:4570399/93‑1 (MQ=255)
tCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcgc < 2:5062887/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCa < 2:4630278/93‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 2:2258801/93‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 2:4255066/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCg < 2:4314039/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGca > 1:5057224/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:6229369/93‑1 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:1244846/93‑1 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg > 1:5785398/1‑93 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg > 1:4852021/1‑93 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg < 2:3297941/93‑1 (MQ=255)
cGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAgg < 2:5619126/93‑1 (MQ=255)
gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt < 2:5304703/93‑1 (MQ=255)
aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt > 1:782310/1‑93 (MQ=255)
aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt < 1:5091774/93‑1 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa > 2:262780/1‑93 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa > 1:3915338/1‑93 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCAACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa > 1:3333212/1‑93 (MQ=255)
ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 1:1053433/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:3770401/93‑1 (MQ=255)
cATCCACGGGGTTTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTCCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:4026693/93‑1 (MQ=255)
aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg > 1:3821826/1‑93 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg < 1:295314/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTa > 2:1994488/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTa < 1:944422/93‑1 (MQ=255)
tGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTat > 2:1143098/1‑93 (MQ=255)
gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 1:522884/93‑1 (MQ=255)
gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 1:4498520/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat > 1:231946/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat < 2:1674182/93‑1 (MQ=255)
tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg > 2:3121421/1‑93 (MQ=255)
tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg < 2:4494343/93‑1 (MQ=255)
ggTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTgg < 2:1605454/93‑1 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc < 2:4204055/93‑1 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc < 1:3113718/93‑1 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc < 2:5496706/93‑1 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg > 1:5565196/1‑93 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg > 2:2318194/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTg > 1:5922363/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTg > 2:5812067/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTg > 1:1701771/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:61194/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:2132685/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGa > 1:5617835/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATTGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAt < 2:649495/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:2760747/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 1:1843848/93‑1 (MQ=255)
cgcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTg < 2:3378279/93‑1 (MQ=255)
cgcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTg < 1:201644/93‑1 (MQ=255)
gcTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTgg < 2:6310924/93‑1 (MQ=255)
tCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCGGATTGGtc > 2:5364904/1‑93 (MQ=255)
tCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc < 2:1781221/93‑1 (MQ=255)
tCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc > 1:4201071/1‑93 (MQ=255)
cATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtct > 1:4054163/1‑93 (MQ=255)
aTCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 1:432925/1‑93 (MQ=255)
tCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg < 2:66468/93‑1 (MQ=255)
tCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg < 1:2737508/93‑1 (MQ=255)
cTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCgg < 1:2518829/93‑1 (MQ=255)
cTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCgg < 2:1752491/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCa < 2:2389698/93‑1 (MQ=255)
ttccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa < 1:1258260/93‑1 (MQ=255)
tccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGTCAat > 1:374550/1‑93 (MQ=255)
ttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAtt > 1:4745707/1‑93 (MQ=255)
tccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTc < 1:5453140/93‑1 (MQ=255)
cccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTcc < 2:1226064/93‑1 (MQ=255)
cccACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTcc < 1:2442645/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCGGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgcc > 1:4700974/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTTATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGTCAATATTccgcc < 2:141080/93‑1 (MQ=255)
cTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTccgccg > 1:2433129/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCTATCCTCGGCCCATGCGCAGTTATCGCACAGGTTGTCAGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCt < 2:6415032/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 1:5633021/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 1:4800731/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 2:1959984/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTCCGCGGCCCAGGCTCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTg < 1:4794967/93‑1 (MQ=255)
cACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTgg > 1:1183113/1‑93 (MQ=255)
cACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTgg > 1:362217/1‑93 (MQ=255)
cACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTgg < 1:6030464/93‑1 (MQ=255)
aCCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGc > 2:5908354/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt > 1:177304/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt > 1:551816/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGTCAATATTCCGCCGCATCTGGCtt > 1:4431544/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCtt < 2:5532224/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCtt < 2:5196405/93‑1 (MQ=255)
tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt < 2:604898/93‑1 (MQ=255)
tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt < 2:2970253/93‑1 (MQ=255)
ttcctcGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTa < 1:2549312/93‑1 (MQ=255)
|
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACCGG > NC_000913/2825010‑2825195
|
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302537.2799926/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302537.903419/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302537.3784582/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGTTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302537.623596/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302537.3205414/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302537.5492660/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGG < SRR4302537.2281298/94‑1 (MQ=60)
GCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCC < SRR4302537.4832386/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCA > SRR4302537.5694307/1‑94 (MQ=60)
CACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTACTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAG > SRR4302537.5355882/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGG < SRR4302537.4915697/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGC < SRR4302537.5928970/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCACATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGC < SRR4302537.4589168/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302537.3429848/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302537.2566450/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTCGCGCTCATCTGTTCCTTGCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302537.2169786/1‑94 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT > SRR4302537.2762097/1‑94 (MQ=60)
CTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAT < SRR4302537.4627884/94‑1 (MQ=60)
CTCAGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAT > SRR4302537.6133562/1‑94 (MQ=60)
TCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302537.4486264/94‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302537.4536279/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCA > SRR4302537.5092038/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC < SRR4302537.4952961/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC > SRR4302537.5574266/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG > SRR4302537.4885493/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG < SRR4302537.4451194/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG > SRR4302537.5825065/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG > SRR4302537.1217314/1‑94 (MQ=60)
GCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGG < SRR4302537.201584/94‑1 (MQ=60)
GAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTT < SRR4302537.2249975/94‑1 (MQ=60)
GAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTT > SRR4302537.787683/1‑94 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA > SRR4302537.5671465/1‑94 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA < SRR4302537.5126833/94‑1 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA > SRR4302537.3942706/1‑94 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA < SRR4302537.5126834/94‑1 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCAACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA > SRR4302537.3356797/1‑94 (MQ=60)
GCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAT < SRR4302537.1785353/94‑1 (MQ=60)
CCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATC < SRR4302537.1060700/94‑1 (MQ=60)
CCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATC > SRR4302537.2537770/1‑94 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302537.3848621/1‑94 (MQ=60)
ATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG > SRR4302537.368058/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302537.297373/94‑1 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT > SRR4302537.5076463/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTAT < SRR4302537.950948/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTG < SRR4302537.4529635/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTG < SRR4302537.526473/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAT > SRR4302537.233580/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAT < SRR4302537.1427903/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATT < SRR4302537.245786/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATT < SRR4302537.3854749/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGG < SRR4302537.5525811/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC < SRR4302537.4798426/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC < SRR4302537.6423724/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC < SRR4302537.2432348/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG < SRR4302537.3135463/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG > SRR4302537.511318/1‑94 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG < SRR4302537.4161036/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG > SRR4302537.5603234/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG > SRR4302537.1713666/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG > SRR4302537.4035190/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTG > SRR4302537.5962999/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGGTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA < SRR4302537.3110883/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA < SRR4302537.3239850/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGA > SRR4302537.5656248/1‑94 (MQ=60)
GCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTG < SRR4302537.1856681/94‑1 (MQ=60)
CGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG < SRR4302537.203088/94‑1 (MQ=60)
CGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG > SRR4302537.2284112/1‑94 (MQ=60)
CTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC > SRR4302537.4230400/1‑94 (MQ=60)
CTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC < SRR4302537.3886817/94‑1 (MQ=60)
CTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC > SRR4302537.1693815/1‑94 (MQ=60)
TCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCT > SRR4302537.4082504/1‑94 (MQ=60)
CATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTG > SRR4302537.5395405/1‑94 (MQ=60)
CATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTC > SRR4302537.435943/1‑94 (MQ=60)
ATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302537.4740251/94‑1 (MQ=60)
ATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302537.4848347/94‑1 (MQ=60)
ATCTGTTACTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302537.2717767/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG < SRR4302537.2756614/94‑1 (MQ=60)
CTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGC < SRR4302537.2536520/94‑1 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302537.2160643/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302537.3733945/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGTCAAT > SRR4302537.377148/1‑94 (MQ=60)
TTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAAT < SRR4302537.1267018/94‑1 (MQ=60)
TTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAAT > SRR4302537.4882294/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATA > SRR4302537.3804523/1‑94 (MQ=60)
CCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAT < SRR4302537.2431988/94‑1 (MQ=60)
CTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATT < SRR4302537.2483445/94‑1 (MQ=60)
CTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATT > SRR4302537.1001062/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATT > SRR4302537.4084180/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATT > SRR4302537.4778498/1‑94 (MQ=60)
TTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTC > SRR4302537.4901699/1‑94 (MQ=60)
TCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCC < SRR4302537.6041433/94‑1 (MQ=60)
TCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCC < SRR4302537.5982955/94‑1 (MQ=60)
TCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCC < SRR4302537.5490339/94‑1 (MQ=60)
CCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCG < SRR4302537.2459841/94‑1 (MQ=60)
CCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGACCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCG > SRR4302537.1853425/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCGGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC > SRR4302537.4733493/1‑94 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC < SRR4302537.5345604/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCC > SRR4302537.4245599/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCG > SRR4302537.2450270/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGC > SRR4302537.5644328/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGC > SRR4302537.2020541/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCA > SRR4302537.1072399/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCAT > SRR4302537.1766180/1‑94 (MQ=60)
CTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATC > SRR4302537.5604160/1‑94 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT < SRR4302537.4624759/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT < SRR4302537.2792406/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT < SRR4302537.4819145/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT < SRR4302537.2215992/94‑1 (MQ=60)
TTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCT < SRR4302537.4484471/94‑1 (MQ=60)
TTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGACTGGGCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTG > SRR4302537.2690295/1‑94 (MQ=60)
TCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGG < SRR4302537.4833851/94‑1 (MQ=60)
TCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGG > SRR4302537.1191341/1‑94 (MQ=60)
TCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGG < SRR4302537.5671560/94‑1 (MQ=60)
TCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGG > SRR4302537.364736/1‑94 (MQ=60)
TCACCTTTCCGCGGCCCAGGCTCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGG < SRR4302537.4828057/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGC < SRR4302537.6071898/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGAATCTGGC < SRR4302537.774483/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCT > SRR4302537.555612/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCT > SRR4302537.178563/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGCTATCGCCGTATTGATTTGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTCGCT > SRR4302537.925559/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGTCAATATTCCGCCGCATCTGGCTT > SRR4302537.4462147/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTT < SRR4302537.1310727/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTT > SRR4302537.5810644/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTAC < SRR4302537.2567172/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTAC < SRR4302537.5146653/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTAC > SRR4302537.1845392/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC < SRR4302537.5819357/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC < SRR4302537.1939155/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC > SRR4302537.3629280/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC < SRR4302537.6443958/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGGCCCAGCCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACC < SRR4302537.4484093/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATAGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACCGG < SRR4302537.743979/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCCCAGGAGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACCGG > SRR4302537.3763252/1‑94 (MQ=60)
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GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTACCGG > NC_000913/2825010‑2825195
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
