Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,838,044 |
+G |
coding (498/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,838,043 | 1 | . | G | 100.0%
| 788.4
/ NA
| 223 | A166G (GCG→GGG) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (113/110); total (113/110) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG > NC_000913/2837951‑2838131
|
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c < 2:5202092/93‑1 (MQ=255)
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c > 1:827769/1‑93 (MQ=255)
aTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c‑g > 2:2628918/1‑93 (MQ=255)
aTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGCTGTTGGTGACGCGGCCTTCTTCCTCCTGCCGCTGATGcgcg‑c‑g > 1:310414/1‑93 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c‑gg > 2:89967/1‑92 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c‑gg > 1:4407124/1‑92 (MQ=255)
gAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c‑ggc > 1:1003121/1‑91 (MQ=255)
gAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcg‑c‑ggc > 2:3656472/1‑91 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCt > 2:1045769/1‑93 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCt > 2:2228040/1‑93 (MQ=255)
gcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTg < 1:3403906/93‑1 (MQ=255)
gcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTg > 1:2390272/1‑93 (MQ=255)
cgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGc < 2:3192134/93‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcca > 1:5581781/1‑91 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcca > 1:4296904/1‑91 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcca < 2:2399110/93‑3 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcca < 2:2737595/93‑3 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACATTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgcca < 2:4276704/93‑3 (MQ=255)
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCcgccat > 1:3058303/1‑90 (MQ=255)
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGAGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGAG‑GCATCTGCcgccat > 2:413010/1‑90 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCa > 2:2986522/1‑93 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCa < 1:1686958/93‑1 (MQ=255)
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCaa > 1:5299228/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCaaa > 2:1992893/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCaaa < 2:6405810/93‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCaaa < 1:4209726/93‑1 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 2:2457080/1‑93 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt < 1:88186/93‑1 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt < 2:4466089/93‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATCTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAtt < 2:460521/93‑1 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAttt > 1:3791773/1‑93 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAAttt > 2:407162/1‑93 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTACTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaaa < 1:4875232/93‑1 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc > 2:6201313/1‑93 (MQ=255)
cccGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc < 2:1659748/92‑1 (MQ=255)
ggACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa > 1:5358061/2‑93 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 1:1516273/93‑1 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa > 1:562396/1‑93 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 1:2903331/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:3833671/93‑1 (MQ=255)
caCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:1402486/92‑1 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 2:1618327/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 2:3211386/1‑93 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:50498/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 2:6233678/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 2:2319362/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 1:2871044/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 1:5497577/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:1299577/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:3730018/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:1872023/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:555595/93‑1 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGc < 1:1273110/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTGG‑CGGCATTTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTGGCTg > 2:2208089/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg > 1:3964911/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 1:1790543/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 2:4825117/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg > 2:3379692/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 2:3479458/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg > 2:526400/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 2:5443728/1‑93 (MQ=255)
gAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt < 2:2065845/93‑1 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt < 1:109708/93‑1 (MQ=255)
gATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAt < 1:5733016/93‑1 (MQ=255)
gATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAt < 2:789262/93‑1 (MQ=255)
gttGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 1:1078767/92‑1 (MQ=255)
aTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 1:2280984/93‑1 (MQ=255)
tGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgc < 1:2516455/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgcg < 2:1438189/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgcg > 1:37255/1‑93 (MQ=255)
gTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCGGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg < 2:1225796/93‑1 (MQ=255)
gTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg < 1:4751819/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg < 2:323427/93‑1 (MQ=255)
tGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg > 2:5097357/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt > 2:5824315/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt < 1:324615/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGtgtg > 1:1168991/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGTCATCGCGGGTGTGCt > 2:1885643/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt > 1:1479476/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGt < 1:985385/93‑1 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTa > 2:4513522/1‑93 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc > 1:5399234/1‑93 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc > 1:6180097/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAAAt > 1:1443067/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc > 1:5442728/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc > 2:4758803/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 2:3424526/93‑1 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 2:5939298/93‑1 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGGCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 1:1353350/93‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 2:2798864/1‑93 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 1:2124778/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa > 2:63331/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa > 1:1152606/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt < 1:3536483/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt < 1:5849376/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa > 1:5674012/1‑93 (MQ=255)
tGATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg > 1:635656/1‑93 (MQ=255)
gATGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa < 1:1928816/93‑1 (MQ=255)
tGGTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc < 1:2653851/93‑1 (MQ=255)
gTCG‑CGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTg > 2:3033108/1‑93 (MQ=255)
|
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCG‑C‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG > NC_000913/2837951‑2838131
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > NC_000913/2837951‑2838138
|
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGCTGTTGGTGACGCGGCCTTCTTCCTCCTGCCGCTGATGCGCGC‑G > SRR4302537.312561/1‑94 (MQ=60)
ATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GG > SRR4302537.4437537/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggc > SRR4302537.1010044/1‑92 (MQ=60)
TGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggc < SRR4302537.5591179/94‑3 (MQ=60)
GAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggca < SRR4302537.1161996/94‑4 (MQ=60)
CGGCTGGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCT < SRR4302537.6225708/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCT < SRR4302537.4808183/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCT > SRR4302537.1451079/1‑94 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTG > SRR4302537.2407105/1‑94 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGC < SRR4302537.3428015/94‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCC < SRR4302537.4307205/94‑1 (MQ=60)
CTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGCca > SRR4302537.5619935/1‑92 (MQ=60)
CTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGCca > SRR4302537.4326774/1‑92 (MQ=60)
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CAT > SRR4302537.3079611/1‑94 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCA > SRR4302537.5696011/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAA > SRR4302537.5335628/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAA < SRR4302537.2408819/94‑1 (MQ=60)
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAA < SRR4302537.1698771/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302537.4239092/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302537.3120976/1‑94 (MQ=60)
AAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATT < SRR4302537.88825/94‑1 (MQ=60)
AAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATT > SRR4302537.1013980/1‑94 (MQ=60)
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CCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA > SRR4302537.566265/1‑94 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302537.1526868/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302537.2923727/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302537.563254/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302537.967010/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302537.2372389/1‑94 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302537.98963/94‑1 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302537.2186810/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302537.170558/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302537.818636/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302537.2891193/94‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302537.2503008/94‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302537.5535108/94‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302537.1308610/94‑1 (MQ=60)
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AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG < SRR4302537.2982483/94‑1 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG < SRR4302537.134766/94‑1 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302537.4824595/1‑94 (MQ=60)
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ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGC > SRR4302537.5514626/1‑94 (MQ=60)
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CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302537.2706410/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302537.2543743/1‑94 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302537.1803046/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302537.1139074/1‑94 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG > SRR4302537.1667386/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302537.2238743/94‑1 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302537.579469/94‑1 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGGGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302537.3820180/1‑94 (MQ=60)
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GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302537.1337783/94‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG < SRR4302537.110514/94‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302537.1295314/1‑94 (MQ=60)
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GTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302537.3803900/1‑94 (MQ=60)
TGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAT < SRR4302537.5717775/94‑1 (MQ=60)
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TGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAT > SRR4302537.3459183/1‑94 (MQ=60)
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TGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCG < SRR4302537.3867545/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCG < SRR4302537.2534137/94‑1 (MQ=60)
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GTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT > SRR4302537.3336650/1‑94 (MQ=60)
GTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT > SRR4302537.1489767/1‑94 (MQ=60)
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TTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC > SRR4302537.6222666/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC > SRR4302537.5436089/1‑94 (MQ=60)
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CTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAT < SRR4302537.4450126/94‑1 (MQ=60)
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CTTCCTGCCGCTGATGGGCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCG < SRR4302537.1362777/94‑1 (MQ=60)
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TTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGA > SRR4302537.1160626/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG < SRR4302537.1820717/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302537.121048/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302537.686433/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTT < SRR4302537.5889492/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTT < SRR4302537.3561466/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTT < SRR4302537.5381307/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTA > SRR4302537.5712833/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG > SRR4302537.5430230/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG > SRR4302537.3024741/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG < SRR4302537.1254525/94‑1 (MQ=60)
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ATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC > SRR4302537.5744518/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT < SRR4302537.2672405/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT < SRR4302537.6081130/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302537.1503246/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302537.5460707/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302537.4663226/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302537.478317/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302537.4989183/94‑1 (MQ=60)
TCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302537.4230469/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATGTGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302537.2474362/94‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302537.5013179/3‑94 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302537.3065806/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302537.90626/92‑1 (MQ=60)
GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > SRR4302537.1254500/1‑94 (MQ=60)
|
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > NC_000913/2837951‑2838138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
