Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,896,819 |
+C |
coding (622/657 nt) |
ygcU ← |
putative oxidoreductase subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 100.0%
| 816.9
/ NA
| 232 | A208G (GCA→GGA) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (134/98); total (134/98) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905
|
tCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTg > 1:3189213/1‑93 (MQ=255)
ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 2:6450556/1‑90 (MQ=255)
ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 1:4849745/1‑90 (MQ=255)
ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 1:1373413/1‑90 (MQ=255)
gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat < 2:3851230/93‑5 (MQ=255)
gATACAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat > 1:5730874/1‑89 (MQ=255)
tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatga > 1:942626/1‑93 (MQ=255)
ataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgat > 2:3687372/1‑93 (MQ=255)
taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatg > 1:5393525/1‑93 (MQ=255)
taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatg > 1:5220148/1‑93 (MQ=255)
gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatgat > 2:1599962/1‑93 (MQ=255)
gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAtgtg > 1:1240681/1‑93 (MQ=255)
gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAtgtg > 1:3409358/1‑93 (MQ=255)
tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCGCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGa < 1:2635222/93‑1 (MQ=255)
agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAc < 2:2140612/93‑1 (MQ=255)
agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAc < 2:596036/93‑1 (MQ=255)
agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAc > 1:3968349/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGaa > 1:2941927/1‑93 (MQ=255)
agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGaa < 2:4978111/93‑1 (MQ=255)
gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAt < 2:1804261/93‑1 (MQ=255)
gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAt < 1:4133139/93‑1 (MQ=255)
agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATg < 1:834160/93‑1 (MQ=255)
ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGt > 2:3003547/1‑93 (MQ=255)
ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc < 1:3013975/93‑1 (MQ=255)
ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 2:3250919/1‑93 (MQ=255)
ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 1:4942698/1‑93 (MQ=255)
ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 1:4657914/1‑93 (MQ=255)
tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg < 2:4136081/93‑1 (MQ=255)
tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg < 1:4764707/93‑1 (MQ=255)
gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 2:1895925/93‑1 (MQ=255)
gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 2:1582585/93‑1 (MQ=255)
ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg < 1:1943137/93‑1 (MQ=255)
ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg > 1:3786765/1‑93 (MQ=255)
tCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCa < 1:627953/93‑1 (MQ=255)
ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCCGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 2:4828254/1‑93 (MQ=255)
ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc < 2:5747059/93‑1 (MQ=255)
gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 2:1138007/1‑93 (MQ=255)
gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGACGATGTGACGAATGTCCGGGCccgccg > 2:5215210/1‑93 (MQ=255)
ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc > 2:2232513/1‑93 (MQ=255)
tGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgc > 2:1348425/1‑93 (MQ=255)
gAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgcg < 2:794648/93‑1 (MQ=255)
aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg < 2:4413676/93‑1 (MQ=255)
aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 1:1090573/93‑1 (MQ=255)
tttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcg > 1:4801570/1‑93 (MQ=255)
ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCTCAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 2:315160/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcgg > 2:3280528/1‑92 (MQ=255)
ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcgg > 1:1332493/1‑92 (MQ=255)
ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:6457487/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:4269262/93‑1 (MQ=255)
aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:550353/1‑93 (MQ=255)
aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:5099551/1‑93 (MQ=255)
aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 2:5085339/1‑93 (MQ=255)
gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc < 2:688939/93‑1 (MQ=255)
aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg > 1:4453202/1‑93 (MQ=255)
ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 2:4224688/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt > 2:1008994/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt > 2:2495683/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt < 2:5825622/93‑1 (MQ=255)
cACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttttt < 2:787005/93‑1 (MQ=255)
cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 2:850267/93‑1 (MQ=255)
cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 1:1002246/93‑1 (MQ=255)
tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:2296594/1‑93 (MQ=255)
tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt < 1:2261457/93‑1 (MQ=255)
ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc < 2:4540001/93‑1 (MQ=255)
aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 2:1448526/93‑1 (MQ=255)
cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg < 1:2296338/93‑1 (MQ=255)
cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGAGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg > 1:1814848/1‑93 (MQ=255)
ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 1:1705120/1‑93 (MQ=255)
tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 1:4904162/1‑93 (MQ=255)
cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa < 1:219276/93‑1 (MQ=255)
aGTGATATAGCACAATGCACCTGCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc < 2:4666179/93‑1 (MQ=255)
gTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg < 1:671527/93‑1 (MQ=255)
tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg > 1:1592390/1‑93 (MQ=255)
gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt > 1:6032043/1‑93 (MQ=255)
tataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 2:4325161/1‑93 (MQ=255)
ataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc < 1:3528578/93‑1 (MQ=255)
taGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa > 1:1885549/1‑93 (MQ=255)
taGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa < 2:5342460/93‑1 (MQ=255)
aGCACAATGCACATTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt < 2:2911628/93‑1 (MQ=255)
gCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc > 2:3926591/1‑93 (MQ=255)
cacaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCa < 1:101096/93‑1 (MQ=255)
cacaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCa < 1:5831294/93‑1 (MQ=255)
acaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 2:1744015/93‑1 (MQ=255)
caATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc > 2:2610/1‑93 (MQ=255)
caATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc > 2:4022191/1‑93 (MQ=255)
caATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc > 1:5587963/1‑93 (MQ=255)
caATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc > 1:3609092/1‑93 (MQ=255)
agaTGCCCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc < 1:3375571/91‑1 (MQ=255)
aaTGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGTCGGTGGCATCAGcc > 2:3551851/1‑93 (MQ=255)
aaTGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGCCACCTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCCTCAGcc > 1:2836897/1‑93 (MQ=255)
aTGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa > 1:226937/1‑93 (MQ=255)
tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 1:2689313/93‑1 (MQ=255)
tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:6084859/1‑93 (MQ=255)
tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:3792696/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 2:3346518/1‑93 (MQ=255)
aCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 2:2406437/93‑1 (MQ=255)
aCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 1:3465576/1‑93 (MQ=255)
cTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 1:2057343/1‑93 (MQ=255)
ttCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 1:2467442/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCtt < 1:90949/93‑1 (MQ=255)
|
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCCAGAC > NC_000913/2896729‑2896911
|
AGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑Ccga > SRR4302537.1383002/1‑91 (MQ=60)
AGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑Ccga > SRR4302537.4883211/1‑91 (MQ=60)
GGATACAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGAT > SRR4302537.5770099/1‑94 (MQ=60)
ATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGA > SRR4302537.949131/1‑94 (MQ=60)
ATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATG > SRR4302537.6367964/1‑94 (MQ=60)
ATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATG > SRR4302537.2304583/1‑94 (MQ=60)
ATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATG > SRR4302537.5256050/1‑94 (MQ=60)
ATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATG > SRR4302537.5430361/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAT > SRR4302537.2043559/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAT > SRR4302537.4251694/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAT > SRR4302537.3949879/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAT > SRR4302537.5526923/1‑94 (MQ=60)
AGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAT > SRR4302537.2306152/1‑94 (MQ=60)
GCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATG < SRR4302537.4347352/94‑1 (MQ=60)
CGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTG > SRR4302537.3433510/1‑94 (MQ=60)
CGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTG > SRR4302537.1249306/1‑94 (MQ=60)
TAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCGCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAC < SRR4302537.2653664/94‑1 (MQ=60)
TAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAC > SRR4302537.3996116/1‑94 (MQ=60)
TAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAC < SRR4302537.5764570/94‑1 (MQ=60)
TAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAC > SRR4302537.2978699/1‑94 (MQ=60)
AGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACG > SRR4302537.3661629/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAA > SRR4302537.4102328/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAA > SRR4302537.2962580/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAA > SRR4302537.3500271/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAA < SRR4302537.5542511/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGTGGTTTTCCGGGGGGAATTTAAAGGGTTTCACTGGTACTTCAGGGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAGGTGACGGA > SRR4302537.2277950/1‑94 (MQ=53)
AGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAT > SRR4302537.3225479/1‑94 (MQ=60)
GAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATG < SRR4302537.1405253/94‑1 (MQ=60)
GAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATG < SRR4302537.4161982/94‑1 (MQ=60)
GAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATG < SRR4302537.2264656/94‑1 (MQ=60)
GAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACATTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATT > SRR4302537.501242/1‑94 (MQ=60)
AGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGT < SRR4302537.839868/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTC > SRR4302537.3413920/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCC > SRR4302537.4976782/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCC < SRR4302537.1343673/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCC > SRR4302537.4690119/1‑94 (MQ=60)
TTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCG < SRR4302537.2269673/94‑1 (MQ=60)
TTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCG < SRR4302537.3034989/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGG < SRR4302537.5538711/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGG < SRR4302537.4797613/94‑1 (MQ=60)
TGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGG > SRR4302537.1302736/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGG > SRR4302537.3813354/1‑94 (MQ=60)
TTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGC < SRR4302537.1956648/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAG < SRR4302537.632229/94‑1 (MQ=60)
CCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGC > SRR4302537.1911226/1‑94 (MQ=60)
GGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCG < SRR4302537.5239011/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCG < SRR4302537.4826913/94‑1 (MQ=60)
GTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGC > SRR4302537.4959932/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCG < SRR4302537.4902523/94‑1 (MQ=60)
GAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGG < SRR4302537.6395970/94‑1 (MQ=60)
AATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGC > SRR4302537.3770825/1‑94 (MQ=60)
ATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCG > SRR4302537.6070099/1‑94 (MQ=60)
ATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCG > SRR4302537.4834695/1‑94 (MQ=60)
ATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCG < SRR4302537.1009366/94‑1 (MQ=60)
ATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCG < SRR4302537.1098104/94‑1 (MQ=60)
TTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGT > SRR4302537.2930463/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGG > SRR4302537.1341778/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTG < SRR4302537.4298925/94‑1 (MQ=60)
TTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTG < SRR4302537.6501254/94‑1 (MQ=60)
TAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGG > SRR4302537.2877785/1‑94 (MQ=60)
AAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGC > SRR4302537.2481034/1‑94 (MQ=60)
AAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGC > SRR4302537.5134686/1‑94 (MQ=60)
AAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGC > SRR4302537.554142/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACG > SRR4302537.4483957/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACG > SRR4302537.4538696/1‑94 (MQ=60)
GATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACG < SRR4302537.1498487/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGT > SRR4302537.94313/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGT > SRR4302537.606256/1‑94 (MQ=60)
TTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTT > SRR4302537.1904780/1‑94 (MQ=60)
TTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTT > SRR4302537.2018503/1‑94 (MQ=60)
TTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTT < SRR4302537.2755899/94‑1 (MQ=60)
TTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTT > SRR4302537.5745953/1‑94 (MQ=60)
TTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTT < SRR4302537.3630356/94‑1 (MQ=60)
CACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTA > SRR4302537.1286118/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAA > SRR4302537.5868856/1‑94 (MQ=60)
CTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAT < SRR4302537.1009161/94‑1 (MQ=60)
CTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAT > SRR4302537.910686/1‑94 (MQ=60)
CTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAT < SRR4302537.2285198/94‑1 (MQ=60)
TGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATG < SRR4302537.2277416/94‑1 (MQ=60)
TGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATG > SRR4302537.987956/1‑94 (MQ=60)
GTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGC < SRR4302537.3448885/94‑1 (MQ=60)
ACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGAGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTG > SRR4302537.1827498/1‑94 (MQ=60)
CTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGT < SRR4302537.2312548/94‑1 (MQ=60)
CTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGT > SRR4302537.1717041/1‑94 (MQ=60)
CTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGT > SRR4302537.5027090/1‑94 (MQ=60)
CTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGGTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGT < SRR4302537.1850415/94‑1 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG < SRR4302537.5289244/94‑1 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG > SRR4302537.4489909/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG > SRR4302537.894327/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG > SRR4302537.688731/1‑94 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG < SRR4302537.2552090/94‑1 (MQ=60)
TTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTG > SRR4302537.4938013/1‑94 (MQ=60)
CAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAC < SRR4302537.220839/94‑1 (MQ=60)
AGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACG < SRR4302537.3070693/94‑1 (MQ=60)
GTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGG < SRR4302537.676121/94‑1 (MQ=60)
GTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGG > SRR4302537.3408755/1‑94 (MQ=60)
GTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGG > SRR4302537.1603518/1‑94 (MQ=60)
TGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGT > SRR4302537.6073491/1‑94 (MQ=60)
TGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGT > SRR4302537.270395/1‑94 (MQ=60)
GATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTG < SRR4302537.4902714/94‑1 (MQ=60)
GATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTG < SRR4302537.1644595/94‑1 (MQ=60)
ATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCA > SRR4302537.1898659/1‑94 (MQ=60)
ATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCA < SRR4302537.3553532/94‑1 (MQ=60)
TAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAT > SRR4302537.4845524/1‑94 (MQ=60)
AGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATC > SRR4302537.2569905/1‑94 (MQ=60)
CACAATGCCCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAG < SRR4302537.4701751/94‑1 (MQ=60)
CACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAG < SRR4302537.5871259/94‑1 (MQ=60)
CACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAG > SRR4302537.1037257/1‑94 (MQ=60)
CACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAG < SRR4302537.101822/94‑1 (MQ=60)
ACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGC > SRR4302537.1077254/1‑94 (MQ=60)
ACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGC > SRR4302537.3634530/1‑94 (MQ=60)
ACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGC > SRR4302537.5626174/1‑94 (MQ=60)
ACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGC > SRR4302537.3508133/1‑94 (MQ=60)
agatgccCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCC < SRR4302537.3399495/87‑1 (MQ=60)
CAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCC > SRR4302537.1138333/1‑94 (MQ=60)
CAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGCCACCTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCCTCAGCC > SRR4302537.2856744/1‑94 (MQ=60)
AATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCA > SRR4302537.6138655/1‑94 (MQ=60)
AATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCA > SRR4302537.228545/1‑94 (MQ=60)
AATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCA > SRR4302537.1725110/1‑94 (MQ=60)
ATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCTAGCCGCGCGGCGTGGCACGATTTTAATGCGTGTGATTGTGCGATCAGCCAA > SRR4302537.546686/1‑94 (MQ=60)
TGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAAT < SRR4302537.2708082/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATA < SRR4302537.650476/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATA < SRR4302537.3038221/94‑1 (MQ=60)
CACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAC < SRR4302537.4159857/94‑1 (MQ=60)
CACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAC < SRR4302537.208016/94‑1 (MQ=60)
CACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAC > SRR4302537.3490083/1‑94 (MQ=60)
ACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACT < SRR4302537.1778091/94‑1 (MQ=60)
CCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTG > SRR4302537.5208095/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTG > SRR4302537.2856667/1‑94 (MQ=60)
CCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTG < SRR4302537.739561/94‑1 (MQ=60)
CCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTG > SRR4302537.2071784/1‑94 (MQ=60)
CTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGC > SRR4302537.2484789/1‑94 (MQ=60)
TTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGACATCAGCCAATACTGCT > SRR4302537.4832749/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTC < SRR4302537.91613/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTC < SRR4302537.4267208/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTC > SRR4302537.5777777/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCC < SRR4302537.84980/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCC < SRR4302537.1524023/94‑1 (MQ=60)
tgcCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCCAG > SRR4302537.569592/4‑94 (MQ=60)
C‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCCAGAC > SRR4302537.6357320/1‑94 (MQ=60)
|
AGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTTCCAGAC > NC_000913/2896729‑2896911
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
