Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,901,550 |
T→C |
intergenic (+154/+1219) |
ygcE → / ← ygcF |
putative kinase/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,901,550 | 0 | T | C | 98.0%
| 873.2
/ 2.0
| 256 | intergenic (+154/+1219) | ygcE/ygcF | putative kinase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/2); new base C (108/143); total (111/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCAC > NC_000913/2901460‑2901641
|
ggggAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCgg < 1:130233/93‑1 (MQ=255)
ggggAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCgg < 2:692573/93‑1 (MQ=255)
gggAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGt > 1:446938/1‑93 (MQ=255)
cATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATc < 1:4731396/93‑1 (MQ=255)
cATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATc > 2:3289406/1‑93 (MQ=255)
cATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATc > 1:2087549/1‑93 (MQ=255)
aTAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATcc > 1:3816410/1‑93 (MQ=255)
aaGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCt > 1:209649/1‑93 (MQ=255)
aGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTg > 2:1627114/1‑93 (MQ=255)
aGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTg < 2:3651885/93‑1 (MQ=255)
gTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGt > 1:5046282/1‑93 (MQ=255)
gTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGt < 2:5917609/93‑1 (MQ=255)
ttCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGtt > 1:3572650/1‑93 (MQ=255)
ttCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGtt > 2:2308089/1‑93 (MQ=255)
ttCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGtt < 1:99138/93‑1 (MQ=255)
tCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGttt < 2:4851210/93‑1 (MQ=255)
aCAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGTCAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTa > 1:4672526/1‑93 (MQ=255)
aCAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTa > 2:1350873/1‑93 (MQ=255)
aCAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTa < 2:4972756/93‑1 (MQ=255)
aCAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTa < 2:6116790/93‑1 (MQ=255)
cAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTAc > 1:3451878/1‑93 (MQ=255)
cAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTAc > 2:1426740/1‑93 (MQ=255)
cAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTAc > 2:1331780/1‑93 (MQ=255)
cAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTAc < 2:1072284/93‑1 (MQ=255)
aaCTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCATGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACa > 1:2658243/1‑93 (MQ=255)
aCTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACaa < 1:416853/93‑1 (MQ=255)
aCTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACaa < 1:6355727/93‑1 (MQ=255)
aCTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACaa < 2:5522738/93‑1 (MQ=255)
cTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAg < 2:2794666/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGa > 1:939381/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGaa > 2:716363/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGaa > 2:4057829/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGaa < 1:5603320/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAat < 2:4512985/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGTAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAata > 1:3290517/1‑93 (MQ=255)
aaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAata < 1:2893109/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAatat < 2:3558468/93‑1 (MQ=255)
aaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATAtt > 2:1756631/1‑93 (MQ=255)
tGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTaa > 1:678130/1‑93 (MQ=255)
gATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAAc > 2:5636985/1‑93 (MQ=255)
tAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTa < 1:5900296/93‑1 (MQ=255)
tAACAAGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTa > 1:3112541/1‑93 (MQ=255)
aaCAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTac < 1:1209507/93‑1 (MQ=255)
aCAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTaca > 1:6427705/1‑93 (MQ=255)
aCAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTaca > 2:5978545/1‑93 (MQ=255)
cAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTacac > 2:541549/1‑93 (MQ=255)
aaGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACt < 2:5282638/93‑1 (MQ=255)
aGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTc < 2:5832558/93‑1 (MQ=255)
gTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCg > 1:2117789/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGa < 1:2545962/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGa < 1:6058532/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGa < 1:4559628/93‑1 (MQ=255)
cGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATg < 1:2816348/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGt > 1:3729829/1‑93 (MQ=255)
tttATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCt > 1:5354775/1‑93 (MQ=255)
ttATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCtt < 1:1760318/93‑1 (MQ=255)
ttATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCtt > 1:2565423/1‑93 (MQ=255)
aTCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTa < 2:4282489/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAg < 1:3322819/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAg < 1:2155110/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAAt < 1:6138228/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAAt > 1:5654331/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAAt < 1:3413488/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATa > 1:2284980/1‑93 (MQ=255)
cTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATaaa > 2:5397870/1‑93 (MQ=255)
tGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATaaaa < 2:3077136/93‑1 (MQ=255)
tGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATaaaa > 1:809893/1‑93 (MQ=255)
tGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATaaaa > 1:4407741/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGa < 1:4067598/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGAc > 2:2899175/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGAc > 1:1022314/1‑93 (MQ=255)
gCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACa < 1:2595172/93‑1 (MQ=255)
cAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACaa < 2:6019913/93‑1 (MQ=255)
aGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAAt < 2:2050800/93‑1 (MQ=255)
aGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAAt < 1:3010819/93‑1 (MQ=255)
gggAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAATAGACAATa < 2:6294672/93‑1 (MQ=255)
gggAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATa < 1:3991992/93‑1 (MQ=255)
ggAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAc > 1:2039427/1‑93 (MQ=255)
ggAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAc < 2:2572634/93‑1 (MQ=255)
ggAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAc > 1:4846356/1‑93 (MQ=255)
gAACATAATAAAAACTTCAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACg < 1:1868552/93‑1 (MQ=255)
aCATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGaa < 2:4581197/93‑1 (MQ=255)
cATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAAt > 2:2159210/1‑93 (MQ=255)
ataataAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATc < 1:1529654/93‑1 (MQ=255)
taataaAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCg < 2:241703/93‑1 (MQ=255)
aataaAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATccc > 1:5867969/1‑91 (MQ=255)
aataaAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGc > 2:3314908/1‑93 (MQ=255)
taaAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCAc > 1:5121374/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACt < 2:926173/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACtt < 1:1130543/93‑1 (MQ=255)
aaCTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTa > 2:4881672/1‑93 (MQ=255)
aaCTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTa < 2:4223466/93‑1 (MQ=255)
cTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATc > 2:5098249/1‑93 (MQ=255)
cTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATc < 1:3194472/93‑1 (MQ=255)
tAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAAt < 1:2464516/93‑1 (MQ=255)
tAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAAt < 1:1484298/93‑1 (MQ=255)
aaCTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAAtt < 2:1897557/93‑1 (MQ=255)
cTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAAtttt < 2:6427705/93‑1 (MQ=255)
tAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTc < 1:1964631/93‑1 (MQ=255)
gTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCAc < 1:6019428/93‑1 (MQ=255)
|
GCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCAC > NC_000913/2901460‑2901641
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT > NC_000913/2901457‑2901643
|
GACGCGGGGAACATAGGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGC < SRR4302537.392677/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGC < SRR4302537.6451858/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCT < SRR4302537.4563399/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCT < SRR4302537.4563225/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTC > SRR4302537.5312950/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTC < SRR4302537.2689461/94‑1 (MQ=60)
GCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCG > SRR4302537.6046534/1‑94 (MQ=60)
GGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGT < SRR4302537.131156/94‑1 (MQ=60)
GGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGT > SRR4302537.450039/1‑94 (MQ=60)
GGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCGGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTT < SRR4302537.6066839/94‑1 (MQ=60)
GGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTT < SRR4302537.2366389/94‑1 (MQ=60)
GGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTT < SRR4302537.3080132/94‑1 (MQ=60)
GGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTT > SRR4302537.3356235/1‑94 (MQ=60)
AACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTAT > SRR4302537.4481029/1‑94 (MQ=60)
AACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTAT > SRR4302537.4714199/1‑94 (MQ=60)
ACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATC > SRR4302537.2102273/1‑94 (MQ=60)
CATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCC > SRR4302537.3843175/1‑94 (MQ=60)
CATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCC < SRR4302537.4764089/94‑1 (MQ=60)
CATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCC < SRR4302537.1139082/94‑1 (MQ=60)
ATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCAGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCC > SRR4302537.2167367/1‑94 (MQ=60)
TAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCT < SRR4302537.5678206/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCT < SRR4302537.6273324/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCT > SRR4302537.211156/1‑94 (MQ=60)
AGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGT > SRR4302537.5081036/1‑94 (MQ=60)
GTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTT > SRR4302537.3597843/1‑94 (MQ=60)
GTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTT < SRR4302537.2104458/94‑1 (MQ=60)
GTGCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTT < SRR4302537.953878/94‑1 (MQ=60)
TTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTT < SRR4302537.300391/94‑1 (MQ=60)
TTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTT < SRR4302537.512092/94‑1 (MQ=60)
TTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTT < SRR4302537.4987011/94‑1 (MQ=60)
TTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTT < SRR4302537.99855/94‑1 (MQ=60)
CGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTT < SRR4302537.297902/94‑1 (MQ=60)
GACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGTCAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTA > SRR4302537.4704855/1‑94 (MQ=60)
GACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTA > SRR4302537.819625/1‑94 (MQ=60)
ACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTAC > SRR4302537.3476291/1‑94 (MQ=60)
CAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACA > SRR4302537.1182601/1‑94 (MQ=60)
AAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCATGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACA > SRR4302537.2676817/1‑94 (MQ=60)
ACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAG < SRR4302537.419749/94‑1 (MQ=60)
ACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAG < SRR4302537.6399109/94‑1 (MQ=60)
ACTTAAAAAATGATAACAAGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAG < SRR4302537.4332627/94‑1 (MQ=60)
CTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGG < SRR4302537.6145612/94‑1 (MQ=60)
TTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGA > SRR4302537.945859/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAA < SRR4302537.3863456/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAA > SRR4302537.2581300/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAA > SRR4302537.3542236/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAAT < SRR4302537.3803336/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAAT < SRR4302537.5641628/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAAT > SRR4302537.3309482/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGTAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATA > SRR4302537.3313769/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATA < SRR4302537.1686624/94‑1 (MQ=60)
AAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATA > SRR4302537.5021104/1‑94 (MQ=60)
AAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATA > SRR4302537.3270590/1‑94 (MQ=60)
AAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATAT > SRR4302537.2850282/1‑94 (MQ=60)
AAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATAT < SRR4302537.2913420/94‑1 (MQ=60)
AAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATT > SRR4302537.6363644/1‑94 (MQ=60)
AAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATT > SRR4302537.4519008/1‑94 (MQ=60)
AAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATT < SRR4302537.6119505/94‑1 (MQ=60)
AAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATT < SRR4302537.2515807/94‑1 (MQ=60)
AATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTA < SRR4302537.5959429/94‑1 (MQ=60)
AATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTA < SRR4302537.2008263/94‑1 (MQ=60)
AATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTA > SRR4302537.1498366/1‑94 (MQ=60)
ATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAA < SRR4302537.3419189/94‑1 (MQ=60)
ATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAA > SRR4302537.682773/1‑94 (MQ=60)
TGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAAC > SRR4302537.5746412/1‑94 (MQ=60)
TGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAAC > SRR4302537.5342609/1‑94 (MQ=60)
GATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACT < SRR4302537.6459505/94‑1 (MQ=60)
ATAACAAGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTA > SRR4302537.3134281/1‑94 (MQ=60)
TAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTAC < SRR4302537.5940784/94‑1 (MQ=60)
TAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTAC > SRR4302537.1294602/1‑94 (MQ=60)
TAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTAC > SRR4302537.5738860/1‑94 (MQ=60)
AACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACA < SRR4302537.1217922/94‑1 (MQ=60)
AACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACA > SRR4302537.6471382/1‑94 (MQ=60)
ACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACAC > SRR4302537.6509500/1‑94 (MQ=60)
CAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACT > SRR4302537.4800017/1‑94 (MQ=60)
AAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTC < SRR4302537.4480633/94‑1 (MQ=60)
AGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCG > SRR4302537.2132703/1‑94 (MQ=60)
AGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCG > SRR4302537.1605375/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGAT < SRR4302537.4591189/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGAT < SRR4302537.2563801/94‑1 (MQ=60)
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GGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTC > SRR4302537.3850606/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCT > SRR4302537.2594359/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCT > SRR4302537.5391452/1‑94 (MQ=60)
TTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTT > SRR4302537.2583399/1‑94 (MQ=60)
TTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTT < SRR4302537.3569291/94‑1 (MQ=60)
TTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTT < SRR4302537.1772589/94‑1 (MQ=60)
TATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTA > SRR4302537.1970290/1‑94 (MQ=60)
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ATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAG > SRR4302537.1843216/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGA < SRR4302537.3346326/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGA < SRR4302537.2170300/94‑1 (MQ=60)
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CCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAAT > SRR4302537.5693027/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATA < SRR4302537.3598732/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATA < SRR4302537.6180433/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATA < SRR4302537.450776/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATA > SRR4302537.2301100/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATA < SRR4302537.3437662/94‑1 (MQ=60)
CTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAA > SRR4302537.815443/1‑94 (MQ=60)
CTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAA > SRR4302537.4438162/1‑94 (MQ=60)
CTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAA < SRR4302537.3193847/94‑1 (MQ=60)
GATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGA > SRR4302537.2757721/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGAC < SRR4302537.4096014/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGAC < SRR4302537.4189637/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGAC > SRR4302537.1029353/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAA < SRR4302537.2613327/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAA < SRR4302537.5924870/94‑1 (MQ=60)
CAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAAT < SRR4302537.786835/94‑1 (MQ=60)
AGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATA < SRR4302537.1366727/94‑1 (MQ=60)
AGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATA < SRR4302537.3315864/94‑1 (MQ=60)
AGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATA < SRR4302537.6519129/94‑1 (MQ=60)
AGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATA < SRR4302537.3031766/94‑1 (MQ=60)
GGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAC > SRR4302537.1090292/1‑94 (MQ=60)
GGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAC < SRR4302537.4019943/94‑1 (MQ=60)
GGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAC > SRR4302537.3114660/1‑94 (MQ=60)
GGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAC > SRR4302537.4879801/1‑94 (MQ=60)
GGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATAC > SRR4302537.2053657/1‑94 (MQ=60)
GAACATAATAAAAACTTCAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGA < SRR4302537.1881558/94‑1 (MQ=60)
ACATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAAT < SRR4302537.2638079/94‑1 (MQ=60)
CATAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATC < SRR4302537.2528613/94‑1 (MQ=60)
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TAATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCCC > SRR4302537.5908225/1‑94 (MQ=60)
ATAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCAC > SRR4302537.5156673/1‑94 (MQ=60)
TAAAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACT > SRR4302537.2104415/1‑94 (MQ=60)
AAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTT < SRR4302537.1138386/94‑1 (MQ=60)
AAAACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTT > SRR4302537.1476100/1‑94 (MQ=60)
AACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTAT < SRR4302537.2419118/94‑1 (MQ=60)
AACTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTAT < SRR4302537.4170952/94‑1 (MQ=60)
CTTTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCA < SRR4302537.3216934/94‑1 (MQ=60)
TTAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAAT < SRR4302537.5539274/94‑1 (MQ=60)
TAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATT > SRR4302537.881556/1‑94 (MQ=60)
TAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATT < SRR4302537.1494628/94‑1 (MQ=60)
TAACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATT < SRR4302537.2481842/94‑1 (MQ=60)
AACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTT > SRR4302537.5607600/1‑94 (MQ=60)
ACTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTT > SRR4302537.2054793/1‑94 (MQ=60)
CTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTC > SRR4302537.2004923/1‑94 (MQ=60)
CTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTC > SRR4302537.4605972/1‑94 (MQ=60)
CTAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTC < SRR4302537.2239708/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCA < SRR4302537.1978293/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCA < SRR4302537.3472009/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACT < SRR4302537.6060780/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT < SRR4302537.6445945/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT > SRR4302537.4488670/1‑94 (MQ=60)
CTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT < SRR4302537.6365448/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT > SRR4302537.4815589/1‑94 (MQ=60)
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GACGCGGGGAACATAAGTTCGACAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTT > NC_000913/2901457‑2901643
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
