Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,976,431 |
T→C |
H164R (CAC→CGC) |
lysA ← |
diaminopimelate decarboxylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,976,431 | 0 | T | C | 100.0%
| 672.9
/ NA
| 195 | H164R (CAC→CGC) | lysA | diaminopimelate decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (87/108); total (87/108) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGTGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGC > NC_000913/2976341‑2976520
|
aaCCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGcgct < 1:5452241/93‑1 (MQ=255)
ccAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGcgcttg < 1:5755812/93‑1 (MQ=255)
ccAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGcgcttg > 2:3439109/1‑93 (MQ=255)
ccAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGcgcttg < 2:5211122/93‑1 (MQ=255)
cAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGcgcttgc > 2:437501/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCATATACCGcgcttgct > 2:5610295/1‑93 (MQ=255)
aTGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTg < 1:4761064/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTg < 1:936472/93‑1 (MQ=255)
tgtgCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGt > 1:1992796/1‑93 (MQ=255)
tgtgCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGt > 2:5513623/1‑93 (MQ=255)
gtgCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGtt < 2:6022255/93‑1 (MQ=255)
gCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGtttt < 2:4606069/93‑1 (MQ=255)
cATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTc > 2:926719/1‑93 (MQ=255)
gtgAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGcc > 1:3023399/1‑93 (MQ=255)
tgAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCa < 1:1419718/93‑1 (MQ=255)
gAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAc > 1:5553628/1‑93 (MQ=255)
gAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAc < 1:697052/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCg > 2:5809072/1‑93 (MQ=255)
tGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCTGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCgg < 2:6380007/93‑1 (MQ=255)
tGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCgg < 1:2339210/93‑1 (MQ=255)
tGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCgg < 1:4809886/93‑1 (MQ=255)
gCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGt < 1:1616356/93‑1 (MQ=255)
ccGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTa < 2:566502/93‑1 (MQ=255)
gACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTAtt < 2:6344235/93‑1 (MQ=255)
gACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTAtt < 1:3915899/93‑1 (MQ=255)
aCCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTg < 1:4178316/93‑1 (MQ=255)
aCCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTg > 1:5066532/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGt > 2:3909196/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGt < 2:6450102/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGt > 1:1924633/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGtt > 1:789142/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGttt > 2:1552848/1‑93 (MQ=255)
cTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGtttt < 1:2948429/93‑1 (MQ=255)
tGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGttttt < 1:102400/93‑1 (MQ=255)
gCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGtttttt < 1:3298893/93‑1 (MQ=255)
cAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATTCCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTg < 1:4294465/93‑1 (MQ=255)
cAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTg > 1:1251240/1‑93 (MQ=255)
cAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTg < 1:4058061/93‑1 (MQ=255)
cAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTg < 1:3999605/93‑1 (MQ=255)
gatgatGACGTTGTATCACTTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGc < 2:5734023/93‑1 (MQ=255)
atgatgACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCt < 1:280138/93‑1 (MQ=255)
atgatgACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCt > 1:5851368/1‑93 (MQ=255)
atgatgACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCt > 2:2688780/1‑93 (MQ=255)
tgatgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTa < 1:5276649/93‑1 (MQ=255)
gatgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTAt < 1:1735436/93‑1 (MQ=255)
gatgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTAt < 1:1567323/93‑1 (MQ=255)
atgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATg > 1:6341648/1‑93 (MQ=255)
atgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATg < 1:6161863/93‑1 (MQ=255)
tgaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGt < 1:5179446/93‑1 (MQ=255)
gaCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTc > 2:3783726/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTcc < 1:5984351/93‑1 (MQ=255)
cGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCg > 2:6215282/1‑93 (MQ=255)
gTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGt > 1:3498372/1‑93 (MQ=255)
gTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGt < 1:2119592/93‑1 (MQ=255)
gTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGt > 1:222692/1‑93 (MQ=255)
gTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGt > 1:3190978/1‑93 (MQ=255)
gTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGt > 1:2865565/1‑93 (MQ=255)
ttGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTg < 1:2484100/93‑1 (MQ=255)
tGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGa > 2:1922425/1‑93 (MQ=255)
gTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGAc < 1:10757/93‑1 (MQ=255)
gTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGAc > 1:2285567/1‑93 (MQ=255)
tCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCaa < 1:3971227/93‑1 (MQ=255)
gTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAAccc > 2:4569322/1‑93 (MQ=255)
tCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAAcccc > 1:426821/1‑93 (MQ=255)
tCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAAcccc < 1:4174763/93‑1 (MQ=255)
cAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCgg > 2:838764/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGCTTTCGCCACCGGGATTGGTTTTTTTGCTATGTGCCTGAACAAACCCCGGATTa > 2:2411656/1‑93 (MQ=255)
cggcggGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTaa < 1:3758206/93‑1 (MQ=255)
ggcggGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAAc < 1:5339772/93‑1 (MQ=255)
ggcggGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAAc > 1:4235109/1‑93 (MQ=255)
ggCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAAcgcga > 2:1836482/1‑92 (MQ=255)
ggCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACgcgc > 1:4386748/1‑93 (MQ=255)
gCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCa < 2:1493511/93‑1 (MQ=255)
gCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCa < 2:2535619/93‑1 (MQ=255)
aGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGc < 2:2088857/93‑1 (MQ=255)
gATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGcc > 2:4401391/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCa < 2:1293343/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATa < 2:1607666/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATa < 1:4138163/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATa < 2:3794638/93‑1 (MQ=255)
ggTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATAc > 2:4212842/1‑93 (MQ=255)
gtgtACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATAcc < 1:4674387/93‑1 (MQ=255)
tgtACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATAccc < 2:1696366/93‑1 (MQ=255)
tgtACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATAccc > 2:3087835/1‑93 (MQ=255)
tACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGa > 2:4955776/1‑93 (MQ=255)
tACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGa < 1:1835124/93‑1 (MQ=255)
tACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGa < 1:6459621/93‑1 (MQ=255)
aCCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAt > 1:2534709/1‑93 (MQ=255)
aCCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAt < 2:1431096/93‑1 (MQ=255)
ccAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATg > 1:3694959/1‑93 (MQ=255)
cAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGc > 2:5372751/1‑93 (MQ=255)
aGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGcc < 2:5472809/93‑1 (MQ=255)
aGATACAGCGCTTGCTGTTTTTGTCTCCGGTATTGGTTTTTTGGCTATTTCCGTGATCACACCCCGGGTTACCGCGGAGGCATACCCCATGcc > 2:4668902/1‑93 (MQ=255)
gATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGccc < 2:2031139/93‑1 (MQ=255)
aTACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCt > 1:3592394/1‑93 (MQ=255)
tACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTg < 2:2933002/93‑1 (MQ=255)
tACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTg < 1:3149706/93‑1 (MQ=255)
tACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGAGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTg < 1:4544047/93‑1 (MQ=255)
aCCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAACCCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTgg < 1:6049582/93‑1 (MQ=255)
aCCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTgg > 2:5910478/1‑93 (MQ=255)
|
GAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGTGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGC > NC_000913/2976341‑2976520
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCAGAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGTGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGCGAAA > NC_000913/2976338‑2976524
|
CCAGAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGC > SRR4302537.4407253/1‑94 (MQ=60)
CAGAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCG > SRR4302537.886459/1‑94 (MQ=60)
GAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCT < SRR4302537.484697/94‑1 (MQ=60)
AACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTT < SRR4302537.5489430/94‑1 (MQ=60)
AACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTT > SRR4302537.1785933/1‑94 (MQ=60)
CCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACGGCGCTTGC > SRR4302537.425265/1‑94 (MQ=60)
CCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGC < SRR4302537.406994/94‑1 (MQ=60)
CCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGC < SRR4302537.5795234/94‑1 (MQ=60)
CCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGC < SRR4302537.4283801/94‑1 (MQ=60)
CAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCT > SRR4302537.905159/1‑94 (MQ=60)
CAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCT > SRR4302537.5691916/1‑94 (MQ=60)
CAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCT < SRR4302537.649407/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGT < SRR4302537.942923/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGT < SRR4302537.4793951/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGT > SRR4302537.2657103/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGT > SRR4302537.2006653/1‑94 (MQ=60)
TGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTT < SRR4302537.2834418/94‑1 (MQ=60)
TGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTT < SRR4302537.3796800/94‑1 (MQ=60)
GTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTT > SRR4302537.3826677/1‑94 (MQ=60)
TGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTT < SRR4302537.701980/94‑1 (MQ=60)
GCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTC < SRR4302537.4172094/94‑1 (MQ=60)
GCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTC < SRR4302537.1388336/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCG < SRR4302537.6081273/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCC > SRR4302537.3044474/1‑94 (MQ=60)
TGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCC < SRR4302537.5195392/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAC > SRR4302537.5591550/1‑94 (MQ=60)
TGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAC < SRR4302537.1429598/94‑1 (MQ=60)
TGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAC > SRR4302537.2401184/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACC < SRR4302537.701827/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCG > SRR4302537.3782339/1‑94 (MQ=60)
TGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGT < SRR4302537.4843088/94‑1 (MQ=60)
TGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGT < SRR4302537.2355696/94‑1 (MQ=60)
GCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTA < SRR4302537.1627647/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTG > SRR4302537.5101409/1‑94 (MQ=60)
GACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTG < SRR4302537.3943270/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTG < SRR4302537.3178393/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTG > SRR4302537.5908170/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGG > SRR4302537.5342708/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGG < SRR4302537.4207485/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGT > SRR4302537.1937993/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTT > SRR4302537.6266847/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTT > SRR4302537.794560/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTT < SRR4302537.4348958/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTT < SRR4302537.2969121/94‑1 (MQ=60)
TGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTT > SRR4302537.5146477/1‑94 (MQ=60)
TGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTT < SRR4302537.103139/94‑1 (MQ=60)
TGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTT < SRR4302537.4715095/94‑1 (MQ=60)
TGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTT > SRR4302537.1490555/1‑94 (MQ=60)
GCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTG < SRR4302537.5797221/94‑1 (MQ=60)
GCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTG < SRR4302537.3322217/94‑1 (MQ=60)
GCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTG > SRR4302537.1259949/1‑94 (MQ=60)
CAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATTCCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGG < SRR4302537.4324323/94‑1 (MQ=60)
CAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGG < SRR4302537.4086417/94‑1 (MQ=60)
CAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGG < SRR4302537.4027606/94‑1 (MQ=60)
CAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGG < SRR4302537.3222227/94‑1 (MQ=60)
CAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGG < SRR4302537.2158446/94‑1 (MQ=60)
AGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGC > SRR4302537.1188892/1‑94 (MQ=60)
GATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCT < SRR4302537.2931867/94‑1 (MQ=60)
GATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCT > SRR4302537.5891508/1‑94 (MQ=60)
ATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTA < SRR4302537.282091/94‑1 (MQ=60)
TGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTAT < SRR4302537.5312956/94‑1 (MQ=60)
GATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATG < SRR4302537.1578259/94‑1 (MQ=60)
GATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATG < SRR4302537.1976626/94‑1 (MQ=60)
GATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATG < SRR4302537.1747542/94‑1 (MQ=60)
GATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATG > SRR4302537.6384977/1‑94 (MQ=60)
ATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGT < SRR4302537.4013998/94‑1 (MQ=60)
ATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGT < SRR4302537.6204267/94‑1 (MQ=60)
TGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTC < SRR4302537.5215088/94‑1 (MQ=60)
TGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTC < SRR4302537.4172534/94‑1 (MQ=60)
GACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCC > SRR4302537.5531408/1‑94 (MQ=60)
GACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCC < SRR4302537.4376447/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCG < SRR4302537.6025421/94‑1 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT > SRR4302537.3213415/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT > SRR4302537.5453919/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT > SRR4302537.3523124/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT > SRR4302537.224279/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT < SRR4302537.1866730/94‑1 (MQ=60)
CGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGT > SRR4302537.2885661/1‑94 (MQ=60)
GTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTG < SRR4302537.2134511/94‑1 (MQ=60)
GTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTG < SRR4302537.280615/94‑1 (MQ=60)
TTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGA < SRR4302537.2501587/94‑1 (MQ=60)
TGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGAC > SRR4302537.2301691/1‑94 (MQ=60)
GTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACC < SRR4302537.10834/94‑1 (MQ=60)
GTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACC < SRR4302537.3998335/94‑1 (MQ=60)
TATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCA > SRR4302537.2037596/1‑94 (MQ=60)
TCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAA > SRR4302537.6374985/1‑94 (MQ=60)
TCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAA < SRR4302537.3999020/94‑1 (MQ=60)
CACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAAC > SRR4302537.3527161/1‑94 (MQ=60)
CGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCC < SRR4302537.2507773/94‑1 (MQ=60)
GTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCC > SRR4302537.429784/1‑94 (MQ=60)
TCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCG < SRR4302537.4203912/94‑1 (MQ=60)
TCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCAACGGTATTGGTTTTTTGGCTATGGCCGTGACCAGACACCG > SRR4302537.2245896/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGAT > SRR4302537.1582884/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGAT < SRR4302537.4795321/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGAT < SRR4302537.3502375/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGAT > SRR4302537.525335/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATT > SRR4302537.3270041/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGGGCATATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTA < SRR4302537.1033050/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAAC < SRR4302537.3784593/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAAC > SRR4302537.4264574/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACG < SRR4302537.5376373/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGC < SRR4302537.5679874/94‑1 (MQ=60)
GGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGC > SRR4302537.4489636/1‑94 (MQ=60)
GGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGC > SRR4302537.4417011/1‑94 (MQ=60)
CAGATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGC > SRR4302537.4205673/1‑94 (MQ=60)
GATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCA > SRR4302537.4089254/1‑94 (MQ=60)
GATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCA < SRR4302537.3020509/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCAT < SRR4302537.1670906/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATAC < SRR4302537.4167028/94‑1 (MQ=60)
GTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCACAACCCGGATTAACGCGCAGCCATACCC < SRR4302537.6514060/94‑1 (MQ=60)
GTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCC < SRR4302537.4687992/94‑1 (MQ=60)
GTGTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCC < SRR4302537.4706723/94‑1 (MQ=60)
GTACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGA > SRR4302537.4314176/1‑94 (MQ=60)
TACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAT < SRR4302537.1847899/94‑1 (MQ=60)
TACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAT < SRR4302537.2346293/94‑1 (MQ=60)
TACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAT > SRR4302537.2552497/1‑94 (MQ=60)
TACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGAT < SRR4302537.6503397/94‑1 (MQ=60)
ACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATG > SRR4302537.3720961/1‑94 (MQ=60)
ACCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATG > SRR4302537.3647585/1‑94 (MQ=60)
CCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGC > SRR4302537.3123819/1‑94 (MQ=60)
CCAGATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGC > SRR4302537.1711039/1‑94 (MQ=60)
GATACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCT > SRR4302537.3617717/1‑94 (MQ=60)
TACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGG < SRR4302537.3171796/94‑1 (MQ=60)
TACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGAGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGG < SRR4302537.4575497/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAACCCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGC < SRR4302537.6091128/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGC < SRR4302537.6115853/94‑1 (MQ=60)
ACCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGC > SRR4302537.2234912/1‑94 (MQ=60)
CCGCGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGCG > SRR4302537.589876/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGTTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGCGAAA < SRR4302537.173464/94‑1 (MQ=60)
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CCAGAACCAATGTGCATGTGAATGCCGACCAGCTGCAGATGATGACGTTGTATCACGTCCAGTGCGGCGGGCAGATCGGTGTACCAGATACCGTGCTTGCTGTTTTCGCCACCGGTATTGGTTTTTTGGCTATGTCCGTGACCAAACCCCGGATTAACGCGCAGCCATACCCGATGCCCTGGCGAAA > NC_000913/2976338‑2976524
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
