Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,108,438 |
C→A |
noncoding (56/76 nt) |
pheV → |
tRNA‑Phe |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,108,438 | 0 | C | A | 100.0%
| 664.6
/ NA
| 193 | noncoding (56/76 nt) | pheV | tRNA‑Phe |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (77/116); total (77/116) |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA > NC_000913/3108349‑3108527
|
agacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGAtt > 2:4298216/1‑93 (MQ=255)
acgagGCGAATCAGGTTTAATGCTCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTcc < 2:4620885/93‑1 (MQ=255)
acgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTcc < 2:473062/93‑1 (MQ=255)
cgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCg < 1:5053540/93‑1 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg > 2:606484/1‑93 (MQ=255)
ggCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGt < 1:231098/93‑1 (MQ=255)
gCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc < 2:2975974/93‑1 (MQ=255)
gCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc < 1:455979/93‑1 (MQ=255)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCg > 1:769501/1‑93 (MQ=37)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCg > 2:686540/1‑93 (MQ=37)
aaTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 1:5120303/93‑1 (MQ=25)
aaTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 1:3888398/93‑1 (MQ=25)
aaTCAGGTTTAATGCCCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 1:180404/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg > 2:2460270/1‑93 (MQ=21)
taaGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGCGTCCTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGc > 2:4075067/3‑93 (MQ=11)
tCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGc > 1:4676094/1‑93 (MQ=18)
tttAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcaccac > 1:566895/1‑93 (MQ=14)
tttAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcaccac > 1:420981/1‑93 (MQ=14)
tttAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcaccac < 1:1645129/93‑1 (MQ=14)
aaTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTaa > 1:4725498/1‑93 (MQ=21)
aTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAt < 2:4896937/93‑1 (MQ=25)
aTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAt < 2:3318307/93‑1 (MQ=25)
aTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAt < 2:1217200/93‑1 (MQ=25)
agcgcCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAAGCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCAGGGCACCACTAAtt < 1:1411369/92‑1 (MQ=11)
gcgcCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTc < 2:4943932/93‑1 (MQ=255)
ccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTa > 1:3378476/1‑93 (MQ=255)
ccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTa < 2:3972561/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTaa > 2:3723975/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTaa > 2:1770791/1‑93 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTaa < 1:5221539/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGTACCACTAATTCTTAAg > 2:818185/1‑93 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAg < 2:2527864/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAg > 1:197551/1‑93 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAg < 1:4340900/93‑1 (MQ=255)
cGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGa > 2:3806505/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGac > 1:3169951/1‑92 (MQ=255)
gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGaa > 2:3468526/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGaa < 1:2237302/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAc > 2:2198180/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAcc < 2:6114310/93‑1 (MQ=255)
cccGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCg > 2:3151520/1‑93 (MQ=255)
cGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGcc > 1:671001/1‑93 (MQ=255)
cGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGcc > 2:5593596/1‑93 (MQ=255)
gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCca < 2:476735/93‑1 (MQ=255)
gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCca > 2:2124151/1‑93 (MQ=255)
aTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCcac > 2:4844576/1‑93 (MQ=255)
aGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACaa < 1:3107238/93‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg > 2:5887923/1‑93 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 2:3559135/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGc < 1:4518535/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGc < 2:716394/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCg < 2:4871764/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCgg < 1:67610/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGt > 2:888498/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGtt < 1:3769638/93‑1 (MQ=255)
cGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGtt < 1:679336/93‑1 (MQ=255)
cGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGtt < 1:4879061/93‑1 (MQ=255)
ggTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGttt > 1:4234532/1‑93 (MQ=255)
ggTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGttt < 1:1694157/93‑1 (MQ=255)
agagCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTg < 1:3210522/93‑1 (MQ=255)
gagCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGc < 1:5429444/93‑1 (MQ=255)
gagCAGGGAATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGc < 2:141668/93‑1 (MQ=255)
agCATGGGATTGAAAATCCCCTTGTCGTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCt < 2:1622360/93‑1 (MQ=25)
agCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCt < 2:5392755/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCttt < 2:3130761/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCttt < 1:3092631/93‑1 (MQ=255)
ggggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTg < 1:5511459/93‑1 (MQ=255)
gggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTgg > 2:5986585/1‑93 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAt < 2:2747930/93‑1 (MQ=255)
aTTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATc > 2:6442211/1‑93 (MQ=255)
aTTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATc > 1:809588/1‑93 (MQ=255)
ttaaaaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCt < 2:4503372/90‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCt < 1:3452587/93‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCCACGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCt < 2:4387694/93‑1 (MQ=255)
gAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGa < 1:4908755/93‑1 (MQ=255)
gAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGa > 1:6092010/1‑93 (MQ=255)
gAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGa < 2:208157/93‑1 (MQ=255)
aaaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAc > 1:2913764/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACa > 2:1482214/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACa < 2:1000835/93‑1 (MQ=255)
aaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACaa > 1:341325/1‑93 (MQ=255)
aaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACaa < 2:537441/93‑1 (MQ=255)
aaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACaa > 1:5526845/1‑93 (MQ=255)
tCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa < 2:5050754/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa < 2:573903/93‑1 (MQ=255)
ccccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATaa > 2:1758296/1‑93 (MQ=255)
ccccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATaa < 1:3494794/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAc > 2:3704879/1‑93 (MQ=255)
ccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAcc < 1:144370/93‑1 (MQ=255)
ccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAcc > 2:2046454/1‑93 (MQ=255)
cGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCt < 1:5236167/93‑1 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCtt > 2:328809/1‑93 (MQ=255)
tgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTc < 1:936967/93‑1 (MQ=255)
gtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCa < 1:4777792/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc < 1:6067348/93‑1 (MQ=255)
ccTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACg > 1:641256/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGa < 2:1329810/93‑1 (MQ=255)
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 2:6373168/1‑93 (MQ=255)
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 1:5971058/1‑93 (MQ=255)
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 2:5258188/1‑93 (MQ=255)
|
GAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA > NC_000913/3108349‑3108527
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > NC_000913/3108345‑3108531
|
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTA > SRR4302537.5410489/1‑94 (MQ=52)
GACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAG > SRR4302537.3421244/1‑94 (MQ=49)
GACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAG > SRR4302537.4639145/1‑94 (MQ=49)
ACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGA < SRR4302537.188629/94‑1 (MQ=46)
GAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATT < SRR4302537.761995/94‑1 (MQ=40)
GAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATT > SRR4302537.3418524/1‑94 (MQ=40)
AGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTC < SRR4302537.517568/94‑1 (MQ=38)
AGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGGAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTC > SRR4302537.682838/1‑94 (MQ=36)
CGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGA < SRR4302537.5088331/94‑1 (MQ=30)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGTAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAG > SRR4302537.3975501/1‑94 (MQ=26)
AGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT < SRR4302537.1777371/94‑1 (MQ=25)
AGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT > SRR4302537.1472419/1‑94 (MQ=25)
GGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTC < SRR4302537.232727/94‑1 (MQ=23)
GCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCC < SRR4302537.459124/94‑1 (MQ=20)
CGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCG > SRR4302537.774778/1‑94 (MQ=15)
AATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGG < SRR4302537.5155592/94‑1 (MQ=10)
AATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGG < SRR4302537.3915597/94‑1 (MQ=10)
AATCAGGTTTAATGCCCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGG < SRR4302537.181687/94‑1 (MQ=9)
ATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC > SRR4302537.4708443/1‑94 (MQ=7)
ATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC > SRR4302537.6017323/1‑94 (MQ=7)
CAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCAC < SRR4302537.648992/94‑1 (MQ=2)
GGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGCATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA < SRR4302537.886427/94‑1 (MQ=0)
GTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCAC > SRR4302537.423897/1‑94 (MQ=0)
GTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCAC > SRR4302537.570791/1‑94 (MQ=0)
GTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCAC < SRR4302537.4515126/94‑1 (MQ=0)
GTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCACGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCAC > SRR4302537.4582879/1‑94 (MQ=0)
TTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCTGAGTCCGGGCACCACT < SRR4302537.3067609/94‑1 (MQ=2)
TTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACT > SRR4302537.2195288/1‑94 (MQ=2)
TTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACT < SRR4302537.1656655/94‑1 (MQ=2)
TAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAA > SRR4302537.4758163/1‑94 (MQ=7)
ATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATT > SRR4302537.6358129/1‑94 (MQ=12)
AGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAAGCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCAGGGCACCACTAATTC < SRR4302537.1421200/94‑1 (MQ=13)
GCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCT < SRR4302537.3492516/94‑1 (MQ=20)
CGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTT > SRR4302537.3635397/1‑94 (MQ=23)
GCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTA > SRR4302537.3402416/1‑94 (MQ=25)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG < SRR4302537.5257453/94‑1 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302537.198960/1‑94 (MQ=30)
CCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGA < SRR4302537.4371016/94‑1 (MQ=33)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAC > SRR4302537.3192222/1‑94 (MQ=32)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAA > SRR4302537.676026/1‑94 (MQ=35)
GTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302537.4992130/94‑1 (MQ=38)
GTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302537.2253082/94‑1 (MQ=38)
TTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGcaca > SRR4302537.4714301/1‑90 (MQ=31)
TTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACC < SRR4302537.4939794/94‑1 (MQ=40)
TGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCC < SRR4302537.6133528/94‑1 (MQ=43)
TGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCC < SRR4302537.1694553/94‑1 (MQ=43)
CCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCC > SRR4302537.675590/1‑94 (MQ=50)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCC < SRR4302537.3827120/94‑1 (MQ=53)
TAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAA < SRR4302537.4322549/94‑1 (MQ=60)
AGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302537.1900472/94‑1 (MQ=60)
AGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302537.3128939/94‑1 (MQ=60)
AGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302537.4829938/94‑1 (MQ=60)
TCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAATTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCG < SRR4302537.3451531/94‑1 (MQ=60)
TCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCG < SRR4302537.4549791/94‑1 (MQ=60)
TCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCG < SRR4302537.2497261/94‑1 (MQ=60)
AGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGG < SRR4302537.68109/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGT < SRR4302537.5926996/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTT < SRR4302537.5320100/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTT > SRR4302537.5126725/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302537.683991/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302537.4912766/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302537.4655068/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT > SRR4302537.4263997/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302537.3796105/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTT > SRR4302537.3114418/1‑94 (MQ=60)
GGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTT < SRR4302537.1706013/94‑1 (MQ=60)
GTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTT > SRR4302537.3200280/1‑94 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGC < SRR4302537.3233100/94‑1 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGC < SRR4302537.5485563/94‑1 (MQ=60)
GAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCT < SRR4302537.5466468/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTT < SRR4302537.3114205/94‑1 (MQ=60)
GGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGG < SRR4302537.3136249/94‑1 (MQ=60)
GGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGG < SRR4302537.5549092/94‑1 (MQ=60)
GGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGTGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAT < SRR4302537.948267/94‑1 (MQ=60)
GGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAT > SRR4302537.850821/1‑94 (MQ=60)
GATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATC < SRR4302537.5269418/94‑1 (MQ=60)
GATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATC > SRR4302537.815138/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT < SRR4302537.781146/94‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTG < SRR4302537.3477004/94‑1 (MQ=60)
TGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGA > SRR4302537.6133867/1‑94 (MQ=60)
GAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAC < SRR4302537.5552561/94‑1 (MQ=60)
GAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAC < SRR4302537.4942635/94‑1 (MQ=60)
GAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAC > SRR4302537.2934230/1‑94 (MQ=60)
AAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAA > SRR4302537.5564571/1‑94 (MQ=60)
AAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAA > SRR4302537.343690/1‑94 (MQ=60)
AATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAGCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAT < SRR4302537.444515/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCGCAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAC < SRR4302537.3397860/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAC < SRR4302537.3519519/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCT < SRR4302537.145398/94‑1 (MQ=60)
CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTT < SRR4302537.5272192/94‑1 (MQ=60)
CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTGTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTT > SRR4302537.2318998/1‑94 (MQ=60)
TGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCA < SRR4302537.943426/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC < SRR4302537.4810777/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG < SRR4302537.6109031/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG > SRR4302537.645626/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAA > SRR4302537.5571428/1‑94 (MQ=60)
TGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAA > SRR4302537.6012043/1‑94 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA > SRR4302537.637075/1‑94 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA > SRR4302537.4541400/1‑94 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA < SRR4302537.4257195/94‑1 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGGCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGATTTTGCTTTTTGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA > SRR4302537.866038/1‑94 (MQ=60)
AGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAACAAATT > SRR4302537.1814714/1‑94 (MQ=60)
AGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > SRR4302537.4472531/1‑94 (MQ=60)
|
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > NC_000913/3108345‑3108531
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
