Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,601 |
+C |
coding (237/282 nt) |
b4568 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,600 | 1 | . | C | 99.6%
| 781.3
/ ‑3.7
| 224 | coding (236/282 nt) | b4568 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (108/115); total (109/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005508‑4005687
|
cgTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑gg > 1:6005885/1‑93 (MQ=255)
tAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑cc > 2:4172552/1‑92 (MQ=255)
gTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTAt < 2:4613267/93‑1 (MQ=255)
tttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTAtc < 2:3365113/93‑1 (MQ=255)
gttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTAtc < 1:1973103/92‑1 (MQ=255)
ttGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTAtct < 1:5162261/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATctct < 1:867074/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTctg < 1:5742837/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTctg < 2:5849500/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTctgc < 1:6248737/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTctgc < 1:1498180/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTctgctg > 1:1033536/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATg > 1:1070896/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATg < 2:1918215/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 2:3837691/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 1:3125885/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 2:4361779/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt > 2:626586/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 1:4696775/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTTGGCCTGCAGTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGt < 2:2733448/93‑1 (MQ=255)
cgcTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATggggt > 2:3308465/1‑91 (MQ=255)
gctgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTa < 2:2922189/93‑1 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATTGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 2:5570611/1‑93 (MQ=255)
tgctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTAcc > 1:4634048/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 1:665620/1‑93 (MQ=255)
gctTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCa > 2:4562419/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa > 1:4832250/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa < 2:2620193/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGa > 1:1141220/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAt > 2:5518288/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCCTACGCTGATTATGGTGGGCGGTAGC‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc > 2:2171494/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGc < 1:211464/93‑1 (MQ=255)
ccTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCt > 2:4721190/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCtc > 1:5866787/1‑92 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:1794966/1‑93 (MQ=255)
cTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTa > 2:1648430/1‑93 (MQ=255)
gCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACg < 2:523758/93‑1 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt < 1:5247500/93‑1 (MQ=255)
cATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgt > 2:6417736/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg < 1:5555628/93‑1 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 2:1244207/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 1:3362802/1‑93 (MQ=255)
tttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtgg > 1:3884343/1‑93 (MQ=255)
ttGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggt < 2:5952308/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACgtggtg > 2:1856950/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGc > 2:1319627/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa < 2:3411702/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCa < 2:4862060/93‑1 (MQ=255)
tATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACt > 2:2019317/1‑93 (MQ=255)
aTCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTg > 1:952309/1‑93 (MQ=255)
aTCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTg > 1:2539678/1‑93 (MQ=255)
cGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaa < 1:43994/93‑1 (MQ=255)
gAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaa > 1:1317677/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTAATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaa < 2:2862989/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa < 2:3951897/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGaaaaaa < 1:536773/93‑1 (MQ=255)
aaaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAag > 1:3782990/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 1:4640687/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAaga < 2:4896680/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGTGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag > 2:1563551/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag < 2:2948874/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAagag > 1:1443391/1‑93 (MQ=255)
tGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGT‑CACTGAAAAAAGAGGc < 2:1468253/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc < 2:2466559/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGc > 2:5133942/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGt < 2:3730274/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 1:2625206/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 1:322071/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 2:3905796/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGtt > 1:6315373/1‑93 (MQ=255)
gCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTc > 1:5898795/1‑93 (MQ=255)
cTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCt > 2:4324925/1‑93 (MQ=255)
tGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTg > 1:80957/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc > 1:4000616/1‑93 (MQ=255)
gCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGc < 2:404675/93‑1 (MQ=255)
aTACGCTAATTATGGTGGCCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCAGTTTCTGCAc < 2:6026030/93‑1 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 2:3131818/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:5284050/1‑93 (MQ=255)
tACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAcc > 1:1254938/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt > 2:2804634/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt < 2:555484/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCt < 2:1694794/93‑1 (MQ=255)
gCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc < 1:2844674/93‑1 (MQ=255)
gCTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGATACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgc > 1:4546921/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTgcg > 1:3827825/1‑93 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGcc < 1:373339/93‑1 (MQ=255)
gATTATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGcc > 2:2814965/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 2:1302862/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCcac > 2:2107592/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg > 1:100009/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAg < 2:5333741/93‑1 (MQ=255)
tggGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCg < 2:304251/93‑1 (MQ=255)
tggGCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCg < 1:1635876/93‑1 (MQ=255)
gcgCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGa < 1:2896880/91‑1 (MQ=255)
ggCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg < 1:5836037/93‑1 (MQ=255)
ggCGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAg < 2:2528115/93‑1 (MQ=255)
cGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 2:684583/93‑1 (MQ=255)
cGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 2:4963881/93‑1 (MQ=255)
cGGT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCt < 1:5040870/93‑1 (MQ=255)
ggT‑GGCCTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTg > 1:2136821/1‑93 (MQ=255)
|
CGTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGT‑GG‑CTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > NC_000913/4005508‑4005687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005509‑4005694
|
GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑C > SRR4302537.2728148/1‑94 (MQ=60)
TAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑Cct < SRR4302537.735883/94‑3 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTA < SRR4302537.2594610/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTA < SRR4302537.2040888/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTAT > SRR4302537.376109/1‑94 (MQ=60)
TTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCT < SRR4302537.1493774/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGCTGGTATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCT < SRR4302537.5106903/94‑1 (MQ=60)
GTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCT < SRR4302537.1986819/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTC < SRR4302537.5197845/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTC < SRR4302537.5244864/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCT < SRR4302537.1034056/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCT > SRR4302537.108327/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTG < SRR4302537.873022/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGC < SRR4302537.5782157/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCT > SRR4302537.1290470/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCT < SRR4302537.1508639/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCT < SRR4302537.6291668/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCT < SRR4302537.5413448/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTG < SRR4302537.859796/94‑1 (MQ=60)
CTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTG > SRR4302537.1040657/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGAT > SRR4302537.1059281/1‑94 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATG > SRR4302537.1078282/1‑94 (MQ=60)
GATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATG < SRR4302537.2892688/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGG > SRR4302537.5823120/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGG < SRR4302537.1129597/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGT < SRR4302537.1535285/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGT < SRR4302537.4706972/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302537.4729268/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTT < SRR4302537.3147783/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTAC < SRR4302537.4467801/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACC > SRR4302537.4666101/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCA > SRR4302537.670159/1‑94 (MQ=60)
GCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAG < SRR4302537.522813/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302537.3689412/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302537.4865617/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGA > SRR4302537.1149149/1‑94 (MQ=60)
TTCGCATGCATTTGATTATCGAAAAACTGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGAT < SRR4302537.1873375/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGC < SRR4302537.2967080/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCT < SRR4302537.212975/94‑1 (MQ=60)
CCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTC > SRR4302537.5907035/1‑94 (MQ=60)
CTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTAC > SRR4302537.3834840/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG > SRR4302537.3106988/1‑94 (MQ=60)
CATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTG < SRR4302537.5283608/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG < SRR4302537.2313154/94‑1 (MQ=60)
ATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGG > SRR4302537.3911511/1‑94 (MQ=60)
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TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTG > SRR4302537.1253050/1‑94 (MQ=60)
TATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGCGGTGCACTG < SRR4302537.4672159/94‑1 (MQ=60)
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CGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAA < SRR4302537.44322/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAA < SRR4302537.561237/94‑1 (MQ=60)
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AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG < SRR4302537.540456/94‑1 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG > SRR4302537.4953828/1‑94 (MQ=60)
AAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAG > SRR4302537.893032/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302537.4419767/1‑94 (MQ=60)
AAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGA > SRR4302537.5934111/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG > SRR4302537.1453446/1‑94 (MQ=60)
AATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAG < SRR4302537.472819/94‑1 (MQ=60)
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CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT > SRR4302537.324304/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT > SRR4302537.6358596/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTT > SRR4302537.2643600/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTC > SRR4302537.5939271/1‑94 (MQ=60)
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CTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTG > SRR4302537.81555/1‑94 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302537.4028625/1‑94 (MQ=60)
TGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGC > SRR4302537.1382971/1‑94 (MQ=60)
TCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCA < SRR4302537.2142337/94‑1 (MQ=60)
CATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTCGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCAC < SRR4302537.4646654/94‑1 (MQ=60)
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ATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302537.1263671/1‑94 (MQ=60)
ATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACC > SRR4302537.2045182/1‑94 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302537.5545138/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCT < SRR4302537.5022335/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGATACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGC > SRR4302537.4578386/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG < SRR4302537.2864583/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCG > SRR4302537.3854666/1‑94 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA < SRR4302537.375925/94‑1 (MQ=60)
GATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCA > SRR4302537.6139831/1‑94 (MQ=60)
ATTATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCAC > SRR4302537.4501663/1‑94 (MQ=60)
TATGGTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAG > SRR4302537.100730/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGGCGGTGG‑CTTGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGG < SRR4302537.1827811/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCG < SRR4302537.5384184/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGA < SRR4302537.1647337/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGCGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG < SRR4302537.6447092/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTCCCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAG < SRR4302537.2917214/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGC < SRR4302537.5876036/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCT < SRR4302537.927139/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG > SRR4302537.2151866/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTG < SRR4302537.5075577/94‑1 (MQ=60)
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GTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302537.1743249/94‑1 (MQ=60)
GTGGCC‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGC < SRR4302537.417888/94‑1 (MQ=60)
GC‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAA > SRR4302537.3037545/1‑94 (MQ=60)
C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > SRR4302537.3108784/1‑94 (MQ=60)
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GTAATGGTTTGGGCTGGGATTGCGCTGCTTGGCCTGCATTTGATTATCGAAAAAATGGCCTGGCTGCATACGCTGATTATGGTGGGCGGTGG‑C‑TGTATCTCTGCTGGATGGGTTACCAGATGCTACGTGGTGCACTGAAAAAAGAGGCGGTTTCTGCACCTGCGCCACAGGTCGAGCTGGCGAAAA > NC_000913/4005509‑4005694
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
