Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,013,176 |
C→G |
G182R (GGA→CGA) |
ysgA ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,013,176 | 0 | C | G | 99.5%
| 712.0
/ ‑5.0
| 205 | G182R (GGA→CGA) | ysgA | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (112/92); minor base T (1/0); total (113/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013086‑4013260
|
ttCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCgg‑g > 2:6133164/1‑93 (MQ=255)
ttAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTa > 2:1029161/1‑93 (MQ=255)
ttAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTa > 1:3288562/1‑93 (MQ=255)
agcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAg < 1:2238240/93‑1 (MQ=255)
gcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGa > 1:4947325/1‑93 (MQ=255)
gcagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGa > 2:505895/1‑93 (MQ=255)
cagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGAt < 2:5555614/93‑1 (MQ=255)
cagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGAt < 2:1063113/93‑1 (MQ=255)
cagcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGAt < 2:426141/93‑1 (MQ=255)
agcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATc < 2:4174280/93‑1 (MQ=255)
agcCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATc > 2:4828409/1‑93 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg > 2:1443846/1‑93 (MQ=255)
cccGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCgg < 1:2296333/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGTCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:1352700/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:6135954/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:5728864/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 2:345375/93‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGtt < 1:654310/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTg > 1:752537/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa > 2:6029551/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa > 1:3434702/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa > 1:2923404/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGa > 1:3207747/1‑93 (MQ=255)
cgcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGat < 2:2249800/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata < 1:125569/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata < 2:5691020/93‑1 (MQ=255)
gcCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGata > 2:2795310/1‑93 (MQ=255)
ccTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGatat < 1:6039532/93‑1 (MQ=255)
ggCGCATGGTTTCAACGCTCGCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCaa < 1:4636073/93‑1 (MQ=255)
cgcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACa < 2:2470226/93‑1 (MQ=255)
cgcATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACa < 2:3579/93‑1 (MQ=255)
gaTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAgg < 1:3069676/92‑1 (MQ=255)
cATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAgg > 1:1678369/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt > 2:2386210/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt < 1:3704944/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt > 2:1486161/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgt > 2:22863/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 2:2856211/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 1:3839032/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgtt > 1:1856226/1‑93 (MQ=255)
gTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGgttgt < 2:3228021/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATACGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGttt < 1:4688261/93‑1 (MQ=255)
ttCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGttt > 2:5894269/1‑93 (MQ=255)
cAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCg > 2:3406303/1‑93 (MQ=255)
gCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGa < 2:2901354/93‑1 (MQ=255)
gCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGa > 2:4395444/1‑93 (MQ=255)
ctctCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGaa < 2:4316881/93‑1 (MQ=255)
ctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt < 1:5279951/93‑1 (MQ=255)
ctcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAtt < 1:2130821/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 2:73578/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 2:5824620/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 2:3299767/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 1:926348/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc > 1:5900258/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 1:1909720/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTc < 1:2734880/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCa < 1:141608/93‑1 (MQ=255)
ccTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCa < 1:3576615/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAg > 1:3463294/1‑93 (MQ=255)
cTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAGCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAg < 1:5154514/93‑1 (MQ=255)
tGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc < 1:4602804/93‑1 (MQ=255)
tGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGc > 2:1563726/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAc > 1:196903/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAc < 2:2479995/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACtt > 1:4279824/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTg < 2:1358565/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt > 1:4592164/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGt < 2:5211310/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTc > 1:2106694/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTc > 1:1067747/1‑93 (MQ=255)
cTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCg > 2:4550581/1‑93 (MQ=255)
tGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGc > 2:5183360/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGcc > 2:56193/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGcc > 1:2376077/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc > 1:995376/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc > 1:1542659/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGccc < 1:2951399/93‑1 (MQ=255)
aTCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGt < 1:492008/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAg < 1:3547611/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCATATAAGACGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAg > 2:6311582/1‑93 (MQ=255)
tGACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGt > 1:4258220/1‑93 (MQ=255)
gACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGtt < 2:2123262/93‑1 (MQ=255)
gACCACCATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGtt < 2:2994170/93‑1 (MQ=255)
accaccATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGttt < 2:202615/93‑1 (MQ=255)
accaccATATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGttt > 2:1764983/1‑93 (MQ=255)
ccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCg > 1:4523841/1‑93 (MQ=255)
ccaTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCg > 1:4391093/1‑93 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt > 2:635348/1‑93 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt < 1:1444418/93‑1 (MQ=255)
caTATAAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGt > 1:1568384/1‑93 (MQ=255)
tataAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAc > 1:5499920/1‑93 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 1:3907500/93‑1 (MQ=255)
taAGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCa < 1:3809864/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAc < 1:2610662/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAc < 2:546072/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAc > 2:3730674/1‑93 (MQ=255)
gCCGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGc > 2:1262917/1‑93 (MQ=255)
acGAGAATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGcc < 2:4525496/92‑1 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc > 2:5292245/1‑93 (MQ=255)
gagaATCGGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAc > 2:3040799/1‑93 (MQ=255)
|
TTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATCCG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > NC_000913/4013086‑4013260
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑CG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG > NC_000913/4013083‑4013262
|
GCTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑G < SRR4302537.3555760/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑G < SRR4302537.1298908/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GG > SRR4302537.1164693/1‑94 (MQ=60)
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GG < SRR4302537.1844954/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GG > SRR4302537.3830350/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTA > SRR4302537.938571/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTA > SRR4302537.3311805/1‑94 (MQ=60)
TTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAA > SRR4302537.5287778/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGA > SRR4302537.4981433/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGA > SRR4302537.477169/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGA > SRR4302537.332761/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGA < SRR4302537.2254024/94‑1 (MQ=60)
AGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCG < SRR4302537.5189675/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGT > SRR4302537.187714/1‑94 (MQ=60)
CCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGT < SRR4302537.2312543/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGTCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.1362123/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑TGCGCGTTAAGATCGGTTG > SRR4302537.143679/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.2132854/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.5768079/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.1688755/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.6178136/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG < SRR4302537.658766/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG > SRR4302537.375622/1‑94 (MQ=60)
CGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTG > SRR4302537.757670/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGA > SRR4302537.3459011/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGA > SRR4302537.2943940/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGA > SRR4302537.3230299/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTGGCGCATCGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGAT < SRR4302537.751077/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATA < SRR4302537.4977581/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATAT < SRR4302537.126470/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATC < SRR4302537.6081023/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATC < SRR4302537.3486388/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302537.836658/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302537.2769095/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCA > SRR4302537.3956326/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAA < SRR4302537.265003/94‑1 (MQ=60)
GGCGCATGGTTTCAACGCTCGCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAAC < SRR4302537.4668141/94‑1 (MQ=60)
GCGCATGGTTGCAACGCTCTCCTGCGAAATCCTGTTATCCTGACCACCATCTAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACA < SRR4302537.4576700/94‑1 (MQ=60)
CGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAG < SRR4302537.1359663/94‑1 (MQ=60)
GCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGG > SRR4302537.1690118/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT < SRR4302537.3091067/94‑1 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT < SRR4302537.597818/94‑1 (MQ=60)
CATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGT > SRR4302537.6136667/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT < SRR4302537.5789709/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302537.3865926/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT < SRR4302537.3731003/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTT > SRR4302537.1869155/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAATAGAGAATC‑GGCGCGATAAGATAGGTTGCGATATCAACATGTT > SRR4302537.4119077/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTG > SRR4302537.3139721/1‑94 (MQ=60)
TTCAGCGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATACGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTC < SRR4302537.4720693/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGG < SRR4302537.5397704/94‑1 (MQ=60)
AACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGT > SRR4302537.5742815/1‑94 (MQ=60)
ACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTG < SRR4302537.2502638/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGA < SRR4302537.3580894/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGA > SRR4302537.1961010/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAT > SRR4302537.6377897/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAAT > SRR4302537.6113929/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC > SRR4302537.5940746/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC < SRR4302537.2145815/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC < SRR4302537.470998/94‑1 (MQ=60)
CTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTC < SRR4302537.5316275/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCA < SRR4302537.2753963/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCA < SRR4302537.1922978/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCA < SRR4302537.932733/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG > SRR4302537.3487782/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG < SRR4302537.142613/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAG < SRR4302537.3601833/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGC > SRR4302537.464100/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGC > SRR4302537.4018714/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAAGC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGC < SRR4302537.5190029/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGACGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGGTTAGGTGAATTCAGG > SRR4302537.3036666/1‑94 (MQ=60)
TGCGGAATGCTTTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCG < SRR4302537.4634662/94‑1 (MQ=60)
TGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCG < SRR4302537.3862661/94‑1 (MQ=60)
TGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCG > SRR4302537.2944219/1‑94 (MQ=60)
CGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGAC > SRR4302537.198307/1‑94 (MQ=60)
GGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACT > SRR4302537.1838254/1‑94 (MQ=60)
GAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTT > SRR4302537.4309576/1‑94 (MQ=60)
GAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTT < SRR4302537.4371072/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGT > SRR4302537.4623927/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC > SRR4302537.1075103/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTC > SRR4302537.2121544/1‑94 (MQ=60)
CTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGC > SRR4302537.3301833/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCC > SRR4302537.2392819/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCC > SRR4302537.1002251/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCC > SRR4302537.1553428/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCG < SRR4302537.2972109/94‑1 (MQ=60)
TATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGT > SRR4302537.2196440/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTC < SRR4302537.495394/94‑1 (MQ=60)
TCCTGACCACCATATACGCCGAGACTCGCC‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCA < SRR4302537.2381389/94‑1 (MQ=60)
TCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGAGCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCA < SRR4302537.1554380/94‑1 (MQ=60)
CCCTGCCCACCATATAAGCAGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCA < SRR4302537.3657813/94‑1 (MQ=60)
CCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAG > SRR4302537.2035667/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT < SRR4302537.3572672/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT < SRR4302537.2259472/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGT > SRR4302537.4287811/1‑94 (MQ=60)
TGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTT > SRR4302537.1240388/1‑94 (MQ=60)
CCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCCGTTTGC > SRR4302537.3868407/1‑94 (MQ=60)
CCACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGC > SRR4302537.4478823/1‑94 (MQ=60)
ACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG > SRR4302537.4555138/1‑94 (MQ=60)
ACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG > SRR4302537.1779266/1‑94 (MQ=60)
ACCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCG > SRR4302537.4421368/1‑94 (MQ=60)
CCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGT > SRR4302537.1579328/1‑94 (MQ=60)
CCATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGT > SRR4302537.1543563/1‑94 (MQ=60)
CATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTA < SRR4302537.1454477/94‑1 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302537.3530326/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC > SRR4302537.5537479/1‑94 (MQ=60)
ATATAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTAC < SRR4302537.4628846/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302537.3836576/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302537.3934815/94‑1 (MQ=60)
TAAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCAC < SRR4302537.1383900/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACG < SRR4302537.2628924/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACG > SRR4302537.4309187/1‑94 (MQ=60)
AGCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCTGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGC < SRR4302537.3482406/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCC > SRR4302537.2411079/1‑94 (MQ=60)
CGAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCAC > SRR4302537.1492729/1‑94 (MQ=60)
GAGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACT < SRR4302537.4811192/94‑1 (MQ=60)
AGAATC‑GGCGCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAGCAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG < SRR4302537.2901501/94‑1 (MQ=60)
|
GCTTTCGCATTAGCAGCCCGCAGCGCCTGGCGCATGGTTTCAACGCTCTCCTGCGGAATGCTGTTATCCTGACCACCATATAAGCCGAGAATC‑CG‑GCGTTAAGATCGGTTGCGATATCAACAGGTTGTTTCGGTGAATTCAGCGACTTGTCGCCCGTCAGTTTGCCGTACCACGCCACTG > NC_000913/4013083‑4013262
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
