Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,276,490 |
A→G |
T145A (ACG→GCG) |
yjcD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,276,490 | 0 | A | G | 100.0%
| 626.3
/ NA
| 181 | T145A (ACG→GCG) | yjcD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (95/86); total (95/86) |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTT > NC_000913/4276400‑4276579
|
ttCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCgcacggcgcg < 2:6120279/93‑1 (MQ=255)
ccTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCggg < 1:5348325/93‑1 (MQ=255)
gATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGAt > 2:784177/1‑93 (MQ=255)
gATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGAt < 2:4066576/93‑1 (MQ=255)
gATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGAt < 1:1870080/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGAtt > 2:5507206/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTg > 2:93193/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTg > 2:5676939/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGt > 2:4341789/1‑93 (MQ=255)
gtgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATc < 2:541488/93‑1 (MQ=255)
gtgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATc < 2:3973838/93‑1 (MQ=255)
tgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCg > 2:152552/1‑93 (MQ=255)
tgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCg > 1:4432946/1‑93 (MQ=255)
tgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCg < 1:4060511/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCgg > 2:73455/1‑93 (MQ=255)
gTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCt > 2:4424424/1‑93 (MQ=255)
gTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCt > 1:1844825/1‑93 (MQ=255)
gTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCt > 1:2461679/1‑93 (MQ=255)
gTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGGATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGTTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGtat > 2:2914503/1‑91 (MQ=255)
ttACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGt < 2:3819850/93‑1 (MQ=255)
aCGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTc > 1:3864446/1‑93 (MQ=255)
gTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctg < 1:6410815/93‑1 (MQ=255)
gTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctg > 1:4203175/1‑93 (MQ=255)
tAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGCGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctgc < 2:3725607/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctgct > 2:421535/1‑93 (MQ=255)
aaTTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctgct > 1:4331426/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctgctg > 2:3443745/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTGCCACGGGTATACGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCctgctg > 1:84336/1‑93 (MQ=255)
tttCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCtgctgc < 1:5623022/93‑1 (MQ=255)
ttCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTgctgct > 1:5501157/1‑93 (MQ=255)
tGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCAt > 2:3153507/1‑93 (MQ=255)
tGCAACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCAt < 1:4965772/93‑1 (MQ=255)
gCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCAtt < 1:1328457/93‑1 (MQ=255)
gCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGATCTGTTCCTGCTGCTCAtt < 2:6305149/93‑1 (MQ=255)
cACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGc < 1:6204617/93‑1 (MQ=255)
aCGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGcc > 1:1651527/1‑93 (MQ=255)
cGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCg < 1:2932337/93‑1 (MQ=255)
tATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTaa > 1:2535632/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAc > 1:4770958/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAc < 1:720421/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAc < 1:5986302/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAc < 2:6015184/93‑1 (MQ=255)
tCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACg > 1:3651776/1‑93 (MQ=255)
tCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACg < 1:1386438/93‑1 (MQ=255)
tCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACg < 1:1179062/93‑1 (MQ=255)
ccGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACgg < 1:2878871/93‑1 (MQ=255)
cGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGgt < 1:2265082/93‑1 (MQ=255)
cGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGgt < 2:2043015/93‑1 (MQ=255)
cGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGgt < 2:4729823/93‑1 (MQ=255)
gTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTCACGgtg > 2:2863232/1‑93 (MQ=255)
gTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGgtg < 2:4286207/93‑1 (MQ=255)
tAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGgtgt < 2:1408763/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTc < 2:5237460/93‑1 (MQ=255)
aGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGAGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTc < 2:6378186/93‑1 (MQ=255)
cTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCgg > 1:2997153/1‑93 (MQ=255)
tGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCggc > 1:6352578/1‑92 (MQ=255)
tGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGt > 1:3065574/1‑93 (MQ=255)
ggATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTc > 2:6416929/1‑93 (MQ=255)
ggATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTc > 2:1033378/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCt < 1:2376087/93‑1 (MQ=255)
gATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCt > 1:2723737/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCt > 1:3332833/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTg > 1:128736/1‑93 (MQ=255)
ttttGCGCACCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTgg < 1:1713901/93‑1 (MQ=255)
ttttGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTgg < 1:1455797/93‑1 (MQ=255)
ttttGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTgg > 1:1008931/1‑93 (MQ=255)
tGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGa < 1:6150181/93‑1 (MQ=255)
cgcAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGAtt < 1:3290515/93‑1 (MQ=255)
gcAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTa > 1:4853503/1‑93 (MQ=255)
cAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTaa < 1:3524731/93‑1 (MQ=255)
cAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTaa > 2:3482207/1‑93 (MQ=255)
aCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTaaaa > 1:1041682/1‑93 (MQ=255)
aCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTaaaa > 1:6258594/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTaaaaa > 2:2560608/1‑93 (MQ=255)
gCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGGTTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCTGTCTGGTGATTAAAAAgcc > 2:6261078/1‑93 (MQ=255)
gCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCTGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAAccc < 2:4784750/93‑1 (MQ=255)
cTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGc < 1:805507/93‑1 (MQ=255)
tCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCt < 2:2474743/93‑1 (MQ=255)
tCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCt > 2:4625175/1‑93 (MQ=255)
cACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCtt < 1:5860273/93‑1 (MQ=255)
cACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCtt < 2:4974315/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGa < 1:3740135/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGa < 2:2444768/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATg < 2:1682428/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATg < 1:1894459/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATgg > 1:4573989/1‑93 (MQ=255)
tgtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATgg < 1:4100530/93‑1 (MQ=255)
tgtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTAATgg < 1:1551122/93‑1 (MQ=255)
gtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGt > 2:4573053/1‑93 (MQ=255)
gtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGt > 2:4832208/1‑93 (MQ=255)
gtgGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTACTCCTGCTGCCCATTTCCGCTAAGGGCGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGAttgc > 2:1267690/1‑90 (MQ=255)
ggCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCt < 1:2666832/93‑1 (MQ=255)
gcacggcgcgGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGcc > 1:5047537/1‑93 (MQ=255)
gcacggcgcgGGGAGTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGcc < 2:3531218/93‑1 (MQ=255)
cgcggcgcggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGccc < 2:2348721/91‑1 (MQ=255)
cacggcgcggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGccc > 2:3285388/1‑93 (MQ=255)
cacggcgcggGGATTGGTATCGATCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGccc < 2:3643254/93‑1 (MQ=255)
acggcgcggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGccgt > 1:3421764/1‑91 (MQ=255)
cggcgcggGGATTGGTGTCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGt < 1:1996960/93‑1 (MQ=255)
cggcgcggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGt < 2:2248931/93‑1 (MQ=255)
|
TTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTT > NC_000913/4276400‑4276579
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCG > NC_000913/4276397‑4276582
|
GTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCG > SRR4302537.5491360/1‑94 (MQ=60)
TGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGC > SRR4302537.4420378/1‑94 (MQ=60)
CCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGG < SRR4302537.6294899/94‑1 (MQ=60)
CCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGG < SRR4302537.840103/94‑1 (MQ=60)
CCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGG < SRR4302537.5384970/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGA > SRR4302537.4993528/1‑94 (MQ=60)
GATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATT < SRR4302537.1883096/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTG > SRR4302537.1385780/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGT < SRR4302537.2411015/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCTCACGGCGCGGGGATTGGTAT > SRR4302537.4330908/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCG > SRR4302537.4463559/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGG < SRR4302537.4088887/94‑1 (MQ=60)
TGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCT < SRR4302537.1551413/94‑1 (MQ=60)
TGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCT > SRR4302537.2478992/1‑94 (MQ=60)
TGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCT > SRR4302537.1857664/1‑94 (MQ=60)
GTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTG > SRR4302537.3452246/1‑94 (MQ=60)
GTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTG > SRR4302537.5558527/1‑94 (MQ=60)
GTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTG > SRR4302537.3231876/1‑94 (MQ=60)
TTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGCGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGT > SRR4302537.2928771/1‑94 (MQ=60)
TTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTT < SRR4302537.6330801/94‑1 (MQ=60)
TACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTC > SRR4302537.3891498/1‑94 (MQ=60)
CGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCT < SRR4302537.1399590/94‑1 (MQ=60)
GGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTG > SRR4302537.4232518/1‑94 (MQ=60)
GGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTG > SRR4302537.1603033/1‑94 (MQ=60)
GGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTG > SRR4302537.745449/1‑94 (MQ=60)
GTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGC < SRR4302537.6454432/94‑1 (MQ=60)
TAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCT > SRR4302537.4361514/1‑94 (MQ=60)
TAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCT < SRR4302537.2213115/94‑1 (MQ=60)
AATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTG > SRR4302537.18634/1‑94 (MQ=60)
AATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTG > SRR4302537.6116160/1‑94 (MQ=60)
AATTTCTGCCACGGGTATACGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTG > SRR4302537.84952/1‑94 (MQ=60)
ATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGC > SRR4302537.1754887/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCT < SRR4302537.5661469/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCT > SRR4302537.5538722/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCT < SRR4302537.6203490/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCT < SRR4302537.106500/94‑1 (MQ=60)
TGCAACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATT < SRR4302537.4999997/94‑1 (MQ=60)
GCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTG < SRR4302537.1337719/94‑1 (MQ=60)
CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCC < SRR4302537.6247378/94‑1 (MQ=60)
CACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCC > SRR4302537.1663108/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGC < SRR4302537.2952927/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGC > SRR4302537.910755/1‑94 (MQ=60)
GTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAA > SRR4302537.2553424/1‑94 (MQ=60)
TATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAAC > SRR4302537.4803899/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACG > SRR4302537.3677482/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACG < SRR4302537.6027384/94‑1 (MQ=60)
ATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACG < SRR4302537.725343/94‑1 (MQ=60)
ATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACG < SRR4302537.3760796/94‑1 (MQ=60)
TCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGG < SRR4302537.1187270/94‑1 (MQ=60)
TCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGG < SRR4302537.1396106/94‑1 (MQ=60)
CCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGT < SRR4302537.2899070/94‑1 (MQ=60)
CCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGT < SRR4302537.188817/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTG < SRR4302537.2281074/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTG < SRR4302537.4400320/94‑1 (MQ=60)
GTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGT > SRR4302537.2988420/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGT > SRR4302537.2883129/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGT > SRR4302537.4684389/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGT > SRR4302537.193972/1‑94 (MQ=60)
TAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTC > SRR4302537.5913667/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCG > SRR4302537.3037520/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGG > SRR4302537.3018049/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGT > SRR4302537.3086934/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGC > SRR4302537.6395946/1‑94 (MQ=60)
TGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTC > SRR4302537.4808614/1‑94 (MQ=60)
GGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCT > SRR4302537.2742762/1‑94 (MQ=60)
GGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCT > SRR4302537.3356415/1‑94 (MQ=60)
GATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTG > SRR4302537.4201417/1‑94 (MQ=60)
GATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTG > SRR4302537.129651/1‑94 (MQ=60)
GATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTG < SRR4302537.2392829/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGG < SRR4302537.2739615/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGG > SRR4302537.1015888/1‑94 (MQ=60)
TTTTGCGCACCTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGT < SRR4302537.1725867/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGT < SRR4302537.1465936/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGA < SRR4302537.2389639/94‑1 (MQ=60)
TGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGAT < SRR4302537.6192481/94‑1 (MQ=60)
TGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGAT > SRR4302537.5251346/1‑94 (MQ=60)
CGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTA > SRR4302537.3947362/1‑94 (MQ=60)
CGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTA < SRR4302537.3313767/94‑1 (MQ=60)
CGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTA > SRR4302537.4886987/1‑94 (MQ=60)
CAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAA < SRR4302537.3549664/94‑1 (MQ=60)
AACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAA > SRR4302537.6301572/1‑94 (MQ=60)
AACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAA > SRR4302537.1048875/1‑94 (MQ=60)
ACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAA < SRR4302537.3845838/94‑1 (MQ=60)
ACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAA > SRR4302537.4126670/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAAC < SRR4302537.6487786/94‑1 (MQ=60)
GCCTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCG < SRR4302537.1199740/94‑1 (MQ=60)
CTCACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCT < SRR4302537.811038/94‑1 (MQ=60)
CACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTG < SRR4302537.5900459/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGA > SRR4302537.5065619/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGAT > SRR4302537.546166/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGAT < SRR4302537.5676360/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGAT < SRR4302537.3766403/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAACAACCCGCTTGCTG > SRR4302537.46065/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATG > SRR4302537.3428225/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGG > SRR4302537.1664222/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGG > SRR4302537.4605646/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGG < SRR4302537.1907621/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGT < SRR4302537.4129155/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTAATGGT < SRR4302537.1561945/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTG > SRR4302537.6422370/1‑94 (MQ=60)
GGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTG < SRR4302537.2685462/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTG < SRR4302537.1317532/94‑1 (MQ=60)
GGCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCGAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTG < SRR4302537.2587710/94‑1 (MQ=60)
GCGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGC > SRR4302537.3326315/1‑94 (MQ=60)
CGCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCC > SRR4302537.5082296/1‑94 (MQ=60)
GCACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCC > SRR4302537.359413/1‑94 (MQ=60)
CACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAANACCCGCTTGATGGTCTGCCCG > SRR4302537.2515434/1‑94 (MQ=60)
CACGGCGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCgt > SRR4302537.3445985/1‑92 (MQ=60)
CGGCGCGGGGATTGGTGTCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTT < SRR4302537.2010845/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCG > SRR4302537.6040130/1‑94 (MQ=60)
|
GTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCG > NC_000913/4276397‑4276582
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
