Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,751,091 |
G→C |
A426P (GCT→CCT) |
recN → |
RecN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,751,091 | 0 | G | C | 100.0%
| 892.9
/ NA
| 260 | A426P (GCT→CCT) | recN | RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (125/135); total (125/135) |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > NC_000913/2751001‑2751178
|
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt > 1:1344519/1‑93 (MQ=255)
tGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAt < 2:1375743/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt > 1:1154541/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAtt < 1:5071641/93‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg > 1:3013840/1‑93 (MQ=255)
ttAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTg > 2:7180679/1‑93 (MQ=255)
tAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGc < 2:4303893/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGcc > 1:5492916/1‑93 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa < 1:1703480/93‑1 (MQ=255)
aTTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaa > 2:3761243/1‑93 (MQ=255)
tttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCaaa > 1:3436745/1‑93 (MQ=255)
ttGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAg < 2:812172/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGTATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 2:3823561/93‑1 (MQ=255)
tGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGt < 1:292364/93‑1 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg < 1:3297756/93‑1 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg > 2:286342/1‑93 (MQ=255)
aCGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCg < 2:5183580/93‑1 (MQ=255)
cGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGc < 2:6098025/93‑1 (MQ=255)
gCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATc < 2:5468186/93‑1 (MQ=255)
aTCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCg > 1:6829489/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg < 2:5808260/93‑1 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 2:1692821/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 1:4842108/1‑93 (MQ=255)
tCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCgg > 1:973664/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggt > 2:6135573/1‑93 (MQ=255)
cACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggt < 2:4753931/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtg > 1:3143110/1‑93 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg > 2:3286201/1‑93 (MQ=255)
ccTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtgg < 1:708055/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCggtggt > 2:3479515/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAAt < 1:6293987/93‑1 (MQ=255)
gcTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGTCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTg > 1:6461457/1‑93 (MQ=255)
cTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGt > 1:1096467/1‑93 (MQ=255)
cTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGt > 2:6830561/1‑93 (MQ=255)
tGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTc > 1:1400535/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTcc < 1:2477684/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCg > 1:1594660/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCCGATCGTACTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCg > 2:6442153/1‑93 (MQ=255)
ggTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGc < 2:2337018/93‑1 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCa < 2:2070621/93‑1 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCa > 1:6937071/1‑93 (MQ=255)
gTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGGAATTGTCCCGCa > 1:5565034/1‑93 (MQ=255)
gATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCa > 2:5607776/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAc > 1:4909282/1‑93 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 2:3119321/93‑1 (MQ=255)
tCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACt < 1:3998529/93‑1 (MQ=255)
cGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTg < 2:6780160/93‑1 (MQ=255)
cGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTg < 2:3612517/93‑1 (MQ=255)
gTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTgg > 2:2464865/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 2:6241509/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 2:2175183/1‑93 (MQ=255)
aTTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCa > 1:5429525/1‑93 (MQ=255)
ttGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCaa < 2:4925614/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt > 2:4638981/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAAt < 2:6034546/93‑1 (MQ=255)
gAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATc < 1:2170842/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCa < 1:4362092/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCa > 2:6925090/1‑93 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg < 1:1243275/93‑1 (MQ=255)
tttCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAg < 2:1179808/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGt < 2:5276272/93‑1 (MQ=255)
ggTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcat > 1:153284/1‑93 (MQ=255)
tAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGtcatca < 2:876261/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAc < 1:2529439/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAc < 2:1793541/93‑1 (MQ=255)
aaCCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAc < 1:4135728/93‑1 (MQ=255)
ccaccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACgg < 2:6882033/93‑1 (MQ=255)
caccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc < 2:6666781/93‑1 (MQ=255)
caccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgc > 1:5546470/1‑93 (MQ=255)
ccaACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGgcgc > 2:2533271/1‑93 (MQ=255)
aaCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGt > 2:1484828/1‑93 (MQ=255)
aaCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGt < 1:6058266/93‑1 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa > 2:631407/1‑93 (MQ=255)
aCCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTa > 1:4548541/1‑93 (MQ=255)
cccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaa > 1:1917587/1‑93 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaa > 2:3422928/1‑93 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaa < 1:5621129/93‑1 (MQ=255)
ccAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaa > 1:5900716/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:6541199/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTaaaa < 1:4152431/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 1:6091703/93‑1 (MQ=255)
aGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAt < 2:3945226/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg < 1:6517295/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg > 2:2790983/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg < 1:3365460/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg > 1:3895768/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg > 1:4018059/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATg < 2:4814536/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATgg < 2:4554534/93‑1 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa < 1:4570385/93‑1 (MQ=255)
cAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaa > 2:1656318/1‑93 (MQ=255)
aGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGaaa < 2:6944966/93‑1 (MQ=255)
gCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAc > 1:267037/1‑93 (MQ=255)
ccAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAcc > 1:7218965/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc < 2:5995725/93‑1 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc < 2:5653303/93‑1 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc > 2:7488256/1‑93 (MQ=255)
cAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAccc < 1:5832500/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg > 2:4495628/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCgg > 2:1998654/1‑93 (MQ=255)
|
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > NC_000913/2751001‑2751178
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2751000‑2751184
|
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT < SRR4302542.7077535/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCT > SRR4302542.457810/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTA < SRR4302542.5994427/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT > SRR4302542.1356085/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT > SRR4302542.5743100/1‑94 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT < SRR4302542.2583703/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTAT > SRR4302542.1185973/1‑94 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT > SRR4302542.1164434/1‑94 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT < SRR4302542.6788147/94‑1 (MQ=60)
TGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATT < SRR4302542.3058081/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302542.2337420/94‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG > SRR4302542.3042646/1‑94 (MQ=60)
GTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTG < SRR4302542.5120928/94‑1 (MQ=60)
TAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCC > SRR4302542.5546270/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA > SRR4302542.3468916/1‑94 (MQ=60)
ATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAA < SRR4302542.1718244/94‑1 (MQ=60)
TTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAG < SRR4302542.405375/94‑1 (MQ=60)
TTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGT > SRR4302542.3107856/1‑94 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCCCCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302542.6140241/94‑1 (MQ=60)
TGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTC < SRR4302542.294916/94‑1 (MQ=60)
ACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGC < SRR4302542.3328864/94‑1 (MQ=60)
CGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCA < SRR4302542.4010995/94‑1 (MQ=60)
GAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCAT < SRR4302542.7046313/94‑1 (MQ=60)
GCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCC < SRR4302542.853755/94‑1 (MQ=60)
GCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCC < SRR4302542.4033110/94‑1 (MQ=60)
CATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCG > SRR4302542.6896609/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302542.4889268/1‑94 (MQ=60)
ATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGG > SRR4302542.982055/1‑94 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG < SRR4302542.2553301/94‑1 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG < SRR4302542.5081093/94‑1 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG > SRR4302542.1255946/1‑94 (MQ=60)
CACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTG > SRR4302542.3172975/1‑94 (MQ=60)
CCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGT < SRR4302542.714172/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG > SRR4302542.5237343/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG > SRR4302542.4727462/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTG > SRR4302542.6527386/1‑94 (MQ=60)
TGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGA > SRR4302542.1577854/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATT < SRR4302542.6355997/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGTCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTG > SRR4302542.6525121/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302542.1105857/1‑94 (MQ=60)
GCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGT > SRR4302542.6000726/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTC > SRR4302542.1412643/1‑94 (MQ=60)
TGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCC > SRR4302542.7512900/1‑94 (MQ=60)
TGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCC < SRR4302542.5591429/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302542.2501716/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC < SRR4302542.1674267/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCC > SRR4302542.6594437/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCG > SRR4302542.1608433/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCA > SRR4302542.7005223/1‑94 (MQ=60)
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GGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGGGAATTGTCCCGCA > SRR4302542.5619105/1‑94 (MQ=60)
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TGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATC < SRR4302542.456118/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCG < SRR4302542.4179754/94‑1 (MQ=60)
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CGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCA > SRR4302542.615423/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC > SRR4302542.4957028/1‑94 (MQ=60)
GATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGACAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCAC < SRR4302542.5217885/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGTGTAACCACCAACCCAGGACAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGACGCATCCGGTTGTGAATTGTCCCGCATCGCACC > SRR4302542.6918879/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACT > SRR4302542.3448929/1‑94 (MQ=60)
TCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTG < SRR4302542.4037968/94‑1 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC > SRR4302542.6598170/1‑94 (MQ=60)
GTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGC > SRR4302542.1358028/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302542.5482285/1‑94 (MQ=60)
TATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCA > SRR4302542.1363074/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAA > SRR4302542.5634341/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATC > SRR4302542.6157472/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC < SRR4302542.2189536/94‑1 (MQ=60)
GAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCC < SRR4302542.5944294/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCA < SRR4302542.4201715/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCCGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGGAGCCTATTGCCAAAGTCCCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGGATCGCACTGGCAATCCA < SRR4302542.1713015/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302542.4404923/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG < SRR4302542.2018396/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAG > SRR4302542.3005220/1‑94 (MQ=60)
TTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302542.1253958/94‑1 (MQ=60)
TTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGG < SRR4302542.1143361/94‑1 (MQ=60)
GGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCAT > SRR4302542.154581/1‑94 (MQ=60)
GTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCA < SRR4302542.1544585/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC < SRR4302542.4092817/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCAC < SRR4302542.3816115/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302542.2553970/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG < SRR4302542.4176474/94‑1 (MQ=60)
AACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACG > SRR4302542.5592140/1‑94 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG > SRR4302542.2834260/1‑94 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG > SRR4302542.5482668/1‑94 (MQ=60)
ACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGG < SRR4302542.7216939/94‑1 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC > SRR4302542.5600367/1‑94 (MQ=60)
CCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGC > SRR4302542.3395680/1‑94 (MQ=60)
CACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCG < SRR4302542.6903561/94‑1 (MQ=60)
CCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCG > SRR4302542.6493704/1‑94 (MQ=60)
AACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTA > SRR4302542.4593059/1‑94 (MQ=60)
AACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTA < SRR4302542.6116904/94‑1 (MQ=60)
AACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTA > SRR4302542.1933682/1‑94 (MQ=60)
ACCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAA > SRR4302542.1934157/1‑94 (MQ=60)
CCCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAA > SRR4302542.5957918/1‑94 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA < SRR4302542.5675734/94‑1 (MQ=60)
CCAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAA > SRR4302542.3346231/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302542.4193317/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302542.2050592/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302542.3196347/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAAT < SRR4302542.6605698/94‑1 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302542.4057713/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302542.6150673/94‑1 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG > SRR4302542.3934231/1‑94 (MQ=60)
AGGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATG < SRR4302542.2695551/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGG < SRR4302542.3397066/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGG < SRR4302542.6581522/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA < SRR4302542.7103845/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA < SRR4302542.5607977/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAA < SRR4302542.2328553/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA > SRR4302542.508466/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA < SRR4302542.4615114/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAA < SRR4302542.5646928/94‑1 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302542.269308/1‑94 (MQ=60)
AGCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAAC > SRR4302542.5832911/1‑94 (MQ=60)
GCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACC < SRR4302542.4043792/94‑1 (MQ=60)
GCCAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACC > SRR4302542.7289780/1‑94 (MQ=60)
CAATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCC < SRR4302542.5889092/94‑1 (MQ=60)
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AATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCG > SRR4302542.3826962/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG < SRR4302542.4741167/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGG > SRR4302542.6492473/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > SRR4302542.482200/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCAC > SRR4302542.1294858/1‑94 (MQ=60)
AGCCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTTAAATGGAAACCCCGGCACT < SRR4302542.4852027/94‑1 (MQ=60)
CCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > SRR4302542.7027281/1‑94 (MQ=60)
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CGATGTTAAATTTGACGAGCATCACCTGGGCGCTGACGGTGCCGATCGTATTGAGTTTCGGGTAACCACCAACCCAGGTCAGCCAATGCAGGCTATTGCCAAAGTCGCATCCGGTGGTGAATTGTCCCGCATCGCACTGGCAATCCAGGTCATCACGGCGCGTAAAATGGAAACCCCGGCACTGA > NC_000913/2751000‑2751184
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
