Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,706,941 |
A→G |
G399G (GGT→GGC) |
yhjW ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,706,941 | 0 | A | G | 85.7%
| 706.9
/ 104.3
| 296 | G399G (GGT→GGC) | yhjW | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (20/22); new base G (152/100); total (173/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 |
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
ATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAA > NC_000913/3706849‑3707032
|
aCATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGcc > 2:1320381/1‑93 (MQ=255)
aTTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCAt < 1:6327963/93‑1 (MQ=255)
ttCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATc > 1:982715/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATcc > 2:3414620/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCgg < 2:2212379/93‑1 (MQ=255)
gCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGt > 1:1024225/1‑93 (MQ=255)
gCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGt < 1:3012254/93‑1 (MQ=255)
gCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGt > 1:1767891/1‑93 (MQ=255)
cTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGtt < 2:4922832/93‑1 (MQ=255)
cTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGtt < 2:4554138/93‑1 (MQ=255)
ttCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGGGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTg > 2:2976104/1‑93 (MQ=255)
ccACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTgcg > 1:1660573/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGcc > 2:1496085/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGcc > 1:4114362/1‑93 (MQ=255)
aCTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGcc < 1:5681755/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGccc > 2:3374530/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCt < 1:1004542/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCt > 2:1716780/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCt > 2:2944490/1‑93 (MQ=255)
gcgcGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTa < 2:2750905/93‑1 (MQ=255)
cgcgAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAg < 2:5824039/93‑1 (MQ=255)
gAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGa > 2:123288/1‑93 (MQ=255)
gAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGa < 2:4194760/93‑1 (MQ=255)
aaGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAt > 1:5165721/1‑93 (MQ=255)
aaGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAt < 2:2324737/93‑1 (MQ=255)
aaGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAt > 2:709783/1‑93 (MQ=255)
aGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAtt > 1:1879333/1‑93 (MQ=255)
aGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAtt < 2:5443136/93‑1 (MQ=255)
aGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAtt < 1:7301996/93‑1 (MQ=255)
aGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAtt > 1:5380922/1‑93 (MQ=255)
cTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgc < 2:4303662/93‑1 (MQ=255)
tACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgct > 2:7187570/1‑93 (MQ=255)
tACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgct > 1:3255812/1‑93 (MQ=255)
tACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgct > 1:7345374/1‑93 (MQ=255)
tACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgct > 1:5222752/1‑93 (MQ=255)
cgcgGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgctgc > 1:3979196/1‑93 (MQ=255)
cgcgGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATtgctgc > 1:1396749/1‑93 (MQ=255)
ggATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCAtt > 2:6279473/1‑93 (MQ=255)
ggATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCAtt < 1:6903902/93‑1 (MQ=255)
aTAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTc < 2:4427632/93‑1 (MQ=255)
aTAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTc < 1:4937544/93‑1 (MQ=255)
aTAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTc < 2:3507600/93‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGt > 1:2090344/1‑93 (MQ=255)
gCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTa < 1:2005937/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTAcc > 2:6143085/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTAcc > 2:500047/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTAcc > 1:2243458/1‑93 (MQ=255)
tgtAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCa > 1:2944710/1‑93 (MQ=255)
gtAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCaa < 2:3194952/93‑1 (MQ=255)
gtAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCaa > 1:1143016/1‑93 (MQ=255)
gtAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCaa > 1:1585595/1‑93 (MQ=255)
tAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAAc > 2:4030954/1‑93 (MQ=255)
aGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACa < 1:2491352/93‑1 (MQ=255)
gTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACat > 2:4618459/1‑93 (MQ=255)
gTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACat > 1:6989040/1‑93 (MQ=255)
ttAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACata > 2:5238924/1‑93 (MQ=255)
ttAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACata > 2:4649461/1‑93 (MQ=255)
ttAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACata > 2:7478982/1‑93 (MQ=255)
ttAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACata < 2:1848821/93‑1 (MQ=255)
ttAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACata > 1:2680732/1‑93 (MQ=255)
aaaaTGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCTCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATatc < 1:6226675/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATatc > 1:260720/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATatcat > 2:6349594/1‑93 (MQ=255)
tGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCt > 1:5998647/1‑93 (MQ=255)
cGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAc > 1:7485630/1‑93 (MQ=255)
cGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAc > 1:4618051/1‑93 (MQ=255)
gAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAcc < 2:2465828/93‑1 (MQ=255)
gAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAcc > 1:6477008/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCg > 1:2868917/1‑93 (MQ=255)
aaCCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCg < 1:5322506/93‑1 (MQ=255)
ccTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGc > 1:23518/1‑93 (MQ=255)
tGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCttcc > 1:4519171/1‑91 (MQ=255)
tGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGc < 2:2689706/93‑1 (MQ=255)
ggTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTgtc > 1:803085/1‑91 (MQ=255)
ggTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGcc > 1:3681859/1‑93 (MQ=255)
gTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCa > 1:4375966/1‑93 (MQ=255)
tATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCAc > 2:4975150/1‑93 (MQ=255)
aTGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACg < 2:2097532/93‑1 (MQ=255)
tGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGa < 1:2385036/93‑1 (MQ=255)
aGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTa < 2:7393126/93‑1 (MQ=255)
gAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAc < 2:3932406/93‑1 (MQ=255)
gAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAc > 2:672546/1‑93 (MQ=255)
gAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAc > 1:7411665/1‑93 (MQ=255)
aTGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGt < 2:6928157/93‑1 (MQ=255)
gATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTgg < 1:6366009/93‑1 (MQ=255)
gATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTgg < 1:6565587/93‑1 (MQ=255)
gATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTgg > 1:4803989/1‑93 (MQ=255)
aTCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGc > 1:4313800/1‑93 (MQ=255)
tCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCt > 1:1257889/1‑93 (MQ=255)
tCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCt > 2:5975116/1‑93 (MQ=255)
tCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCt > 2:7131324/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTc > 2:6372632/1‑93 (MQ=255)
aGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTTCCACGATTACGTGGCTcc > 1:5089134/1‑93 (MQ=255)
gATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTTCCACGATTACGTGGCTCCg > 1:3544863/1‑93 (MQ=255)
gATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCg > 1:6758203/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCa > 2:5598448/1‑93 (MQ=255)
tGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCa > 2:3582101/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCAc > 2:7048360/1‑93 (MQ=255)
gCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCAc > 1:7178887/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCAcc < 2:7165835/93‑1 (MQ=255)
|
ATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAA > NC_000913/3706849‑3707032
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAATC > NC_000913/3706848‑3707034
|
AATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTG < SRR4302542.6060606/94‑1 (MQ=60)
AATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTG < SRR4302542.832459/94‑1 (MQ=60)
AATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTA > SRR4302542.277297/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATC > SRR4302542.2499430/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATC > SRR4302542.991178/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATC < SRR4302542.6390315/94‑1 (MQ=60)
TTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCC < SRR4302542.1117070/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCG < SRR4302542.6625842/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCG > SRR4302542.6365875/1‑94 (MQ=60)
CCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGG > SRR4302542.5385612/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGG < SRR4302542.2386237/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGG > SRR4302542.762059/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGG < SRR4302542.2654874/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGT > SRR4302542.1033050/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGT > SRR4302542.1783220/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGT < SRR4302542.6393248/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGT > SRR4302542.16083/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGT > SRR4302542.6156013/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTT > SRR4302542.1753690/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTT < SRR4302542.1019041/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTT > SRR4302542.7203384/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTT < SRR4302542.3041048/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTT < SRR4302542.1822831/94‑1 (MQ=60)
GCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTT < SRR4302542.4634234/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGCGCGAAGCTACGCGGGTAACGCTGGGGGGAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGGTTTCCATTCGGGGTGCG > SRR4302542.2368748/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCG > SRR4302542.1674914/1‑94 (MQ=60)
CACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCC > SRR4302542.434762/1‑94 (MQ=60)
CACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCC > SRR4302542.4154906/1‑94 (MQ=60)
ACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCC < SRR4302542.5736928/94‑1 (MQ=60)
ACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCC > SRR4302542.6433620/1‑94 (MQ=60)
CTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCT < SRR4302542.6827287/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTA > SRR4302542.6667659/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTA > SRR4302542.2949267/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTA < SRR4302542.7494691/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTA < SRR4302542.1013191/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAG < SRR4302542.2299513/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAG < SRR4302542.5140646/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAG < SRR4302542.3526988/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCG < SRR4302542.1925716/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGA > SRR4302542.1264652/1‑94 (MQ=60)
GAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAT < SRR4302542.1851880/94‑1 (MQ=60)
GAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGAT > SRR4302542.5215927/1‑94 (MQ=60)
AAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATT < SRR4302542.3977009/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATT > SRR4302542.1895604/1‑94 (MQ=60)
AAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATT > SRR4302542.5433193/1‑94 (MQ=60)
AGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTG < SRR4302542.7373542/94‑1 (MQ=60)
CTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCT < SRR4302542.4536995/94‑1 (MQ=60)
CTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCT > SRR4302542.7417313/1‑94 (MQ=60)
CTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCT > SRR4302542.3286563/1‑94 (MQ=60)
CTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCT > SRR4302542.5273546/1‑94 (MQ=60)
CTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCT < SRR4302542.4107096/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGC > SRR4302542.1408819/1‑94 (MQ=60)
ACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGC > SRR4302542.4018457/1‑94 (MQ=60)
GGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTT > SRR4302542.5005769/1‑94 (MQ=60)
GGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTT < SRR4302542.6971684/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCG < SRR4302542.5225137/94‑1 (MQ=60)
ATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCG < SRR4302542.4985535/94‑1 (MQ=60)
TAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGT > SRR4302542.2108386/1‑94 (MQ=60)
TAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGT > SRR4302542.408860/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTA > SRR4302542.4619775/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTAC < SRR4302542.2023262/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTAC < SRR4302542.5103017/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACC > SRR4302542.2262752/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCA > SRR4302542.3791130/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAG < SRR4302542.2215606/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAG > SRR4302542.3011925/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAG > SRR4302542.5397396/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAG > SRR4302542.1230537/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCA > SRR4302542.7382464/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCA > SRR4302542.2972905/1‑94 (MQ=60)
GTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCA > SRR4302542.1514665/1‑94 (MQ=60)
TGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAA > SRR4302542.5189824/1‑94 (MQ=60)
TGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAA > SRR4302542.1599278/1‑94 (MQ=60)
TGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAA > SRR4302542.1152802/1‑94 (MQ=60)
TGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAA > SRR4302542.6329967/1‑94 (MQ=60)
AGTTAAAATGCGAATCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACAT < SRR4302542.2084299/94‑1 (MQ=60)
AGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACAT > SRR4302542.7057690/1‑94 (MQ=60)
AGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACAT > SRR4302542.7057689/1‑94 (MQ=60)
AGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACAT < SRR4302542.2515522/94‑1 (MQ=60)
GTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATA > SRR4302542.2706597/1‑94 (MQ=60)
GTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATA < SRR4302542.2537649/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT < SRR4302542.4375454/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT < SRR4302542.3019536/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT < SRR4302542.6625217/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT < SRR4302542.5535595/94‑1 (MQ=60)
TTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT < SRR4302542.6499728/94‑1 (MQ=60)
GTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATAT > SRR4302542.250055/1‑94 (MQ=60)
TAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATC > SRR4302542.7125274/1‑94 (MQ=60)
TAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATC > SRR4302542.262937/1‑94 (MQ=60)
TAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATC > SRR4302542.3176621/1‑94 (MQ=60)
AAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCTCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCA < SRR4302542.6287991/94‑1 (MQ=60)
AAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCA < SRR4302542.2598028/94‑1 (MQ=60)
AAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCA < SRR4302542.2016253/94‑1 (MQ=60)
AAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCAT < SRR4302542.910959/94‑1 (MQ=60)
AATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATC < SRR4302542.3526314/94‑1 (MQ=60)
ATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCT > SRR4302542.2901852/1‑94 (MQ=60)
ATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCT > SRR4302542.6056743/1‑94 (MQ=60)
ATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCT > SRR4302542.5523210/1‑94 (MQ=60)
TGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTA > SRR4302542.1376791/1‑94 (MQ=60)
GCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAC > SRR4302542.7559025/1‑94 (MQ=60)
GCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAC > SRR4302542.5328530/1‑94 (MQ=60)
GCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTAC > SRR4302542.4663166/1‑94 (MQ=60)
CGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACC > SRR4302542.6540821/1‑94 (MQ=60)
CGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACC < SRR4302542.2677316/94‑1 (MQ=60)
CGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACC < SRR4302542.698134/94‑1 (MQ=60)
CGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACC < SRR4302542.642012/94‑1 (MQ=60)
GAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCG > SRR4302542.7279558/1‑94 (MQ=60)
GAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCG > SRR4302542.2896478/1‑94 (MQ=60)
GAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCG > SRR4302542.2247856/1‑94 (MQ=60)
GAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCG < SRR4302542.4977949/94‑1 (MQ=60)
AACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGG < SRR4302542.5374212/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGC > SRR4302542.23719/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCT > SRR4302542.3582162/1‑94 (MQ=60)
CTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTT > SRR4302542.6278878/1‑94 (MQ=60)
TTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTTC > SRR4302542.7259266/1‑94 (MQ=60)
TTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGC > SRR4302542.2772053/1‑94 (MQ=60)
TTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTCC > SRR4302542.4563449/1‑94 (MQ=60)
TGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGTC > SRR4302542.809992/1‑94 (MQ=60)
TGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCC > SRR4302542.3717933/1‑94 (MQ=60)
TGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCC > SRR4302542.7452584/1‑94 (MQ=60)
TGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCC < SRR4302542.954684/94‑1 (MQ=60)
GGTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCA > SRR4302542.4418919/1‑94 (MQ=60)
GTATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCAC > SRR4302542.3216422/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGA > SRR4302542.1659633/1‑94 (MQ=60)
ATGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGA > SRR4302542.7560737/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGAT > SRR4302542.4227010/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGAT < SRR4302542.4694918/94‑1 (MQ=60)
TGCAGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGAT < SRR4302542.2407140/94‑1 (MQ=60)
AGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTTC > SRR4302542.6005573/1‑94 (MQ=60)
AGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAC < SRR4302542.453024/94‑1 (MQ=60)
AGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAC > SRR4302542.1279934/1‑94 (MQ=60)
AGAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAC > SRR4302542.3663673/1‑94 (MQ=60)
AGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTAC > SRR4302542.7484207/1‑94 (MQ=60)
GAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACG < SRR4302542.1045124/94‑1 (MQ=60)
GAATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACG < SRR4302542.5913218/94‑1 (MQ=60)
AATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGT > SRR4302542.4381308/1‑94 (MQ=60)
AATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGT < SRR4302542.5250274/94‑1 (MQ=60)
ATGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTG < SRR4302542.7501014/94‑1 (MQ=60)
TGATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGG > SRR4302542.4850792/1‑94 (MQ=60)
GATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGGCACGCTTACGGGGC > SRR4302542.736730/1‑94 (MQ=60)
GATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGC > SRR4302542.4356188/1‑94 (MQ=60)
GATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGC < SRR4302542.6428703/94‑1 (MQ=60)
GATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGC > SRR4302542.6802974/1‑94 (MQ=60)
GATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGC < SRR4302542.6630288/94‑1 (MQ=60)
ATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCT > SRR4302542.1268702/1‑94 (MQ=60)
ATCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCT < SRR4302542.4725793/94‑1 (MQ=60)
TCAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTC > SRR4302542.7429120/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTTCCACGATTACGTGGCTCC > SRR4302542.5138598/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTTGCTCC > SRR4302542.1483200/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCC > SRR4302542.1707895/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCC < SRR4302542.2027543/94‑1 (MQ=60)
AGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTTCCACGATTACGTGGCTCCG > SRR4302542.3577978/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCG > SRR4302542.6824678/1‑94 (MQ=60)
AGATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCG > SRR4302542.6943508/1‑94 (MQ=60)
GATGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGC > SRR4302542.4976383/1‑94 (MQ=60)
TGCTTGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCAC > SRR4302542.7249301/1‑94 (MQ=60)
TGCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAAT > SRR4302542.3860197/1‑94 (MQ=60)
GCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAATC < SRR4302542.443855/94‑1 (MQ=60)
GCCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAATC < SRR4302542.1009394/94‑1 (MQ=60)
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AATACATTCCGGCTTCCACTGCGCGAAGCTACGCGGATAACGCTGGGTGTAGTTAAAATGCGAACCTTTGGTATGCAGAATGATCAGATGCTTACCATCCGGGTTGCGCCCTAGCGATTGCTGCATTTCGTCTACCAGCAACATATCATCTACCGGCTTGCCACGATTACGTGGCTCCGCACCAATC > NC_000913/3706848‑3707034
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
