Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,951,166 |
+C |
coding (35/1818 nt) |
ilvD → |
dihydroxyacid dehydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,951,166 | 1 | . | C | 88.3%
| 990.3
/ 87.1
| 352 | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (39/2); new base C (81/229); total (121/231) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.56e-18 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951074‑3951248
|
gagaCAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCCCCACCCCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑gg < 1:4851723/93‑1 (MQ=255)
agacagacACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑gg‑g > 2:7051257/1‑93 (MQ=255)
acagacaCTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑ggcgc < 1:412369/93‑4 (MQ=255)
ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGaa < 1:1569347/93‑1 (MQ=255)
gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 1:927478/93‑1 (MQ=255)
gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 2:4825269/93‑1 (MQ=255)
gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 2:5406808/93‑1 (MQ=255)
taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 1:103815/93‑1 (MQ=255)
aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAcc < 1:741572/93‑1 (MQ=255)
aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAcc < 1:353788/93‑1 (MQ=255)
ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:845191/93‑1 (MQ=255)
ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:3196846/93‑1 (MQ=255)
ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:6065333/93‑1 (MQ=255)
taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGAc < 2:5333102/93‑1 (MQ=255)
aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGc < 2:957574/93‑1 (MQ=255)
aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGcc < 2:2663605/93‑1 (MQ=255)
aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGCGTGCTCCTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGACCGACGcc > 1:5906495/1‑93 (MQ=255)
tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCgc > 2:3662612/1‑92 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:1412959/93‑1 (MQ=255)
tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:5986847/93‑1 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:6983791/93‑1 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:986790/93‑1 (MQ=255)
tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:2046976/93‑1 (MQ=255)
aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCCGGGG‑GG‑GG‑GCCCCGGGAAGACCGACGCAGACTTCGGt > 1:7516668/1‑93 (MQ=255)
aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:3000627/93‑1 (MQ=255)
aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGAATGACCGACGCCGCTTTCggga > 2:1658526/1‑91 (MQ=255)
tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:5229961/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:6343984/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCACCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGc > 2:2992113/1‑93 (MQ=255)
ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGcc < 2:3222798/93‑1 (MQ=255)
ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGGGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCGGGATGACCGACCCCGACTTCGGTAAGcc > 2:126234/1‑93 (MQ=255)
cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 1:7289263/93‑1 (MQ=255)
cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGC‑‑CGT‑GGCGCGCCACCCGAAAGACCGACGCCCATTTCGGTAAGCCg > 2:6868591/1‑93 (MQ=255)
gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:368293/93‑1 (MQ=255)
gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:2628252/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:4374603/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 1:5304233/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCGGAATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGACGAt > 2:6375495/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGACCGACGCCGCTTTCGGTAAGCCGAt > 2:2059183/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAtt < 1:1120083/93‑1 (MQ=255)
cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:2032299/93‑1 (MQ=255)
gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:4886070/93‑1 (MQ=255)
gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:5446489/93‑1 (MQ=255)
gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCCGGATGAACGACCCCGGTTTTGGGAAGCCGATTTTc > 2:5154059/1‑93 (MQ=255)
ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACCCCCCCTTCCGTTAACCCATTATcc > 1:5481670/1‑92 (MQ=255)
caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:3866044/93‑1 (MQ=255)
caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 2:4228915/93‑1 (MQ=255)
caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:4587403/93‑1 (MQ=255)
accaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgcg < 1:2753093/93‑1 (MQ=255)
ccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCgg < 2:2169291/93‑1 (MQ=255)
caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:2838864/93‑1 (MQ=255)
caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt > 2:853079/1‑93 (MQ=255)
accacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCACCCGGCTGAACGGCGCCGAATTCGCTAAGCCCATTATtgcccgt > 2:3464763/1‑89 (MQ=255)
accacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGGCGATTATCGCGGtt > 2:1712497/1‑93 (MQ=255)
ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TCT‑GGCGCGCCACCGGCAAGACCGACCCCGCATTTGGGAAGCCGGTTATCCCGGAtg > 2:2270777/1‑93 (MQ=255)
ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGCGGGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAAAGACCCAAGCCGATTTTCGTAAGCCGAATATCGCGGTtg > 2:4027117/1‑93 (MQ=255)
cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgt < 2:7275722/93‑1 (MQ=255)
cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGa < 1:18116/93‑1 (MQ=255)
cTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGa > 2:6668332/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:1931831/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:6217645/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCGGAATGACCGACCCCGACTTTGGTAAGCCGATTATTGCGGTTGTGGACTc > 1:5815698/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 2:2124657/93‑1 (MQ=255)
gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 2:5820597/93‑1 (MQ=255)
gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 1:6453782/93‑1 (MQ=255)
gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCCC‑‑CGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACCCCCATTTCTGGAAGCCGAATATCGCGGGTGTGAACTCGt > 2:1835021/1‑93 (MQ=255)
tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:4020692/93‑1 (MQ=255)
tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:7165877/93‑1 (MQ=255)
cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:2415418/93‑1 (MQ=255)
tAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGAACGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAACTCGTTCAc > 2:7379058/1‑93 (MQ=255)
aaTATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAcc < 1:229251/93‑1 (MQ=255)
atatGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCGGAATGACCGACGCCGATTTCTGGAAGCCGATTATTGCGGGTGTGAACTCGTTTAccc > 2:3819537/1‑93 (MQ=255)
atGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 2:1102658/93‑1 (MQ=255)
ggCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAtt > 1:3451728/1‑93 (MQ=255)
gCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:4552445/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:4965476/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg < 2:2505553/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg < 2:5625899/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa > 1:1304150/1‑93 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:3586425/93‑1 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:6603125/93‑1 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:6512653/93‑1 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:2733269/93‑1 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:213888/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:3128340/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:1467639/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 2:6279802/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 2:3161799/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg > 1:444801/1‑93 (MQ=255)
cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 1:4013517/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:1899041/1‑93 (MQ=255)
cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:1331193/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATATCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:2932866/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg < 2:3290640/93‑1 (MQ=255)
gTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 2:1206985/93‑1 (MQ=255)
gTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc > 1:6735586/1‑93 (MQ=255)
tGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa > 2:4733837/1‑93 (MQ=255)
tGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa > 2:1065487/1‑93 (MQ=255)
gcgc‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc > 2:6808347/1‑93 (MQ=255)
gcgc‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc > 2:1587199/1‑93 (MQ=255)
|
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951074‑3951248
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG > NC_000913/3951073‑3951249
|
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G < SRR4302542.5333343/94‑1 (MQ=60)
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G < SRR4302542.6867613/94‑1 (MQ=60)
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGGGGTGT‑‑‑G‑‑G > SRR4302542.3526835/1‑94 (MQ=60)
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGGGCCGT‑‑‑G‑‑G > SRR4302542.985392/1‑94 (MQ=60)
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGGGCGCTGT‑‑‑G‑‑G > SRR4302542.896795/1‑94 (MQ=60)
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCCCCACCCCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑C < SRR4302542.4898969/94‑1 (MQ=60)
AGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcg < SRR4302542.5298353/94‑3 (MQ=60)
GACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgc < SRR4302542.1613373/94‑4 (MQ=60)
ACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcg < SRR4302542.415918/94‑5 (MQ=60)
ACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑GCgg > SRR4302542.7606046/1‑92 (MQ=60)
CAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgc > SRR4302542.4134060/1‑90 (MQ=60)
CAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggggc > SRR4302542.6507008/1‑90 (MQ=60)
AGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgcc > SRR4302542.4796785/1‑88 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgcca < SRR4302542.1844526/94‑8 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgcca < SRR4302542.807447/94‑8 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccc > SRR4302542.3803507/1‑88 (MQ=60)
ACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccac < SRR4302542.5677007/94‑9 (MQ=60)
ACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCCGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggggcccc > SRR4302542.926097/1‑87 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGGGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccacc < SRR4302542.5702546/94‑10 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccacc < SRR4302542.1279140/94‑10 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccacc < SRR4302542.5981316/94‑10 (MQ=60)
ACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccaccg < SRR4302542.3511299/94‑11 (MQ=60)
CTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccaccgg < SRR4302542.3752911/94‑12 (MQ=60)
CTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcggcccccg > SRR4302542.5335350/1‑84 (MQ=60)
CTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccg > SRR4302542.2258252/1‑84 (MQ=60)
TGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGA < SRR4302542.1363804/94‑1 (MQ=60)
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAAT < SRR4302542.1582901/94‑1 (MQ=60)
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAAT < SRR4302542.971438/94‑1 (MQ=60)
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGGGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcggcccccggaa > SRR4302542.2139684/1‑81 (MQ=60)
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATG < SRR4302542.3088672/94‑1 (MQ=60)
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATG < SRR4302542.2108313/94‑1 (MQ=60)
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATG < SRR4302542.1464514/94‑1 (MQ=60)
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATG < SRR4302542.3669152/94‑1 (MQ=60)
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCACGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATG < SRR4302542.3900131/94‑1 (MQ=60)
AGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgggccacccggaaga > SRR4302542.5171357/1‑78 (MQ=60)
GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGAC < SRR4302542.935461/94‑1 (MQ=60)
GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCCGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggaagac > SRR4302542.4494496/1‑78 (MQ=60)
TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACC < SRR4302542.104676/94‑1 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCG < SRR4302542.3642946/94‑1 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCG < SRR4302542.748004/94‑1 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCG < SRR4302542.356874/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGA < SRR4302542.7521240/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGGGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggggcccccccgaagaacga > SRR4302542.3506984/1‑75 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302542.6124080/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302542.3099353/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302542.86482/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302542.3227118/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302542.852480/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTCCCGTTCCGCCACCACCACACATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302542.1119945/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302542.594558/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302542.6322611/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgcccccgggaagaccgacgcc > SRR4302542.3055877/1‑71 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGCGTGCTCCTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGGATGACCGACGCC > SRR4302542.5963735/1‑94 (MQ=60)
AGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCG < SRR4302542.6551810/94‑1 (MQ=60)
AGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATAGGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑GGCG‑‑‑GG‑CCACCGGAATGACCGACGCCG < SRR4302542.3696942/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302542.4285429/94‑1 (MQ=60)
TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTT < SRR4302542.2513392/94‑1 (MQ=60)
TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTT < SRR4302542.2080121/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < SRR4302542.5130462/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.7052385/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.6917932/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.409492/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.995294/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.1387146/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302542.2080160/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGGGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccccaagagcggccccccttttc > SRR4302542.381598/1‑64 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < SRR4302542.3539959/94‑1 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < SRR4302542.7256882/94‑1 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < SRR4302542.2064670/94‑1 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑GCGCGC‑CC‑CCGGAATGACCGACGCCCATTTCccta > SRR4302542.1123232/1‑90 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggggcccccgggatgaacggcgccgattttggta > SRR4302542.4796081/1‑61 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302542.3029328/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302542.2312706/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302542.6091326/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302542.5482544/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302542.1502942/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302542.4704804/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302542.5280824/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCC < SRR4302542.6361843/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCC < SRR4302542.6406486/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccccccgcaagaccgaccccccatttcggaagac > SRR4302542.3548035/1‑56 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GGGCGC‑CC‑CCCGAATGACCGACGCCGACTTCGGGAAGAC > SRR4302542.2655718/1‑94 (MQ=53)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCG < SRR4302542.3463125/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCG < SRR4302542.3928638/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < SRR4302542.7360718/94‑1 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAT < SRR4302542.2653644/94‑1 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAT < SRR4302542.371496/94‑1 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggatgaccgaccccgctttctgttaggcgag > SRR4302542.5077481/1‑54 (MQ=54)
TTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATT < SRR4302542.4115002/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATT < SRR4302542.5355764/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccgcaagaacgccgcccctttctggaagccgatt > SRR4302542.7153232/1‑53 (MQ=52)
TCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < SRR4302542.1129656/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < SRR4302542.1854933/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < SRR4302542.183056/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < SRR4302542.4381646/94‑1 (MQ=60)
CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < SRR4302542.3459263/94‑1 (MQ=60)
GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgcgccacccggatgaccgacccccccttccgttaacccattatcc > SRR4302542.5534916/1‑48 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < SRR4302542.6933901/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < SRR4302542.2191673/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggaagaccgacccccactttggtaagccggatattcc > SRR4302542.2881065/1‑48 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GCGCGC‑CC‑CCGGGATGACCGACGCCGAGTTCGGGAAGCCGcttattcc > SRR4302542.2026838/1‑86 (MQ=52)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG < SRR4302542.3904256/94‑1 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG < SRR4302542.2800693/94‑1 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG < SRR4302542.4632274/94‑1 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG < SRR4302542.4632276/94‑1 (MQ=60)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGG < SRR4302542.5290575/94‑1 (MQ=60)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGG < SRR4302542.2779629/94‑1 (MQ=60)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCGGT‑‑‑G‑‑GGGCGC‑CC‑CCCGAATGAACGACGCCGATTTTGGTAAGCCGATTATCGCGG > SRR4302542.7588502/1‑94 (MQ=44)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGCTGT‑‑‑G‑‑Gcgggccccccggaagaacgccgccgcgtttggtgagccgattatctcgg > SRR4302542.2604106/1‑45 (MQ=60)
CCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGT < SRR4302542.1655412/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302542.2271751/94‑1 (MQ=60)
ACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTG < SRR4302542.1631622/94‑1 (MQ=60)
ACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GGGCGC‑CCCCCGG‑ATGACCGACGCCGCTTTCGGTAAGCCGATTATCTCGGGTG > SRR4302542.1475973/1‑94 (MQ=50)
CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < SRR4302542.6621110/94‑1 (MQ=60)
CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < SRR4302542.4928048/94‑1 (MQ=60)
CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < SRR4302542.7441852/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < SRR4302542.4506667/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < SRR4302542.3307846/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GGGCGC‑CCCCCGG‑ATGACCGCCGCCGCTTTCGGGAAGCCGATTTTCGCGGGTGTG > SRR4302542.7441361/1‑94 (MQ=25)
ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGG‑‑G‑‑‑GC‑CC‑CCCGAATGACCGACGCCGCTTTTTGTAAGCCGCTTATCGCGGGTGTGG > SRR4302542.7363888/1‑94 (MQ=32)
CTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < SRR4302542.18277/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GCGCGC‑CC‑CCGGGATGACCGACGCCGCTTTTGGTAAGCCCATTATCTCGGTTGTGAA > SRR4302542.5654276/1‑94 (MQ=34)
ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < SRR4302542.6343879/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < SRR4302542.1948515/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GCGCGC‑CC‑CCGGAATGACCGACCCCGACTTTGGTAAGCCGATTATTGCGGTTGTGGACTC > SRR4302542.5872164/1‑94 (MQ=44)
GTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTT < SRR4302542.6517329/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302542.1954774/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302542.2438900/94‑1 (MQ=60)
GTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAC < SRR4302542.5911390/94‑1 (MQ=60)
GTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAC < SRR4302542.6424549/94‑1 (MQ=60)
AATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCC < SRR4302542.231216/94‑1 (MQ=60)
AATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCC < SRR4302542.957139/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAT < SRR4302542.1555055/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT < SRR4302542.2703868/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT > SRR4302542.3484018/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT < SRR4302542.2538930/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGT > SRR4302542.3752932/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTA > SRR4302542.1315378/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAC < SRR4302542.189729/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAC < SRR4302542.1201857/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302542.4288187/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302542.6022448/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302542.215728/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302542.5880412/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302542.5465342/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302542.274409/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG > SRR4302542.448649/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302542.1480310/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302542.3176431/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302542.3158090/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGG > SRR4302542.2259550/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG > SRR4302542.5807909/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302542.4053132/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG > SRR4302542.3721276/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302542.6437061/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGT < SRR4302542.7500861/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC > SRR4302542.6801890/1‑94 (MQ=60)
GTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA < SRR4302542.4564603/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA < SRR4302542.706936/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG < SRR4302542.2423998/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGT‑‑‑G‑‑GC‑‑GCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG < SRR4302542.127266/94‑1 (MQ=60)
|
CGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑‑G‑‑G‑‑‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG > NC_000913/3951073‑3951249
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
