Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,502,680 |
C→T |
A352V (GCA→GTA) |
b4279 → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,502,680 | 0 | C | T | 88.9%
| 750.7
/ 55.5
| 262 | A352V (GCA→GTA) | b4279 | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/10); new base T (135/98); total (154/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-05 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATT > NC_000913/4502590‑4502770
|
gTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTaa < 2:7229780/93‑1 (MQ=255)
gTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTaa < 1:2425685/93‑1 (MQ=255)
tATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAAc > 1:5077940/1‑93 (MQ=255)
ttGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTg > 2:6999739/1‑93 (MQ=255)
ttGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTg > 2:4842785/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTgg < 1:6389572/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTgg < 1:7061797/93‑1 (MQ=255)
gCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTgga < 1:7140113/93‑1 (MQ=255)
aGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggagg > 1:1376953/1‑93 (MQ=255)
aGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggagg > 2:4757874/1‑93 (MQ=255)
gggTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTggagga > 1:4230424/1‑93 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTTTATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa > 1:2231270/1‑93 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa > 1:441186/1‑93 (MQ=255)
ggttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGaa < 2:1020/93‑1 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt > 1:6424245/1‑93 (MQ=255)
gttggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAt < 2:1067342/93‑1 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc < 2:1219583/93‑1 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc < 1:6757335/93‑1 (MQ=255)
ggttCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGc < 1:5321536/93‑1 (MQ=255)
ccAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCa > 2:3442150/1‑93 (MQ=255)
ccAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCa > 1:5190802/1‑93 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCAc > 2:2725898/1‑93 (MQ=255)
cAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCAc > 1:2059929/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCt < 2:687024/93‑1 (MQ=255)
tttATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTa < 2:1905444/93‑1 (MQ=255)
tatataTGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTAtt < 1:6160472/93‑1 (MQ=255)
tatataTGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGCAtt > 2:419469/1‑93 (MQ=255)
atatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa > 2:3900874/1‑93 (MQ=255)
atatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa > 1:488929/1‑93 (MQ=255)
atatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa < 2:3037592/93‑1 (MQ=255)
atatatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTa < 1:1613139/93‑1 (MQ=255)
atatGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGc > 2:5647310/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtac > 1:3701323/1‑93 (MQ=255)
tGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtac > 1:2202019/1‑93 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacat < 2:4122196/93‑1 (MQ=255)
aTTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacat < 1:2564720/93‑1 (MQ=255)
ttACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacata < 2:852171/93‑1 (MQ=255)
aCTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCtacataca > 1:2880511/1‑93 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt > 2:357587/1‑93 (MQ=255)
tttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAtt > 1:90359/1‑93 (MQ=255)
ttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAttt > 1:6911931/1‑93 (MQ=255)
ttCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAttt > 1:192703/1‑93 (MQ=255)
tCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTc > 2:2675416/1‑93 (MQ=255)
tCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTc < 1:2675421/93‑1 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg > 2:3357685/1‑93 (MQ=255)
aacaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAgg > 1:1128603/1‑93 (MQ=255)
acaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGa > 2:5569494/1‑93 (MQ=255)
acaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGa < 1:5703928/93‑1 (MQ=255)
acaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGa > 2:7451812/1‑93 (MQ=255)
acaaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGa > 1:3799325/1‑93 (MQ=255)
caaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTATCTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGat < 1:1942936/93‑1 (MQ=255)
caaAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGat > 2:1462980/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGata > 2:3212035/1‑93 (MQ=255)
aaaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGatat > 2:4550248/1‑93 (MQ=255)
aaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtatt < 1:3170409/93‑1 (MQ=255)
aaTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtatt < 1:1261132/93‑1 (MQ=255)
aTTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtatta > 1:5508007/1‑93 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 2:2192027/93‑1 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 1:2902166/93‑1 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 1:1039816/93‑1 (MQ=255)
ttAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAtattat < 1:5020146/93‑1 (MQ=255)
tAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATg > 2:5092348/1‑93 (MQ=255)
agagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGc < 2:1845337/93‑1 (MQ=255)
agagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGc < 1:1785991/93‑1 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt > 2:4455792/1‑93 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt > 1:4194380/1‑93 (MQ=255)
gagGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCt > 2:431074/1‑93 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa < 2:6640075/93‑1 (MQ=255)
ggATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTa > 2:6781807/1‑93 (MQ=255)
gATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAg > 1:1061512/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgt > 2:4367702/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgt > 1:3848214/1‑93 (MQ=255)
tAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtg < 2:3864215/93‑1 (MQ=255)
tAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtg < 2:6577104/93‑1 (MQ=255)
tAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtg > 2:1674366/1‑93 (MQ=255)
aGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGgtgt < 1:624377/93‑1 (MQ=255)
gggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGtt < 2:4573146/93‑1 (MQ=255)
ggACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGttt < 1:4136763/93‑1 (MQ=255)
gACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTc > 2:7093826/1‑93 (MQ=255)
gACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTc > 1:4744363/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatt > 2:3662468/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatta > 1:3587247/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatta > 1:7337928/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatta < 2:5751571/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCatta < 2:5956999/93‑1 (MQ=255)
gTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattat > 1:6607306/1‑93 (MQ=255)
gTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattat > 1:619006/1‑93 (MQ=255)
tCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCattatt < 2:2963737/93‑1 (MQ=255)
ttatttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCa < 1:478365/93‑1 (MQ=255)
ttatAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGt > 1:5878082/1‑93 (MQ=255)
ataACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 1:6065437/93‑1 (MQ=255)
ataACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTa < 1:3422012/93‑1 (MQ=255)
taACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAc > 2:6334516/1‑93 (MQ=255)
aaCTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACg > 2:5364743/1‑93 (MQ=255)
cTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGt < 2:5802683/93‑1 (MQ=255)
cTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGt < 1:7397500/93‑1 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt > 2:6164022/1‑93 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt < 2:2449012/93‑1 (MQ=255)
ttAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGtt > 2:3148994/1‑93 (MQ=255)
ggggTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCa > 1:4451213/1‑93 (MQ=255)
|
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATT > NC_000913/4502590‑4502770
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC > NC_000913/4502587‑4502771
|
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT < SRR4302542.2127332/94‑1 (MQ=60)
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT > SRR4302542.3852450/1‑94 (MQ=60)
TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGT > SRR4302542.3789409/1‑94 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA < SRR4302542.3383815/94‑1 (MQ=60)
AGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTA > SRR4302542.554806/1‑94 (MQ=60)
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAC > SRR4302542.2639341/1‑94 (MQ=60)
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAAC < SRR4302542.2449279/94‑1 (MQ=60)
GTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAAC > SRR4302542.5127286/1‑94 (MQ=60)
TATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACT < SRR4302542.3370464/94‑1 (MQ=60)
TATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACT < SRR4302542.3780895/94‑1 (MQ=60)
TATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACT > SRR4302542.3818464/1‑94 (MQ=60)
ATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTG > SRR4302542.6386507/1‑94 (MQ=60)
ATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTG > SRR4302542.5141957/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGA < SRR4302542.6452520/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGA < SRR4302542.7131107/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG < SRR4302542.7210184/94‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAG < SRR4302542.6948843/94‑1 (MQ=60)
CAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGG > SRR4302542.1388855/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGA > SRR4302542.4272093/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTCCAAAATTTTTATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAA > SRR4302542.2250469/1‑94 (MQ=60)
GGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAA > SRR4302542.445008/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAAT > SRR4302542.6487553/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATG < SRR4302542.4947120/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATG < SRR4302542.2766943/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGG > SRR4302542.5361576/1‑94 (MQ=60)
GGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCC < SRR4302542.6823804/94‑1 (MQ=60)
GGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCC < SRR4302542.5373229/94‑1 (MQ=60)
GTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCG > SRR4302542.371821/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCG > SRR4302542.4794142/1‑94 (MQ=60)
TCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCA > SRR4302542.5241231/1‑94 (MQ=60)
CCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCAC > SRR4302542.2077730/1‑94 (MQ=60)
AAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTG < SRR4302542.6043492/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTG > SRR4302542.2463117/1‑94 (MQ=60)
AATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGT > SRR4302542.4488549/1‑94 (MQ=60)
ATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTA > SRR4302542.6683701/1‑94 (MQ=60)
TTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTAT > SRR4302542.4255723/1‑94 (MQ=60)
TTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTAT > SRR4302542.7242571/1‑94 (MQ=60)
TTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATT > SRR4302542.1055829/1‑94 (MQ=60)
TATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTA > SRR4302542.493153/1‑94 (MQ=60)
TATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTA < SRR4302542.6220148/94‑1 (MQ=60)
TATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTA < SRR4302542.6268549/94‑1 (MQ=60)
TATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTA > SRR4302542.174302/1‑94 (MQ=60)
ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAG > SRR4302542.4223739/1‑94 (MQ=60)
ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAG < SRR4302542.1627074/94‑1 (MQ=60)
ATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAG > SRR4302542.7425458/1‑94 (MQ=60)
ATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCT < SRR4302542.6657862/94‑1 (MQ=60)
TATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTA > SRR4302542.742275/1‑94 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC > SRR4302542.2220977/1‑94 (MQ=60)
ATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTAC > SRR4302542.3737950/1‑94 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACAT < SRR4302542.926238/94‑1 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACAT < SRR4302542.3515850/94‑1 (MQ=60)
GATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACAT > SRR4302542.2987598/1‑94 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA < SRR4302542.2589577/94‑1 (MQ=60)
ATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATA > SRR4302542.7183169/1‑94 (MQ=60)
TTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATAC < SRR4302542.2035234/94‑1 (MQ=60)
TACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACA > SRR4302542.2908179/1‑94 (MQ=60)
TACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACA > SRR4302542.5346103/1‑94 (MQ=60)
ACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACAT > SRR4302542.4121699/1‑94 (MQ=60)
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CTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATT < SRR4302542.4985160/94‑1 (MQ=60)
TTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTT > SRR4302542.5553851/1‑94 (MQ=60)
TTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTT > SRR4302542.6979788/1‑94 (MQ=60)
TTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTT > SRR4302542.194334/1‑94 (MQ=60)
TCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCA < SRR4302542.1123436/94‑1 (MQ=60)
TCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCA < SRR4302542.2701246/94‑1 (MQ=60)
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CCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAG < SRR4302542.6875120/94‑1 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG > SRR4302542.2235263/1‑94 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG < SRR4302542.1079045/94‑1 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG > SRR4302542.4844751/1‑94 (MQ=60)
CAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGG > SRR4302542.1138236/1‑94 (MQ=60)
AACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGA > SRR4302542.3836933/1‑94 (MQ=60)
AACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGA > SRR4302542.796630/1‑94 (MQ=60)
AACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGA > SRR4302542.6131855/1‑94 (MQ=60)
ACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGAT < SRR4302542.5759298/94‑1 (MQ=60)
CAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTATCTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATA < SRR4302542.1959736/94‑1 (MQ=60)
AAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATAT > SRR4302542.4394801/1‑94 (MQ=60)
AAAATTAAGAGGATTAGGGACCAGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATAT < SRR4302542.489676/94‑1 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA > SRR4302542.2083111/1‑94 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA < SRR4302542.3200483/94‑1 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA > SRR4302542.5561531/1‑94 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA < SRR4302542.625941/94‑1 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA < SRR4302542.1271977/94‑1 (MQ=60)
AATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTA < SRR4302542.1946578/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTAT < SRR4302542.3384749/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTAT < SRR4302542.1814193/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTAT < SRR4302542.6993446/94‑1 (MQ=60)
TTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATG < SRR4302542.1048747/94‑1 (MQ=60)
TTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATG < SRR4302542.2930022/94‑1 (MQ=60)
TTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATG < SRR4302542.5068894/94‑1 (MQ=60)
TTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATG > SRR4302542.6063401/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGC > SRR4302542.572538/1‑94 (MQ=60)
AGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCT > SRR4302542.4235733/1‑94 (MQ=60)
AGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCT < SRR4302542.1801490/94‑1 (MQ=60)
AGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCT > SRR4302542.1317706/1‑94 (MQ=60)
GAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTT > SRR4302542.2323048/1‑94 (MQ=60)
GGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAG > SRR4302542.1070637/1‑94 (MQ=60)
GATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGG > SRR4302542.6481532/1‑94 (MQ=60)
GATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGG > SRR4302542.6606755/1‑94 (MQ=60)
ATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGT > SRR4302542.2390063/1‑94 (MQ=60)
ATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGT > SRR4302542.3886239/1‑94 (MQ=60)
TTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTG < SRR4302542.4605158/94‑1 (MQ=60)
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GGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTC > SRR4302542.1197403/1‑94 (MQ=60)
GGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTC > SRR4302542.4248123/1‑94 (MQ=60)
GACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCA < SRR4302542.128304/94‑1 (MQ=60)
GACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGGGTTTCA > SRR4302542.6225387/1‑94 (MQ=60)
ACCGGACTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGAATTAGCTACATACATTTCCGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCAT > SRR4302542.2058969/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATT > SRR4302542.5106323/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATT > SRR4302542.4027993/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTA > SRR4302542.3620704/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTA > SRR4302542.7409805/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTA < SRR4302542.1507792/94‑1 (MQ=60)
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GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302542.2121985/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302542.6672398/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302542.624329/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTAT > SRR4302542.1871338/1‑94 (MQ=60)
CTTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCA > SRR4302542.308773/1‑94 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT < SRR4302542.482513/94‑1 (MQ=60)
TTATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGCATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCAT > SRR4302542.5155634/1‑94 (MQ=60)
TATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATT > SRR4302542.7075748/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG > SRR4302542.2860677/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG > SRR4302542.3667730/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG > SRR4302542.4568636/1‑94 (MQ=60)
ATTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTG < SRR4302542.5696439/94‑1 (MQ=60)
TTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGT < SRR4302542.5901506/94‑1 (MQ=60)
TTTATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGT > SRR4302542.5935069/1‑94 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302542.6124186/94‑1 (MQ=60)
ATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTAC < SRR4302542.3454070/94‑1 (MQ=60)
CTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTT > SRR4302542.6155724/1‑94 (MQ=60)
CTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTT < SRR4302542.7469899/94‑1 (MQ=60)
CTTAGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTT < SRR4302542.2516778/94‑1 (MQ=60)
AGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCA > SRR4302542.4494871/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCA > SRR4302542.2923576/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCA > SRR4302542.6369990/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTTAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATT > SRR4302542.6013071/1‑94 (MQ=60)
GGGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATT > SRR4302542.388117/1‑94 (MQ=60)
GGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC > SRR4302542.4596254/1‑94 (MQ=60)
GGTAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC < SRR4302542.177956/94‑1 (MQ=60)
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TAGGTATTGCAGGGTTGGTTCCAAAATTTATATATGATTACTTTCCAACAAAATTAAGAGGATTAGGGACCGGTCTTATTTATAACTTAGGGGCAACTGGAGGAATGGCCGCACCTGTATTAGCTACATACATTTCAGGATATTATGGCTTAGGTGTTTCATTATTCATTGTTACGGTTGCATTC > NC_000913/4502587‑4502771
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
