Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > NC_000913/3824377‑3824560
|
CGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACA > SRR4302542.1149191/1‑94 (MQ=60)
CTACCAGAGTTGAACGTTGGCCGGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACC < SRR4302542.1622614/94‑1 (MQ=60)
TACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCT < SRR4302542.1928426/94‑1 (MQ=60)
CCCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTG < SRR4302542.6560242/94‑1 (MQ=60)
ACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTG > SRR4302542.2713114/1‑94 (MQ=60)
ACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTG < SRR4302542.5313307/94‑1 (MQ=60)
ACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTG < SRR4302542.2866421/94‑1 (MQ=60)
CAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCT > SRR4302542.4621468/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCT < SRR4302542.3947587/94‑1 (MQ=60)
AGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTG > SRR4302542.6401259/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTG > SRR4302542.310864/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTG > SRR4302542.421836/1‑94 (MQ=60)
AGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGAGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTG > SRR4302542.6468219/1‑94 (MQ=60)
GAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGG < SRR4302542.3342738/94‑1 (MQ=60)
GTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTT > SRR4302542.1030322/1‑94 (MQ=60)
GTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTT < SRR4302542.2240735/94‑1 (MQ=60)
GTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTT > SRR4302542.5781191/1‑94 (MQ=60)
GTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATAAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTT < SRR4302542.813615/94‑1 (MQ=60)
TTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTG > SRR4302542.1170433/1‑94 (MQ=60)
TTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTG > SRR4302542.3557724/1‑94 (MQ=60)
TTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTG > SRR4302542.4104739/1‑94 (MQ=60)
TGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGC > SRR4302542.2342588/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGTCCTGCTACACGGGGGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTCCACCTGCTGGTTGCCAC < SRR4302542.1899065/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAA > SRR4302542.2334150/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAA > SRR4302542.2581257/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAAC > SRR4302542.2575565/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACC < SRR4302542.2125741/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACC < SRR4302542.1775964/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCAAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACC < SRR4302542.5258010/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCG < SRR4302542.1529164/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGTACACGGGCGGATGAAGCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGT < SRR4302542.4369555/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGGT > SRR4302542.6298266/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTA < SRR4302542.2356975/94‑1 (MQ=60)
CTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTA > SRR4302542.684838/1‑94 (MQ=60)
GTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTG < SRR4302542.6068451/94‑1 (MQ=60)
GTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTG < SRR4302542.1764603/94‑1 (MQ=60)
TACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGA > SRR4302542.414560/1‑94 (MQ=60)
TACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGA > SRR4302542.3235937/1‑94 (MQ=60)
ACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAA > SRR4302542.1864950/1‑94 (MQ=60)
ACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGT < SRR4302542.3023648/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTC < SRR4302542.6506241/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCG < SRR4302542.669673/94‑1 (MQ=60)
GGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGG < SRR4302542.5538507/94‑1 (MQ=60)
GCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGC < SRR4302542.2904541/94‑1 (MQ=60)
CGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCG < SRR4302542.4524512/94‑1 (MQ=60)
CGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCG > SRR4302542.2322530/1‑94 (MQ=60)
GGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGT > SRR4302542.3961150/1‑94 (MQ=60)
GATGAAATCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTT < SRR4302542.4329121/94‑1 (MQ=60)
GATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTT < SRR4302542.6484259/94‑1 (MQ=60)
GATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTT < SRR4302542.4311549/94‑1 (MQ=60)
ATGAACCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTG < SRR4302542.6617807/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGA > SRR4302542.1014583/1‑94 (MQ=60)
TGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGA > SRR4302542.500959/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAATGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAT < SRR4302542.7373981/94‑1 (MQ=60)
GAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAT < SRR4302542.5158719/94‑1 (MQ=60)
GAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGAT > SRR4302542.6791186/1‑94 (MQ=60)
AAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATG > SRR4302542.2660156/1‑94 (MQ=60)
AAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATG > SRR4302542.1124041/1‑94 (MQ=60)
AAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATG < SRR4302542.1763723/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGATCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGT > SRR4302542.1928402/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGT > SRR4302542.6069146/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTG < SRR4302542.4312729/94‑1 (MQ=60)
NNTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGC < SRR4302542.3210011/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCC > SRR4302542.1592662/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCT < SRR4302542.2527753/94‑1 (MQ=60)
GCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTA > SRR4302542.5156975/1‑94 (MQ=60)
CCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAA > SRR4302542.843969/1‑94 (MQ=60)
CCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAA > SRR4302542.7481336/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAAC > SRR4302542.4436252/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAAC > SRR4302542.3387067/1‑94 (MQ=60)
GAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACG < SRR4302542.6187162/94‑1 (MQ=60)
GAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACG < SRR4302542.798991/94‑1 (MQ=60)
GAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACG > SRR4302542.5077779/1‑94 (MQ=60)
AGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGC > SRR4302542.6116421/1‑94 (MQ=60)
AGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGC > SRR4302542.4754571/1‑94 (MQ=60)
GAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCC < SRR4302542.3648419/94‑1 (MQ=60)
AAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCA > SRR4302542.5770060/1‑94 (MQ=60)
ACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGT < SRR4302542.4181502/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGT > SRR4302542.3209469/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTC > SRR4302542.1799438/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCT > SRR4302542.4670134/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCT < SRR4302542.1153224/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTG < SRR4302542.2210503/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGAT > SRR4302542.4420548/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGAT < SRR4302542.2276079/94‑1 (MQ=60)
GGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATG > SRR4302542.6627965/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATG > SRR4302542.2985197/1‑94 (MQ=60)
GGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATG > SRR4302542.3760619/1‑94 (MQ=60)
GGTGAAGGCGACGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATG < SRR4302542.525157/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGA > SRR4302542.5368640/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGAT > SRR4302542.4410429/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGAT > SRR4302542.817651/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGAT < SRR4302542.643865/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTA < SRR4302542.4611876/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTA < SRR4302542.834127/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTAT < SRR4302542.393886/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTAT < SRR4302542.5918886/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTAT > SRR4302542.6950177/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTAT < SRR4302542.6882170/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATC > SRR4302542.665921/1‑94 (MQ=60)
GGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATC < SRR4302542.2198808/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATC > SRR4302542.1831144/1‑94 (MQ=60)
GGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATC < SRR4302542.6932500/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCGTTTAAACAAGGTAAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATC < SRR4302542.6790981/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCG < SRR4302542.4375541/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCG < SRR4302542.3530141/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCG < SRR4302542.3928148/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCG < SRR4302542.6465979/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAA > SRR4302542.4286132/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAA < SRR4302542.2029723/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAA > SRR4302542.3804352/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAA > SRR4302542.5545397/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAA > SRR4302542.982848/1‑94 (MQ=60)
TCGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAA > SRR4302542.1462391/1‑94 (MQ=60)
CGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAA > SRR4302542.1608603/1‑94 (MQ=60)
CGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAA < SRR4302542.5838502/94‑1 (MQ=60)
CGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAA < SRR4302542.6684104/94‑1 (MQ=60)
CGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAA > SRR4302542.5432132/1‑94 (MQ=60)
CGTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAA > SRR4302542.6138068/1‑94 (MQ=60)
GTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAAC > SRR4302542.2924202/1‑94 (MQ=60)
GTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAAC > SRR4302542.2332641/1‑94 (MQ=60)
GTTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAAC < SRR4302542.1613388/94‑1 (MQ=60)
TTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACC > SRR4302542.6899894/1‑94 (MQ=60)
TTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACC < SRR4302542.2702993/94‑1 (MQ=60)
TTTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACC < SRR4302542.6264059/94‑1 (MQ=60)
TTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCC < SRR4302542.3305218/94‑1 (MQ=60)
TTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCC > SRR4302542.7523880/1‑94 (MQ=60)
TTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCC < SRR4302542.1534805/94‑1 (MQ=60)
TTAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCC < SRR4302542.2975801/94‑1 (MQ=60)
TAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCG < SRR4302542.72092/94‑1 (MQ=60)
TAAACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCG < SRR4302542.547254/94‑1 (MQ=60)
AACAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGA > SRR4302542.5703491/1‑94 (MQ=60)
ACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAG < SRR4302542.5999280/94‑1 (MQ=60)
ACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAG < SRR4302542.1888862/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC > SRR4302542.5759482/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC > SRR4302542.1208746/1‑94 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC < SRR4302542.4402756/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC < SRR4302542.939686/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC < SRR4302542.470434/94‑1 (MQ=60)
CAAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGC < SRR4302542.5959194/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCG > SRR4302542.4927413/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCG > SRR4302542.2503307/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCT < SRR4302542.1866457/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCT < SRR4302542.7360237/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTG > SRR4302542.6360228/1‑94 (MQ=60)
GAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGG > SRR4302542.2110554/1‑94 (MQ=60)
GAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGG < SRR4302542.4544817/94‑1 (MQ=60)
GAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGG > SRR4302542.129913/1‑94 (MQ=60)
GAGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGG > SRR4302542.738783/1‑94 (MQ=60)
AGCCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGG > SRR4302542.2459352/1‑94 (MQ=60)
CCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTC > SRR4302542.7482518/1‑94 (MQ=60)
CCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTC > SRR4302542.1005614/1‑94 (MQ=60)
CCACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTC < SRR4302542.5161126/94‑1 (MQ=60)
TACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.6155968/1‑94 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT < SRR4302542.3938507/94‑1 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.296400/1‑94 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.4059984/1‑94 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.2633168/1‑94 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT < SRR4302542.1274397/94‑1 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.108378/1‑94 (MQ=60)
CACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > SRR4302542.2565641/1‑94 (MQ=60)
|
CGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCT > NC_000913/3824377‑3824560
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
