Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > NC_000913/4163135‑4163321
|
CTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCA > SRR4302542.6298300/1‑94 (MQ=60)
TACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGAT < SRR4302542.1505482/94‑1 (MQ=60)
TACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAT < SRR4302542.5196619/94‑1 (MQ=60)
TACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCAAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAT < SRR4302542.6271719/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATT > SRR4302542.4077770/1‑94 (MQ=60)
ACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATT < SRR4302542.6868664/94‑1 (MQ=60)
ACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATT < SRR4302542.5631742/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTG < SRR4302542.306834/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTG < SRR4302542.2560639/94‑1 (MQ=60)
CGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGT > SRR4302542.1588971/1‑94 (MQ=60)
CGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGT > SRR4302542.4574042/1‑94 (MQ=60)
GGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTC > SRR4302542.6509808/1‑94 (MQ=60)
GATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA > SRR4302542.1883093/1‑94 (MQ=60)
GATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA < SRR4302542.1205279/94‑1 (MQ=60)
ATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑C > SRR4302542.5322929/1‑94 (MQ=60)
ATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑C < SRR4302542.3265899/94‑1 (MQ=60)
ATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑C < SRR4302542.4411229/94‑1 (MQ=60)
TCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CC < SRR4302542.714360/94‑1 (MQ=60)
TCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CC > SRR4302542.5409139/1‑94 (MQ=60)
TCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CC < SRR4302542.1363956/94‑1 (MQ=60)
CTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCG > SRR4302542.7163950/1‑94 (MQ=60)
CTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCG > SRR4302542.7010843/1‑94 (MQ=60)
CTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCG > SRR4302542.4271172/1‑94 (MQ=60)
CTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCG > SRR4302542.3028898/1‑94 (MQ=60)
CTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCG > SRR4302542.3670186/1‑94 (MQ=60)
TCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGC > SRR4302542.291043/1‑94 (MQ=60)
TCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGC > SRR4302542.1282394/1‑94 (MQ=60)
CCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCG > SRR4302542.5177419/1‑94 (MQ=60)
CCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCG > SRR4302542.6138123/1‑94 (MQ=60)
CCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCG < SRR4302542.2262487/94‑1 (MQ=60)
CATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGG < SRR4302542.4202544/94‑1 (MQ=60)
CATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGG < SRR4302542.960334/94‑1 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGT > SRR4302542.4109149/1‑94 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGT < SRR4302542.157078/94‑1 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGT > SRR4302542.2502949/1‑94 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGT < SRR4302542.6205061/94‑1 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGT > SRR4302542.3182158/1‑94 (MQ=60)
ATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGT < SRR4302542.1348797/94‑1 (MQ=60)
TTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTG < SRR4302542.956611/94‑1 (MQ=60)
ACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCA > SRR4302542.2453220/1‑94 (MQ=60)
CATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAA > SRR4302542.7555996/1‑94 (MQ=60)
CATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAA > SRR4302542.6014864/1‑94 (MQ=60)
ATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAG < SRR4302542.1320295/94‑1 (MQ=60)
ATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAG < SRR4302542.4109343/94‑1 (MQ=60)
TTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAA > SRR4302542.6963109/1‑94 (MQ=60)
TTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAA > SRR4302542.224163/1‑94 (MQ=60)
TATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAAC > SRR4302542.5395190/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACG > SRR4302542.5345997/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACG < SRR4302542.6794515/94‑1 (MQ=60)
ATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACG > SRR4302542.2315583/1‑94 (MQ=60)
ATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACG < SRR4302542.2074070/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGT < SRR4302542.4811232/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGT < SRR4302542.2504237/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTT > SRR4302542.5910495/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTT < SRR4302542.39519/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTT > SRR4302542.6209011/1‑94 (MQ=60)
GCNNTNGNTAACNTNGCTTTCCCGTATGGCGAAAANAGCGAAGCGNTTATTGNTGNNNGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTT < SRR4302542.5194294/94‑1 (MQ=60)
CTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTA < SRR4302542.1657151/94‑1 (MQ=60)
TTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTAT > SRR4302542.1371443/1‑94 (MQ=60)
TTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTAT < SRR4302542.3208050/94‑1 (MQ=60)
TTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTAT < SRR4302542.3208049/94‑1 (MQ=60)
CGATAACGTTGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCC > SRR4302542.2901773/1‑94 (MQ=60)
CGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCC > SRR4302542.1571649/1‑94 (MQ=60)
CGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCC > SRR4302542.1098756/1‑94 (MQ=60)
CGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCC > SRR4302542.1242597/1‑94 (MQ=60)
GATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCC > SRR4302542.5323877/1‑94 (MQ=60)
GATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCC > SRR4302542.4896803/1‑94 (MQ=60)
GATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCC > SRR4302542.466395/1‑94 (MQ=60)
ATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCT > SRR4302542.701649/1‑94 (MQ=60)
TAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTT < SRR4302542.4708211/94‑1 (MQ=60)
AACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTG > SRR4302542.3946785/1‑94 (MQ=60)
AACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTG > SRR4302542.2391451/1‑94 (MQ=60)
AACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTG < SRR4302542.7523053/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGC > SRR4302542.4146482/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGC > SRR4302542.4146483/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCG > SRR4302542.803632/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGC > SRR4302542.4074543/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTG < SRR4302542.3431727/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTCCCGTATGGCAAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTG < SRR4302542.5410109/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGC > SRR4302542.4960838/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGC > SRR4302542.1234011/1‑94 (MQ=60)
TTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCT < SRR4302542.1197921/94‑1 (MQ=60)
TTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCT < SRR4302542.4286915/94‑1 (MQ=60)
TCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAAATGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGT > SRR4302542.7442692/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTGATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGT > SRR4302542.5717676/1‑94 (MQ=60)
CCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTG > SRR4302542.5516525/1‑94 (MQ=60)
CCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTG < SRR4302542.4930793/94‑1 (MQ=60)
CCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTG > SRR4302542.1350044/1‑94 (MQ=60)
CCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGG > SRR4302542.2427429/1‑94 (MQ=60)
CCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGG > SRR4302542.5143145/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTC > SRR4302542.2569535/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTC < SRR4302542.2064227/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCG < SRR4302542.6608891/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGC > SRR4302542.7289786/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGC < SRR4302542.6618598/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCT < SRR4302542.3138638/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTT < SRR4302542.5432604/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGACTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTT < SRR4302542.7375876/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTT < SRR4302542.3941590/94‑1 (MQ=60)
GGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTT < SRR4302542.4266277/94‑1 (MQ=60)
CGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGC > SRR4302542.2266774/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCA > SRR4302542.6609167/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCA > SRR4302542.4888129/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAA > SRR4302542.5957613/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAAC < SRR4302542.2125075/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAAC > SRR4302542.3261468/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAAC > SRR4302542.4002024/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACA > SRR4302542.7265339/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACA > SRR4302542.6145410/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACA < SRR4302542.2057464/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACT < SRR4302542.2302421/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACT > SRR4302542.4866599/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACT < SRR4302542.4391617/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTG < SRR4302542.1362053/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGC > SRR4302542.937001/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCC > SRR4302542.6120706/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCC > SRR4302542.4222159/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCC > SRR4302542.5178374/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCC < SRR4302542.1738650/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCA < SRR4302542.4170574/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCA > SRR4302542.1397013/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCA > SRR4302542.2567580/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCA > SRR4302542.1942383/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAG < SRR4302542.3585200/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGT < SRR4302542.6620839/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGT < SRR4302542.6094308/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTA > SRR4302542.3927151/1‑94 (MQ=60)
CGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTAC > SRR4302542.24467/1‑94 (MQ=60)
CGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTAC < SRR4302542.6729569/94‑1 (MQ=60)
CGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATACCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTAC < SRR4302542.7588025/94‑1 (MQ=60)
CGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTAC > SRR4302542.1776219/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACC > SRR4302542.930229/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACC > SRR4302542.930523/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTT < SRR4302542.1577553/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTT > SRR4302542.4071659/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTT > SRR4302542.6421680/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTT > SRR4302542.6292496/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTT > SRR4302542.2187278/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTT < SRR4302542.5977869/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTC > SRR4302542.2001844/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGAGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTC > SRR4302542.4160828/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTC > SRR4302542.5366862/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTC < SRR4302542.551615/94‑1 (MQ=60)
TGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCA > SRR4302542.146580/1‑94 (MQ=60)
TGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCA < SRR4302542.5923312/94‑1 (MQ=60)
TGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTT < SRR4302542.1378415/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCC < SRR4302542.4419465/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCT < SRR4302542.3690832/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCT < SRR4302542.764751/94‑1 (MQ=60)
CGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTG < SRR4302542.4353544/94‑1 (MQ=60)
CGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTG > SRR4302542.7363585/1‑94 (MQ=60)
CGAGTGGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTG > SRR4302542.5401906/1‑94 (MQ=60)
CGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTG < SRR4302542.5079666/94‑1 (MQ=60)
GAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGC > SRR4302542.7250947/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGCGATTGTCACCCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCAT < SRR4302542.2375182/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTA > SRR4302542.6632566/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTAC < SRR4302542.2458964/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACG > SRR4302542.5565821/1‑94 (MQ=60)
GCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCG < SRR4302542.920827/94‑1 (MQ=60)
GCGATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCG < SRR4302542.2196103/94‑1 (MQ=60)
GATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > SRR4302542.3771531/1‑94 (MQ=60)
GATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > SRR4302542.5231419/1‑94 (MQ=60)
GATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > SRR4302542.2106246/1‑94 (MQ=60)
AATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > SRR4302542.6893253/1‑94 (MQ=60)
|
CTTACCGGATCTCCATTACATTTATGCTTTCGATAACGTCGCTTTCCCGTATGGCGAAAAAAGCGAAGCGTTTATTGTTGAGCGAGTGGTGGCAATTGTCA‑CCGCGGTGCAAGAACGTTATCCCCTTGCGCTGGCTGTGGTCGCTTGCAACACTGCCAGTACCGTTTCACTTCCTGCATTACGCGAA > NC_000913/4163135‑4163321
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
