Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
2,838,044 |
+G |
coding (498/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 2,838,043 | 1 | . | G | 99.6%
| 2062.5
/ ‑2.1
| 528 | coding (497/1458 nt) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base G (222/303); total (222/306) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 584 total aligned reads displayed.
CGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > NC_000913/2837948‑2838134
|
cGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc < 2:10713744/96‑1 (MQ=255)
gagaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑g > 1:7110612/1‑96 (MQ=255)
gagaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑g < 1:11276933/96‑1 (MQ=255)
gagaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑g < 2:13789218/96‑1 (MQ=255)
gagaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTGCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑g > 2:9002888/1‑96 (MQ=255)
agaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGTTTTCTTTTTTTTTCCGGTGGCGGTcgc‑gg > 1:6582860/1‑95 (MQ=255)
gaTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggc > 2:172987/1‑94 (MQ=255)
aTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggca < 2:10377147/96‑4 (MQ=255)
aTGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggca < 1:3183218/96‑4 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggcat > 1:1084434/1‑92 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggcat > 1:5689541/1‑92 (MQ=255)
tGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTcgc‑ggcat > 1:3815439/1‑92 (MQ=255)
aGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCt < 2:12660393/96‑1 (MQ=255)
aGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCATGCCGCTGATGGTCGC‑GTCATCt > 2:13040397/1‑96 (MQ=255)
aGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGCTTTCTTCTTACTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCt > 2:3600713/1‑96 (MQ=255)
cggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGc < 2:62033/96‑1 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCTACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGcc < 1:12558439/96‑1 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGGCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGcc > 2:8860456/1‑96 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGcc < 1:1530685/96‑1 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGcc > 1:5369053/1‑96 (MQ=255)
ggcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTGCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGcc < 2:13916429/96‑1 (MQ=255)
gcgTGCTGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTNCcg < 2:4433112/96‑1 (MQ=255)
gTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCcgac < 1:11889113/96‑3 (MQ=255)
gTGCAGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCcgcc > 2:9321582/1‑95 (MQ=255)
tGCTGACAAAAGGATGGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCcgcca < 2:271238/96‑3 (MQ=255)
tGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCcgcca < 1:4037666/96‑3 (MQ=255)
gCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCcgccat < 2:5548601/96‑4 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCa < 1:1737282/96‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCa > 2:2568578/1‑96 (MQ=255)
aCAAAAGGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGAGGGTGCTTACTTCTTGCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCaaa < 1:302333/96‑1 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGGGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAt > 1:2479812/1‑96 (MQ=255)
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAtt > 2:7750880/1‑96 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttt > 2:6023082/1‑96 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttt < 2:5703518/96‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttt < 2:6343624/96‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttt < 2:8075591/96‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttt < 1:7044872/96‑1 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTa < 2:9826526/96‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 2:8327689/1‑96 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGCGCTTTCGTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GACATCTGCAGC‑CATCAAATTTaa > 1:9778409/1‑96 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaa > 1:9978918/1‑96 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc < 1:8939469/96‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc < 1:12377963/96‑1 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcaa < 1:13059369/96‑3 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 1:10360704/96‑1 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 2:4853099/96‑1 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 1:1001294/1‑96 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 1:4514895/1‑96 (MQ=255)
ccGCCCTTAACCATACTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTCCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 2:1961616/96‑1 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAACACCAata > 2:417183/1‑96 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 1:5164300/1‑96 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:796406/1‑96 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:13262630/1‑96 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 1:13940253/96‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc > 1:8056767/1‑96 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CTTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg < 2:14066722/96‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 1:6757255/1‑96 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt > 1:5879601/1‑96 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 2:11681803/96‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 2:11056982/96‑1 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGTTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 1:13442762/96‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc < 1:2836761/96‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc < 1:6153585/96‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCg < 2:10928840/96‑1 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGAt < 1:2012473/96‑1 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGTGAt > 1:8448653/1‑96 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt > 1:12161938/1‑96 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt > 1:5588647/1‑96 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg < 2:3224717/96‑1 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGcc > 2:2353772/1‑96 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa > 1:13764286/1‑96 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCacc < 1:11107438/96‑3 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 2:7416731/96‑1 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 2:4576603/96‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg > 2:5266516/1‑96 (MQ=255)
gATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgc < 1:9238493/96‑1 (MQ=255)
tGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg > 1:3473795/1‑96 (MQ=255)
tgtcGGTTCTTTCTTCTTCCTCCCGCTGATGGTCGCGG‑CCTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt < 2:6639246/93‑1 (MQ=255)
tgccGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtgt < 1:7580013/93‑1 (MQ=255)
gccGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGtgtg < 2:6832088/94‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGCGTGCTg > 2:9591377/1‑96 (MQ=255)
gCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTa > 2:1578883/1‑96 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCAGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:4305500/96‑1 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGAGGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTTAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 2:12772264/1‑96 (MQ=255)
ttcttctccCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt < 2:373932/96‑1 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg < 2:10496533/96‑1 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTGAATCCGa > 1:9499427/1‑96 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa > 2:12171305/1‑96 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGt < 2:4018985/96‑1 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt > 2:13551176/1‑96 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:12048978/96‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg > 2:10237331/1‑96 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGATTTATTg > 1:4847707/1‑96 (MQ=255)
gCTGATGGTCTCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATAGCCATCGCGCGGCGGCTGGTGCATCCGAGTTTTATTGa > 1:11540264/1‑96 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa < 2:5458070/96‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc > 2:70702/1‑96 (MQ=255)
gATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGGCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 2:2269089/1‑96 (MQ=255)
tagTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGa > 1:10537450/3‑96 (MQ=255)
ggTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt > 2:11489772/1‑96 (MQ=255)
gTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:8655069/96‑1 (MQ=255)
|
CGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > NC_000913/2837948‑2838134
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 302 total aligned reads displayed.
TCCTCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > NC_000913/2837944‑2838145
|
NNNTCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G < SRR4302518.11804763/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G < SRR4302518.7976908/101‑1 (MQ=60)
NNNGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggt < SRR4302518.11851842/101‑3 (MQ=60)
CTCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑N‑NN > SRR4302518.7382247/1‑101 (MQ=60)
TCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggca < SRR4302518.3331545/101‑4 (MQ=60)
TCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggca > SRR4302518.6553147/1‑98 (MQ=60)
TCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑NNN > SRR4302518.11756907/1‑101 (MQ=60)
NNNATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATC < SRR4302518.13770110/101‑1 (MQ=60)
NNNATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATC < SRR4302518.8633049/101‑1 (MQ=60)
CGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCT < SRR4302518.561500/101‑1 (MQ=60)
AGATTAGCGGCGTGCTGAGAAAAGGATCGCCGACCTTAAGCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggcannn > SRR4302518.10621609/1‑95 (MQ=60)
GATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGCTGGTCGCGG‑CATCTG > SRR4302518.195328/1‑101 (MQ=60)
ATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTTCCGCTGATGGTCGC‑Ggcatcnnn > SRR4302518.14412929/1‑93 (MQ=60)
TGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCG > SRR4302518.5978129/1‑101 (MQ=60)
TGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCC > SRR4302518.3995816/1‑101 (MQ=60)
TGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑Ggcatctnnn > SRR4302518.12730581/1‑92 (MQ=60)
NNNGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCTACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCC < SRR4302518.10572600/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCC < SRR4302518.11716632/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGTC < SRR4302518.8492131/101‑1 (MQ=60)
NNNCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGCTCGCGG‑CATCTGCTG < SRR4302518.11833727/101‑1 (MQ=60)
GAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCG > SRR4302518.1176633/1‑101 (MQ=60)
GAGCGGCGGCCTGACAAAAGGGTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCG < SRR4302518.3789453/101‑1 (MQ=60)
AGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGGCGC > SRR4302518.5992737/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGac < SRR4302518.12455163/101‑3 (MQ=60)
NNNGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCC < SRR4302518.9092949/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCC < SRR4302518.10150804/101‑1 (MQ=60)
CGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCca < SRR4302518.3041115/101‑3 (MQ=60)
NNNGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302518.10938072/101‑1 (MQ=60)
NNNGTGCTCACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302518.10031550/101‑1 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCNNN > SRR4302518.13100629/1‑101 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGGGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGAGGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT > SRR4302518.4093788/1‑101 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATC > SRR4302518.7146671/1‑101 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATC > SRR4302518.1009973/1‑101 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTCTCTTCGTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCcnnn > SRR4302518.13302346/1‑97 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA < SRR4302518.1814742/101‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGATGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCcannn > SRR4302518.9843530/1‑96 (MQ=60)
NNNCTGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAAACATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAA < SRR4302518.10748508/101‑1 (MQ=60)
GTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCcatnnn > SRR4302518.12905092/1‑95 (MQ=60)
GTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCcatnnn > SRR4302518.11388845/1‑95 (MQ=60)
TGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAA < SRR4302518.6243860/101‑1 (MQ=60)
NNNGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.10181074/101‑1 (MQ=60)
NNNGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.8408314/101‑1 (MQ=60)
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCcatcannn > SRR4302518.9723188/1‑93 (MQ=60)
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.5770410/101‑1 (MQ=60)
CTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAANNN > SRR4302518.10380830/1‑101 (MQ=60)
NNNCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTT < SRR4302518.7417759/101‑1 (MQ=60)
NGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTN < SRR4302518.5725722/101‑1 (MQ=60)
NNNAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTA < SRR4302518.8941910/101‑1 (MQ=60)
GACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTA > SRR4302518.6327866/1‑101 (MQ=60)
GACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATNNN > SRR4302518.14162468/1‑101 (MQ=60)
TCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302518.1864158/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAA < SRR4302518.8241072/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAA < SRR4302518.7592479/101‑1 (MQ=60)
NNNGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAATC < SRR4302518.14968426/101‑1 (MQ=60)
NNNGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACC < SRR4302518.12961754/101‑1 (MQ=60)
NNNATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA < SRR4302518.10847745/101‑1 (MQ=60)
NNNATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACAA < SRR4302518.13663803/101‑1 (MQ=60)
AGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA < SRR4302518.1098702/101‑1 (MQ=60)
AGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA > SRR4302518.328442/1‑101 (MQ=60)
AGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGCGCTTTCGTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GACATCTGCAGC‑CATCAAATTTAAAANNN > SRR4302518.10247337/1‑101 (MQ=60)
NNNTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302518.10302917/101‑1 (MQ=60)
GGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACNNN > SRR4302518.10453888/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.9341948/101‑1 (MQ=60)
NNNCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.9014270/101‑1 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCNNN > SRR4302518.11266204/1‑101 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.3748369/101‑1 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.1281677/101‑1 (MQ=60)
NNNGCCGCCCTTAACCATTCTGAAGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302518.10473679/101‑1 (MQ=60)
NNNGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302518.7459803/101‑1 (MQ=60)
ATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAGTTTAAAACCAATA > SRR4302518.4882855/1‑101 (MQ=60)
acgccctCCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302518.5915959/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCGGC‑CATCAAATTTAAAACCAANNN > SRR4302518.14455827/1‑101 (MQ=60)
TCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302518.5806429/1‑101 (MQ=60)
CTCCGACCTTAACCATTCTTAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302518.3782389/101‑1 (MQ=60)
CGCCGACCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG < SRR4302518.7085989/101‑1 (MQ=60)
NNNGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGGTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302518.13444844/101‑1 (MQ=60)
GCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT > SRR4302518.4749895/1‑101 (MQ=60)
CCCGACCTTACCCATTCTGAAGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302518.4567139/101‑1 (MQ=60)
CCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302518.5884656/101‑1 (MQ=60)
NNNACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302518.9484306/101‑1 (MQ=60)
CCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302518.250249/101‑1 (MQ=60)
CCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC > SRR4302518.4483689/1‑101 (MQ=60)
CGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG < SRR4302518.6167360/101‑1 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302518.714127/1‑101 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302518.5430689/1‑101 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGC < SRR4302518.733114/101‑1 (MQ=60)
CACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTNNN > SRR4302518.14401554/1‑101 (MQ=60)
NNNTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT < SRR4302518.13019796/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT < SRR4302518.13057104/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT < SRR4302518.8908600/101‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCNNN > SRR4302518.10929086/1‑101 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT > SRR4302518.2656170/1‑101 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCG > SRR4302518.2222730/1‑101 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGGGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAACATGTCGCT > SRR4302518.6994572/1‑101 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT > SRR4302518.7014371/1‑101 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302518.4580725/101‑1 (MQ=60)
NNNAACCATTCTGAATGTGATTGTTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACTAATATGTCGCTGG < SRR4302518.14060559/101‑1 (MQ=60)
NNNAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302518.8553480/101‑1 (MQ=60)
NNNAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302518.11368691/101‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302518.895514/101‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCNNN > SRR4302518.8457661/1‑101 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302518.4500860/1‑101 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302518.2970787/101‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302518.7110089/1‑101 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302518.6466604/101‑1 (MQ=60)
NNNACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302518.14560080/101‑1 (MQ=60)
TACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG < SRR4302518.5764365/101‑1 (MQ=60)
NNNCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTCCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302518.14875717/101‑1 (MQ=60)
NNNCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302518.13269760/101‑1 (MQ=60)
NNNCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCCA < SRR4302518.11301409/101‑1 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGG > SRR4302518.6177570/1‑101 (MQ=60)
ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGAT < SRR4302518.2105203/101‑1 (MQ=60)
ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT > SRR4302518.221770/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGACT < SRR4302518.11123467/101‑1 (MQ=60)
CCATTCTGAATGTGATGGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302518.5038096/101‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302518.3817982/1‑101 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302518.5201088/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTTC < SRR4302518.11192333/101‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATNNN > SRR4302518.11686255/1‑101 (MQ=60)
TTCTGAATGTGTTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC < SRR4302518.3551055/101‑1 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGNNN > SRR4302518.12675679/1‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGNNN > SRR4302518.12739212/1‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302518.5872171/1‑101 (MQ=60)
nnnatgcgactggctaccattCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCCGGCGATTGCCATC < SRR4302518.14032084/80‑1 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCNNN > SRR4302518.12133434/1‑101 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCNNN > SRR4302518.8830280/1‑101 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC < SRR4302518.194483/101‑1 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302518.5560599/101‑1 (MQ=60)
NNNGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC < SRR4302518.9684262/101‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC < SRR4302518.4409172/101‑1 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCG < SRR4302518.6767047/101‑1 (MQ=60)
gtTGATTGGTGACGTTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGG < SRR4302518.3612223/99‑1 (MQ=60)
TGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGNNN > SRR4302518.7517101/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGT < SRR4302518.12474110/101‑1 (MQ=60)
GGTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGNNN > SRR4302518.9637495/1‑101 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGG > SRR4302518.2801288/1‑101 (MQ=60)
nnngttgcCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302518.7967734/93‑1 (MQ=60)
NNNGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302518.7443023/101‑1 (MQ=60)
GTTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGCTTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302518.3209591/101‑1 (MQ=60)
TTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTNNN > SRR4302518.13360784/1‑101 (MQ=60)
TGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302518.3635429/1‑101 (MQ=60)
GGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGACATCGCGGGTGTGCT > SRR4302518.6066166/1‑101 (MQ=60)
GTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTG < SRR4302518.180010/101‑1 (MQ=60)
TGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGG < SRR4302518.6525001/101‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGT < SRR4302518.2336182/101‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGT > SRR4302518.5282231/1‑101 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGGGCTGGG > SRR4302518.1635969/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGacatattg < SRR4302518.12063916/101‑9 (MQ=60)
ACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAGCGCGGGTGTGCTGGTA > SRR4302518.1159548/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC < SRR4302518.9517310/101‑1 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGTTGTGCTGGTACA > SRR4302518.2660105/1‑101 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGAGTGCGGGAACA > SRR4302518.3346063/1‑101 (MQ=60)
NNNTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATC < SRR4302518.12783655/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATC < SRR4302518.10389446/101‑1 (MQ=60)
GCTTTTTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.1521717/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.3173739/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC > SRR4302518.4711215/1‑101 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.4180810/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.2018734/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACANNN > SRR4302518.7478555/1‑101 (MQ=60)
CTTTCTTCTTCCTTCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATacgctgacggtaaacggtgattatannn > SRR4302518.11465334/1‑73 (MQ=60)
TTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCNNN > SRR4302518.14746460/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCTCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATTTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302518.4296127/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT < SRR4302518.5523180/101‑1 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302518.827322/101‑1 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTNNN > SRR4302518.7852062/1‑101 (MQ=60)
TTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302518.3109444/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302518.11358957/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302518.9865032/101‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGTGGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302518.3549520/101‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302518.926713/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA < SRR4302518.4960777/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGGTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA > SRR4302518.5907519/1‑101 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTAGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGGACATACGAGTTTTATTNNN > SRR4302518.7851096/1‑101 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC < SRR4302518.3046665/101‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACG > SRR4302518.5502443/1‑101 (MQ=60)
CGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302518.1755562/101‑1 (MQ=60)
CGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGATTTATTGAACTG > SRR4302518.5101038/1‑101 (MQ=60)
GTTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGGACATCCGAGTTTTATTGAACNNN > SRR4302518.12324488/1‑101 (MQ=60)
GCTGATGGTCTCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATAGCCATCGCGCGGCGGCTGGTGCATCCGAGTTTTATTGAAannn > SRR4302518.12082969/1‑97 (MQ=47)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > SRR4302518.1373368/1‑101 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.6932054/101‑1 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGCACATCCGAGTTTTATTGAACTGNNN > SRR4302518.14027647/1‑101 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACAGCCGAGTTTTATTGAACTGNNN > SRR4302518.14143797/1‑101 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CAACTGCCGC‑CATCAAATTAAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.1179344/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.14306203/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.9076303/101‑1 (MQ=60)
nnngtcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAATCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGTTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302518.9349914/92‑1 (MQ=60)
gtggccgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302518.3111563/92‑1 (MQ=60)
ATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302518.4066951/101‑1 (MQ=60)
tagtcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGNNN > SRR4302518.11030702/9‑101 (MQ=60)
nnntcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302518.11106163/93‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302518.3987126/101‑1 (MQ=60)
GGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAGGGCGA > SRR4302518.4221734/1‑101 (MQ=60)
TCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATACGTCGCTGGCGATTGCCAACGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA < SRR4302518.1635168/101‑1 (MQ=60)
NNN‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAATCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.13135358/101‑1 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG > SRR4302518.526050/1‑101 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302518.6132705/101‑1 (MQ=60)
gcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.1388300/98‑1 (MQ=60)
ccgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.917324/98‑1 (MQ=60)
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TCCTCGAGATGAGCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > NC_000913/2837944‑2838145
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |