Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
2,838,055 |
Δ1 bp |
coding (509/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 2,838,055 | 0 | G | . | 100.0%
| 2414.3
/ NA
| 502 | coding (509/1458 nt) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (214/288); total (214/288) |
Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > NC_000913/2837965‑2838145
|
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCaa > 1:6022299/1‑96 (MQ=255)
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCaa < 2:6049114/96‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCaa > 1:13540910/1‑96 (MQ=255)
aCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCaaa > 2:6735218/1‑96 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAt < 1:8009024/96‑1 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAt < 1:9713953/96‑1 (MQ=255)
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAtt > 2:10253179/1‑96 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAttn < 1:5448008/96‑2 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTa < 2:9826526/96‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa < 1:1784183/96‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 1:315747/1‑96 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCGAATTTaaa > 1:9892536/1‑96 (MQ=255)
gATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaaa > 1:7074102/1‑96 (MQ=255)
gATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaaa > 2:9038051/1‑96 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc < 2:12708519/96‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCGGC‑CATCAAATTTAAAAcc > 1:13823102/1‑96 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAcc < 1:12377963/96‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGACTGGTGACGGTGCTTACTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GACATCTACCGC‑CATCAAATTTATAAcc > 2:13670178/1‑96 (MQ=255)
cGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 2:12923258/96‑1 (MQ=255)
gccgccCTTAACCCTTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAccta < 1:14306689/96‑3 (MQ=255)
gCCGACCTTATCCATCCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTTTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:4810305/96‑1 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 1:1001294/1‑96 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 2:10470214/1‑96 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 1:4448844/1‑96 (MQ=255)
ccGCCCTTAACCATACTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTCCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 2:1961616/96‑1 (MQ=255)
ccGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 1:8910429/96‑1 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:8166331/96‑1 (MQ=255)
aaacTTACCCCTTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat < 1:394539/93‑1 (MQ=255)
aCCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:6735218/96‑1 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 1:10439673/1‑96 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 1:2534251/1‑96 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGAAGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 1:6912361/1‑96 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:8532654/96‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:9221526/96‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc > 1:1677360/1‑96 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc > 2:2334508/1‑96 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg < 1:5869901/96‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg < 2:13828207/96‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGGGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg < 2:7078210/96‑1 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 2:9582174/96‑1 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg > 1:213164/1‑96 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 2:6310686/96‑1 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg > 2:5427101/1‑96 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 1:862218/96‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc > 1:3646995/1‑96 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc > 1:4943822/1‑96 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCg > 1:11163564/1‑96 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCg < 2:10552796/96‑1 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt > 1:12161938/1‑96 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt > 1:5588647/1‑96 (MQ=255)
cTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGact < 1:10624202/96‑3 (MQ=255)
cTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTCCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt < 2:8905495/96‑1 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg > 1:8417805/1‑96 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCACTATGTCGCTGGCGATTGcc < 2:12100353/96‑1 (MQ=255)
aggtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa > 1:11877070/3‑96 (MQ=255)
gtgATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 2:13180091/96‑1 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATc < 2:7416731/96‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTCCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg < 2:10856913/96‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg < 2:13344450/96‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg < 1:5227709/96‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcg > 1:563934/1‑96 (MQ=255)
aTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgcg < 1:6437857/96‑1 (MQ=255)
ttGGTGACGTTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg < 1:3451548/96‑1 (MQ=255)
ttGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg > 2:2650135/1‑96 (MQ=255)
tGGTGAGGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg < 2:5682608/96‑1 (MQ=255)
tGGTGACGATGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCggg > 1:12967873/1‑96 (MQ=255)
ggTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgggg > 2:10075688/1‑95 (MQ=255)
cGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAGTATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt < 2:11587745/96‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATCTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTgg < 2:5778179/96‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGt > 2:11863508/1‑96 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTGCCAGCCGCTGATGGCCGCGG‑CATCTGCCGC‑TATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGt < 2:689930/96‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTa > 2:1578883/1‑96 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 2:3365481/96‑1 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:9078849/96‑1 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:11497656/96‑1 (MQ=255)
cTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGATGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc > 2:14131665/1‑96 (MQ=255)
tttCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa < 2:8025468/96‑1 (MQ=255)
tttCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa < 2:7762611/96‑1 (MQ=255)
tttCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa > 2:4547001/1‑96 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt < 2:3732542/96‑1 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACAt > 2:3048161/1‑96 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc > 2:246344/1‑96 (MQ=255)
cttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 2:364677/96‑1 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAg < 2:11016234/96‑1 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAg > 1:7467226/1‑96 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGt < 2:4018985/96‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGt > 1:428007/1‑96 (MQ=255)
cTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtttt > 2:5486623/1‑96 (MQ=255)
cTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtttt < 2:1131623/96‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa > 1:13285544/1‑96 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 2:6446871/1‑96 (MQ=255)
gCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt < 1:10849735/96‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:12176073/96‑1 (MQ=255)
cTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa < 1:4713276/96‑1 (MQ=255)
gATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 2:4219812/1‑96 (MQ=255)
cgcgg‑cATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGc < 1:2971950/92‑1 (MQ=255)
cATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAg < 2:5164300/96‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAATCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc < 1:12546556/96‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCCTCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc < 1:9253007/96‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc > 1:2751747/1‑96 (MQ=255)
|
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > NC_000913/2837965‑2838145
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 283 total aligned reads displayed.
GCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGGTGAA > NC_000913/2837956‑2838155
|
NNNGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GACATCTGCCGC‑CAT < SRR4302518.14053528/101‑1 (MQ=60)
NNNGTGCTCACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302518.10031550/101‑1 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTCCTTTCTTCTTCCGGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302518.196427/101‑1 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCNNN > SRR4302518.13100629/1‑101 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGCNNN > SRR4302518.11361588/1‑101 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT > SRR4302518.5643873/1‑101 (MQ=60)
GGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGGGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGAGGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT > SRR4302518.4093788/1‑101 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATC > SRR4302518.1009973/1‑101 (MQ=60)
GCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATC > SRR4302518.7146671/1‑101 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA < SRR4302518.1814742/101‑1 (MQ=60)
CGTGCTGACAAAAGCATCGCCGACCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA < SRR4302518.1812219/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAAACATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAA < SRR4302518.10748508/101‑1 (MQ=60)
gcCTGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGAGGGTGCTTACTTCTTGCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAA < SRR4302518.314536/99‑1 (MQ=60)
TGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAA < SRR4302518.6243860/101‑1 (MQ=60)
NNNGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.10181074/101‑1 (MQ=60)
NNNGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.8408314/101‑1 (MQ=60)
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.6748090/101‑1 (MQ=60)
GCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302518.5770410/101‑1 (MQ=60)
NNNCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTT < SRR4302518.7417759/101‑1 (MQ=60)
NNNCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTT < SRR4302518.9559874/101‑1 (MQ=60)
NGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTN < SRR4302518.5725722/101‑1 (MQ=60)
GACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATNNN > SRR4302518.14162468/1‑101 (MQ=60)
TCAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302518.1864158/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAA < SRR4302518.7592479/101‑1 (MQ=60)
NNNGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAATC < SRR4302518.14968426/101‑1 (MQ=60)
AGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA < SRR4302518.1098702/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302518.10302917/101‑1 (MQ=60)
GGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCGAATTTAAAACNNN > SRR4302518.10364656/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.9341948/101‑1 (MQ=60)
GATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.6965786/101‑1 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCNNN > SRR4302518.7447853/1‑101 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCNNN > SRR4302518.11266204/1‑101 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302518.3748369/101‑1 (MQ=60)
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NNNGCCGCCCTTAACCATTCTGAAGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302518.10473679/101‑1 (MQ=60)
NNNGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302518.7459803/101‑1 (MQ=60)
ATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAGTTTAAAACCAATA > SRR4302518.4882855/1‑101 (MQ=60)
ATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAATCCANNN > SRR4302518.10925592/1‑101 (MQ=60)
acgccctCCTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302518.5915959/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302518.5806429/1‑101 (MQ=60)
TCGCCAAACTTACCCCTTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302518.409999/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT < SRR4302518.13082565/101‑1 (MQ=60)
nnnctACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATT < SRR4302518.11791960/96‑1 (MQ=60)
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NNNACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302518.14578132/101‑1 (MQ=60)
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CCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC > SRR4302518.4483689/1‑101 (MQ=60)
CGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG < SRR4302518.6167360/101‑1 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302518.5430689/1‑101 (MQ=60)
CACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTNNN > SRR4302518.14401554/1‑101 (MQ=60)
NNNTTACCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT < SRR4302518.13019796/101‑1 (MQ=60)
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ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCNNN > SRR4302518.10929086/1‑101 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT > SRR4302518.2656170/1‑101 (MQ=60)
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ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCG > SRR4302518.2222730/1‑101 (MQ=60)
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ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGAAGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCT > SRR4302518.7279096/1‑101 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302518.614717/101‑1 (MQ=60)
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NNNAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302518.8553480/101‑1 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG > SRR4302518.1751367/1‑101 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302518.895514/101‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302518.7110089/1‑101 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGGGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC < SRR4302518.6466604/101‑1 (MQ=60)
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TACCCATTCTGAAGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG < SRR4302518.4042715/101‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGNNN > SRR4302518.12602575/1‑101 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG > SRR4302518.1023815/1‑101 (MQ=60)
NNNCATTCTGAATGTGATTGGTGCCGGTGCTTTCTCCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302518.14875717/101‑1 (MQ=60)
NNNCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGTTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA < SRR4302518.13269760/101‑1 (MQ=60)
AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGG > SRR4302518.6177570/1‑101 (MQ=60)
ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT > SRR4302518.221770/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302518.14413596/101‑1 (MQ=60)
NNNTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT < SRR4302518.13751965/101‑1 (MQ=60)
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CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302518.3817982/1‑101 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATNNN > SRR4302518.11686255/1‑101 (MQ=60)
TTCTGAATGTGTTTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC < SRR4302518.3551055/101‑1 (MQ=60)
tgttAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302518.3669045/5‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGTGATTGNNN > SRR4302518.8862161/1‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGNNN > SRR4302518.12739212/1‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGNNN > SRR4302518.12675679/1‑101 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302518.5872171/1‑101 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAT < SRR4302518.703372/101‑1 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAT > SRR4302518.475514/1‑101 (MQ=60)
nnnatgcgactggctaccattCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCCGGCGATTGCCATC < SRR4302518.14032084/80‑1 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCNNN > SRR4302518.8830280/1‑101 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCNNN > SRR4302518.12133434/1‑101 (MQ=60)
NNNATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCACC < SRR4302518.11627045/101‑1 (MQ=60)
GAAGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302518.5496598/101‑1 (MQ=60)
NNNGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC < SRR4302518.9684262/101‑1 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC < SRR4302518.4409172/101‑1 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCNNN > SRR4302518.14394415/1‑101 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCG < SRR4302518.6767047/101‑1 (MQ=60)
AGGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCNNN > SRR4302518.12442564/1‑101 (MQ=60)
TGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGT < SRR4302518.6493529/101‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGG > SRR4302518.2801288/1‑101 (MQ=60)
nnngttgcCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302518.7967734/93‑1 (MQ=60)
GTTGGTGCCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGCTTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302518.3209591/101‑1 (MQ=60)
TTGGTGACGGTTCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTG < SRR4302518.3308606/101‑1 (MQ=60)
TTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTNNN > SRR4302518.13360784/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCAGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGCG < SRR4302518.11147243/101‑1 (MQ=60)
TGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302518.3635429/1‑101 (MQ=60)
TGGTGACGATGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGNNN > SRR4302518.13568986/1‑101 (MQ=60)
TGTGACGGTGCTTACTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTTCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGACGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT < SRR4302518.6296927/101‑1 (MQ=60)
GGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGACATCGCGGGTGTGCT > SRR4302518.6066166/1‑101 (MQ=60)
TGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGG < SRR4302518.6025184/101‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGT < SRR4302518.2336182/101‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGN > SRR4302518.118307/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGacatattg < SRR4302518.12063916/101‑9 (MQ=60)
ACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGGCGCGG‑CATCTTCCGC‑CATTAAATTTATCACAAATATGGCGCTGTTGATTGCGATCGCGGGTGTGCTGNNN > SRR4302518.8314335/1‑101 (MQ=20)
ccgttCTTTCTTCTTCCTGCAGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC < SRR4302518.4519313/96‑1 (MQ=60)
NNNTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAC < SRR4302518.9517310/101‑1 (MQ=60)
CGGTGCTTTTTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTTC < SRR4302518.3596588/101‑1 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGTTGTGCTGGTACA > SRR4302518.2660105/1‑101 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGAGTGCGGGAACA > SRR4302518.3346063/1‑101 (MQ=60)
NNNTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATC < SRR4302518.12783655/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATC < SRR4302518.10389446/101‑1 (MQ=60)
GCTTTTTTCTCCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAACCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.1521717/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302518.2018734/101‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC > SRR4302518.4711215/1‑101 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACANNN > SRR4302518.7478555/1‑101 (MQ=60)
CTTTCTTCTTCCTTCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATacgctgacggtaaacggtgattatannn > SRR4302518.11465334/1‑73 (MQ=60)
TTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCNNN > SRR4302518.14746460/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGGG < SRR4302518.9845277/101‑1 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCTCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATTTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302518.4296127/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302518.3217359/1‑101 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT < SRR4302518.5523180/101‑1 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302518.827322/101‑1 (MQ=60)
TTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT > SRR4302518.444777/1‑101 (MQ=60)
TTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302518.3109444/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302518.11358957/101‑1 (MQ=60)
ctccatccgctgttgttcgcgtCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTTGCGATTCCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302518.1900730/79‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302518.9865032/101‑1 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302518.926713/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTNNN > SRR4302518.9153732/1‑101 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTNNN > SRR4302518.13897703/1‑101 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA < SRR4302518.4960777/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGGTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA > SRR4302518.5907519/1‑101 (MQ=60)
TGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTAGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGGACATACGAGTTTTATTNNN > SRR4302518.7851096/1‑101 (MQ=60)
NNNGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC < SRR4302518.8484310/101‑1 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC < SRR4302518.3046665/101‑1 (MQ=60)
NNNTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302518.10144841/101‑1 (MQ=60)
NNNTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAGTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302518.13029854/101‑1 (MQ=60)
CGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302518.1755562/101‑1 (MQ=60)
CGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGATTTATTGAACTG > SRR4302518.5101038/1‑101 (MQ=60)
CGCTGATGGTCGC‑GCCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTG < SRR4302518.5529632/101‑1 (MQ=60)
GTTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGGACATCCGAGTTTTATTGAACNNN > SRR4302518.12324488/1‑101 (MQ=60)
GCTGATGGTCTCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATAGCCATCGCGCGGCGGCTGGTGCATCCGAGTTTTATTGAAannn > SRR4302518.12082969/1‑97 (MQ=47)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGA > SRR4302518.5273600/1‑101 (MQ=60)
GCTGATGGACGCGG‑CAGCTGCCGC‑CATCAAAATTAAAACCAATATGTCGCTCGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTGTTATTGAACTGA > SRR4302518.2118983/1‑101 (MQ=60)
NNNATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302518.7398462/101‑1 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.6932054/101‑1 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > SRR4302518.1373368/1‑101 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CAACTGCCGC‑CATCAAATTAAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.1179344/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.10516642/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.8209816/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302518.9076303/101‑1 (MQ=60)
GATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302518.3940438/101‑1 (MQ=60)
nnngtcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAATCCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGTTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302518.9349914/92‑1 (MQ=60)
gtggccgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302518.3111563/92‑1 (MQ=60)
tagtcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGNNN > SRR4302518.11030702/9‑101 (MQ=60)
nnntcgcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302518.11106163/93‑1 (MQ=60)
nnngtcgcggtATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGTC < SRR4302518.13644093/90‑1 (MQ=60)
GGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > SRR4302518.2974334/1‑101 (MQ=60)
GGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAGGGCGA > SRR4302518.4221734/1‑101 (MQ=60)
TCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATACGTCGCTGGCGATTGCCAACGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA < SRR4302518.1635168/101‑1 (MQ=60)
NNN‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCCTCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.9699386/101‑1 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG > SRR4302518.526050/1‑101 (MQ=60)
gcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.1388300/98‑1 (MQ=60)
ccgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302518.917324/98‑1 (MQ=60)
G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGAGGC > SRR4302518.7116427/1‑101 (MQ=60)
CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGATTTTTATTGAACTGATGGCGAAGGCGNNN > SRR4302518.13090495/1‑101 (MQ=60)
CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGagacagcgnnn > SRR4302518.13485317/1‑90 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGNNN > SRR4302518.10346686/1‑101 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCC > SRR4302518.2676692/1‑101 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCC > SRR4302518.2882240/1‑101 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAGTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302518.4025040/1‑101 (MQ=60)
TCTGCCGC‑AATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA < SRR4302518.3403317/101‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCNNN > SRR4302518.11250537/1‑101 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGG < SRR4302518.7229576/101‑1 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGG < SRR4302518.5874112/101‑1 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCANNN > SRR4302518.14278248/1‑101 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGG > SRR4302518.4137918/1‑101 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGG < SRR4302518.6328686/101‑1 (MQ=60)
NNNATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGGTGA < SRR4302518.12864196/101‑1 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGGTGAA < SRR4302518.1928680/101‑1 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGGTGAA > SRR4302518.1154318/1‑101 (MQ=60)
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GCGGCGTGCTGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCAGGGTGAA > NC_000913/2837956‑2838155
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |