Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,838,055 |
Δ1 bp |
coding (509/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,838,055 | 0 | G | . | 100.0%
| 1227.1
/ NA
| 267 | coding (509/1458 nt) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (123/144); total (123/144) |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837968‑2838142
|
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCa > 1:2404838/1‑93 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCa > 1:3626756/1‑93 (MQ=255)
cAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCa > 1:31076/1‑93 (MQ=255)
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCaa > 2:5094812/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCaaa < 1:1784621/93‑1 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 2:5404767/1‑93 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 1:2275533/1‑93 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 2:6691964/1‑93 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 1:3247487/1‑93 (MQ=255)
ggATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAtnt > 2:6409801/1‑93 (MQ=255)
gATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTa > 2:6929337/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa > 2:2802410/1‑93 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc > 2:783458/1‑93 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc < 1:5218129/93‑1 (MQ=255)
gCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAc < 1:3894952/93‑1 (MQ=255)
cgcccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 1:6446130/90‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:3679818/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 1:4363560/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 2:4225840/1‑93 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 1:2853627/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 1:2682065/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 1:673756/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:1576538/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 2:3222337/1‑93 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt > 1:3058884/1‑93 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 1:904627/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 2:4083787/93‑1 (MQ=255)
tAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGt < 1:1273849/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 1:7005186/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 1:4555092/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 1:5002071/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:7118435/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:5943513/93‑1 (MQ=255)
aCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCg > 1:86050/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 2:2012002/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt > 1:760605/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 1:5504188/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 2:5214546/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg > 2:1381678/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTga > 2:2324321/1‑92 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 1:4031474/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 2:4818148/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa < 1:14356/93‑1 (MQ=255)
gAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAt > 2:6771628/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:6653675/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:1126705/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt < 2:5561622/93‑1 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg > 1:3346311/1‑93 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg > 1:615356/1‑93 (MQ=255)
tgtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGc > 2:4345862/1‑93 (MQ=255)
gtgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGcc > 2:3882663/1‑93 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa < 1:1723229/93‑1 (MQ=255)
gATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCAt > 1:7387510/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtg < 1:3982921/93‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc < 1:14684/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt > 1:3999065/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTg > 2:3578844/1‑93 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTggga > 1:4243074/1‑91 (MQ=255)
cttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa > 1:796091/1‑93 (MQ=255)
cttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACa > 2:4651037/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGTTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 1:4797963/1‑93 (MQ=255)
ttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACAt > 2:7182707/1‑93 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc > 1:6892113/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc < 1:6413404/93‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg < 2:3040020/93‑1 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 1:5601275/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa < 1:4677638/93‑1 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa > 2:4594373/1‑93 (MQ=255)
tcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGa < 2:5813808/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt > 2:2592854/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt > 1:568831/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa < 1:6021503/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 1:3446400/1‑93 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt < 1:2142867/93‑1 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 1:5745824/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAtt < 1:6306665/93‑1 (MQ=255)
cTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAtt < 2:1838403/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa < 2:4576329/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa > 1:7320481/1‑93 (MQ=255)
gATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa > 2:134138/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa < 2:6627298/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc < 1:2076277/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAc < 2:6384636/93‑1 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:7190568/89‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg > 1:4958020/4‑93 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 2:6204913/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 2:1012425/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 2:1114316/90‑1 (MQ=255)
cggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATgg < 1:5798436/91‑1 (MQ=255)
ggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGc > 1:594656/2‑93 (MQ=255)
ggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGc < 1:3654428/92‑1 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg > 1:4725204/1‑93 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg > 2:3485208/1‑93 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGCGGTTTTTTTAACTGATGGCg > 2:4401411/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaa > 2:2164353/1‑93 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa > 2:3368727/1‑93 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc < 2:5489136/93‑1 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc > 2:4485212/1‑93 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc < 2:7455086/93‑1 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc > 1:1199172/1‑93 (MQ=255)
|
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837968‑2838142
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837965‑2838148
|
TGACAAAGGGACCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302542.5034256/94‑1 (MQ=60)
TGACAAAAGGATCGCCGCCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT < SRR4302542.5668724/94‑1 (MQ=60)
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT > SRR4302542.4527218/1‑94 (MQ=60)
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CAT > SRR4302542.4527219/1‑94 (MQ=60)
GACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATC > SRR4302542.6698676/1‑94 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA > SRR4302542.3660542/1‑94 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA > SRR4302542.31353/1‑94 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA < SRR4302542.7265084/94‑1 (MQ=60)
ACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCA > SRR4302542.2428243/1‑94 (MQ=60)
CAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAA > SRR4302542.6411877/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302542.450618/1‑94 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302542.2262955/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302542.1800106/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302542.3278179/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302542.2295096/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302542.2833503/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302542.3879714/94‑1 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302542.6500654/1‑94 (MQ=60)
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AACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCG > SRR4302542.86767/1‑94 (MQ=60)
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CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302542.5745923/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302542.5557684/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302542.6469549/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302542.1375984/1‑94 (MQ=60)
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CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302542.4843210/1‑94 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT < SRR4302542.14478/94‑1 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT < SRR4302542.6742289/94‑1 (MQ=60)
TGAATGTGAGCGGTGACGGTTCTTTTTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GTCATCTCCCGC‑CATCAAATTAAAAACCAACATGTCGCTGGCGAT < SRR4302542.3362102/94‑1 (MQ=42)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302542.6719237/1‑94 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302542.1136325/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302542.3137103/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302542.3377806/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG < SRR4302542.4023256/94‑1 (MQ=60)
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GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTG < SRR4302542.5186232/94‑1 (MQ=60)
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CTGCCGCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302542.573722/1‑94 (MQ=60)
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GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT > SRR4302542.3974418/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302542.1158941/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302542.2161352/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302542.6681606/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302542.629329/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATT < SRR4302542.6303425/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG < SRR4302542.7225452/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG < SRR4302542.6368798/94‑1 (MQ=60)
TGATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302542.7392180/1‑94 (MQ=60)
TGATGGGCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTTGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302542.6986323/1‑94 (MQ=60)
GATGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAA < SRR4302542.7493113/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT < SRR4302542.2094214/94‑1 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG > SRR4302542.5006185/1‑94 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302542.7081749/94‑1 (MQ=60)
CGCGG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302542.7261118/94‑1 (MQ=60)
gcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302542.1773413/91‑1 (MQ=60)
gcgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTCATTGAACTGATGG < SRR4302542.4179653/91‑1 (MQ=60)
cgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302542.4949451/3‑94 (MQ=60)
cgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302542.2179453/3‑94 (MQ=60)
cgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302542.599784/3‑94 (MQ=60)
cgG‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302542.5854713/92‑1 (MQ=60)
G‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG > SRR4302542.4771256/1‑94 (MQ=60)
G‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302542.3688645/94‑1 (MQ=60)
G‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG > SRR4302542.5872792/1‑94 (MQ=60)
G‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302542.5888292/94‑1 (MQ=60)
G‑G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302542.4952754/94‑1 (MQ=60)
G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA < SRR4302542.5722386/94‑1 (MQ=60)
G‑CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > SRR4302542.3671339/1‑94 (MQ=60)
CATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAA < SRR4302542.6015647/94‑1 (MQ=60)
TCTGTCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302542.4965260/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302542.6828799/94‑1 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302542.3252830/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > SRR4302542.1209493/1‑94 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCTATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCG < SRR4302542.1004229/94‑1 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCG > SRR4302542.6713968/1‑94 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCG < SRR4302542.1764177/94‑1 (MQ=60)
GCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGG < SRR4302542.3336807/94‑1 (MQ=60)
CCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC < SRR4302542.1598332/94‑1 (MQ=60)
CCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > SRR4302542.335953/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302542.2355601/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302542.2743584/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302542.3094338/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302542.3261219/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGCGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302542.831022/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA < SRR4302542.7382750/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302542.7124246/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302542.2286930/1‑94 (MQ=60)
|
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑G‑CATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837965‑2838148
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
