Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTAT > NC_000913/1733188‑1733374
|
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTG > SRR4302541.8876949/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTG > SRR4302541.8876948/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTG < SRR4302541.2456461/94‑1 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTG < SRR4302541.3652052/94‑1 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTG > SRR4302541.5813391/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTA > SRR4302541.3172772/1‑94 (MQ=60)
ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTA < SRR4302541.6989603/94‑1 (MQ=60)
TCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACC > SRR4302541.1425447/1‑94 (MQ=60)
CAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCC > SRR4302541.2173222/1‑94 (MQ=60)
CAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCC > SRR4302541.5795814/1‑94 (MQ=60)
AATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTG > SRR4302541.3303434/1‑94 (MQ=60)
AATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTG < SRR4302541.8086413/94‑1 (MQ=60)
acacgTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCACCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTT < SRR4302541.253302/89‑1 (MQ=60)
TCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTT < SRR4302541.1387865/94‑1 (MQ=60)
TCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTT < SRR4302541.2670123/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTG < SRR4302541.5312532/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTG < SRR4302541.1770382/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTG < SRR4302541.4448353/94‑1 (MQ=60)
CACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTG > SRR4302541.1882858/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGT < SRR4302541.493836/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGT < SRR4302541.7492865/94‑1 (MQ=60)
ACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGT > SRR4302541.2885481/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTT < SRR4302541.4601363/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTT < SRR4302541.2834697/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTT < SRR4302541.1273525/94‑1 (MQ=60)
TTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTA > SRR4302541.6062303/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTA > SRR4302541.3392659/1‑94 (MQ=60)
TCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTAC < SRR4302541.6040774/94‑1 (MQ=60)
CTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACG > SRR4302541.5464502/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACG < SRR4302541.3971783/94‑1 (MQ=60)
CTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACG > SRR4302541.1858816/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGC > SRR4302541.6483862/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGC > SRR4302541.6483863/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGC > SRR4302541.1779775/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGC > SRR4302541.2107794/1‑94 (MQ=60)
TCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCA < SRR4302541.3663993/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAAC > SRR4302541.1910525/1‑94 (MQ=60)
GTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACA < SRR4302541.3427797/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACA < SRR4302541.5094223/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTCCCCTGTTGTTACGGCAACA < SRR4302541.3273866/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACA < SRR4302541.8784670/94‑1 (MQ=60)
GTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACA < SRR4302541.3714634/94‑1 (MQ=60)
TGAAGACTACTGGCAGCGCCCCTCTGTTGGCGCTCGGCGGGGAATGCCCCCAAAAACACTTCGCTAAACCTTTACCCTGTTGTTACGGCACCAG > SRR4302541.1536089/1‑94 (MQ=60)
TGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAG < SRR4302541.6815918/94‑1 (MQ=60)
GAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGG < SRR4302541.3825458/94‑1 (MQ=60)
AAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGG > SRR4302541.7795299/1‑94 (MQ=60)
AAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGG < SRR4302541.1714198/94‑1 (MQ=60)
AAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGG < SRR4302541.4421155/94‑1 (MQ=60)
AGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGT < SRR4302541.1439739/94‑1 (MQ=60)
AGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGT > SRR4302541.2277318/1‑94 (MQ=60)
GACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTA > SRR4302541.2736780/1‑94 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAA > SRR4302541.7478249/1‑94 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAA < SRR4302541.4262121/94‑1 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAA < SRR4302541.4296930/94‑1 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAA < SRR4302541.4395772/94‑1 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAA < SRR4302541.4395774/94‑1 (MQ=60)
ACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACGGGGTAA < SRR4302541.686231/94‑1 (MQ=60)
CTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGTTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAG > SRR4302541.5443116/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAG > SRR4302541.914806/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAG > SRR4302541.7303507/1‑94 (MQ=60)
CTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAG > SRR4302541.8102733/1‑94 (MQ=60)
TACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGT < SRR4302541.2557914/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTT > SRR4302541.6573867/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTC > SRR4302541.5536163/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTC > SRR4302541.1859200/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCA > SRR4302541.5869623/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGAAACAGGGTAAGTTCAT > SRR4302541.3830332/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCAT > SRR4302541.4667150/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCAT > SRR4302541.7790601/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATC > SRR4302541.4318783/1‑94 (MQ=60)
GCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATC > SRR4302541.6903863/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCT < SRR4302541.1703588/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCT < SRR4302541.5040243/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCT > SRR4302541.2411303/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTT < SRR4302541.7911843/94‑1 (MQ=60)
CGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTT < SRR4302541.8146019/94‑1 (MQ=60)
CGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTT < SRR4302541.2372933/94‑1 (MQ=60)
GCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTG < SRR4302541.3958536/94‑1 (MQ=60)
CCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGT > SRR4302541.4459506/1‑94 (MQ=60)
CCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGT > SRR4302541.2923956/1‑94 (MQ=60)
CCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACACGCTACGTTCATCTTTTTT > SRR4302541.2923955/1‑94 (MQ=60)
CACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGCTGTTACGGCAACAGGGCAAGTTCATCTTTTGTC > SRR4302541.5368480/1‑94 (MQ=60)
CACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTC > SRR4302541.4350574/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCAC < SRR4302541.7236146/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCAC > SRR4302541.8198284/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCAC > SRR4302541.3863658/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCT > SRR4302541.3849715/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCT < SRR4302541.2262651/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCGCTCGTCGGATAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCT < SRR4302541.1021426/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTT < SRR4302541.663065/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTT < SRR4302541.5591692/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTT < SRR4302541.1745040/94‑1 (MQ=60)
GGCTCTCGTCGGGTAATGACCCCAAGAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTT < SRR4302541.1352771/94‑1 (MQ=60)
GCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTA < SRR4302541.6433631/94‑1 (MQ=60)
CTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATT < SRR4302541.5747277/94‑1 (MQ=60)
TCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAACCTTTGCCCTGTTGTTACGGCATCAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTT < SRR4302541.1823309/94‑1 (MQ=60)
TCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTT < SRR4302541.3008575/94‑1 (MQ=60)
TCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTT > SRR4302541.2680757/1‑94 (MQ=60)
TCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTT < SRR4302541.1823308/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTG < SRR4302541.6060312/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTG > SRR4302541.4196275/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTG > SRR4302541.5726414/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGC < SRR4302541.3684286/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGC < SRR4302541.3684285/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCT < SRR4302541.8065457/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTA > SRR4302541.7164353/1‑94 (MQ=60)
GGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAC < SRR4302541.4853981/94‑1 (MQ=60)
GGGTAATGACCACAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGACAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAC < SRR4302541.5966415/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGACCACAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACC > SRR4302541.2230308/1‑94 (MQ=60)
GTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCC > SRR4302541.2276476/1‑94 (MQ=60)
GTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCC < SRR4302541.6606002/94‑1 (MQ=60)
AATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTATGGTTACTGGGTAAGTTCATCatcagtcttaccattgaagctgctacccta > SRR4302541.7884132/1‑64 (MQ=45)
TGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATC < SRR4302541.3903718/94‑1 (MQ=60)
TGACCCC‑AAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCC < SRR4302541.5797762/94‑1 (MQ=60)
ACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCA < SRR4302541.4655378/94‑1 (MQ=60)
ACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCA < SRR4302541.5260106/94‑1 (MQ=60)
CCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCAT < SRR4302541.2528161/94‑1 (MQ=60)
CCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCAT > SRR4302541.6647514/1‑94 (MQ=60)
CCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATAC > SRR4302541.5076185/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACG > SRR4302541.8083467/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACG > SRR4302541.1982240/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACG > SRR4302541.2459795/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACG > SRR4302541.33845/1‑94 (MQ=60)
CAAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACG > SRR4302541.5812989/1‑94 (MQ=60)
AAAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGC > SRR4302541.4011848/1‑94 (MQ=60)
AAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGC > SRR4302541.4241626/1‑94 (MQ=60)
AAAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCA > SRR4302541.3689057/1‑94 (MQ=60)
AAACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCAC > SRR4302541.7460382/1‑94 (MQ=60)
AAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCATATCCATACGCAC > SRR4302541.1796839/1‑94 (MQ=60)
ACACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAA > SRR4302541.8327714/1‑94 (MQ=60)
ACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAA > SRR4302541.8003941/1‑94 (MQ=60)
CACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCTACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAAT < SRR4302541.8599726/94‑1 (MQ=60)
CACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCCACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAAT < SRR4302541.8599725/94‑1 (MQ=60)
CACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAAT > SRR4302541.98306/1‑94 (MQ=60)
CACTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAAT > SRR4302541.6372022/1‑94 (MQ=60)
ACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATA > SRR4302541.1965672/1‑94 (MQ=60)
ACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGGTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATA > SRR4302541.1965671/1‑94 (MQ=60)
CTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACTGCCACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAA > SRR4302541.3405527/1‑94 (MQ=60)
CTTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAA > SRR4302541.6157337/1‑94 (MQ=60)
TTCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAG < SRR4302541.3033832/94‑1 (MQ=60)
TTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAG < SRR4302541.1453284/94‑1 (MQ=60)
TTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAG < SRR4302541.4112063/94‑1 (MQ=60)
TCGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATAAGCACAATAAGG > SRR4302541.5297446/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGC > SRR4302541.5962490/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGC < SRR4302541.7872099/94‑1 (MQ=60)
CGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGC > SRR4302541.8184832/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGC < SRR4302541.7407902/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT > SRR4302541.6709974/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT < SRR4302541.6484662/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT < SRR4302541.6484664/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT < SRR4302541.7390313/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT < SRR4302541.6928040/94‑1 (MQ=60)
GCTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT > SRR4302541.4927685/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCT < SRR4302541.5339453/94‑1 (MQ=60)
CTAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTA > SRR4302541.5927346/1‑94 (MQ=60)
CTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTA > SRR4302541.496334/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCCACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAT > SRR4302541.6159404/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAT > SRR4302541.6159403/1‑94 (MQ=60)
TAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAT > SRR4302541.7741/1‑94 (MQ=60)
AAAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATT < SRR4302541.8510744/94‑1 (MQ=60)
AAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATT < SRR4302541.7753946/94‑1 (MQ=60)
AAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATT < SRR4302541.3379722/94‑1 (MQ=60)
AAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTG < SRR4302541.1319253/94‑1 (MQ=60)
AAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTG < SRR4302541.7234024/94‑1 (MQ=60)
AAACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTG < SRR4302541.7234025/94‑1 (MQ=60)
AACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGT < SRR4302541.7937872/94‑1 (MQ=60)
ACTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTA < SRR4302541.1358901/94‑1 (MQ=60)
ACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTA < SRR4302541.308079/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTAC > SRR4302541.8642739/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTAC < SRR4302541.6128833/94‑1 (MQ=60)
CTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTAC > SRR4302541.5455789/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACG > SRR4302541.7222856/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACG > SRR4302541.5825228/1‑94 (MQ=60)
TTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCTATACGCACAATAAGGCTATTGTACG < SRR4302541.8568249/94‑1 (MQ=60)
TTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACG < SRR4302541.870117/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGT > SRR4302541.5723940/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTA > SRR4302541.6872384/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTA > SRR4302541.3454869/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTA > SRR4302541.6872383/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGGAAGTTCATAATTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACCATAAGGCTAATATACGTA > SRR4302541.3454872/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTAT > SRR4302541.2879174/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTAT > SRR4302541.4793299/1‑94 (MQ=60)
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ATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTAT > NC_000913/1733188‑1733374
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
