Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
866,086 |
G→A |
G99D (GGC→GAC) |
ybiK → |
putative asparaginase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 866,086 | 0 | G | A | 100.0%
| 813.9
/ NA
| 215 | G99D (GGC→GAC) | ybiK | putative asparaginase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (109/106); total (109/106) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGGCGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAA > NC_000913/865996‑866174
|
gAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTggcggacg > 1:4470304/1‑93 (MQ=255)
gAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGCGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTggcggacg > 2:2698257/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGt > 1:5112529/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGt < 2:4966218/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGt < 1:2880647/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGt < 2:2078195/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGt < 1:1796340/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGtt < 2:2480595/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGtt < 1:2068229/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTa > 1:4513545/1‑93 (MQ=255)
ttGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTa < 2:3968651/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGt > 2:2195318/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGt < 1:5203109/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGTCAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTc > 2:3125765/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCa < 2:17883/93‑1 (MQ=255)
gcTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCAt > 2:5261887/1‑93 (MQ=255)
gcTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCAt > 1:6252548/1‑93 (MQ=255)
gcTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCAt < 2:6180797/93‑1 (MQ=255)
cTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATc > 1:5330992/1‑93 (MQ=255)
tGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCt > 2:2336353/1‑93 (MQ=255)
gTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTg > 1:2766323/1‑93 (MQ=255)
tCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGc < 2:6231554/93‑1 (MQ=255)
tCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGc < 1:3700759/93‑1 (MQ=255)
cTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCg > 2:5403116/1‑93 (MQ=255)
tttACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGt < 1:3566065/93‑1 (MQ=255)
ttACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTa < 2:154222/93‑1 (MQ=255)
tACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCCTCTGCGTaa > 2:6079444/1‑93 (MQ=255)
tACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTaa < 2:3194254/93‑1 (MQ=255)
aCGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAAt > 1:156275/1‑93 (MQ=255)
aCGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAAt > 2:45383/1‑93 (MQ=255)
cgcgTGATGAAACCCATGAACTGGGCGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATc < 2:442093/93‑1 (MQ=255)
cgcgTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATc < 1:108506/93‑1 (MQ=255)
cgcgTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCGGCGTAATc < 1:6316178/93‑1 (MQ=255)
gTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCgg > 2:4374288/1‑93 (MQ=255)
gTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCgg < 2:1291648/93‑1 (MQ=255)
gTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCgg < 1:3125535/93‑1 (MQ=255)
tgatgaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGt > 2:4823546/1‑93 (MQ=255)
tgatgaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGt > 2:3406078/1‑93 (MQ=255)
gatgaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGtt > 1:1697589/1‑93 (MQ=255)
gatgaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGtt > 2:5139156/1‑93 (MQ=255)
tgaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCt < 1:3249602/93‑1 (MQ=255)
tgaAACCCATGAACTGGACACCTGTGTGATGGATGGTAGCACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCt < 2:5688119/93‑1 (MQ=255)
gaAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCtt > 2:2871343/1‑93 (MQ=255)
aaCCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTgc < 2:3648861/93‑1 (MQ=255)
aCCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTgcc > 2:3531520/1‑93 (MQ=255)
aTGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGccc > 2:3811261/1‑93 (MQ=255)
cTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTg < 2:351514/93‑1 (MQ=255)
tGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTgg > 2:5545558/1‑93 (MQ=255)
cggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTgg < 1:4152535/92‑1 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt > 2:4333418/1‑93 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt > 1:3331512/1‑93 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt < 2:1624328/93‑1 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt > 1:2825119/1‑93 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt < 2:1337518/93‑1 (MQ=255)
ggACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGt > 2:1093844/1‑93 (MQ=255)
gACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTg > 1:5897590/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGCCTGGTGa < 2:417227/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATg < 2:6284729/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATgg > 1:2564182/1‑93 (MQ=255)
cTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGa < 2:4993876/93‑1 (MQ=255)
cTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGa > 1:6390594/1‑93 (MQ=255)
tgtgtgATGGATGGTAACCCCCTGAAACCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAg < 1:3489013/93‑1 (MQ=255)
tgtgtgATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTGGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTTGTGATGGAg > 2:390545/1‑93 (MQ=255)
tgtgtgATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAg > 2:2553956/1‑93 (MQ=255)
gtgtgATGGATGGTAACGCCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGc < 2:4160752/93‑1 (MQ=255)
tggatggTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGcc < 2:1590637/93‑1 (MQ=255)
gatggTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCg > 2:77297/1‑93 (MQ=255)
gatggTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCg < 2:1688245/93‑1 (MQ=255)
ggTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCAt < 2:2651356/93‑1 (MQ=255)
tAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCAtgt < 1:5385437/93‑1 (MQ=255)
tAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCAtgt < 2:2721793/93‑1 (MQ=255)
aaCACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCAtgtg > 1:5968206/1‑93 (MQ=255)
acCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatg > 2:1124132/1‑93 (MQ=255)
acCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatg > 2:5223837/1‑93 (MQ=255)
acCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatg > 1:2735301/1‑93 (MQ=255)
cccTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatga < 2:657981/93‑1 (MQ=255)
cccTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatga < 1:467379/93‑1 (MQ=255)
cccTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatga > 1:3181687/1‑93 (MQ=255)
ccTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatgat < 2:575585/93‑1 (MQ=255)
cTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatgatg > 1:1777859/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCCTGtgatgatga > 1:2680892/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatgatga > 1:1342263/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGtgatgatga > 1:1426405/1‑93 (MQ=255)
gAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTgatgatgat < 1:2987728/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGAtt < 1:1606716/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGAtt > 1:5482709/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTgg < 1:2299271/93‑1 (MQ=255)
aGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTgg > 2:1509346/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTgg > 2:134740/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGc > 1:2273704/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGc < 1:4091569/93‑1 (MQ=255)
ggtgcggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGaa < 2:1376676/93‑1 (MQ=255)
gtgcggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAg < 1:4561795/93‑1 (MQ=255)
gtgcggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAg < 1:6381595/93‑1 (MQ=255)
gtgcggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAg < 1:122938/93‑1 (MQ=255)
tgcggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAgg < 1:855147/93‑1 (MQ=255)
ggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGc < 2:105493/93‑1 (MQ=255)
ggtgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGc > 1:1130405/1‑93 (MQ=255)
tgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAg < 1:3854785/93‑1 (MQ=255)
tgGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAg < 1:4896277/93‑1 (MQ=255)
|
GAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGGCGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAA > NC_000913/865996‑866174
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGGCGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATTT > NC_000913/865994‑866179
|
CGGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGAC < SRR4302534.6219036/94‑1 (MQ=60)
CGGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGAC > SRR4302534.5436235/1‑94 (MQ=60)
GGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACG > SRR4302534.3759831/1‑94 (MQ=60)
GGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACG > SRR4302534.4591207/1‑94 (MQ=60)
GGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACG < SRR4302534.243300/94‑1 (MQ=60)
GAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGT < SRR4302534.4841996/94‑1 (MQ=60)
GAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGT > SRR4302534.5250500/1‑94 (MQ=60)
AATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTT < SRR4302534.2956250/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTT > SRR4302534.2575599/1‑94 (MQ=60)
AATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTT < SRR4302534.1842996/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTT > SRR4302534.1733487/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTA < SRR4302534.5420761/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTA < SRR4302534.2122323/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTA < SRR4302534.4784729/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTA > SRR4302534.4635797/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAG < SRR4302534.6257713/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTGTCTTTACGCTTGATGAAACCCATGATCTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGT < SRR4302534.113900/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGT > SRR4302534.6557050/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGT < SRR4302534.4624289/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGATAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTC > SRR4302534.5341437/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTC < SRR4302534.5343480/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCAT > SRR4302534.6422052/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATC > SRR4302534.5474770/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATC > SRR4302534.6127609/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATC > SRR4302534.4506298/1‑94 (MQ=60)
TGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTG < SRR4302534.5880807/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTG > SRR4302534.2839147/1‑94 (MQ=60)
TCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCG < SRR4302534.3800240/94‑1 (MQ=60)
CTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGT > SRR4302534.4665640/1‑94 (MQ=60)
CTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGT > SRR4302534.2660599/1‑94 (MQ=60)
TTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTA < SRR4302534.3661990/94‑1 (MQ=60)
TACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAAT > SRR4302534.652877/1‑94 (MQ=60)
TACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAAT > SRR4302534.160363/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCC < SRR4302534.111406/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCC < SRR4302534.3270152/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCGGCGTAATCC < SRR4302534.6486886/94‑1 (MQ=60)
GCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCG < SRR4302534.3907592/94‑1 (MQ=60)
CGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGG > SRR4302534.651006/1‑94 (MQ=60)
GTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGT < SRR4302534.3207708/94‑1 (MQ=60)
TGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTT > SRR4302534.1741702/1‑94 (MQ=60)
ATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCT > SRR4302534.3228023/1‑94 (MQ=60)
ATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCT < SRR4302534.970210/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCCATGACCTGGACGCCTGTGTGATGGATCATAACTCCCTCAAAGCCGGTGCGATGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTT < SRR4302534.4640074/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTT < SRR4302534.2804303/94‑1 (MQ=60)
TGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTT < SRR4302534.3336138/94‑1 (MQ=60)
AAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGC < SRR4302534.5517271/94‑1 (MQ=60)
AACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCC < SRR4302534.1671290/94‑1 (MQ=60)
ACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCG > SRR4302534.2709602/1‑94 (MQ=60)
CCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACAACCTGAAAGCCGGGGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGAGTCTTGACGC > SRR4302534.1314206/1‑94 (MQ=60)
CATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCC > SRR4302534.3111090/1‑94 (MQ=60)
ATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCG < SRR4302534.645682/94‑1 (MQ=60)
ATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCG < SRR4302534.2079628/94‑1 (MQ=60)
TGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGG > SRR4302534.4491672/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGC > SRR4302534.2899206/1‑94 (MQ=60)
AACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCT < SRR4302534.3542722/94‑1 (MQ=60)
ACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTG > SRR4302534.3431380/1‑94 (MQ=60)
TGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGT > SRR4302534.3420625/1‑94 (MQ=60)
TGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGT > SRR4302534.2899382/1‑94 (MQ=60)
CGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGT < SRR4302534.4264633/94‑1 (MQ=60)
GGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTG > SRR4302534.2849444/1‑94 (MQ=60)
GGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTG > SRR4302534.6057726/1‑94 (MQ=60)
GACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGA < SRR4302534.4837379/94‑1 (MQ=60)
GCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGG > SRR4302534.2632145/1‑94 (MQ=60)
GCCTGAGTGATGGATGGTAACACCCTGTAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGATAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCTGCTGGTGAAGG > SRR4302534.5904234/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGA > SRR4302534.6563204/1‑94 (MQ=60)
CCTGGGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCTGTTCAGTGGCGGATGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGGCGCCCGGCTGGTGATGGA < SRR4302534.5085149/94‑1 (MQ=60)
TGTGTGATGGATGGTAACCCCCTGAAACCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGC < SRR4302534.3582792/94‑1 (MQ=60)
TGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGcacg > SRR4302534.3643032/1‑90 (MQ=60)
TGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAA < SRR4302534.1442593/94‑1 (MQ=60)
TGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCC < SRR4302534.210147/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCG < SRR4302534.2985421/94‑1 (MQ=60)
GATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGC > SRR4302534.4154421/1‑94 (MQ=60)
ATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCA < SRR4302534.5167648/94‑1 (MQ=60)
GTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGT < SRR4302534.1626724/94‑1 (MQ=60)
TAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTG < SRR4302534.5530493/94‑1 (MQ=60)
TAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTG > SRR4302534.6130285/1‑94 (MQ=60)
ACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGGCCGCATGTGAT > SRR4302534.2820089/1‑94 (MQ=60)
CACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATG > SRR4302534.2807406/1‑94 (MQ=60)
CACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATG < SRR4302534.2955145/94‑1 (MQ=60)
CACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATG < SRR4302534.3353591/94‑1 (MQ=60)
ACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGA > SRR4302534.3265758/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGA > SRR4302534.3919413/1‑94 (MQ=60)
CCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGAT < SRR4302534.479165/94‑1 (MQ=60)
CCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATG > SRR4302534.5447339/1‑94 (MQ=60)
CCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATG > SRR4302534.1795806/1‑94 (MQ=60)
CCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATG > SRR4302534.1824024/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCCTGTGATGATGA > SRR4302534.2751754/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGA > SRR4302534.1463919/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGA > SRR4302534.1377650/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATT < SRR4302534.3065855/94‑1 (MQ=60)
GAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATT > SRR4302534.5630566/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATT < SRR4302534.1842452/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTG < SRR4302534.1648679/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTG < SRR4302534.5607321/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGG < SRR4302534.671844/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGC < SRR4302534.2360303/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGC > SRR4302534.2334014/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCG < SRR4302534.4201512/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCG < SRR4302534.2227743/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGA > SRR4302534.4205648/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGA < SRR4302534.3111014/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGTGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAA > SRR4302534.1473571/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGG < SRR4302534.6553971/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGG < SRR4302534.126188/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGG < SRR4302534.4685473/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGG < SRR4302534.876723/94‑1 (MQ=60)
CGGTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGC > SRR4302534.1159954/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAG < SRR4302534.1172547/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGA < SRR4302534.3958279/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGA < SRR4302534.5029022/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAA < SRR4302534.5998238/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAA > SRR4302534.2342847/1‑94 (MQ=60)
GCGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAA < SRR4302534.1431399/94‑1 (MQ=60)
CGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGGAAA > SRR4302534.3629835/1‑94 (MQ=60)
CGGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAA > SRR4302534.2482852/1‑94 (MQ=60)
GGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAAT < SRR4302534.3611097/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAAT < SRR4302534.2759360/94‑1 (MQ=60)
GACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATT < SRR4302534.6547935/94‑1 (MQ=60)
GACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATT > SRR4302534.914774/1‑94 (MQ=60)
ACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATTT < SRR4302534.6197989/94‑1 (MQ=60)
ACGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATTT < SRR4302534.4882041/94‑1 (MQ=60)
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CGGAATTGGCGCTGTCTTTACGCGTGATGAAACCCATGAACTGGACGCCTGTGTGATGGATGGTAACACCCTGAAAGCCGGTGCGGTGGCGGGCGTTAGTCATCTGCGTAATCCGGTTCTTGCCGCCCGGCTGGTGATGGAGCAAAGCCCGCATGTGATGATGATTGGCGAAGGGGCAGAAAATTT > NC_000913/865994‑866179
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
